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不同生物型烟粉虱体内Wolbachia共生菌的检测及其系统树分析 被引量：14
1
作者 褚栋 丛斌 +3 位作者 张友军 徐宝云 吴青君 朱国仁 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期518-525,共8页
Wolbachia是广泛分布于节肢动物体内一类共生细菌,它能够通过多种机制调控宿主的生殖方式。近年来的研究表明,Wolbachia与许多外来生物的成功入侵相关。本文利用长PCR的方法特异扩增了不同生物型烟粉虱(共24个种群)体内Wolbachia的wsp基... Wolbachia是广泛分布于节肢动物体内一类共生细菌,它能够通过多种机制调控宿主的生殖方式。近年来的研究表明,Wolbachia与许多外来生物的成功入侵相关。本文利用长PCR的方法特异扩增了不同生物型烟粉虱(共24个种群)体内Wolbachia的wsp基因,结果发现B型和Q型烟粉虱入侵种群体内均未检测到Wolbachia,而在非B/Q型的浙江种群和肯尼亚种群体内检测到了Wolbachia。对该wsp基因进行测序并和已知序列进行同源性分析发现,浙江烟粉虱种群的Wolbachia属于B组Con/Rug亚种群,而肯尼亚种群属于B组Btab1亚种群。Wolbachia的存在与否可能与烟粉虱的成功入侵有一定的关系。 展开更多
关键词 生物型烟粉虱 WOLBACHIA 共生菌 检测 系统树 生物入侵 支序分析 害虫
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利用DNA序列构建系统树的方法 被引量：25
2
作者 李涛 赖旭龙 钟扬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期205-210,共6页
利用DNA序列进行系统发生分析是分子进化研究的必要手段。构建系统树的方法有距离法、简约法、最大似然法以及贝叶斯推断法等。要解决特定的系统发生问题,首先要挑选合理的分类群及序列,尽量减少数据的偏倚,然后选择构树方法,最后还要... 利用DNA序列进行系统发生分析是分子进化研究的必要手段。构建系统树的方法有距离法、简约法、最大似然法以及贝叶斯推断法等。要解决特定的系统发生问题,首先要挑选合理的分类群及序列,尽量减少数据的偏倚,然后选择构树方法,最后还要对结果进行评价并给出进化学上的解释。通过讨论挑选数据的原则及存在的问题,介绍了几种构树方法的基本原理及步骤,并列举了它们的优缺点。 展开更多
关键词 DNA序列 系统树 分子进化 距离法 简约法 贝叶斯推断法
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福建沿海地区人T淋巴细胞白血病病毒1型膜基因的克隆和系统树分析 被引量：13
3
作者 王颖彬 张军 +4 位作者 张国忠 逄淑强 徐颖潇 杨丰 夏宁邵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期193-197,共5页
人T淋巴细胞白血病病毒 1型 (HTLV 1)是最早发现的一种RNA肿瘤病毒。利用HTLV 1基因组长末端重复区 (LTR)或膜基因 (env)序列进行系统树分析 ,可分为C、J、WA、CA和M 5个亚型。为了解我国HTLV 1流行区毒株的主要基因型别 ,从福建莆田地... 人T淋巴细胞白血病病毒 1型 (HTLV 1)是最早发现的一种RNA肿瘤病毒。利用HTLV 1基因组长末端重复区 (LTR)或膜基因 (env)序列进行系统树分析 ,可分为C、J、WA、CA和M 5个亚型。为了解我国HTLV 1流行区毒株的主要基因型别 ,从福建莆田地区克隆出 3株HTLV 1的env基因。其序列与已知各亚型代表株进行系统树分析 ,结果表明均为C亚型。首次证实了中国大陆HTLV 1C亚型的存在。该地区地处福建沿海 ,近几个世纪以来对海外人口迁徙频繁。这一地区HTLV 1C亚型的存在是否与目前全球性C亚型的分布有关 ,值得进一步研究。 展开更多
关键词 人类T淋巴细胞白血病病毒 膜基因 系统树分析
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遗传距离与利用微卫星进行系统树构建初探 被引量：4
4
作者 毛永江 常洪 +6 位作者 杨章平 张柳 许明 常国斌 孙伟 宋光明 Henner Simianer 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期129-135,共7页
以中国牛亚科家畜6个群体12对微卫星数据为基础,采用6种遗传距离(DA、DC、DS、Dsw,(σμ)2和DTL)和2种聚类方法(UPGMA和NJ法),探索它们对系统树构建准确性的影响。结果表明:微卫星位点平均杂合度水平显著影响系统树构建的准确性,用DA和D... 以中国牛亚科家畜6个群体12对微卫星数据为基础,采用6种遗传距离(DA、DC、DS、Dsw,(σμ)2和DTL)和2种聚类方法(UPGMA和NJ法),探索它们对系统树构建准确性的影响。结果表明:微卫星位点平均杂合度水平显著影响系统树构建的准确性,用DA和DC遗传距离构建的系统树准确性相对较高,但很难确定NJ法和UPGMA法哪一种更适合于系统树的构建,而DTL遗传距离用于系统树构建有待进一步完善;最后,对微卫星用于家畜系统树构建的有效性和局限性进行了探讨。 展开更多
关键词 系统树构建 微卫星 遗传距离
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系统树的构建及其在SARS病毒分类中的应用 被引量：1
5
作者 黄丽红 荀鹏程 +1 位作者 赵杨 陈峰 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2006年第4期315-318,共4页
目的探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用。方法系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法。本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病毒和来自F... 目的探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用。方法系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法。本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病毒和来自Flaviviridae和Togaviridae两个科的4个单链RNA病毒的完全基因组数据,选用UPGMA距离法构建系统树,构建SARS病毒分类。结果SARS病毒在冠状病毒中自身构成一个独立分支,与哺乳动物为宿主的冠状病毒的亲缘关系最近。结论系统发育树可以用于新型病毒的分类。 展开更多
关键词 系统树 PHYLIP软件 SARS病毒
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三种保守蛋白系统树支持卡氏肺孢子虫作为古子囊菌的分类地位(英文) 被引量：2
6
作者 燕安 潘淼 李颖 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第23期3536-3539,共4页
目的卡氏肺孢子虫作为肺炎的病原物,其分类地位一直存在争议。近二十年来,关于卡氏肺孢子虫的分子生物学证据多支持其为真菌的观点,但卡氏肺孢子虫在真菌内部的分类地位需要确定。方法本研究在swissprot数据库中搜集真菌和卡氏肺孢子虫... 目的卡氏肺孢子虫作为肺炎的病原物,其分类地位一直存在争议。近二十年来,关于卡氏肺孢子虫的分子生物学证据多支持其为真菌的观点,但卡氏肺孢子虫在真菌内部的分类地位需要确定。方法本研究在swissprot数据库中搜集真菌和卡氏肺孢子虫中的肌动蛋白、α微管蛋白和钙调素这三种保守蛋白的氨基酸序列,使用phylip3.6a软件中的邻接法构建三种保守蛋白的系统树,从而探讨卡氏肺孢子虫的分类地位。结果三种蛋白的分子系统树都支持了将卡氏肺孢子虫作为子囊菌的早期分支古子囊菌的分类观点。结论古子囊菌可能并不是一个单起源群。 展开更多
关键词 分子系统树 卡氏肺孢子虫 古子囊菌
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山东省HIV-1流行毒株的基因特征和系统树分析 被引量：4
7
作者 刘传新 邢辉 +6 位作者 苏生利 潘品良 黄涛 范秀娟 冯毅 傅继华 邵一鸣 《中国性病艾滋病防治》 1999年第5期220-223,共4页
从13名山东省HIV感染者的淋巴细胞(PBMC)中提取前病毒DNA,使用套式PCR方法扩增HIV-lenv基因的C2-V3区。经序列分析发现13份样品均为B′,亚型(泰国B亚型),其与国际参考序列Bcon、泰国代表株93th067A、中国云南省代表株RL42、云南省共享序... 从13名山东省HIV感染者的淋巴细胞(PBMC)中提取前病毒DNA,使用套式PCR方法扩增HIV-lenv基因的C2-V3区。经序列分析发现13份样品均为B′,亚型(泰国B亚型),其与国际参考序列Bcon、泰国代表株93th067A、中国云南省代表株RL42、云南省共享序列96Yn-Bcon的基因离散率分别为7.31％、5.72％、4.25％、3.76％,而远离其它亚型。由系统树可以更清楚看到13个毒株全部与93th067A、RL42等B,亚型流行株聚在一起。通过GCG软件包计算这些毒株彼此间的基因离散率的变异系数为2.71％。以上数据提示HIV-1在山东省的流行时间不长。且与云南省相同亚型的HIV-1毒株密切相关。 展开更多
关键词 HIV 套式PCR 序列分析 系统树 基因特征
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陆地植物新系统树之诠释与简评 被引量：1
8
作者 方炎明 《南京林业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期1-7,共7页
近十年来陆地植物主要谱系系统发育关系已经得到解决,包含角苔类、苔类和藓类的苔藓植物,但可能不是一个单系分支。重新定义的单系的蕨类植物,其中不包括石松植物。根据分子数据结合形态上近裔共性,若干分支的单系性得到支持,这些分支... 近十年来陆地植物主要谱系系统发育关系已经得到解决,包含角苔类、苔类和藓类的苔藓植物,但可能不是一个单系分支。重新定义的单系的蕨类植物,其中不包括石松植物。根据分子数据结合形态上近裔共性,若干分支的单系性得到支持,这些分支包括真双子叶植物、核心真双子叶植物、蔷薇分支和菊分支等。另外还讨论了有关苔藓植物和买麻藤目系统发育的若干争议问题,并就今后的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 系统树 陆地植物 苔藓植物 单系蕨类植物 真双子叶植物
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基于ITS序列分析的部分榕属植物系统树构建 被引量：1
9
作者 李升星 陈家林 +3 位作者 张太奎 贺笑 刘小珍 张汉尧 《福建林业科技》 2016年第1期9-13,共5页
以榕属中黄金榕、橡皮树、小叶榕3个树种为研究对象,以其叶片为试材提取基因组DNA,进行ITS-PCR扩增。对扩增产物测序结果进行分析,在NCBI上选取同源率较高的27个树种的ITS序列与其进行同源比较,并建立系统树分析它们之间的亲缘进化关系... 以榕属中黄金榕、橡皮树、小叶榕3个树种为研究对象,以其叶片为试材提取基因组DNA,进行ITS-PCR扩增。对扩增产物测序结果进行分析,在NCBI上选取同源率较高的27个树种的ITS序列与其进行同源比较,并建立系统树分析它们之间的亲缘进化关系。结果表明:30种榕属植物基于ITS序列分析与传统分类学略有差异,通过结合ITS鉴定与形态分类相结合可以为以后榕属的分类提供借鉴。 展开更多
关键词 榕属 ITS序列分析 系统树构建
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基于进化式专家系统树的无人机空战决策技术 被引量：15
10
作者 王炫 王维嘉 +1 位作者 宋科璞 王敏文 《兵工自动化》 2019年第1期42-47,共6页
为解决传统专家系统方法无法应付非预期情况的问题,提出一种进化式的专家系统树方法来研究空战决策。以中距空战为例,建立2维典型空战模型,将遗传算法和专家系统相结合,建立进化式专家系统树框架和战术决策系统,并在一对一空战场景下对... 为解决传统专家系统方法无法应付非预期情况的问题,提出一种进化式的专家系统树方法来研究空战决策。以中距空战为例,建立2维典型空战模型,将遗传算法和专家系统相结合,建立进化式专家系统树框架和战术决策系统,并在一对一空战场景下对所建立的方法进行仿真验证。仿真结果表明:该方法通过在多种战场设定下对决策规则的离线进化,使决策系统可根据战场情况做出调整,在己方飞行性能不占优势的情况下达成制胜目标。 展开更多
关键词 空战决策 专家系统树 遗传算法 进化计算
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对生物系统树图的思考
11
作者 杨瑞林 杨艳萍 《山西师范大学学报（自然科学版）》 2005年第4期83-87,共5页
本文认为生物系统树图要体现生物多样性思想.生物系统树总体上应该绘制成近似倒圆锥体.确定生物之间亲缘关系要以现在为起点向过去追溯物种出现的时间.
关键词 生物进化 生物多样性 生物系统树
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泉州市无偿献血者4例HTLV-1毒株膜基因系统树分析 被引量：6
12
作者 林毅胜 吴福林 张志珊 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第5期406-409,416,共5页
目的　HTLV的感染人群分布有明显的区域性特点 ,福建东南沿海是我国HTLV的主要流行区之一 ,输血是HTLV的主要传播途径。因此 ,调查泉州市无偿献血者HTLV - 1感染情况 ,了解该地区HTLV - 1毒株亚型、感染来源、基因特点 ,对阐明我国HTLV ... 目的　HTLV的感染人群分布有明显的区域性特点 ,福建东南沿海是我国HTLV的主要流行区之一 ,输血是HTLV的主要传播途径。因此 ,调查泉州市无偿献血者HTLV - 1感染情况 ,了解该地区HTLV - 1毒株亚型、感染来源、基因特点 ,对阐明我国HTLV - 1分布、起源和传播过程具有重要意义。方法　用PCR法扩增HTLV - 1毒株的外膜基因gp4 6片段 (envgp4 6 ) ,自动测序仪测序 ,并进行同源性比较和系统树分析。结果　获得了泉州无偿献血者 4例HTLV - 1envgp4 6部分氨基酸序列。结论　泉州市 4例HTLV - 1与来自日本、台湾HTLV - 1氨基酸序列接近 ,都属C亚型。 展开更多
关键词 献血者HTLV-1 基因亚型 聚合酶链反应 序列分析 系统树分析
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系统发育系统学——对现代系统生物学的理解与探讨(5)支序图、系统树及祖裔关系 被引量：3
13
作者 孟津 王晓鸣 《古脊椎动物学报》 CSCD 北大核心 1989年第4期306-312,共7页
在重建系统发育关系的研究中,对于祖裔关系的认识存在两种主要的不同派别,即传统的演化论学派和支序学派。传统的演化论学派认为,通过古生物资料来找到系统发育中的实际祖先类型是重建生物系统发育的一个基本内容,而祖先类型是有可能被... 在重建系统发育关系的研究中,对于祖裔关系的认识存在两种主要的不同派别,即传统的演化论学派和支序学派。传统的演化论学派认为,通过古生物资料来找到系统发育中的实际祖先类型是重建生物系统发育的一个基本内容,而祖先类型是有可能被认识到的(Bretsky,1979;Gingerich,1979)。支序学派并不迥避对祖-裔关系的讨论。 展开更多
关键词 系统发育 支序图 系统树
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基于DNA序列分析的刚竹属系统树构建 被引量：8
14
作者 朱芳明 杜建伟 +1 位作者 周国贤 张汉尧 《西部林业科学》 CAS 2015年第2期63-68,共6页
提取刚竹属中毛金竹、毛竹、龟甲竹、人面竹、紫竹、白哺鸡竹、黄槽竹、芽竹、蓉城竹、红壳雷竹、假毛竹、金竹、黄纹竹等13个竹种的DNA,对其内转录间隔区(ITS)序列以及maturase K(mat K)序列进行PCR扩增和序列测定。构建了与其亲缘关... 提取刚竹属中毛金竹、毛竹、龟甲竹、人面竹、紫竹、白哺鸡竹、黄槽竹、芽竹、蓉城竹、红壳雷竹、假毛竹、金竹、黄纹竹等13个竹种的DNA,对其内转录间隔区(ITS)序列以及maturase K(mat K)序列进行PCR扩增和序列测定。构建了与其亲缘关系接近的刚竹属6个种、牡竹属3个种共22个竹种基于ITS序列的系统发育树和刚竹属7个种、牡竹属3个种共23个竹种基于mat K的系统发育树,并探讨了其亲缘关系。结果显示,实验所用的大部分竹种分类结果与传统分类类似,但黄纹竹、毛竹与其他刚竹属竹种的遗传距离较远,却与牡竹属的竹种聚类,与传统分类相左。通过测序分析认为其为杂种的可能性较高,并由此推测杂种的存在是造成竹子分子分类困难的一大原因。 展开更多
关键词 刚竹属 ITS MAT K 序列分析 系统发育树
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从未经培养的HIV-1阳性外周血克隆及系统树分析HIV-1中国株E亚型gp120基因
15
作者 张洪涛 季阳 +2 位作者 潘品良 肖瑶 邵一鸣 《中国输血杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期213-215,共3页
目的:研究中国HIV-1 E亚型代表株的主要结构基因及其功能。方法:选择3份根据HIV-1 的外膜基因(C2-V3)的序列分析判定为E亚型的阳性血样,采用克隆和系统树分析,通过套式PCR得到全长的gp120 基因片段,并插入到pFastBacl载体中,以双脱氧末... 目的:研究中国HIV-1 E亚型代表株的主要结构基因及其功能。方法:选择3份根据HIV-1 的外膜基因(C2-V3)的序列分析判定为E亚型的阳性血样,采用克隆和系统树分析,通过套式PCR得到全长的gp120 基因片段,并插入到pFastBacl载体中,以双脱氧末端终止法测定全部的DNA 序列。结果:来自广东和广西的样品的gp120 基因归于E亚型,E亚型中国株内的遗传距离为2.56% ～5.87% ,与16 株国际标准株比较,遗传距离为3.60% ～27.98% 。所有克隆到的gp120 基因都具有完整的阅读框架,无大的缺失和插入。结论:HIV-1 E亚型进入中国的时间不长;克隆到的E亚型代表株的gp120 基因具有完整的结构和功能。 展开更多
关键词 HIV-1 E 亚型 GP120 前病毒 系统树分析
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水稻中受体激酶的系统树分析
16
作者 董亿 张建国 +2 位作者 王永军 张劲松 陈受宜 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2004年第6期647-654,共8页
植物受体激酶(RLKs)在植物细胞内的反应中发挥着重要作用。为了比较拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)和水稻(Orvza sativa L.)中受体激酶的进化关系，作者通过对北京华大基因研究中心(BGI)的籼稻蛋白质数据库进行BLASTP搜索，找到267个... 植物受体激酶(RLKs)在植物细胞内的反应中发挥着重要作用。为了比较拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)和水稻(Orvza sativa L.)中受体激酶的进化关系，作者通过对北京华大基因研究中心(BGI)的籼稻蛋白质数据库进行BLASTP搜索，找到267个受体激酶类似基因，根据它们的胞外结构域可以将这些基因分为不同的类型。与拟南芥中受体激酶的系统树比较分析表明，不同类型的受体激酶具有不同的序列保守性，说明在植物进化过程中，不同类型的受体激酶具有不同的进化关系。水稻受体激酶与拟南芥受体激酶BRI1的多序列匹配结果也表明二者可能具有不同的磷酸化位点。 展开更多
关键词 受体激酶 系统树 磷酸化位点 水稻
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舍弗勒新型变矩器系统树立行业标杆 被引量：1
17
《通用机械》 2016年第10期13-13,共1页
随着对节油和减排的需求越来越高，自动变速箱在全球范围内越来越普及。采用新型液力变矩器系统的用户友好型自动变速箱正在树立新的效率标准，舍弗勒在这一领域占据领先地位。
关键词 液力变矩器 系统树 自动变速箱 标杆 行业 全球范围
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肯尼亚新发现的头骨化石改变了人类进化系统树的模式
18
作者 吴汝康 《人类学学报》 1987年第1期79-80,共2页
1986年8月,肯尼亚国家博物馆的理查德·利基(Richard Leakey)宣布,他们在肯尼亚北部特卡纳湖两岸发现了一个非常完整的人科成员的头骨(缺下颌骨),年代为距今250万年。这个发现使原先的二分叉模式的人类进化系统树改变成了三分叉的... 1986年8月,肯尼亚国家博物馆的理查德·利基(Richard Leakey)宣布,他们在肯尼亚北部特卡纳湖两岸发现了一个非常完整的人科成员的头骨(缺下颌骨),年代为距今250万年。这个发现使原先的二分叉模式的人类进化系统树改变成了三分叉的模式。 这个头骨是1985年夏季由美国约翰·霍普金斯大学的沃克(Alan Walker)从特卡纳湖西岸富含化石的堆积中发现的,头骨标本编号为KNM-WT17000,这个地点就在1984年发现著名的直立人男孩的完整骨架以南32公里处。 展开更多
关键词 系统树 人类进化 头骨化石 肯尼亚 新发现 南方古猿非洲种 直立人 分叉 特卡 利基
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李氏方法与Farris氏方法产生的分支系统树的比较
19
作者 秦廷奎 段宇 《植物分类学报》 CSCD 1993年第1期100-104,共5页
关键词 分支分类学 系统树 植物分类学
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广州华侨城Techcon楼控系统树行业典范
20
《电气应用》 北大核心 2009年第16期3-3,共1页
近日，采用同方泰德国际Techcon 04系列楼控系统的“华侨城体育文化中心”项目成功验收。
关键词 系统树 华侨城 行业 广州 文化中心
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