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京海黄鸡白介素8基因5′调控区单核苷酸多态性及其与柔嫩艾美耳球虫抗性指标的关联性 被引量:1
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作者 王晓慧 于海亮 +7 位作者 邹文斌 糜长浩 戴国俊 张涛 张跟喜 谢恺舟 王金玉 施会强 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1262-1269,共8页
【目的】研究白介素8(IL-8)基因5′调控区单核苷酸突变对鸡柔嫩艾美耳球虫(E. tenella)抗性指标的影响。【方法】本试验利用DNA直接测序技术,检测京海黄鸡IL-8基因5′调控区单核苷酸多态性(SNPs),并对5′调控区的SNPs突变前后的转录因... 【目的】研究白介素8(IL-8)基因5′调控区单核苷酸突变对鸡柔嫩艾美耳球虫(E. tenella)抗性指标的影响。【方法】本试验利用DNA直接测序技术,检测京海黄鸡IL-8基因5′调控区单核苷酸多态性(SNPs),并对5′调控区的SNPs突变前后的转录因子进行预测,然后分析SNPs与柔嫩艾美耳球虫抗性指标的关联性。【结果】测序结果表明:IL-8基因5′调控区共检测到3个突变位点(T-550C、G-398T和T-360C),均形成了3种基因型,杂合度在0.436~0.471,PIC值在0.25~0.50,均属于中度多态,且3个突变位点均处于哈代-温伯格平衡状态。生物信息学分析表明:3个突变位点均改变了其原有的转录因子结合位点。关联分析显示:T-550C突变位点的TC型个体的IL-8表达量与TT型差异显著,TC型GSH-PX、CAT、IL-2、IL-6、IFN-γ指标均高于其他2种基因型,但差异不显著。G-398T突变位点的TT型个体SOD活性和GT型个体CAT活性均显著高于GG型;TT型个体NO含量与GG型差异极显著,与GT型差异显著;TT型IL-2表达量显著高于GT型。T-360C突变位点的TT型和TC型个体SOD活性与CC型差异极显著或差异显著;TT型和TC型个体的NO含量均显著高于CC型;TT型个体的IL-2、IL-8表达量均显著高于CC型。【结论】G-398T和T-360C突变位点的TT型个体球虫抗性优于其他基因型个体,T-550C突变位点的杂合型个体球虫抗性优于纯合型个体,表明IL-8基因5′调控区的突变对球虫抗性指标有显著的调控作用,可作为球虫病抗性鸡新品种或新品系的育种参考依据。 展开更多
关键词 京海黄鸡 柔嫩艾美耳球虫 白介素8基因 5′调控区SNPs 抗性指标
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中国荷斯坦牛白介素8受体基因编码区多态性与乳腺炎的关联分析 被引量:11
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作者 官久强 王洪梅 +5 位作者 王长法 李秋玲 李建斌 帅素容 侯明海 仲跻峰 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期1057-1065,共9页
【目的】通过研究中国荷斯坦牛白介素8受体的亚基A和B(IL8RA和IL8RB)基因编码区多态性与乳腺炎的关联性,找到与乳腺炎相关SNPs,为乳腺炎抗性分子育种提供可用的分子标记。【方法】采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,对中国荷斯坦... 【目的】通过研究中国荷斯坦牛白介素8受体的亚基A和B(IL8RA和IL8RB)基因编码区多态性与乳腺炎的关联性,找到与乳腺炎相关SNPs,为乳腺炎抗性分子育种提供可用的分子标记。【方法】采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,对中国荷斯坦牛的IL8RA和IL8RB编码区的遗传多态性进行了研究,分别利用SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。【结果】找到了8个SNPs,其中5个为新SNPs,分别为IL8RA的980(G/A)、995(G/A)和1008(C/T)和IL8RB的938(C/T)、959(C/T),这8个位点均不连锁。对IL8RA和IL8RB的单倍型分析发现,单倍型频率大于0.01的有15种。各SNPs与中国荷斯坦牛体细胞评分(SCS)和产奶量的关联分析表明,IL8RA735(C/G)、816(C/A)、819(A/G)位点与SCS、产奶量相关,IL8RA的735(C/G)、816(C/A)、819(A/G)位点的C、C、G等位基因和IL8RB的938(C/T)、959(C/T)位点的T等位基因均为低SCS、高产奶量的优秀等位基因。另外,IL8RA的CCGAAC单倍型纯合个体的SCS极显著低于CAGGGT和GCAGGC单倍型纯合个体(P<0.01),而其305d产奶量极显著高于另外两种单倍型纯合子;IL8RBCT单倍型纯合个体的SCS显著低于CC、TC和TT单倍型个体,其305d产奶量显著或极显著高于其余3种单倍型。【结论】IL8RA和IL8RB的单倍型CCGAAC和CT在SCS和产奶量方面是优良的单倍型,可作为选择抗乳腺炎的分子标记。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 白介素8受体基因 单倍型 优良等位基因 乳腺炎抗性
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Effect of cagE gene on Helicobacter pylori-associated gastritis and levels of interleukin-8
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作者 徐灿 李兆申 +4 位作者 屠振兴 张乐之 龚燕芳 满晓华 许爱芳 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2004年第1期22-26,共5页
Objective: To investigate the status of cagE gene of Helicobacter pylori(H. pylori) isolated from patients with various gastrointestinal diseases and its relationship with the pathological inflammation grade and level... Objective: To investigate the status of cagE gene of Helicobacter pylori(H. pylori) isolated from patients with various gastrointestinal diseases and its relationship with the pathological inflammation grade and levels of IL 8 in the gastric mucosa and IL 8 secretion in gastric epithelial cells stimulated by H. pylori . Methods: cagE was amplified by polymerase chain reaction (PCR) in 145 clinical isolates. The inflammation grade of gastric mucosa was evaluated pathologically. IL 8 levels of gastric mucosa and IL 8 concentration of the supernatant of the cocultured SGC 7 901 cells and H. pylori was assayed by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Results: cagE was positive in 79.3% of all the H. pylori strains. The mean score of the cagE positive gastritis in the antrum and corpus was (1.865±0.335) and (1.759±0.310). Meanwhile, the cagE negative grade was (1.689±0.294), (1.608±0.284). There was no significant difference ( P >0 05). The mean levels of IL 8 in cagE positive group in antrum and corpus were (390.6±101.4) pg/mg and (368.6±91.2) pg/mg; and cagE negative group were (328.6±102.8) pg/mg and (332.6±96.7) pg/mg. IL 8 in SGC7901 cells induced by cagE positive and negative group averaged (789.5±146.7) pg/ml and (757.6±136.4) pg/ml. There was still no significant difference( P >0.05). Conclusion: Positive rate of cagE is very high in Chinese patients regardless of the clinical outcome. And there was no direct relationship between cagE gene and the inflammation grade and IL 8 levels of H. pylori infected gastric mucosa and IL 8 secretion in gastric epithelial cells stimulated by H. pylori . 展开更多
关键词 Helicobacter pylori CAGE gastrointestinal disease IL 8 gastric epithelial cell
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IL-8基因多态性与中国人群炎症性肠病风险的相关性 被引量:8
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作者 梁万东 李劲松 +4 位作者 李克深 金捷 闫峻 杨纪峰 毕云天 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第26期1825-1829,共5页
目的观察白细胞介素8(IL-8)基因多态性与炎症性肠病(IBD)的相关性。方法应用PCR-RFLP法和PCR-SSP法对183例无关联的IBD患者[包括142例溃疡性结肠炎(UC)患者和41例克罗恩病(CD)]和160例健康对照者IL-8基因的5个单核苷酸多态位点... 目的观察白细胞介素8(IL-8)基因多态性与炎症性肠病(IBD)的相关性。方法应用PCR-RFLP法和PCR-SSP法对183例无关联的IBD患者[包括142例溃疡性结肠炎(UC)患者和41例克罗恩病(CD)]和160例健康对照者IL-8基因的5个单核苷酸多态位点(SNPs)(-845(T/C),-738(T/A),-353(A/T),-251(T/A)和+678(T/C))进行分析。结果单个SNP与IBD发生风险没有关联,IL-8基因-353A/T、-251T/A和+678T/C三位点的特殊单体型AAT在UC患者中的频率明显高于健康对照组(31.0%比23.7%,P=0.046),不过这种单体型在CD患者和对照中的分布没有差别。结论IL-8基因的单体型AAT与UC发病之间明显存在一定程度的关联(OR=1.441,95%C11.007~2.063)。 展开更多
关键词 结肠炎 溃疡性 白介素8基因 单核苷酸多态 单体型
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