为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG...为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG信号通路富集分析。结果表明:在乌苏里貉卵巢组织中共鉴定到4915种蛋白,其中372种为显著差异表达蛋白(P≤0.05,差异倍数≥1.2或≤0.83),上调307种,下调65种。差异表达蛋白主要参与了羧酸代谢过程、胞内氨基酸代谢过程、转录起始、胞内脂代谢过程、磷脂代谢过程、GTP生物合成过程、UTP生物合成过程、CTP生物合成过程等生物学过程,主要参与了组氨酸代谢、氨酰-tRNA生物合成、N-聚糖生物合成、β-丙氨酸新陈代谢、PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路等16条信号通路;有11种差异表达蛋白与卵泡发育和排卵相关。蛋白网络互作分析获得10种核心蛋白,参与了蛋白折叠和蛋白合成。说明试验筛选到的显著差异表达蛋白可能与乌苏里貉的产仔数相关。展开更多
组学技术主要包括基因组、转录组、代谢组和蛋白组,是当前挖掘和解析植物天然产物生物合成途径的重要技术手段。本文主要概述了生物合成基因簇、基因共表达、基因家族和表观共调控在植物天然产物合成途径解析中的应用,并对当前生物合成...组学技术主要包括基因组、转录组、代谢组和蛋白组,是当前挖掘和解析植物天然产物生物合成途径的重要技术手段。本文主要概述了生物合成基因簇、基因共表达、基因家族和表观共调控在植物天然产物合成途径解析中的应用,并对当前生物合成途径解析的主要进展进行了回顾,以期为植物生物合成途径挖掘和解析提供参考。Omics technologies, which mainly include genomics, transcriptomics, metabolomics, and proteomics, are important technical methods for mining and analyzing the biosynthetic pathways of natural products in plants at present. This review mainly outlines the application of biosynthetic gene clusters, gene co-expression, gene families, and epigenetic co-regulation in the analysis of plant natural product synthesis pathways, and summarize the main progress in the current analysis of biosynthetic pathways, to provide a sight for the mining and analysis of plant biosynthetic pathways.展开更多
文摘为了筛选与繁殖性能相关的显著差异表达蛋白及信号通路,试验采用TMT(tandem mass tag)标记蛋白定量技术与生物信息学分析方法,对高产(产仔数在11只以上)与低产(产仔数在7只以下)乌苏里貉卵巢组织进行差异表达蛋白筛选,GO功能注释、KEGG信号通路富集分析。结果表明:在乌苏里貉卵巢组织中共鉴定到4915种蛋白,其中372种为显著差异表达蛋白(P≤0.05,差异倍数≥1.2或≤0.83),上调307种,下调65种。差异表达蛋白主要参与了羧酸代谢过程、胞内氨基酸代谢过程、转录起始、胞内脂代谢过程、磷脂代谢过程、GTP生物合成过程、UTP生物合成过程、CTP生物合成过程等生物学过程,主要参与了组氨酸代谢、氨酰-tRNA生物合成、N-聚糖生物合成、β-丙氨酸新陈代谢、PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路等16条信号通路;有11种差异表达蛋白与卵泡发育和排卵相关。蛋白网络互作分析获得10种核心蛋白,参与了蛋白折叠和蛋白合成。说明试验筛选到的显著差异表达蛋白可能与乌苏里貉的产仔数相关。
文摘组学技术主要包括基因组、转录组、代谢组和蛋白组,是当前挖掘和解析植物天然产物生物合成途径的重要技术手段。本文主要概述了生物合成基因簇、基因共表达、基因家族和表观共调控在植物天然产物合成途径解析中的应用,并对当前生物合成途径解析的主要进展进行了回顾,以期为植物生物合成途径挖掘和解析提供参考。Omics technologies, which mainly include genomics, transcriptomics, metabolomics, and proteomics, are important technical methods for mining and analyzing the biosynthetic pathways of natural products in plants at present. This review mainly outlines the application of biosynthetic gene clusters, gene co-expression, gene families, and epigenetic co-regulation in the analysis of plant natural product synthesis pathways, and summarize the main progress in the current analysis of biosynthetic pathways, to provide a sight for the mining and analysis of plant biosynthetic pathways.
