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基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型
1
作者 胡玉莲 齐健 +4 位作者 王姝洁 洪波 孙晓君 王宏志 聂金福 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期597-603,共7页
目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定... 目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定量仪检测cfDNA浓度;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测cfDNA的H4C6甲基化水平;使用Logistic回归算法构建H4C6甲基化水平联合cfDNA浓度的癌症风险预测模型;使用受试者工作特征(ROC)曲线和校准曲线评估模型的准确性;使用决策曲线分析(DCA)评估模型的临床效益。结果 联合H4C6甲基化水平与cfDNA浓度构建的模型区分肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、泛癌与健康组的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.769、0.988、0.934、0.922、0.830;校准曲线的平均绝对误差小于0.05;DCA曲线的净收益大于0。结论 基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建的癌症风险预测模型有较好的预测性能,有助于给临床前决策提供合理且有效的建议,最终可能给患者提供有针对性的、个性化的癌症检测与诊断方案。 展开更多
关键词 H4C6甲基化水平 cfDNA浓度 癌症风险预测
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重金属对水稻和小麦DNA甲基化水平的影响 被引量：53
2
作者 葛才林 杨小勇 +3 位作者 刘向农 孙锦荷 罗时石 王泽港 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 2002年第5期363-368,共6页
和对照相比 ,0 .0 2 5 (或 0 .0 5 )～ 0 .1mmol/L的Cu2 + 及 0 .0 2 5 (或 0 .0 5 )～ 1.0mmol/L的Cd2 + 或Hg2 + 导致水稻 (或小麦 )叶DNA中的 5 甲基胞嘧啶百分含量大幅度上升 ;当Cu2 + 浓度 >0 .1mmol/L时 ,小麦和水稻叶DNA中 ... 和对照相比 ,0 .0 2 5 (或 0 .0 5 )～ 0 .1mmol/L的Cu2 + 及 0 .0 2 5 (或 0 .0 5 )～ 1.0mmol/L的Cd2 + 或Hg2 + 导致水稻 (或小麦 )叶DNA中的 5 甲基胞嘧啶百分含量大幅度上升 ;当Cu2 + 浓度 >0 .1mmol/L时 ,小麦和水稻叶DNA中 5 甲基胞嘧啶的百分含量随Cu2 + 浓度的增高略有下降 ,但仍高于对照。 0 .1～ 1.0mmol/L的Cu2 + 、Cd2 + 和Hg2 + 也导致小麦穗DNA中 5 甲基胞嘧啶的百分含量随Cu2 + 、Cd2 + 和Hg2 + 浓度的增高逐步升高。不大于 0 .5mmol/L的Cu2 + 和Cd2 + 能使小麦和水稻根系DNA中 5 甲基胞嘧啶的百分含量显著高于对照 ,而 0 .1～ 1.0mmol/L的Hg2 + 以及 1.0mmol/L的Cu2 + 和Cd2 + 则造成小麦和水稻根系DNA中 5 甲基胞嘧啶的百分含量显著低于对照。 展开更多
关键词 水稻 小麦 NA甲基化水平 重金属胁迫
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HPLC法测定不同年龄人参DNA的甲基化水平 被引量：10
3
作者 董亚娟 程舟 +5 位作者 李珊 周铜水 陈家宽 万树文 顾敏 张文驹 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1416-1418,共3页
关键词 DNA甲基化 甲基化水平 HPLC法 年龄 人参 测定 基因组表达 化学修饰
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S-腺苷酰L-甲硫氨酸 (SAM)对 HL-60细胞 DNA甲基化酶活力和甲基化水平的影响(英文) 被引量：6
4
作者 白坚石 马晴 +1 位作者 王萍 何忠效 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期155-159,共5页
以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力... 以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力未见升高 .说明细胞基因组甲基化水平升高并不是胞内 DNA甲基化酶催化能力改变的结果 ,而是由于 SAM进入细胞提供过量甲基造成的 . 展开更多
关键词 S-腺苷酰-L-甲硫氨酸 HL-60细胞 细胞分化 DNA甲基化酶 甲基化水平 酶活
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广西长寿地区人群白细胞DNA总体甲基化水平研究 被引量：3
5
作者 张志勇 李春宏 +5 位作者 仇小强 农清清 何敏 覃健 蒋贵发 黄明立 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1513-1516,共4页
目的比较广西长寿地区巴马县人群与一般地区人群的白细胞DNA总体甲基化水平,探讨长寿与DNA甲基化之间可能存在的关系。方法（1）在巴马县长寿村落抽取健康个体199人组成实验组,另抽取与实验组年龄性别相匹配的个体163人组成对照组。（2... 目的比较广西长寿地区巴马县人群与一般地区人群的白细胞DNA总体甲基化水平,探讨长寿与DNA甲基化之间可能存在的关系。方法（1）在巴马县长寿村落抽取健康个体199人组成实验组,另抽取与实验组年龄性别相匹配的个体163人组成对照组。（2）取研究对象外周血2 ml,分离白细胞、提取DNA,用高效液相色谱法检测其中胞嘧啶（dC）和5-甲基胞嘧啶（5-dmC）浓度,计算5-dmC/（dC＋5-dmC）比值,以比值代表研究对象总体甲基化水平。结果（1）对照组和实验组研究对象的总体甲基化水平都呈增龄性下降,下降速率分别为-0.874 3和-1.151 7,年龄与甲基化比值呈负相关,相关系数分别是-0.480和-0.639;（2）实验组人群DNA总体甲基化水平比对照组的高（P〈0.001）;分年龄组段比较,在10～、20～、40～、50～、60～年龄段,实验组人群的甲基化水平高于对照组（P〈0.05）。结论巴马县人群长寿与其DNA总体甲基化水平较高可能有一定的关系。 展开更多
关键词 巴马县 长寿 DNA总体甲基化水平
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白菜DNA甲基化水平的反相离子对高效液相色谱法研究 被引量：4
6
作者 吴筱丹 王华 楼健 《理化检验（化学分册）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期5-6,10,共3页
建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测... 建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测定DNA水样所产生的胞嘧啶和甲基胞嘧啶的含量,即可得知DNA甲基化程度。胞嘧啶和甲基胞嘧啶回收率分别为99.6%及103.3%,RSD为3.7%(日内)及5.2%(日间)。 展开更多
关键词 反相-离子对 HPLC DNA 甲基化水平 白菜 胞嘧啶 甲基胞嘧啶
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反相高效液相色谱法测定人乳腺癌MCF7细胞中基因组DNA甲基化水平 被引量：2
7
作者 蔡鑫泽 乔莹 +4 位作者 都姝妍 刘楠 陈冬 车睿超 姜奕 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期898-900,903,共4页
目的利用反相高效液相色谱法检测MCF7细胞系中基因组DNA的甲基化水平。方法采用Nano LC(75μm×15 cm,5μm)和Micro LC(1.0 mm×15 cm,5μm)的C18反相色谱柱,以甲醇-醋酸铵缓冲液(pH 5.0)为流动相,使用线性梯度程序,将MCF7细胞... 目的利用反相高效液相色谱法检测MCF7细胞系中基因组DNA的甲基化水平。方法采用Nano LC(75μm×15 cm,5μm)和Micro LC(1.0 mm×15 cm,5μm)的C18反相色谱柱,以甲醇-醋酸铵缓冲液(pH 5.0)为流动相,使用线性梯度程序,将MCF7细胞中基因组DNA水解产物进行分离,两种体系流速分别是300 nl/min和40μl/min,在273 nm波长处检测,利用外标法分别检测DNA中脱氧胞嘧啶(dC)和甲基化脱氧胞嘧啶(5mdC)含量。结果 MCF7基因组DNA的水解产物,经反相色谱分离得到的峰图有较好的准确性与重复性;DNA水解后的产物为弱保留化合物,且Micro LC分离效果优于Nano LC;乳腺癌细胞MCF7甲基化水平为19.3%,高于正常细胞中基因组DNA甲基化水平。结论成功的将MCF7细胞中基因组DNA水解产物经反相色谱分离;使用Micro LC分离DNA水解后的弱保留产物较佳;MCF7细胞系基因组DNA甲基化水平高于正常细胞。 展开更多
关键词 反相高效液相色谱法 基因组 甲基化水平 乳腺癌
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长爪沙鼠肝脏基因组DNA甲基化水平检测 被引量：2
8
作者 王志远 刘月环 《实验动物与比较医学》 CAS 2018年第1期44-47,共4页
目的用间接ELISA法检测长爪沙鼠肝脏基因组DNA整体甲基化的水平。方法选取新生仔鼠6只(仔鼠组),3月龄鼠12只[其中青年对照组6只,高脂饮食诱发非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)青年模型组6只],8月龄中老龄鼠6只(中老龄),各组均为雄性,按组采集... 目的用间接ELISA法检测长爪沙鼠肝脏基因组DNA整体甲基化的水平。方法选取新生仔鼠6只(仔鼠组),3月龄鼠12只[其中青年对照组6只,高脂饮食诱发非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)青年模型组6只],8月龄中老龄鼠6只(中老龄),各组均为雄性,按组采集血清(新生鼠除外)用于总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)检测,同时采集肝脏标本二份,一份作常规HE染色的形态学观察,一份提基因组DNA,用ELISA法试剂盒检测肝脏基因组DNA整体甲基化的水平[即5-甲基胞嘧啶(5-mc)含量]。结果青年模型组鼠及中老龄鼠均出现高脂血症,血清TC及TG均不同程度显著上升,青年对照组鼠血脂正常。病理学检查显示,青年模型组与中老龄组鼠肝脏出现较为明显的脂肪变性,而青年对照组肝脏无异常,新生仔鼠肝血窦中可见大量成堆分布有单核细胞和红细胞。肝脏基因组DNA整体甲基化水平,青年模型组沙鼠>新生仔鼠>老龄鼠>5对照组鼠。结论长爪沙鼠NAFLD及年龄增加引起的脂肪性变程度与其基因组DNA甲基化水平相关,间接ELISA法检测肝脏基因组DNA整体甲基化水平简便、迅速,成本低,或可以作为评价其表观遗传学的一种方法。 展开更多
关键词 长爪沙鼠 基因组DNA整体甲基化水平 5-甲基胞嘧啶(5-mc) 间接ELISA法 非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)
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^3H—SAM掺入法检测胃癌DNA甲基化水平
9
作者 房静远 朱舜时 +3 位作者 萧树东 江绍基 夏宗勤 照日格图 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第4期254-256,共3页
目的：探讨人胃癌ＤＮＡ甲基化情况及检测方法。方法：以甲基化酶温育与３Ｈ－ＳＡＭ掺入法检测２１例人胃癌癌旁和外周正常区域的总基因组ＤＮＡ甲基化水平，并与相同标本的ＨｐａⅡ／ＭｓｐⅠ酶解、Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｏｌｔ分析癌基... 目的：探讨人胃癌ＤＮＡ甲基化情况及检测方法。方法：以甲基化酶温育与３Ｈ－ＳＡＭ掺入法检测２１例人胃癌癌旁和外周正常区域的总基因组ＤＮＡ甲基化水平，并与相同标本的ＨｐａⅡ／ＭｓｐⅠ酶解、Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｏｌｔ分析癌基因甲基化的结果相比较。结果：发现前者检测癌细胞甲基化的敏感性高于后者；而对于癌前病变区，前者的阳性率又低于后者；两种方法都显示癌细胞总基因组ＤＮＡ甲基化和ｃ－ｍｙｃ，ｃ－Ｈａ－ｒａｓ癌基因甲基化水平降低。结论：在人胃癌发生中有ＤＮＡ甲基化的改变，两种检测ＤＮＡ甲基化方法的结果有所不同，可相互借鉴和补充。 展开更多
关键词 胃癌 ^3H-SAM掺入法 DNA甲基化 甲基化水平
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亚硫酸盐测序法定量分析ABO基因启动子区CpG岛甲基化水平
10
作者 应燕玲 朱发明 +2 位作者 许先国 吕杭军 严力行 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第S1期131-131,共1页
关键词 ABO 测序法 CPG岛甲基化 启动子 甲基化水平 胃癌细胞株 DNA 人全血 部分甲基化 抽提质粒
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辅助性T细胞22联合白细胞介素-10甲基化水平在宫颈癌前病变诊断的应用研究 被引量：1
11
作者 赵卉 《中国药物与临床》 CAS 2018年第9期1506-1508,共3页
宫颈癌是一种严重威胁人类健康的恶性疾病,流行病学研究表明,子宫颈癌的发生率逐年增高并呈现年轻化的趋势。由于宫颈癌的发生是一个渐进的过程,其中宫颈癌前病变对于肿瘤的发生和发展具有重要影响;因此,对宫颈癌前病变的患者进行早期... 宫颈癌是一种严重威胁人类健康的恶性疾病,流行病学研究表明,子宫颈癌的发生率逐年增高并呈现年轻化的趋势。由于宫颈癌的发生是一个渐进的过程,其中宫颈癌前病变对于肿瘤的发生和发展具有重要影响;因此,对宫颈癌前病变的患者进行早期诊断和治疗对于避免宫颈恶性肿瘤的发生和发展具有帮助。 展开更多
关键词 宫颈癌前病变 子宫颈癌 白细胞介素-10 辅助性T细胞 甲基化水平 病变诊断 宫颈恶性肿瘤 应用
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生物素标记的甲基化间区位点扩增技术分辨不同组织DNA甲基化水平方法初探
12
作者 王小怡 王博 +2 位作者 王雪伟 高哲 郭大玮 《中国医药生物技术》 2017年第1期80-83,共4页
DNA甲基化是重要的表观遗传修饰之一。在哺乳动物细胞中,DNA甲基化参与基因表达和染色质结构的调控,与多种癌症的发生发展相关。DNA甲基化在胚胎发育早期、个体生长发育及多种疾病的发生发展过程中起着重要的作用,是当前表观遗传研究领... DNA甲基化是重要的表观遗传修饰之一。在哺乳动物细胞中,DNA甲基化参与基因表达和染色质结构的调控,与多种癌症的发生发展相关。DNA甲基化在胚胎发育早期、个体生长发育及多种疾病的发生发展过程中起着重要的作用,是当前表观遗传研究领域的热点之一。 展开更多
关键词 DNA甲基化 甲基化水平 生物素标记 扩增技术 表观遗传修饰 组织 区位 哺乳动物细胞
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基因组DNA甲基化水平与不明原因早期自然流产的相关性 被引量：10
13
作者 晁远 翁立冬 曾嵘 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1498-1502,共5页
目的探讨基因组DNA甲基化水平与人不明原因早期自然流产的关系并从mRNA表达量上研究DNMT1、DNMT3A和DNMT3B在自然流产绒毛DNA甲基化中的作用。方法收集45例核型正常自然流产绒毛组织及其中33例母亲外周血和44例核型正常人工流产绒毛组... 目的探讨基因组DNA甲基化水平与人不明原因早期自然流产的关系并从mRNA表达量上研究DNMT1、DNMT3A和DNMT3B在自然流产绒毛DNA甲基化中的作用。方法收集45例核型正常自然流产绒毛组织及其中33例母亲外周血和44例核型正常人工流产绒毛组织及其中34例母亲外周血,采用高效液相色谱法(HPLC)测定基因组DNA甲基化水平并用荧光定量PCR法检测其中33例人工流产绒毛和30例自然流产绒毛DNMT mRNA的表达。结果 (1)自然流产绒毛组DNA甲基化水平低于人工流产绒毛组(P<0.01);(2)自然流产母亲组和人工流产母亲组间DNA甲基化水平差异无统计学意义(P>0.05);(3)自然流产绒毛组DNMT1和DNMT3AmRNA的表达低于人工流产绒毛组(P<0.05);(4)自然流产绒毛组DNMT3B mRNA的表达与人工流产绒毛组差异无统计学意义(P>0.05)。结论(1)人类早期自然流产中确实存在着绒毛组织基因组DNA甲基化的不足;(2)自然流产绒毛中DNA甲基化的不足可能与DNMT1和DNMT3A表达降低有关。 展开更多
关键词 基因组DNA甲基化水平 自然流产 绒毛组织 外周血 DNA甲基转移酶
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蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及其启动子区甲基化水平与抗结核药物致肝损伤的关系 被引量：2
14
作者 胡宝翠 郝金奇 +5 位作者 施瑞清 侯瑞丽 余艳琴 张冬 邓乐乐 韦丽琴 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2020年第6期598-603,共6页
目的抗结核药物致肝损伤(ADIH)的发生与CYP2E1基因多态性及甲基化水平是否相关的研究甚少。文中旨在探讨蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH的关系。方法选取2015年11月至2018年6月于内蒙古通辽市结核病防治... 目的抗结核药物致肝损伤(ADIH)的发生与CYP2E1基因多态性及甲基化水平是否相关的研究甚少。文中旨在探讨蒙古族结核病患者CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH的关系。方法选取2015年11月至2018年6月于内蒙古通辽市结核病防治所标准化治疗的135例蒙古族结核病患者。根据ADIH判定标准选取发生肝损伤的蒙古族结核病患者为ADIH组(n=45),按照1∶2比例匹配未发生肝损伤的蒙古族结核病患者为对照组(n=90)。进行DNA提取,聚合酶链反应(PCR)扩增CYP2E1基因,确定CYP2E1 rs2031920基因型,分析CYP2E1基因多态性及启动子区甲基化水平与ADIH之间的关系。结果CYP2E1 rs2031920基因型、C1和C2基因频率在ADIH组和对照组中分布差异无统计学意义(P>0.05)。ADIH组CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平较对照组明显降低[(0.711±0.085)vs(0.759±0.062)],差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归显示CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平是ADIH发生的影响因素(P<0.005),甲基化水平每升高0.1个单位,ADIH发生风险降低0.388倍,其OR(95%CI)值为0.388(0.204~0.739)。结论蒙古族ADIH患者的CYP2E1基因启动子区总体甲基化水平降低,但CYP2E1基因多态性与ADIH的发生无关,提示CYP2E1基因甲基化可应用于结核病患者ADIH的预防和治疗。 展开更多
关键词 蒙古族 抗结核药物致肝损伤 CYP2E1基因多态性 CYP2E1基因启动子区甲基化水平
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基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法 被引量：3
15
作者 马浪浪 梁振娟 +3 位作者 先新 罗仕文 李清超 梁黔云 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期45-50,共6页
DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测... DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测的方法主要有BSP-seq(亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法)、Me DIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序法)、MBD-seq(甲基化DNA富集结合高通量测序法)。就这3种方法在原理、流程、优缺点、优化使用及后期需要用到的部分生物信息学资源等方面的研究进展作一综述,旨在为研究者在采用高通量测序方法研究DNA甲基化模式时提供一些思路。 展开更多
关键词 高通量测序技术 全基因组 DNA甲基化水平 BSP-seq MeDIP-seq MBD-seq
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胆囊癌组织甲基化水平的研究 被引量：2
16
作者 朝乐孟 李全福 《内蒙古医科大学学报》 2013年第2期88-92,共5页
目的:探讨胆囊癌组织总甲基化水平变化、Bcl-2和p53基因的甲基化水平变化在胆囊癌发病中的作用。方法:改进的酶联免疫吸附技术检测45例胆囊癌组织和40例胆囊炎组织基因组总甲基化水平,应用甲基化特异性PCR技术检测胆囊癌和胆囊炎组织Bcl... 目的:探讨胆囊癌组织总甲基化水平变化、Bcl-2和p53基因的甲基化水平变化在胆囊癌发病中的作用。方法:改进的酶联免疫吸附技术检测45例胆囊癌组织和40例胆囊炎组织基因组总甲基化水平,应用甲基化特异性PCR技术检测胆囊癌和胆囊炎组织Bcl-2/p53基因甲基化水平。结果:胆囊癌组织基因组总甲基化水平(4.87±1.1%)低于胆囊炎组织基因组总甲基化水平(6.278±0.91%),P<0.05;胆囊癌组织中p53基因甲基化发生率高于慢性胆囊炎(64%17.5%),P<0.05;胆囊癌组织中Bcl-2基因甲基化发生率与慢性胆囊炎(17.7%vs 15%,P>0.05)无明显差异。结论:基因组总甲基化水平降低和p53高甲基化可能是胆囊癌发生的分子机制之一。 展开更多
关键词 胆囊癌 总甲基化水平 BCL-2 P53 DNA甲基化
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胆囊癌组织bcl-2和p53基因甲基化水平研究 被引量：2
17
作者 朝乐孟 李全福 《承德医学院学报》 2013年第1期10-12,共3页
目的:探讨胆囊癌组织总甲基化水平、bcl-2和p53基因甲基化水平在胆囊癌发病中的作用。方法:改进的酶联免疫吸附技术检测45例胆囊癌组织和40例胆囊炎组织基因组总甲基化水平,应用甲基化特异性PCR技术检测bcl-2和p53基因甲基化水平,应用荧... 目的:探讨胆囊癌组织总甲基化水平、bcl-2和p53基因甲基化水平在胆囊癌发病中的作用。方法:改进的酶联免疫吸附技术检测45例胆囊癌组织和40例胆囊炎组织基因组总甲基化水平,应用甲基化特异性PCR技术检测bcl-2和p53基因甲基化水平,应用荧光RT-PCR技术检测bcl-2和p53 mRNA的表达。结果:胆囊癌组织基因组总甲基化水平明显低于胆囊炎,差异具有统计学意义(P<0.05)。胆囊癌组织p53基因甲基化发生率高于胆囊炎(64.4%vs17.5%),差异具有统计学意义(P<0.05);胆囊癌组织bcl-2基因甲基化发生率与胆囊炎比较差异无统计学意义(17.8%vs 15.0%,P>0.05)。胆囊癌组织bcl-2 mRNA的表达明显高于胆囊炎、p53 mRNA的表达明显低于胆囊炎,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:基因组总甲基化水平降低和p53高甲基化可能是胆囊癌发生的分子机制之一。 展开更多
关键词 胆囊癌 总甲基化水平 BCL-2 p53 DNA甲基化
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刺参基因组DNA甲基化水平及模式对温度变化的响应 被引量：2
18
作者 温争争 左闪 +5 位作者 陈梦 周红学 孙国华 冯艳微 王卫军 杨建敏 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2021年第3期46-54,共9页
本研究为了探讨刺参(Apostichopus japonicus)在不同温度胁迫下的DNA甲基化水平与甲基化模式变化,利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)和酶联免疫吸附法(ELISA)对刺参在3个温度下(20℃、26℃和32℃)的纵肌、呼吸树、消化道和体壁4个... 本研究为了探讨刺参(Apostichopus japonicus)在不同温度胁迫下的DNA甲基化水平与甲基化模式变化,利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)和酶联免疫吸附法(ELISA)对刺参在3个温度下(20℃、26℃和32℃)的纵肌、呼吸树、消化道和体壁4个组织进行分析。WGBS测序结果显示,在消化道组织中,20℃、26℃和32℃温度组全基因组总甲基化水平分别为(1.70±0.01)%、(1.79±0.11)%和(1.59±0.04)%,26℃组处于休眠状态,刺参消化道基因组甲基化水平升高,而32℃组高温胁迫下,甲基化水平下降;在总甲基化位点中,CG类型是主要的甲基化修饰(96%以上),CHH和CHG位点占比较低;30%甲基化水平的甲基化位点中,CHG和CHH为本类型甲基化的最高点,且显著高于CG类型。ELISA检测结果显示,3种不同温度下,刺参呼吸树和消化道组织的甲基化水平范围为2.68%~3.29%,均高于纵肌和体壁组织;温度变化后,刺参呼吸树和消化道组织的总甲基化水平均有显著变化,而纵肌和体壁的总甲基化水平基本不变,表明DNA甲基化可能参与刺参的高温胁迫调控机制。刺参应对温度变化过程中DNA甲基化水平的研究,从表观遗传学视角解析温度升高对刺参不同组织的影响,可为丰富刺参甲基化研究内容和无脊椎动物的甲基化发生规律提供参考。 展开更多
关键词 刺参 DNA甲基化水平及模式 休眠 高温胁迫 全基因组重亚硫酸盐测序技术 酶联免疫吸附
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通过影响DNA甲基化水平实现蜜蜂生殖的营养调控——蜂王与工蜂级型分化形成的分子机理
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作者 陈璇 胡福良 《中国蜂业》 2008年第6期54-54,共1页
最近，澳大利亚科学家发现蜜蜂生殖状况的营养调控是通过影响DNA甲基化水平得以实现的，从而首次从分子水平阐释了蜜蜂表观遗传现象的原因。这一研究结果发表在2008年3月28日出版的美国《科学》杂志上。
关键词 甲基化水平 营养调控 生殖状况 DNA 分子机理 蜜蜂 分化 工蜂
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