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粗穗披碱草1H^(t)S染色体特异荧光原位杂交标记开发
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作者 宫文萍 汪晓璐 +6 位作者 王开 韩冉 祁广 徐文竞 曾小雪 郭军 刘成 《山东农业科学》 北大核心 2024年第7期16-22,共7页
小麦-粗穗披碱草1H^(t)S.1BL罗伯逊易位系高抗小麦条锈病和叶锈病,是小麦遗传改良的优异基因源。我们前期利用中国春ph1b基因突变体对该易位系进行诱导,获得了一批诱导后代材料,为了从中准确鉴定小麦-粗穗披碱草1H^(t)S小片段易位系,需... 小麦-粗穗披碱草1H^(t)S.1BL罗伯逊易位系高抗小麦条锈病和叶锈病,是小麦遗传改良的优异基因源。我们前期利用中国春ph1b基因突变体对该易位系进行诱导,获得了一批诱导后代材料,为了从中准确鉴定小麦-粗穗披碱草1H^(t)S小片段易位系,需要建立能够覆盖粗穗披碱草1H^(t)S染色体的荧光原位杂交(FISH)标记。本研究利用21个小麦及其近缘种探针、61个基于中国春基因组序列新开发的小麦1BS染色体探针以及40个根据简单三碱基重复序列新开发的探针对小麦-粗穗披碱草1H^(t)S.1BL易位系进行非变性FISH分析。结果显示,B74、B76和B77等36个探针(33个为新开发的)在1H^(t)S染色体上具有杂交信号,并且杂交信号可分为仅在染色体末端、仅在着丝粒处、同时在着丝粒处和近着丝粒处、覆盖1H^(t)S约3/4染色体臂、覆盖绝大部分1H^(t)S共五种类型。因此,部分探针单独使用或多个探针联合使用,其信号能覆盖1H^(t)S染色体,能够满足小麦-粗穗披碱草1H^(t)S小片段易位系鉴定,这可为小麦背景中粗穗披碱草染色质追踪提供新的检测手段。 展开更多
关键词 粗穗披碱草 1H^(t)S染色体 探针 荧光原位杂交标记
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粗穗披碱草1H^tS染色体的蛋白质二硫键异构酶基因CAPS标记 被引量:4
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作者 宫文萍 刘成 +2 位作者 李光蓉 周建平 杨足君 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期409-415,共7页
中国春-粗穗披碱草罗伯逊1Ht S.1BL易位系高抗小麦条锈病、叶锈病和白粉病。为了获得抗病小片段易位系,用中国春ph1b基因缺失突变体对1Ht S.1BL进行了诱导,获得了大量诱导后代。本研究用位于小麦1DS染色体的87个EST-STS标记对中国春、... 中国春-粗穗披碱草罗伯逊1Ht S.1BL易位系高抗小麦条锈病、叶锈病和白粉病。为了获得抗病小片段易位系,用中国春ph1b基因缺失突变体对1Ht S.1BL进行了诱导,获得了大量诱导后代。本研究用位于小麦1DS染色体的87个EST-STS标记对中国春、粗穗披碱草和1Ht S.1BL易位系进行分析,未发现多态性标记。对其中扩增较好的引物BE444859的PCR产物进行随机克隆测序,获得了14个序列,与已发表的小麦蛋白质二硫键异构酶基因序列具有97%以上的同源性,14个序列均包含3个外显子和2个内含子。限制性酶切位点分析表明,仅2个序列含有HaeIII酶切位点。验证实验结果表明,BE444859/HaeIII组合可以在供试材料中获得多态性。进而用BE444859/HaeIII对一套中国春-粗穗披碱草附加系和151株诱导后代材料进行分析,结果显示,特异多态性条带仅出现在含1Ht S的材料中;68株后代材料均可扩增出多态性带。因此,BE444859/HaeIII可以作为粗穗披碱草蛋白质二硫键异构酶基因CAPS标记,用于检测小麦背景中的1Ht S染色体。本研究揭示当杂交亲本间无直接PCR多态性而又需要建立标记时,发展CAPS标记是行之有效的方法。 展开更多
关键词 粗穗披碱草 分子标记 蛋白质二硫键异构酶基因
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粗穗披碱草1H^(t)S染色体臂特异标记开发 被引量:1
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作者 王晖 郭军 +7 位作者 周宝元 汪晓璐 韩冉 徐文竞 刘爱峰 李豪圣 刘成 刘建军 《山东农业科学》 北大核心 2021年第5期87-93,共7页
粗穗披碱草1H^(t)S染色体臂上含有抗叶锈病基因Lr55和一个暂未被命名的抗条锈病基因,是改良小麦的优异基因源。为了开发1H^(t)S特异分子标记用于辅助小麦抗病育种,本研究对不同小麦染色体第一同源群短臂上的基因序列进行生物信息学分析... 粗穗披碱草1H^(t)S染色体臂上含有抗叶锈病基因Lr55和一个暂未被命名的抗条锈病基因,是改良小麦的优异基因源。为了开发1H^(t)S特异分子标记用于辅助小麦抗病育种,本研究对不同小麦染色体第一同源群短臂上的基因序列进行生物信息学分析,选取同一基因的长度差异大且扩增长度适宜的同一内含子,在其两侧的外显子区分别设计上、下游引物。以中国春-粗穗披碱草1H^(t)S·1BL易位系和中国春为材料,对开发及合成的引物进行PCR筛选,获得可以在二者中扩增出多态性带的引物。利用筛选出的引物对一套中国春-粗穗披碱草染色体系进行扩增,验证其特异性。进而对相应的杂交分离群体进行扩增,验证其可用性。结果共建立了1H^(t)S染色体臂特异标记18个,为小麦背景中1H^(t)S染色质检测和小麦-粗穗披碱草1H^(t)S染色体小片段易位系的易位断点判定提供了方法。 展开更多
关键词 粗穗披碱草 染色体臂 分子标记 基因共线性
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小麦背景中披碱草部分染色体的FISH鉴定 被引量:1
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作者 宫文萍 汪晓璐 +5 位作者 韩冉 李光蓉 李豪圣 刘建军 刘成 杨足君 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期789-795,共7页
为了建立小麦背景中粗穗披碱草(Elymus trachycaulus)和纤毛披碱草(Elymus ciliaris)染色体的跟踪鉴定方法,本研究利用寡聚核苷酸Oligo-pSc119.2-1和Oligo-pTa-535-1为探针的双色荧光原位杂交(FISH)和以(GAA)8为探针的单色FISH,分别对4... 为了建立小麦背景中粗穗披碱草(Elymus trachycaulus)和纤毛披碱草(Elymus ciliaris)染色体的跟踪鉴定方法,本研究利用寡聚核苷酸Oligo-pSc119.2-1和Oligo-pTa-535-1为探针的双色荧光原位杂交(FISH)和以(GAA)8为探针的单色FISH,分别对4个小麦-粗穗披碱草附加系和5个小麦-纤毛披碱草附加系染色体进行分析。结果发现,经与小麦FISH核型比对后,建立了可用于追踪小麦背景中粗穗披碱草1St、5Ht、6Ht和7Ht染色体的标准FISH核型;而纤毛披碱草Sc和Yc染色体FISH信号较弱。FISH检测发现,小麦-粗穗披碱草1St附加系自交自发变成了1St(1BS·3BL)代换系,且在其染色体组中检测到了一对T1BL·3BS易位染色体,同时发现5AS端部寡聚核苷酸Oligo-pSc119.2-1序列发生了删除。另外,在小麦-粗穗披碱草5Ht附加系中发现2B染色体短臂末端删除现象,形成了2B-del和2BS-4AS·4AL易位染色体,而另一条2B和4A为正常的完整染色体。这种染色体结构重排事件表明,部分小麦-远缘物种附加系细胞学并不稳定,因此,繁种前后应对材料进行单株细胞学鉴定。上述小麦-粗穗披碱草染色体结构变异体的获得,为研究染色体结构重排与基因转录表达和表型变化的关系提供了研究基础。 展开更多
关键词 粗穗披碱草 纤毛碱草 荧光原位杂交 染色体重排
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