根据GenBank上的禽呼肠病毒（ARV）S1基因序列，设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物，对13个ARV毒株进行RT—PCR扩增、克隆及序列测定。结果显示，13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297bp，编码98个氨基酸；P1...根据GenBank上的禽呼肠病毒（ARV）S1基因序列，设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物，对13个ARV毒株进行RT—PCR扩增、克隆及序列测定。结果显示，13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297bp，编码98个氨基酸；P17蛋白基因ORF全长为441bp，编码146个氨基酸。这13个ARV毒株P10、P17蛋白基因核苷酸同源性分别在96．6%～100%和95．2％～99．3%之间，推导的氨基酸同源性分别在98．2％～100%和91．9%～99．0%之间。将这13个ARV毒株与Gen Bank上其他正呼肠病毒毒株，包括番鸭株（DRV）和飞狐上分离到的内尔森海湾病毒（Nelson Bay Vir US，NBV）及两个澳洲分离株（ARM—1和SOM-4）进行同源性比较和遗传进化树分析，结果表明，呼肠病毒有地域和种类的差别。展开更多
应用EMBOSS的CHIPS和CUSP程序对禽呼肠病毒(ARV)3个编码蛋白的基因密码子偏爱性进行分析,其结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,ARVσC、ARVσB和ARVσNS的Nc(Effective number of condons)值为56.689、56.457...应用EMBOSS的CHIPS和CUSP程序对禽呼肠病毒(ARV)3个编码蛋白的基因密码子偏爱性进行分析,其结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,ARVσC、ARVσB和ARVσNS的Nc(Effective number of condons)值为56.689、56.457和51.532。3种蛋白的部分编码密码子使用频率有较大的差异,其与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,表明ARVσC和ARVσNS的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而ARVσB的密码子与原核生物较近,其表达系统选择在大肠埃希菌较为合适。展开更多
文摘根据GenBank上的禽呼肠病毒（ARV）S1基因序列，设计并合成了一对跨越P10和P17非结构蛋白基因的特异性引物，对13个ARV毒株进行RT—PCR扩增、克隆及序列测定。结果显示，13个ARV毒株的P10蛋白基因ORF全长均为297bp，编码98个氨基酸；P17蛋白基因ORF全长为441bp，编码146个氨基酸。这13个ARV毒株P10、P17蛋白基因核苷酸同源性分别在96．6%～100%和95．2％～99．3%之间，推导的氨基酸同源性分别在98．2％～100%和91．9%～99．0%之间。将这13个ARV毒株与Gen Bank上其他正呼肠病毒毒株，包括番鸭株（DRV）和飞狐上分离到的内尔森海湾病毒（Nelson Bay Vir US，NBV）及两个澳洲分离株（ARM—1和SOM-4）进行同源性比较和遗传进化树分析，结果表明，呼肠病毒有地域和种类的差别。
文摘应用EMBOSS的CHIPS和CUSP程序对禽呼肠病毒(ARV)3个编码蛋白的基因密码子偏爱性进行分析,其结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,ARVσC、ARVσB和ARVσNS的Nc(Effective number of condons)值为56.689、56.457和51.532。3种蛋白的部分编码密码子使用频率有较大的差异,其与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,表明ARVσC和ARVσNS的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而ARVσB的密码子与原核生物较近,其表达系统选择在大肠埃希菌较为合适。
