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应用简单序列重复区间扩增多态性分子标记鉴定我国12个城市与地区常见嗜尸蝇类的研究 被引量：2
1
作者 胡佳林 郑学礼 +2 位作者 王倩 陈晓光 黄勇平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期524-528,共5页
目的探讨应用ISSR分子标记鉴定我国不同地区常见嗜尸蝇类,分析其亲源关系及基因差异。方法采集广州、深圳、阳江、南京、长春、宜昌、北京、武汉等12个城市与地区常见嗜尸蝇类:家蝇(Musca domestica),丝光绿蝇(Lucilia sericata),大头金... 目的探讨应用ISSR分子标记鉴定我国不同地区常见嗜尸蝇类,分析其亲源关系及基因差异。方法采集广州、深圳、阳江、南京、长春、宜昌、北京、武汉等12个城市与地区常见嗜尸蝇类:家蝇(Musca domestica),丝光绿蝇(Lucilia sericata),大头金蝇(Chrysomyia megacephala),黑尾麻蝇(Helicophagella melanura),棕尾别麻蝇(Boetthcherisca peregrina)。设计22个ISSR引物,对采集的蝇类基因组DNA进行PCR扩增,从中筛选出8个引物用于我国不同地区法医蝇类的鉴定,进行ISSR分析,用PAUP聚类分析软件绘制聚类图。结果8种ISSR引物鉴定我国部分城市与地区5种蝇类,总共扩增样品次数为121,可放大679个清晰和稳定的带,其中516个是多态性。结果表明我国不同城市与地区的家蝇、大头金蝇、丝光绿蝇、棕尾麻蝇、黑尾麻蝇分别呈现不同带谱,不同地区的家蝇呈现种内与地域多态性的遗传带谱,而5种腐尸性蝇种间呈现完全不同的带谱,发现种特异性的片段。聚类分析结果显示:10个不同地区的家蝇聚类为一棵分枝树,细分为4个不同层次的类群,不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇的绝大多数种类聚类在一起,亦存在种内基因型与地理株的基因组DNA差异。结论应用ISSR技术,首次对我国12个城市和地区的常见嗜尸蝇类做出鉴定,揭示我国10个城市与地区的家蝇种类存在种内基因型和遗传的差异;不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇亦存在种内基因型与地理株基因组DNA的差异。 展开更多
关键词 法医昆虫 中国不同地区 嗜尸蝇 分子标记 简单序列重复区间扩增多态性
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羌活和宽叶羌活简单重复序列区间扩增反应体系的正交优化 被引量：5
2
作者 古松 蒋舜媛 +3 位作者 唐学芳 孙辉 杨志荣 孙群 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期2892-2894,共3页
目的通过探讨羌活和宽叶羌活ISSR实验中各种因素的影响，以建立羌活和宽叶羌活的简单重复序列区间扩增（ISSR—PCR）最佳反应体系。方法利用正交实验设计L9（3^4）对羌活和宽叶羌活ISSR-PCR反应体系的4因素（Mg^2＋，dNTP，引物，Taq酶... 目的通过探讨羌活和宽叶羌活ISSR实验中各种因素的影响，以建立羌活和宽叶羌活的简单重复序列区间扩增（ISSR—PCR）最佳反应体系。方法利用正交实验设计L9（3^4）对羌活和宽叶羌活ISSR-PCR反应体系的4因素（Mg^2＋，dNTP，引物，Taq酶）在3个水平上进行优化实验，PCR结果用SPSS13．0统计软件分析，并设置梯度PCR进行引物退火温度筛选。结果在20μl ISSR—PCR反应体系中，各组分的最适浓度为：2．0mmol／L Mg^2＋，250μmol／L dNTPs，0．50μmol／L引物，1U Taq酶，40ng DNA模板；模板DNA 40—90μg，不同引物有不同的最佳退火温度，范围在48—52℃。结论该优化体系的建立为进一步进行羌活和宽叶羌活种群间遗传多样性研究提供了参考。 展开更多
关键词 羌活 宽叶羌活 简单重复序列区间扩增 正交实验设计
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地龙类药用动物的简单序列重复区间分子鉴定研究 被引量：4
3
作者 吴文如 李薇 赖小平 《广州中医药大学学报》 CAS 2011年第4期423-426,共4页
【目的】探索利用简单序列重复区间(ISSR)分子标记方法在核酸分子水平上鉴别不同来源的地龙类药用动物。【方法】从100条ISSR引物中筛选出能扩增明显多态性条带的引物,对采集自广东、福建、湖北、上海等地的7个不同品种的地龙类药用动... 【目的】探索利用简单序列重复区间(ISSR)分子标记方法在核酸分子水平上鉴别不同来源的地龙类药用动物。【方法】从100条ISSR引物中筛选出能扩增明显多态性条带的引物,对采集自广东、福建、湖北、上海等地的7个不同品种的地龙类药用动物样品进行扩增和凝胶电泳分析,寻找特征位点。采用NTSYS软件计算材料间的相似系数,并用UPGMA法构建系统树,按遗传距离构建分子聚类图。【结果】8条引物共扩增出137个DNA片段,其中127个片段呈现多态性,平均多态位点百分率为92.35%,可单独或联合应用鉴别地龙类药用动物。【结论】ISSR分子标记技术具有较好的可靠性和重现性,可用于地龙类药用动物的鉴别和遗传亲缘关系研究。 展开更多
关键词 地龙 简单序列重复区间 分子鉴定 基因扩增
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甜槠种群遗传多样性的简单重复序列区间初步分析 被引量：3
4
作者 金则新 李钧敏 潘冠琼 《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期672-678,共7页
应用简单重复序列区间（ISSR）分子标记方法对甜槠种群的遗传多样性和遗传分化进行了初步研究．从100个引物中筛选出12个用于正式扩增的ISSR引物，在9个种群179个个体中共检测到202个位点，其中198个是多态位点，多态位点百分率（P）为9... 应用简单重复序列区间（ISSR）分子标记方法对甜槠种群的遗传多样性和遗传分化进行了初步研究．从100个引物中筛选出12个用于正式扩增的ISSR引物，在9个种群179个个体中共检测到202个位点，其中198个是多态位点，多态位点百分率（P）为98．02％．各种群多态位点百分率在60．40％～70．30％，平均为65．29％．甜槠物种水平的Shannon信息指数（I）为0．5322、Nei指数（h）为0．3597．各种群J平均为0．3635、h平均为0．2468．AMOVA分子差异分析表明，65．96％的变异存在于种群内，34．04％的变异存在于种群间，种群间的基因分化系数（GST）为0．3138．甜槠种群间的基因流（Nm）为1．0933．9个种群的平均遗传距离为0．1849，遗传距离与地理距离呈显著正相关．利用UPGMA法对9个种群进行聚类，结果显示浙江省内的8个种群聚成一类，庐山种群单独成一类． 展开更多
关键词 甜槠 遗传多样性 遗传分化 简单重复序列区间(ISSR)
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红树植物海桑简单重复序列区间(ISSR)条件的优化 被引量：55
5
作者 李海生 陈桂珠 《广东教育学院学报》 2004年第2期80-83,共4页
海桑(Sonneratiacaseolaris(L.)Engler)是海桑科一种重要的红树植物.为利用ISSR分子标记研究海桑的遗传多样性,对影响ISSR PCR的多个因素,包括Taq酶的用量、Mg2+浓度和dNTP浓度、引物浓度及其退火温度、模板DNA浓度等进行研究,确定了海... 海桑(Sonneratiacaseolaris(L.)Engler)是海桑科一种重要的红树植物.为利用ISSR分子标记研究海桑的遗传多样性,对影响ISSR PCR的多个因素,包括Taq酶的用量、Mg2+浓度和dNTP浓度、引物浓度及其退火温度、模板DNA浓度等进行研究,确定了海桑ISSR PCR分析的最适条件:10μLPCR反应体积中,10×buffer(100mmol·L-1KCl,80mmol·L-1(NH4)2SO4,100mmol·L-1Tris HCl,pH9.0,0.5%NP 40)1μL,0.35UTaq酶,2～3.75mmol·L-1Mg2+,300μmol·L-1dNTP,0.3μmol·L-1引物,10ng模板DNA. 展开更多
关键词 红树植物 海桑 遗传多样性 ISSR “简单重复序列区间扩增多态DNA” 分子标记技术
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基于表达序列标签的简单重复序列标记开发策略 被引量：3
6
作者 闫学兵 阙友雄 +1 位作者 许莉萍 李国印 《生物技术通讯》 CAS 2011年第1期118-121,共4页
作为一种新型分子标记,表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接的关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记... 作为一种新型分子标记,表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接的关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记的开发策略、方法及其应用进展,总结了其中存在的一些问题,目的是为今后该领域的研究提供一定的参考。 展开更多
关键词 表达序列标签 简单重复序列 标记开发 策略
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乌头简单序列重复区间扩增条件的优化
7
作者 张岳峰 万里翔 侯大斌 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期2136-2138,共3页
目的保证乌头ISSR-PCR的稳定性、提高对乌头遗传多样性,亲缘关系分析、种质鉴定的可靠性。方法收集西南地区23个乌头材料,以Mg2+,dNTP,引物和聚合酶建立L9(34)正交设计,并同时考察模板和甲酰胺浓度及退火温度,建立适宜的ISSR-PCR体系。... 目的保证乌头ISSR-PCR的稳定性、提高对乌头遗传多样性,亲缘关系分析、种质鉴定的可靠性。方法收集西南地区23个乌头材料,以Mg2+,dNTP,引物和聚合酶建立L9(34)正交设计,并同时考察模板和甲酰胺浓度及退火温度,建立适宜的ISSR-PCR体系。结果以Mg2+2.0 mmol/L、dNTP 0.25 mmol/L、引物0.3μmol/L、rTaq酶1U、模板1.5 ng/μl、甲酰胺2%及退火温度(Tm-3)℃的ISSR反应体系最优。结论实验建立的ISSR-PCR体系反应稳定,能用于乌头的ISSR分析。 展开更多
关键词 乌头 简单序列重复区间 优化
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大蒜转录组简单重复序列标记分析与分子标记开发 被引量：4
8
作者 刘新雨 田洁 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第9期1615-1625,共11页
为探明大蒜转录组简单重复序列标记(SSR)的特征,开发适合大蒜育种的SSR引物,利用MISA软件对大蒜转录组序列进行SSR位点检测与信息分析,并通过PCR扩增检测引物的有效性和多态性。结果表明:大蒜转录组测序获得444865条unigenes,共鉴定出14... 为探明大蒜转录组简单重复序列标记(SSR)的特征,开发适合大蒜育种的SSR引物,利用MISA软件对大蒜转录组序列进行SSR位点检测与信息分析,并通过PCR扩增检测引物的有效性和多态性。结果表明:大蒜转录组测序获得444865条unigenes,共鉴定出141132个SSR位点,出现频率为31.72%,平均每3.45 kb出现1个SSR位点。单核苷酸和二核苷酸为SSR位点中优势类型,分别占总SSR的68.02%和24.12%;SSR位点共有82种重复基序,以A/T和AT/AT数量较多,占总SSR位点的65.02%和12.37%。利用Primer 3.0共设计出125616对SSR引物,在随机选取的14对引物中有12对引物能够有效扩增,其中6对引物在35份大蒜资源中表现出多态性,扩增共得到26条多态性条带,每对引物平均产生4.33条条带。UPGMA分析显示,在遗传相似系数0.7569处,35份大蒜资源可被分成5大类群。综上所述,利用大蒜转录组数据进行SSR分子标记开发能够获得较高频率的SSR位点,且开发的SSR标记可用性强。 展开更多
关键词 大蒜 转录组 简单重复序列标记 多态性
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镉胁迫对不同甜玉米自交系幼苗生长的影响及其相关简单重复序列分子标记初筛 被引量：3
9
作者 姜昊梁 黄允 +7 位作者 梁绍芳 谢梦晨 徐天成 宋芷婷 向文文 陈青春 万小荣 孙伟 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第8期1582-1590,共9页
为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单... 为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单重复序列(SSR)分子标记。结果显示,从耐镉性判断,KY188、M114A为敏感型自交系,T96-4、M3、T35和T8-1为耐受型自交系。与对照处理相比:KY188(敏感型)经过镉胁迫处理后,叶绿素含量随时间推进显著(P<0.05)降低,苗高、总根数、根长、地上部鲜重和干重、地下部鲜重和干重、总鲜重、总干重分别显著(P<0.05)降低了18.87%、24.32%、21.13%、58.86%、2.04%、33.77%、26.11%、47.11%、14.29%;T96-4(耐受型)经过镉胁迫处理后,上述指标无显著变化。通过相关性分析,共检测到9个与甜玉米苗期耐镉性状相关的SSR标记,分别位于第2、3、4、5、6、8、9、10号染色体上。 展开更多
关键词 镉胁迫 主成分分析 耐镉性 简单重复序列分子标记 甜玉米
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采用简单序列重复标记检测的加倍单倍体大麦品系的异常分离
10
作者 HaithamSayed 向平 《国外作物育种》 2003年第2期13-14,共2页
关键词 大麦 加倍单倍体品系 简单序列重复标记 SSR标记 异常分离 检测
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采用简单序列重复标记所鉴定的桃树、扁桃和亲缘种间的关系
11
作者 P．Martfnez-Comez 向平 《国外作物育种》 2004年第1期44-45,共2页
桃树(Prunus persica)和扁桃(P．dulcis)是桃属Amygdalus亚属的两个物种，已在全球广泛用于商品种植。这些物种分别起源于亚洲东南部和中部，且代表了两个不同环境下的趋异进化。在野生种中发现了相关的桃属物种。以前几位研究者已报道... 桃树(Prunus persica)和扁桃(P．dulcis)是桃属Amygdalus亚属的两个物种，已在全球广泛用于商品种植。这些物种分别起源于亚洲东南部和中部，且代表了两个不同环境下的趋异进化。在野生种中发现了相关的桃属物种。以前几位研究者已报道了在非灌溉自然条件下这些桃属近缘种作为桃树和扁桃的根状茎的直接应用。 展开更多
关键词 简单序列重复标记 桃树 扁桃 亲缘种 亲缘关系
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苹果纯合系的简单序列重复标记的分析
12
作者 M.Hofer 向平 《国外作物育种》 2003年第3期50-51,共2页
关键词 苹果 纯合系 简单序列重复标记 SSR标记 等位基因
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采用RAPD和简单序列重复标记描述智利葡萄品种间的遗传变异特性
13
作者 R.Herrera 向平 《国外作物育种》 2003年第2期61-62,共2页
关键词 智利葡萄 品种 遗传变异 RAPD 简单序列重复标记 SSR
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用于梨遗传分析的简单序列重复标记
14
作者 T.Yamamoto 向平 《国外作物育种》 2003年第2期61-61,共1页
关键词 梨 遗传分析 简单序列重复标记 SSR 遗传多样性
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栽培花生变种的简单序列重复标记
15
作者 谢国禄（摘译） 《作物育种信息》 2006年第8期10-11,共2页
花生（Arachis hypogaea L．）是全世界栽培的一个重要的油料作物。栽培花生有6个变种hypogaea、hirsuta、frastigiata、peruviana、aequatoriana和vulgaris。根据其表型性状和生长习性来看，头两个变种属于hypogaea亚种，后4个变种属于... 花生（Arachis hypogaea L．）是全世界栽培的一个重要的油料作物。栽培花生有6个变种hypogaea、hirsuta、frastigiata、peruviana、aequatoriana和vulgaris。根据其表型性状和生长习性来看，头两个变种属于hypogaea亚种，后4个变种属于fastigiata亚种。 展开更多
关键词 简单序列重复标记 花生 栽培 变种 油料作物 生长习性 表型性状 亚种 种属
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热带玉米群体中基于简单序列重复标记的遗传距离和杂种优势
16
作者 J．C．Reif 向平 《国外作物育种》 2003年第6期21-21,共1页
关键词 热带 玉米 群体 简单序列重复标记 遗传距离 杂种优势 育种 SSR 遗传多样性
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用于酶解图谱分析和测定核桃品种遗传关系的简单序列相互重复标记
17
作者 DanielPotter FangyouGao 谢国禄 《国外作物育种》 2003年第2期59-60,共2页
关键词 核桃 品种鉴定 遗传关系 简单序列相互重复标记 ISSR 酶解图谱分析
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采用简单序列重复标记筛选的7个多年生黑麦草品种的遗传多样性
18
作者 ChristineKubik等 向平 《国外作物育种》 2002年第2期63-63,共1页
关键词 简单序列 重复标记 多年生黑麦草 品种 遗传多样性 黑麦草
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通过简单重复序列标记分析41个苹果砧木品种的遗传多样性
19
作者 黄琳琳 《中国果业信息》 2012年第4期54-54,共1页
据《Journal of the American Society for Horticul-tural Science》（2012年1月）中一篇研究报道,北京农林科学院林业果树研究所的研究人员通过简单重复序列（SSR）标记技术,对41个矮化、半矮化和早花苹果砧木品种进行了遗传多样性分析。
关键词 遗传多样性分析 简单重复序列 砧木品种 标记技术 苹果 果树研究所 农林科学院 研究人员
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简单重复序列的筛选与应用 被引量：5
20
作者 张志敏 熊国梅 +1 位作者 王慧娟 刘中来 《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第3期254-257,共4页
综述目前简单重复序列 (SSR) 4种筛选方法的基本原理和主要步骤 ;介绍SSR标记在遗传多样性分析、遗传图谱构建。
关键词 简单序列重复(SSR) 分子标记 遗传多样性 遗传图谱 比较基因组学
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