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微量材料系列性基因表达分析技术的研究
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作者 郑芳 周新 +2 位作者 严明 叶水清 刘芳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期464-474,共11页
建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的S... 建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的SAGE库 ,比较了两个库的SAGE标签 ,为CAD发病机理的研究提供了大量表达异常基因的资料 .从而为后续分离与CAD发病相关的新基因打下了基础 .miniSAGE技术是一种有力的基因表达分析方法 ,可用于微量RNA (1μg)材料的基因表达分析 。 展开更多
关键词 微量材料 系列性基因表达分析技术 冠心病 成纤维细胞 多因素复杂疾病 流行病
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基因表达系列性分析技术及其应用 被引量:4
2
作者 张锦超 俞炜源 《生物技术通讯》 CAS 2002年第5期395-399,共5页
基因表达系列性分析(SAGE)是一种高通量的基因表达模式研究技术,能够对特定细胞或组织中的大量转录本同时进行定量分析。本文综述了SAGE技术的基本原理和实验流程以及近年来SAGE方法上的改进,同时介绍了该技术的一些应用研究实例和Inter... 基因表达系列性分析(SAGE)是一种高通量的基因表达模式研究技术,能够对特定细胞或组织中的大量转录本同时进行定量分析。本文综述了SAGE技术的基本原理和实验流程以及近年来SAGE方法上的改进,同时介绍了该技术的一些应用研究实例和Internet上可资利用的SAGE数据库资源。 展开更多
关键词 基因表达系列性分析 应用 基因表达模式 SAGE标签
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应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异 被引量:4
3
作者 鲍忠赞 张彩霞 +6 位作者 徐世清 周前凯 魏广兵 王华 刘腾 金鑫 司马杨虎 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期456-467,共12页
高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕... 高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。 展开更多
关键词 家蚕 高温 基因表达系列分析技术 差异表达基因
原文传递
基因表达系列分析技术及其应用
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作者 党冬梅 魏晓萍 +1 位作者 惠起源 符兆英 《延安大学学报(医学科学版)》 2005年第1期61-63,共3页
基因表达系列分析(Serial Analysis of GeneExpression,SAGE)是近几年来发展起来的一种全基因组基因表达分析和寻找差异基因的新技术,能同时对大量的转录物进行定性和定量分析,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基... 基因表达系列分析(Serial Analysis of GeneExpression,SAGE)是近几年来发展起来的一种全基因组基因表达分析和寻找差异基因的新技术,能同时对大量的转录物进行定性和定量分析,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基因的全貌,特别对低丰度表达基因有较高的检测结果,因而具有重要的应用价值.它不但能快速详细地同时分析成千上万个基因转录子的丰富信息,还能发现新基因.SAGE是目前较为成熟的用于全基因组基因分析的方法,经过数年的探索,SAGE受到广泛关注,显示出广阔前景.本文简介SAGE技术的基本原理、操作方法、应用前景、优缺点. 展开更多
关键词 基因表达系列分析技术 临床应用 基本原理 操作方法
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基因表达系列分析技术在植物基因表达分析中的应用 被引量:8
5
作者 朱莉 常汝镇 邱丽娟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1233-1240,共8页
基因表达系列分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组... 基因表达系列分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异 ,从而发现新基因。SAGE技术在植物方面的应用相对较少 ,但进展很快。本文着重介绍了SAGE在植物基因表达分析中的应用 ,分析SAGE所存在的问题。 展开更多
关键词 基因表达 系列分析技术 植物 应用 数字化分析 转录物水平 细胞 组织基因 功能基因组学
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基因表达聚类分析技术的现状与发展 被引量:7
6
作者 杨春梅 万柏坤 高晓峰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第6期974-979,共6页
随着多个生物基因组测序的完成、DNA芯片技术的广泛应用 ,基因表达数据分析已成为后基因组时代的研究热点 .聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类 ,有助于对未知功能的基因进行研究 ,是目前基因表达分析研究的主要计... 随着多个生物基因组测序的完成、DNA芯片技术的广泛应用 ,基因表达数据分析已成为后基因组时代的研究热点 .聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类 ,有助于对未知功能的基因进行研究 ,是目前基因表达分析研究的主要计算技术之一 .已有多种聚类分析算法用于基因表达数据分析 ,各种算法因其着眼点、原理等方面的差异 ,而各有其优缺点 .如何对各种聚类算法的有效性进行分析、并开发新型的。 展开更多
关键词 基因表达 聚类分析技术 DNA芯片 非监督聚类 监督聚类 基于模型聚类
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用表达性差异显示分析技术分离人胎肝组织选择性表达基因 被引量:2
7
作者 许望翔 魏汉东 +1 位作者 汪思应 杨晓明 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期192-194,共3页
目的 :建立 4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库 ,为研究胚胎肝组织特异表达基因提供有力的工具。方法 :采用表达性差异显示分析 (representationaldifferenceanalysis,RDA)技术建立 4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库 ,并测定部分... 目的 :建立 4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库 ,为研究胚胎肝组织特异表达基因提供有力的工具。方法 :采用表达性差异显示分析 (representationaldifferenceanalysis,RDA)技术建立 4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库 ,并测定部分克隆核苷酸序列 ,以竞争PCR检测代表性基因的差异表达。结果与结论 :以珠蛋白家族基因为标志 ,所建差减cDNA文库中α 珠蛋白家族基因的表达频率较未差减cDNA文库增高 7倍 ,同时该文库也含有多种与肝生长密切相关的基因 ,表明RDA技术确是研究差异表达基因的有效手段 ,所建EST库富集胎肝特异表达基因 .部分克隆序列分析获得 2种未报道序列 ,其中一株含有丝 /苏氨酸激酶结构域 。 展开更多
关键词 人胎肝 基因表达 基因分离 表达性差异显示分析技术
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基因表达系列分析的研究进展及应用 被引量:4
8
作者 黎双飞 朱作言 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2003年第5期100-104,共5页
简要概括了SAGE的基本原理和实验程序,侧重对该技术的程序修改和完善以及该方法最近在筛选候选新基因方面的应用进行综述报道。
关键词 基因表达系列分析 SAGE 基本原理 实验程序 标签库 基因测序技术
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NaCl胁迫下‘心文41号’核桃的生理响应及耐盐基因表达
9
作者 郑旭 李敖 +4 位作者 姬新颖 聂瑞宁 吴承勖 唐佳莉 张俊佩 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2024年第5期105-115,共11页
[目的]旨在研究不同NaCl胁迫条件下‘心文41号’(Juglans cordiformis‘Xinwen No.41’)核桃幼苗的生理特性及离子转运、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联信号基因表达的响应差异。[方法]采取盆栽控盐的方法,选择长势一致的‘心文41号’核... [目的]旨在研究不同NaCl胁迫条件下‘心文41号’(Juglans cordiformis‘Xinwen No.41’)核桃幼苗的生理特性及离子转运、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联信号基因表达的响应差异。[方法]采取盆栽控盐的方法,选择长势一致的‘心文41号’核桃幼苗作为试验对象,设置100、150、200 mmol·L^(-1)3个NaCl浓度进行处理,同时以清水作为对照组(CK)。经过20 d的胁迫处理,对幼苗的表型、光合等指标进行了测定,通过非损伤微测技术(NMT)评估了根系Na^(+)、K^(+)、H^(+)通量。提取叶片和根部的RNA测定MAPK级联信号传导和离子转运相关基因的表达。通过冗余分析(RDA)探究了生理指标与基因表达之间的相关性,旨在揭示心形核桃幼苗对盐胁迫调节机制的反应特征。[结果]随着NaCl浓度增加,心形核桃幼苗的根系体积和总生物量显著减少,叶片出现枯黄和萎蔫现象。光合生理参数(净光合速率、蒸腾速率和气孔导度)呈下降趋势,胞间CO_(2)浓度逐渐增加。叶片和根系中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)活性,脯氨酸(Pro),丙二醛(MDA)和过氧化氢(Hydrogen peroxide,H_(2)O_(2))含量均出现不同程度的增加,根系中Na^(+)含量显著积累,随盐浓度增加其外排趋势明显,叶片中K^(+)外排和H^(+)内流以维持胞内渗透势的稳态。耐盐相关基因质膜Na^(+)/H^(+)逆向转运体(Salt Overly Sensitive,SOS1)在叶片表达量高于根系,液泡膜Na^(+)/H^(+)逆向转运体1(NHX1)呈先上调后下调的趋势,且液泡H^(+)-ATPase c亚基(VHA-C1)在根系中显著上调。在100 mmol·L^(-1)NaCl浓度胁迫下,WRKY65(WRKY transcription factor 65)、MKK9(Mitogen-activated protein kinase kinase 9)和MPK3(Mitogen-activated protein kinase 3)基因的表达呈上升趋势,且叶片中的表达量显著高于根系。[结论]NaCl胁迫条件下,心形核桃根系受胁迫影响大于叶片,JrSOS1、JrNHX1、JrNHX2与抗盐能力密切相关,是作为抵御盐胁迫的关键基因。 展开更多
关键词 心形核桃 NACL胁迫 基因表达 非损伤微测技术 冗余分析
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基因表达快速分析新技术-MPSS简介 被引量:2
10
作者 张智俊 罗淑萍 谭晓风 《生物技术》 CAS CSCD 2003年第2期40-41,共2页
介绍了一种新的基因表达快速分析技术 -MPSS技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。
关键词 基因表达 快速分析技术 MPSS技术 技术原理 技术路线 应用 大量平行测序技术
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机械点样DNA微点阵技术及其在基因表达分析上的应用(I) 被引量:7
11
作者 周冬生 杨瑞馥 《生物技术通讯》 CAS 2002年第4期315-321,共7页
从芯片制作、芯片杂交、芯片扫读与图像分析、基因表达数据分析等方面,详细介绍了机械点样DNA微点阵技术及其应用于多基因表达分析的基本步骤与原理。
关键词 机械点样DNA微点阵技术 基因表达分析 应用 生物芯片
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基因表达的连续分析技术 被引量:1
12
作者 孙剑 《生命的化学》 CAS CSCD 2003年第4期313-315,共3页
基因表达的连续分析技术是一种能对某一细胞群或特定的微解剖结构基因表达做全面分析的技术。本文就基因表达的连续分析技术的原理、方法进行综述。
关键词 基因表达 基因表达的连续分析技术 SAGE 转录组
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基因差异表达分析技术在寄生虫学中的应用研究进展
13
作者 夏艳勋 李国清 +2 位作者 苑纯秀 赵传璧 林矫矫 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第3期63-68,共6页
生物体表现出的各种生物学特性,主要是由于基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性差异表达引起的。这些基因的差异表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着,决定了生命活动的多样性。而基因差异表达研究的各种分析技术正是在此基础上... 生物体表现出的各种生物学特性,主要是由于基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性差异表达引起的。这些基因的差异表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着,决定了生命活动的多样性。而基因差异表达研究的各种分析技术正是在此基础上发展起来并在兽医寄生虫学中得到广泛应用。以mR-NA差异显示、抑制消减杂交法和DNA微列阵分析等为代表的基因差异表达分析技术,在基因表达谱的分析及基因生物学功能研究,阐述寄生虫的发病机制,寄生虫疾病诊断,筛选合适的药物靶标和疫苗候选分子有效地防病治病方面发挥着重要作用。 展开更多
关键词 基因差异表达分析技术 寄生虫学 应用
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基因差异表达分析技术及其在糖尿病研究中的应用
14
作者 罗洁 许辉 《实用预防医学》 CAS 2005年第6期1482-1485,共4页
随着差异表达基因检测技术的不断发展,建立了很多新的检测方法,本文对差异显示反转录PCR技术(DDRT-PCR)、代表性差异分析技术(RDA)、抑制消减杂交技术(SSH)、获得全长基因的消减杂交法、基因表达系列分析(SAGE)、限制性显示技术(RD-PCR... 随着差异表达基因检测技术的不断发展,建立了很多新的检测方法,本文对差异显示反转录PCR技术(DDRT-PCR)、代表性差异分析技术(RDA)、抑制消减杂交技术(SSH)、获得全长基因的消减杂交法、基因表达系列分析(SAGE)、限制性显示技术(RD-PCR)和基因芯片技术的基本原理作了综述,介绍了它们的应用状况和优缺点,并对基因差异表达分析技术在糖尿病研究中的近期应用及其前景作了简要介绍。随着研究的进一步深入,基因差异表达分析技术和方法将在糖尿病及其他疾病的分子机制、临床诊断、治疗和预防等领域中具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 基因差异表达分析技术 糖尿病 研究
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机械点样DNA微点阵技术及其在基因表达分析上的应用(II)
15
作者 周冬生 杨瑞馥 《生物技术通讯》 CAS 2002年第5期408-414,共7页
从芯片制作、芯片杂交、芯片扫读与图像分析、基因表达数据分析等方面,详细介绍了机械点样DNA微点阵技术及其应用于多基因表达分析的基本步骤与原理。
关键词 机械点样DNA微点阵技术 基因表达分析 应用 生物芯片
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几种基因差异表达分析技术在原核生物差异基因筛选中的应用 被引量:5
16
作者 胡烨 李影 钱爱东 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第2期103-106,共4页
原核生物差异基因筛选方面,目前代表性差异分析方法(RDA)、消减抑制杂交法(SSH)、限制性酶切片段差异显示(RFDD-PCR)以及cDNA-AFLP等技术经改良后,可用于原核生物差异基因筛选的研究。论文对这几种方法的优缺点及应用进行了介绍。
关键词 基因差异表达分析技术 差异基因筛选 原核生物
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用改进的DDRT-PCR技术进行小麦穗和花药特异表达基因的分析
17
作者 刘秀珍 孙兰珍 +2 位作者 刘保申 宋伟 刘青 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2005年第1期113-118,共6页
本研究采用改进的DDRT-PCR技术对小麦穗和花药发育的不同阶段进行了差别表达分析,以找出穗和花药的特异表达基因。用30个随机单引物进行RAPD扩增,从展示的近1000条带中找出14条差别cDNA片段,然后以cDNA为探针进行反向Northern-Blot,结... 本研究采用改进的DDRT-PCR技术对小麦穗和花药发育的不同阶段进行了差别表达分析,以找出穗和花药的特异表达基因。用30个随机单引物进行RAPD扩增,从展示的近1000条带中找出14条差别cDNA片段,然后以cDNA为探针进行反向Northern-Blot,结果得到一条在花药内特异表达增强的阳性片段,命名为S1176450。 展开更多
关键词 DDRT-PCR技术 特异表达基因 小麦穗 RAPD扩增 CDNA片段 表达分析 花药发育 单引物 450 差别
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原发灶不明转移癌基因表达谱分析技术进展
18
作者 韩倩 林连君 刘新民 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2017年第6期554-558,共5页
原发灶不明转移癌(CUP)是一类经组织病理学证实为转移性,但经多种临床诊疗手段无法明确原发灶的肿瘤。明确肿瘤原发部位是CUP诊断的第一步,组织病理学、免疫组织化学技术、PET/CT都是临床常用的诊疗手段。基因表达谱分析技术是近年新兴... 原发灶不明转移癌(CUP)是一类经组织病理学证实为转移性,但经多种临床诊疗手段无法明确原发灶的肿瘤。明确肿瘤原发部位是CUP诊断的第一步,组织病理学、免疫组织化学技术、PET/CT都是临床常用的诊疗手段。基因表达谱分析技术是近年新兴的一种诊断原发灶的方法,具有较高的诊断准确率、敏感性和特异性,有望实现CUP患者的个体化治疗。 展开更多
关键词 原发灶不明转移癌 基因表达分析技术 诊断进展
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基因芯片技术分析斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制 被引量:18
19
作者 胡和平 张俊平 +4 位作者 应康 肖振宇 吴红梅 毛裕民 吴孟超 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期645-649,共5页
目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、D... 目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、DN Apolymerase delta、X RCC9等 )、能量代谢基因 (如 malate dehydrogenase、ADP/ ATP translocase等 )、致瘤活性基因 (如 c- myc、tre等 )以及肿瘤特异表达基因 (如 bladder cancer related protein等 )。相反 ,斑蝥素促进了多种细胞生长抑制基因 (如 BCRA2、BTG2、dual- specificity protein phosphatase等 )以及凋亡相关基因 (如 ATL - derived PMA- responsive peptide等 )的表达。 结论 :斑蝥素改变调控细胞周期进程、细胞增殖。 展开更多
关键词 肝癌 QGY7703细胞 斑蝥素 基因芯片技术分析 基因表达
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多发性骨髓瘤的基因表达谱分析 被引量:12
20
作者 石奕武 胡维新 +3 位作者 汤立军 田菁燕 易伟峰 谭达人 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期201-205,共5页
目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,3... 目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,32 9条表达降低。结论 :MM的发生发展涉及多基因的改变 。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 基因表达 分析 cDNA芯片技术 骨髓基因
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