基于纯培养和超高深宏基因组测序技术分析茅台镇两企业高温大曲微生物多样性差异

1

作者 王玉荣 侯强川 +3 位作者 田龙新 刘菊珍 周加平 郭壮 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第4期108-115,共8页

以茅台镇不同酒厂高温大曲为研究对象,采用纯培养技术和宏基因组测序对高温大曲中微生物多样性进行解析。结果发现,分离的212株芽孢杆菌主要为77株索诺拉沙漠芽孢杆菌(Bacillus sonorensis)、39株地衣芽孢杆菌(B. licheniformis)和19株... 以茅台镇不同酒厂高温大曲为研究对象,采用纯培养技术和宏基因组测序对高温大曲中微生物多样性进行解析。结果发现,分离的212株芽孢杆菌主要为77株索诺拉沙漠芽孢杆菌(Bacillus sonorensis)、39株地衣芽孢杆菌(B. licheniformis)和19株解淀粉芽孢杆菌(B. amyloliquefaciens)等。通过宏基因组Binning技术共获得55个高质量基因组,其中有18个疑似新菌株,分别为Bacillus sp.、Lactobacillus sp.和Weissella sp.等。菌群结构分析表明,高温大曲中的主要菌属分别为Desmospora sp. 8437、B. sonorensis和B. amyloliquefaciens等,其中A酒厂在B. sonorensis和B. amyloliquefaciens等的相对丰度显著较低(P<0.05)。A酒厂高温大曲中微生物的多样性和丰富度均显著低于B酒厂(P<0.05),且两者的菌群结构存在明显的差异。在功能方面,A酒厂高温大曲中丰度较高的差异代谢通路主要与氨基酸的生物合成相关,而B酒厂高温大曲中丰度较高的差异代谢通路主要与L-鼠李糖的降解相关。由此可见,本研究对后续发酵工艺的改良和优良菌株的筛选具有积极意义。 展开更多

关键词 高温大曲 纯培养技术 宏基因组 芽孢杆菌 生物信息学

下载PDF 职称材料

基于纯培养和高通量测序技术解析仙桃地区鲊菜细菌多样性

2

作者 胡雨婷 符漫 +4 位作者 王玉荣 张彦 张海波 孙雅芳 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2022年第10期95-99,共5页

为解析湖北省仙桃地区鲊菜中细菌多样性,该研究在采用纯培养技术对乳酸菌菌株进行分离鉴定的基础上,进一步使用Illumina MiSeq高通量测序技术对其细菌多样性进行解析。纯培养结果发现,分离到的44株乳酸菌隶属于乳酸杆菌属(Lactobacillus... 为解析湖北省仙桃地区鲊菜中细菌多样性,该研究在采用纯培养技术对乳酸菌菌株进行分离鉴定的基础上,进一步使用Illumina MiSeq高通量测序技术对其细菌多样性进行解析。纯培养结果发现,分离到的44株乳酸菌隶属于乳酸杆菌属(Lactobacillus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、魏斯氏菌属(Weissella)和乳球菌属(Lactococcus),其中植物乳杆菌(L.plantarum)和戊糖乳杆菌(L.pentosus)分别占总分离株含量的40.91%和34.09%。Illumina MiSeq高通量测序结果显示,鲊菜中优势细菌属主要包括乳酸杆菌属、明串珠菌属、魏斯氏菌属、假单胞菌属(Pseudomonas)和肠杆菌属(Enterobacter),其平均相对含量分别为85.03%、3.31%、1.68%、1.50%和1.05%。由此可见,仙桃地区鲊菜中乳酸菌具有较高的多样性,且以植物乳杆菌和戊糖乳杆菌为主。 展开更多

关键词 鲊菜 纯培养技术 高通量测序 细菌多样性

下载PDF 职称材料

提高微生物可培养性的方法和措施 被引量：57

3

作者 郭斌 吴晓磊 钱易 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期504-507,共4页

目前自然界中只有极少部分微生物能够得到培养,严重阻碍了对微生物生命活动规律的研究和微生物资源的开发。改进传统培养方法,采用新型培养技术,提高微生物可培养性,大量培养自然界中存在的微生物,从而更全面、准确地了解微生物细胞的... 目前自然界中只有极少部分微生物能够得到培养,严重阻碍了对微生物生命活动规律的研究和微生物资源的开发。改进传统培养方法,采用新型培养技术,提高微生物可培养性,大量培养自然界中存在的微生物,从而更全面、准确地了解微生物细胞的生命规律、获悉微生物群落中各种微生物之间的动态相互作用和相互协调的规律,对环境微生物工艺进行准确地设计、精细地调控和高效地利用。简要介绍了微生物不可培养的原因,系统总结了有关提高微生物可培养性方法的最新研究进展,提出研究中存在的问题,并阐述了模拟自然环境条件、强调微生物相互关系是提高微生物可培养性的关键。 展开更多

关键词 微生物可培养性 纯培养技术 群体感应

下载PDF 职称材料

高温大曲中芽孢杆菌菌群多样性解析及其分离株鉴定

4

作者 黄锶钘 王玉荣 +4 位作者 贺子豪 田龙新 周加平 刘菊珍 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第3期79-83,共5页

为探究湖北襄阳地区高温大曲中芽孢杆菌(Bacillus)菌群多样性,该研究通过下载并筛选高温大曲样品芽孢杆菌相对含量>2.0%的测序数据,采用Illumina Mi Seq高通量测序技术和传统纯培养技术相结合的方法对大曲样品中芽孢杆菌多样性进行... 为探究湖北襄阳地区高温大曲中芽孢杆菌(Bacillus)菌群多样性,该研究通过下载并筛选高温大曲样品芽孢杆菌相对含量>2.0%的测序数据,采用Illumina Mi Seq高通量测序技术和传统纯培养技术相结合的方法对大曲样品中芽孢杆菌多样性进行解析。结果表明,高温大曲中芽孢杆菌相对含量>2.0%的样品共有12份,包括8份白色大曲样品和4份黄色大曲样品,所有样品共获得77 825条代表性序列,1 197个操作分类单元(OTUs)。多样性分析结果表明,较之黄色大曲,白色大曲样品中芽孢杆菌的超1指数和发现物种数显著偏高(P<0.05)。OTU分析结果表明,OTU5321和OTU5291在所有样品中均存在,其在白色大曲和黄色大曲中累积包含序列分别占总序列数的49.43%和41.32%。传统纯培养技术分析结果表明,解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)为高温大曲中芽孢杆菌的主要可培养菌种。由此可知,白色大曲芽孢杆菌群落结构的丰富度更高,且解淀粉芽孢杆菌为高温大曲中芽孢杆菌的主要可培养菌种,为后续高温大曲中芽孢杆菌的应用及菌种选育具有指导作用。 展开更多

关键词 高温大曲 芽孢杆菌 高通量测序 操作分类单元 传统纯培养技术

下载PDF 职称材料

传统技术与现代分子生物学技术在瘤胃微生物多样性方面的研究进展 被引量：2

5

作者 成玉梅 邓卫东 毛华明 《动物医学进展》 CSCD 2006年第z1期51-54,共4页

为了提高反刍动物利用瘤胃微生物的效率,微生物学家和动物营养学家都致力于瘤胃微生物的培养分离纯化和生理生化特性研究。但是由于瘤胃微生物大多是厌氧性的,很难培养成功,传统技术在瘤胃微生物的研究上受到很多限制。随着科学技术的进... 为了提高反刍动物利用瘤胃微生物的效率,微生物学家和动物营养学家都致力于瘤胃微生物的培养分离纯化和生理生化特性研究。但是由于瘤胃微生物大多是厌氧性的,很难培养成功,传统技术在瘤胃微生物的研究上受到很多限制。随着科学技术的进步,现代分子技术也开始逐渐渗透到瘤胃微生物的研究中来。文章将瘤胃微生物多样性研究的方法简要划分为纯培养技术,现代分子生物学技术和上述两种方法的联合使用,并重点阐述了不同方法的优缺点,展望了瘤胃微生物多样性研究方法的发展前景。 展开更多

关键词 瘤胃微生物 多样性 纯培养技术 分子生物学技术

下载PDF 职称材料

兰陵浓香大曲理化性质和细菌群落多样性研究

6

作者 孔祥聪 邢文慧 +4 位作者 管桂坤 刘宇 蔡文超 单春会 郭壮 《中国酿造》 CAS 北大核心 2023年第7期126-131,共6页

该研究对山东兰陵浓香大曲的理化性质和细菌菌群多样性进行解析,并结合传统纯培养技术、形态观察及分子生物学技术对其蕴含的细菌菌株进行分离鉴定。结果表明,兰陵大曲样品的淀粉含量、蛋白质含量、糖化力、酯化力、酒化力和液化力均符... 该研究对山东兰陵浓香大曲的理化性质和细菌菌群多样性进行解析,并结合传统纯培养技术、形态观察及分子生物学技术对其蕴含的细菌菌株进行分离鉴定。结果表明,兰陵大曲样品的淀粉含量、蛋白质含量、糖化力、酯化力、酒化力和液化力均符合QB/T 4259—2011《浓香大曲》要求。兰陵大曲优势细菌门(平均相对含量>1.0%)为厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),优势细菌属(平均相对含量>1.0%)为芽孢杆菌属(Bacillus)(79.86%)、不动杆菌属(Acinetobacter)(9.71%)和高温放线菌属(Thermoactinomyces)(3.97%);基于纯培养技术从中共分离鉴定出16株芽孢杆菌和3株乳酸菌,包括7株地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、4株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、2株澳洲芽孢杆菌(Bacillus australimaris)、2株副地衣芽孢杆菌(Bacillus paralicheniformis)、1株西姆芽孢杆菌(Bacillus siamensis)、2株戊糖乳杆菌(Lactiplantibacillus pentosus)和1株乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici)。 展开更多

关键词 浓香大曲 高通量测序 纯培养技术 细菌 多样性 分离 鉴定

下载PDF 职称材料

食醋中污染菌的分离与鉴定 被引量：9

7

作者 翟磊 苏姣姣 +3 位作者 刘洋 曹艳花 姚粟 程池 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期198-202,共5页

首次关于耐酸乳杆菌是引起食醋变质的报道,旨在为食醋生产企业进行微生物污染控制提供理论依据。采用PCRDGGE技术以及纯培养技术,对正常醋样和污染醋样的微生物群落结构和种类进行了研究,通过对比分析以及回接实验发现了引起食醋变质的... 首次关于耐酸乳杆菌是引起食醋变质的报道,旨在为食醋生产企业进行微生物污染控制提供理论依据。采用PCRDGGE技术以及纯培养技术,对正常醋样和污染醋样的微生物群落结构和种类进行了研究,通过对比分析以及回接实验发现了引起食醋变质的污染菌为耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)。 展开更多

关键词 PCR-DGGE 纯培养技术 耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)

下载PDF 职称材料

微生物多样性的研究方法概况 被引量：7

8

作者 陈晶 《生物技术》 CAS CSCD 2005年第4期85-87,共3页

介绍了进行微生物多样性研究多种方法,将其简要划分为三大部分:1.经典纯培养技术的改进方法;2.现代分子生物学技术;3.上述两种方法的联合使用;并重点阐述了这些方法的优缺点,展望了微生物多样性研究方法的发展前景。

关键词 微生物 多样性 难培养 分子生物学方法 纯培养技术

下载PDF 职称材料

利用宏基因组技术发掘新木聚糖酶基因 被引量：2

9

作者 罗阳 何波 +1 位作者 王佳堃 刘建新 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第11期86-91,共6页

木聚糖酶将日粮中的木聚糖降解成低聚糖。低聚糖及其厌氧发酵产物、短链脂肪酸可促进消化道发育,维持消化道微生物稳态。发掘新高效的木聚糖酶一直是酶工程研究的热点。宏基因组技术为此研究提供了保障。BAC和Fosmid宏基因组文库承载的... 木聚糖酶将日粮中的木聚糖降解成低聚糖。低聚糖及其厌氧发酵产物、短链脂肪酸可促进消化道发育,维持消化道微生物稳态。发掘新高效的木聚糖酶一直是酶工程研究的热点。宏基因组技术为此研究提供了保障。BAC和Fosmid宏基因组文库承载的信息量大,但阳性克隆率低,加大了分析工作量。木聚糖酶功能域由保守区和可变区嵌合构成,这为利用功能域基因研究木聚糖酶基因的多样性及其与微生物菌群的关系提供了条件。为此,本文在总结纯培养技术优缺点的基础上,重点归纳了BAC和Fosmid宏基因组文库及木聚糖酶功能域基因文库在发掘新木聚糖酶基因的应用。 展开更多

关键词 木聚糖酶基因 宏基因组技术 纯培养技术

原文传递

环境微生物中芳环加氧酶的获取策略 被引量：2

10

作者 苟敏 唐溪 +3 位作者 孔春雷 沈娥 曲媛媛 周集体 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期880-887,共8页

芳环加氧酶可催化芳香环的羟基化反应,广泛应用于生物修复及化工合成行业.本文在综述芳环加氧酶的分类和应用的基础上,详细探讨基于纯培养技术与宏基因组技术的芳环加氧酶开发策略,并首次对这些策略进行比较和评估.利用传统的纯培养技... 芳环加氧酶可催化芳香环的羟基化反应,广泛应用于生物修复及化工合成行业.本文在综述芳环加氧酶的分类和应用的基础上,详细探讨基于纯培养技术与宏基因组技术的芳环加氧酶开发策略,并首次对这些策略进行比较和评估.利用传统的纯培养技术已经获得大量的芳环加氧酶,然而这些加氧酶种类单一,重复率高,且新颖性不足.新兴的宏基因组技术赋予了开发未培养微生物资源的新思路,但利用其获取芳环加氧酶的研究刚刚起步,存在着筛选效率低、异源表达困难等难题.本文从基因信息量、筛选通量与效率、时间与成本以及目的基因下游表达可行性等方面对这两种方法进行综合评价,并提出宏基因组技术筛选不同类型芳环加氧酶的适用方法.纯培养技术与宏基因组技术的有机结合,与蓬勃发展的各种组学技术一起,将有助于推动芳环加氧酶的理论研究及生物催化产业的快速发展. 展开更多

关键词 芳环加氧酶获取策略 纯培养技术 宏基因组技术 评价 环境微生物

原文传递

自然发酵乳制品中细菌多样性的研究进展 被引量：1

11

作者 赵飞燕 刘文俊 张和平 《内蒙古农业大学学报（自然科学版）》 CAS 2021年第6期116-120,共5页

传统发酵乳制品具有悠久的食用历史,蕴藏着异常丰富的乳酸菌菌种资源。内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室基于传统纯培养和宏基因组测序等方法,系统研究了自然发酵乳制品中细菌多样性,本文对实验室前期的研究工作进行总... 传统发酵乳制品具有悠久的食用历史,蕴藏着异常丰富的乳酸菌菌种资源。内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室基于传统纯培养和宏基因组测序等方法,系统研究了自然发酵乳制品中细菌多样性,本文对实验室前期的研究工作进行总结,探讨了不同地域不同种类自然发酵乳制品的细菌多样性。 展开更多

关键词 自然发酵乳制品 纯培养技术 宏基因组测序 细菌多样性

原文传递