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甲基化敏感扩增多态性技术检测体系的建立
被引量：
1
1
作者
彭海
席婷
+1 位作者
张静
魏传斌
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2011年第5期34-36,共3页
为了获得理想的甲基化检测效果,通过调整基因组DNA用量、PCR试剂浓度等因素,优化了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)体系。结果表明:基因组用量为250 ng,预扩与选扩体系分别采用Fermentas公司生产的PCR混合物1/2和1/4体系时,能得到理想...
为了获得理想的甲基化检测效果,通过调整基因组DNA用量、PCR试剂浓度等因素,优化了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)体系。结果表明:基因组用量为250 ng,预扩与选扩体系分别采用Fermentas公司生产的PCR混合物1/2和1/4体系时,能得到理想的检测效果。
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关键词
甲基
化
敏感
扩
增
多态性
技术
优
化
酶切
PCR
扩
增
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职称材料
黑果枸杞MSAP技术体系的构建
2
作者
刘晓雯
张得芳
王占林
《青海大学学报》
2024年第2期35-42,共8页
为利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)构建黑果枸杞MSAP技术反应体系,本试验采用CTAB法提取黑果枸杞DNA,通过双酶切、预扩增和选择性扩增对16对引物的多态性进行初步筛选并构建MSAP技术体系。结果表明:双酶切进行12 h,DNA模板能够酶切...
为利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)构建黑果枸杞MSAP技术反应体系,本试验采用CTAB法提取黑果枸杞DNA,通过双酶切、预扩增和选择性扩增对16对引物的多态性进行初步筛选并构建MSAP技术体系。结果表明:双酶切进行12 h,DNA模板能够酶切完全;预扩增反应产物条带集中在250~1000 bp处,选择性扩增可筛选出6对引物组合,条带明显。本研究为后续黑果枸杞DNA甲基化水平的相关分析研究奠定了基础。
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关键词
黑果枸杞
甲基
化
敏感
多态性
扩
增
技术
(
msap
)
DNA
甲基
化
引物组合
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职称材料
干旱胁迫下甘蓝型油菜全基因组DNA甲基化分析
3
作者
王建平
张书芬
+7 位作者
朱家成
何俊平
曹金华
文雁成
胡坤
赵磊
王东国
蔡东芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期585-593,共9页
为实现油菜抗旱稳产,了解甘蓝型油菜DNA甲基化及其在干旱胁迫应答过程中可能起到的作用,分别以抗旱和干旱敏感油菜品系为材料,利用扩增片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术(AFSM)对其在干旱和复水处理下的叶和根组织进行全基因组DNA甲...
为实现油菜抗旱稳产,了解甘蓝型油菜DNA甲基化及其在干旱胁迫应答过程中可能起到的作用,分别以抗旱和干旱敏感油菜品系为材料,利用扩增片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术(AFSM)对其在干旱和复水处理下的叶和根组织进行全基因组DNA甲基化分析。结果发现:两个材料在三个处理条件下共鉴定到22 157个甲基化位点,以5mCCGG全甲基化位点为主,主要发生在基因的编码区,其次是启动子区。干旱胁迫诱导油菜全基因组DNA甲基化水平的变化,不同材料组织之间存在差异。干旱胁迫诱导叶组织整体甲基化水平升高,根组织差异不明显;复水处理导致叶组织整体甲基化水平下降,根组织的甲基化水平在两个材料间存在差异。差异甲基化位点的基因主要参与光合作用,类囊体、核糖体、质体和核膜等细胞组成,转运及转运蛋白活性等分子生物学功能。
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关键词
甘蓝型油菜
干旱胁迫
DNA
甲基
化
AFSM(
扩
增
片段单核苷酸
多态性
和
甲基
化
检测
技术
)
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职称材料
桃同株叶片杂色材料的MSAP分析
4
作者
蔡志翔
沈志军
+2 位作者
马瑞娟
严娟
俞明亮
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第3期662-667,共6页
为探寻桃同株叶片杂色材料PCM-1的突变机制,建立了桃PCM-1G和PCM-1R DNA样品的基因池,用256对甲基化敏感扩增多态性（MSAP）选择性扩增引物进行全基因组甲基化MSAP分析。筛选出23对条带清晰、丰富且重复性好的引物组合。扩增出200～1 00...
为探寻桃同株叶片杂色材料PCM-1的突变机制,建立了桃PCM-1G和PCM-1R DNA样品的基因池,用256对甲基化敏感扩增多态性（MSAP）选择性扩增引物进行全基因组甲基化MSAP分析。筛选出23对条带清晰、丰富且重复性好的引物组合。扩增出200～1 000 bp的位点397个,其中PCM-1G、PCM-1R两种类型半甲基化位点分别为38个和44个,分别占全部位点的9.6%和11.1%;全甲基化位点分别为64个和67个,分别占全部位点的16.1%和16.9%;总甲基化率分别为25.7%和28.0%。成功分离了29条甲基化修饰DNA序列,通过测序发现有22条能够得到桃基因组支持且同源性较高,其中2条来自于类胡萝卜素裂解双加氧酶4（CCD4）、3条来自于Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶;推测CCD4和Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶可能与叶色嵌合突变有关。
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关键词
桃
嵌合体
DNA
甲基
化
甲基
化
敏感
多态性
扩
增
(
msap
)
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职称材料
题名
甲基化敏感扩增多态性技术检测体系的建立
被引量：
1
1
作者
彭海
席婷
张静
魏传斌
机构
江汉大学生命科学学院
四川农业大学水稻研究所
出处
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2011年第5期34-36,共3页
基金
湖北省自然科学基金(2009CDB259)
湖北省中青年人才项目(Q20104504)
+1 种基金
武汉市高校科研项目(2008K006
2009K067)
文摘
为了获得理想的甲基化检测效果,通过调整基因组DNA用量、PCR试剂浓度等因素,优化了甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)体系。结果表明:基因组用量为250 ng,预扩与选扩体系分别采用Fermentas公司生产的PCR混合物1/2和1/4体系时,能得到理想的检测效果。
关键词
甲基
化
敏感
扩
增
多态性
技术
优
化
酶切
PCR
扩
增
Keywords
methylation sensitive amplified polymorphism
optimization
enzyme digestion
PCR amplification
分类号
S33 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
黑果枸杞MSAP技术体系的构建
2
作者
刘晓雯
张得芳
王占林
机构
青海大学农林科学院
出处
《青海大学学报》
2024年第2期35-42,共8页
基金
国家自然科学基金项目(32170239)
青海省科学技术厅项目(2022-ZJ-725)。
文摘
为利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)构建黑果枸杞MSAP技术反应体系,本试验采用CTAB法提取黑果枸杞DNA,通过双酶切、预扩增和选择性扩增对16对引物的多态性进行初步筛选并构建MSAP技术体系。结果表明:双酶切进行12 h,DNA模板能够酶切完全;预扩增反应产物条带集中在250~1000 bp处,选择性扩增可筛选出6对引物组合,条带明显。本研究为后续黑果枸杞DNA甲基化水平的相关分析研究奠定了基础。
关键词
黑果枸杞
甲基
化
敏感
多态性
扩
增
技术
(
msap
)
DNA
甲基
化
引物组合
Keywords
Lycium ruthenicum Murr.
methylation-sensitive amplified polymorphism(
msap
)
DNA methylation
primer combination
分类号
Q691 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
干旱胁迫下甘蓝型油菜全基因组DNA甲基化分析
3
作者
王建平
张书芬
朱家成
何俊平
曹金华
文雁成
胡坤
赵磊
王东国
蔡东芳
机构
河南省农业科学院经济作物研究所/农业农村部黄淮海油料作物重点实验室/河南省油料作物遗传改良重点实验室
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期585-593,共9页
基金
十三五国家重点研发计划(2018YFD0100600)
国家现代农业产业技术体系-油菜(CARS-12)
河南省重大科技专项(151100111200)。
文摘
为实现油菜抗旱稳产,了解甘蓝型油菜DNA甲基化及其在干旱胁迫应答过程中可能起到的作用,分别以抗旱和干旱敏感油菜品系为材料,利用扩增片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术(AFSM)对其在干旱和复水处理下的叶和根组织进行全基因组DNA甲基化分析。结果发现:两个材料在三个处理条件下共鉴定到22 157个甲基化位点,以5mCCGG全甲基化位点为主,主要发生在基因的编码区,其次是启动子区。干旱胁迫诱导油菜全基因组DNA甲基化水平的变化,不同材料组织之间存在差异。干旱胁迫诱导叶组织整体甲基化水平升高,根组织差异不明显;复水处理导致叶组织整体甲基化水平下降,根组织的甲基化水平在两个材料间存在差异。差异甲基化位点的基因主要参与光合作用,类囊体、核糖体、质体和核膜等细胞组成,转运及转运蛋白活性等分子生物学功能。
关键词
甘蓝型油菜
干旱胁迫
DNA
甲基
化
AFSM(
扩
增
片段单核苷酸
多态性
和
甲基
化
检测
技术
)
Keywords
Brassica napus
drought stress
DNA methylation
AFSM(amplified-fragment single nucleotide polymorphism and methylation)
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
桃同株叶片杂色材料的MSAP分析
4
作者
蔡志翔
沈志军
马瑞娟
严娟
俞明亮
机构
江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第3期662-667,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31101517)
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(12)5034]
文摘
为探寻桃同株叶片杂色材料PCM-1的突变机制,建立了桃PCM-1G和PCM-1R DNA样品的基因池,用256对甲基化敏感扩增多态性（MSAP）选择性扩增引物进行全基因组甲基化MSAP分析。筛选出23对条带清晰、丰富且重复性好的引物组合。扩增出200～1 000 bp的位点397个,其中PCM-1G、PCM-1R两种类型半甲基化位点分别为38个和44个,分别占全部位点的9.6%和11.1%;全甲基化位点分别为64个和67个,分别占全部位点的16.1%和16.9%;总甲基化率分别为25.7%和28.0%。成功分离了29条甲基化修饰DNA序列,通过测序发现有22条能够得到桃基因组支持且同源性较高,其中2条来自于类胡萝卜素裂解双加氧酶4（CCD4）、3条来自于Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶;推测CCD4和Omega-羟基棕榈酸阿魏酸转移酶可能与叶色嵌合突变有关。
关键词
桃
嵌合体
DNA
甲基
化
甲基
化
敏感
多态性
扩
增
(
msap
)
Keywords
Prunuspersica
chimaera
DNA methylation
methylationsensitive amplification polymorphism（
msap
）
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲基化敏感扩增多态性技术检测体系的建立
彭海
席婷
张静
魏传斌
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2011
1
下载PDF
职称材料
2
黑果枸杞MSAP技术体系的构建
刘晓雯
张得芳
王占林
《青海大学学报》
2024
0
下载PDF
职称材料
3
干旱胁迫下甘蓝型油菜全基因组DNA甲基化分析
王建平
张书芬
朱家成
何俊平
曹金华
文雁成
胡坤
赵磊
王东国
蔡东芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
4
桃同株叶片杂色材料的MSAP分析
蔡志翔
沈志军
马瑞娟
严娟
俞明亮
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
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