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三叶青相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系的建立与优化
被引量:
7
1
作者
纪其雄
彭昕
+1 位作者
吴晓菁
杨雄志
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期562-566,共5页
目的建立浙江和江西产的三叶青(Tetrastigma hemsleyanum)SRAP-PCR的反应体系和扩增程序。方法应用L9(34)正交设计方法,以三叶青基因组DNA为模板,研究了Mg2+、dNTP、引物和模板DNA 4种PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,根据梯度PCR...
目的建立浙江和江西产的三叶青(Tetrastigma hemsleyanum)SRAP-PCR的反应体系和扩增程序。方法应用L9(34)正交设计方法,以三叶青基因组DNA为模板,研究了Mg2+、dNTP、引物和模板DNA 4种PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,根据梯度PCR仪引物的条带数量及清晰度选择退火温度。结果优化后的25μL反应体系包含:10×PCR buffer2.5μL,2.5mmol/L MgCl2,0.15mmol/Ld NTP,0.15μmol/L引物,1.0U Taq DNA聚合酶,50ng DNA模板。扩增程序的最佳退火温度为51℃。并筛选出8对扩增产物丰富,多态性好的引物。结论正交设计优化的三叶青SRAP反应体系,经过10份样品检验,证明该体系稳定可靠,多态性好,可用于三叶青遗传多样性分析。
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关键词
三叶青
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
(
srap
-
PCR)
正交设计
下载PDF
职称材料
正交设计优化半夏相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系
被引量:
1
2
作者
杨旻
陈科力
《湖北中医药大学学报》
2011年第6期23-25,共3页
目的采用正交设计优化半夏SRAP-PCR的反应体系。方法以半夏基因组DNA为模板,应用L_(16)(4~5)正交表,研究了Taq酶、Mg^(2+)、随机引物、dNTPs和模板DNA 5种SRAP反应组分浓度变化对扩增结果的影响。结果优化反应体系为:25μL反应体系中含...
目的采用正交设计优化半夏SRAP-PCR的反应体系。方法以半夏基因组DNA为模板,应用L_(16)(4~5)正交表,研究了Taq酶、Mg^(2+)、随机引物、dNTPs和模板DNA 5种SRAP反应组分浓度变化对扩增结果的影响。结果优化反应体系为:25μL反应体系中含有buffer2.5μL、Taq酶1.0U、Mg^(2+)2.5mmol/L、引物0.8μmol/L、dNTPs0.1 mmol/L、模板DNA 50 ng。结论正交设计能客观高效的优化半夏SRAP反应体系。
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关键词
半夏
正交设计
综合评分法
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
(
srap—
pcb
)
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职称材料
麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性(SRAP)分析
被引量:
9
3
作者
沈俊岭
倪慧群
+1 位作者
陈晓阳
黄少伟
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期347-353,共7页
采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体...
采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体系为:10×PCR buffer2μL,DNA模板20ng,Taq酶16.67nkat,Mg2+2.50mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)120.00μmol·L-1,引物0.15μmol·L-1,总体积为20μL;并从274对引物中选出具有多态性的45对引物,共检测出500条清晰的条带,其中多态性条带141条,占总条带数的28.20%。非加权成对算术平均法(UPGMA)聚类分析及主成分分析表明,各个种源间的亲缘关系均很近,其相似系数为0.791~0.940,8个种源被聚为3类,其中印度尼西亚种源单独聚为1类,来自不同地域的7个中国种源被混聚为另外2类。
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关键词
林木育种学
麻疯树
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
亲缘关系
聚类分析
主成分分析
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职称材料
题名
三叶青相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系的建立与优化
被引量:
7
1
作者
纪其雄
彭昕
吴晓菁
杨雄志
机构
浙江医药高等专科学校
太极集团浙江东方制药有限公司
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期562-566,共5页
基金
2013年浙江省公益性技术资助项目(2013C32103)
2013年浙江省教育厅高校科研项目(Y201330174)
文摘
目的建立浙江和江西产的三叶青(Tetrastigma hemsleyanum)SRAP-PCR的反应体系和扩增程序。方法应用L9(34)正交设计方法,以三叶青基因组DNA为模板,研究了Mg2+、dNTP、引物和模板DNA 4种PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,根据梯度PCR仪引物的条带数量及清晰度选择退火温度。结果优化后的25μL反应体系包含:10×PCR buffer2.5μL,2.5mmol/L MgCl2,0.15mmol/Ld NTP,0.15μmol/L引物,1.0U Taq DNA聚合酶,50ng DNA模板。扩增程序的最佳退火温度为51℃。并筛选出8对扩增产物丰富,多态性好的引物。结论正交设计优化的三叶青SRAP反应体系,经过10份样品检验,证明该体系稳定可靠,多态性好,可用于三叶青遗传多样性分析。
关键词
三叶青
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
(
srap
-
PCR)
正交设计
Keywords
Tetrastigma hemsleyanum
srap
-
PCR
orthogonal design
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
正交设计优化半夏相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系
被引量:
1
2
作者
杨旻
陈科力
机构
湖北中医药大学省部共建中药资源和中药复方教育部重点实验室
出处
《湖北中医药大学学报》
2011年第6期23-25,共3页
基金
国家十一五科技支撑计划项目子项目(2006BA106A10-2-2)
文摘
目的采用正交设计优化半夏SRAP-PCR的反应体系。方法以半夏基因组DNA为模板,应用L_(16)(4~5)正交表,研究了Taq酶、Mg^(2+)、随机引物、dNTPs和模板DNA 5种SRAP反应组分浓度变化对扩增结果的影响。结果优化反应体系为:25μL反应体系中含有buffer2.5μL、Taq酶1.0U、Mg^(2+)2.5mmol/L、引物0.8μmol/L、dNTPs0.1 mmol/L、模板DNA 50 ng。结论正交设计能客观高效的优化半夏SRAP反应体系。
关键词
半夏
正交设计
综合评分法
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
(
srap—
pcb
)
Keywords
srap
Pinellia ternata
Orthogonal design
Comprehensive scoring method
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性(SRAP)分析
被引量:
9
3
作者
沈俊岭
倪慧群
陈晓阳
黄少伟
机构
北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室
华南农业大学林学院
出处
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期347-353,共7页
基金
"十一五"国家科技支撑计划项目(2006BAD07A04)
广东省科技攻关重点项目(2007B020703003)
文摘
采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体系为:10×PCR buffer2μL,DNA模板20ng,Taq酶16.67nkat,Mg2+2.50mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)120.00μmol·L-1,引物0.15μmol·L-1,总体积为20μL;并从274对引物中选出具有多态性的45对引物,共检测出500条清晰的条带,其中多态性条带141条,占总条带数的28.20%。非加权成对算术平均法(UPGMA)聚类分析及主成分分析表明,各个种源间的亲缘关系均很近,其相似系数为0.791~0.940,8个种源被聚为3类,其中印度尼西亚种源单独聚为1类,来自不同地域的7个中国种源被混聚为另外2类。
关键词
林木育种学
麻疯树
相关
序列
扩
增多
态
性
-
聚合
酶
链式反应
亲缘关系
聚类分析
主成分分析
Keywords
forest tree breeding
Jatropha curcas
srap
-
PCR
genetic relation
cluster analysis
prin
-
ciple component analysis
分类号
S722 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三叶青相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系的建立与优化
纪其雄
彭昕
吴晓菁
杨雄志
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2015
7
下载PDF
职称材料
2
正交设计优化半夏相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应体系
杨旻
陈科力
《湖北中医药大学学报》
2011
1
下载PDF
职称材料
3
麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性(SRAP)分析
沈俊岭
倪慧群
陈晓阳
黄少伟
《浙江林学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
9
下载PDF
职称材料
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