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蚯蚓联合生防细菌Bacillus velezensis改善连作百合土壤细菌群落结构及防治枯萎病的效果
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作者 鲁耀雄 高鹏 +6 位作者 彭福元 李卫东 李静 崔新卫 黄国林 潘素君 王运生 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期147-159,共13页
【目的】从土壤理化性状和微生物群落结构及多样性角度,研究蚯蚓联合生防细菌改善百合连作障碍的机理和效果,为湖南百合产业化种植提供技术措施。【方法】采用盆栽试验方法,在湖南长沙连续种植了两季百合(Lilium lancifolium Thunb.)。... 【目的】从土壤理化性状和微生物群落结构及多样性角度,研究蚯蚓联合生防细菌改善百合连作障碍的机理和效果,为湖南百合产业化种植提供技术措施。【方法】采用盆栽试验方法,在湖南长沙连续种植了两季百合(Lilium lancifolium Thunb.)。供试土壤为红壤,生防菌为Bacillales velezensis YFB3-1菌液(菌体浓度为10^(9) CFU/mL),蚯蚓为赤子爱胜蚓(Eisenia fetida)。试验设单施菌液(T1)、只接种蚯蚓(T2)、同时使用菌液和蚯蚓(T3) 3个处理,以不使用菌剂和蚯蚓为对照(CK)。调查了两茬百合产量和枯萎病病情指数,分析了第二茬百合根际土壤理化性质、细菌群落结构和多样性,以及连作百合产量与根际土壤理化性质、细菌群落和枯萎病的相关性。【结果】与第一茬相比,同一处理的第二茬百合产量都显著下降。两年连作百合产量都以同时使用菌液和蚯蚓(T3)处理为最高,分别为16464、15674 kg/hm^(2),都显著高于同年份其他处理。两年连作百合枯萎病发病率和病情指数都以T3为最低,都显著低于同年份其他处理,T3处理百合枯萎病病情指数分别为18.15(2019年)、25.00 (2020年),并且两年的防治效果(T3)都明显优于单施菌液(T1)和接种蚯蚓(T2)。相比于对照(CK),2019、2020年T3处理百合枯萎病防治效果分别为44.55%、37.66%,分别增产15.05%、14.78%。蚯蚓联合生防菌YFB3-1增加了根际土壤Rhizobiales、Flavobacteriales、Pseudomonadales、Bacillales等有益微生物的种群丰度,蚯蚓与生防菌YFB3-1在抑制连作百合枯萎病方面具有显著的互作效应,因而缓解连作百合产量下降的效果最佳。【结论】在施用芽孢杆菌生防菌剂防治连作百合枯萎病的同时,可以增施有机肥(牛粪)来提高土壤中蚯蚓数量,有效预防百合枯萎病发生,减少连作百合产量损失。 展开更多
关键词 连作百合 蚯蚓 贝莱斯芽孢杆菌 枯萎病 土壤细菌群落结构 土壤结构
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镉污染对滨海滩涂围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响
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作者 陈海生 陈韬略 +6 位作者 蔡林生 李若华 罗文 高永胜 李振宇 裴孝钟 王雪 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期21-28,共8页
研究镉(Cd)污染对滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响,探求有益于Cd污染农田土壤修复的耐Cd细菌菌群。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd浓度分别为0,3.5,60 mg·kg^(-1)时对台州湾滩涂湿地围垦区西兰花根际土... 研究镉(Cd)污染对滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响,探求有益于Cd污染农田土壤修复的耐Cd细菌菌群。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd浓度分别为0,3.5,60 mg·kg^(-1)时对台州湾滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构和多样性指数的影响。结果表明:所有样品中检测到的细菌菌群分属于35门、97纲、205目、315科、506属。低浓度Cd污染时,西兰花根际土壤细菌Chao 1指数和Shannon指数与对照相比大幅度升高,而高浓度Cd污染时,土壤细菌Chao 1指数和Shannon均大幅度下降。随着Cd污染程度的增加,西兰花根际土壤放线菌门和浮霉菌门相对丰度呈一直下降的趋势,拟杆菌门和芽单胞菌门相对丰度呈一直升高的趋势。土壤变形菌门和髌骨菌门相对丰度呈先下降后上升的趋势,而土壤酸杆菌门、棒状杆菌门、疣微菌门、硝化螺旋菌门和厚壁菌门相对丰度呈先上升后下降的趋势。变形菌门、拟杆菌门、髌骨菌门和芽单胞菌门在高浓度Cd污染下为农田土壤细菌群落的主体。土壤罗思河小杆菌属相对丰度在低浓度Cd污染时呈下降趋势,而在高浓度Cd污染时呈升高趋势,土壤鞘氨醇单胞菌属的相对丰度在低浓度Cd污染时呈上升趋势,在高浓度Cd污染时呈下降趋势。土壤罗思河小杆菌属、马赛菌属、黄杆菌属和杜擀氏菌属可以被认为是西兰花根际土壤高抗Cd污染的细菌菌属。研究结果可为滨海滩涂地西兰花重金属污染土壤微生物修复提供依据。 展开更多
关键词 镉污染 细菌群落结构 高通量测序 西兰花
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电场耦合垂直流人工湿地对农村污水的净化效果及细菌群落结构变化特征
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作者 卢秀秀 刘云根 +5 位作者 王妍 熊烈钞 伏川东 彭丽萍 马荣 文明发 《环境科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期787-799,共13页
为进一步提高人工湿地处理农村污水效果,构建了耦合电场垂直流人工湿地系统(E-VFCW系统),以昆明市盘龙区长地梗城中村东干渠的原水为处理对象,探究其稳定性及净化效果,通过微生物群落演变特征,揭示其污染物去除的生物学化学机制.结果表... 为进一步提高人工湿地处理农村污水效果,构建了耦合电场垂直流人工湿地系统(E-VFCW系统),以昆明市盘龙区长地梗城中村东干渠的原水为处理对象,探究其稳定性及净化效果,通过微生物群落演变特征,揭示其污染物去除的生物学化学机制.结果表明:①与垂直流人工湿地系统(VFCW系统)相比,E-VFCW系统对农村污水的净化效果更高,化学需氧量(COD)、总磷(TP)、氨氮(NH_(4)^(+)-N)、总氮(TN)处理效果分别提高了7.94%、5.67%、51.14%、27.54%,其中NH_(4)^(+)-N去除率存在显著差异(P<0.05).②E-VFCW系统中,相对丰度排序前三的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria),其相对丰度之和约为80%;优势菌属包括脱氯单胞菌属(Dechloromonas)、黄杆菌属(Flavobacterium)和假单胞菌属(Pseudomonas)等.③冗余分析表明,E-VFCW系统中变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿菌门(Chlorobi)、放线菌门(Actinobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)是COD、TN、TP、NH_(4)^(+)-N净化的主要驱动因素.④秩相关分析表明,电场施加能促进E-VFCW系统中产电细菌假单胞菌(增加4.76%)、氢噬胞菌(增加2.02%)、黄杆菌(增加12.54%)等的富集和积累.研究显示,将电场与垂直流人工湿地进行耦合后,可使产电细菌相对丰度显著增加,可为农村污水治理提供理论指导和科学依据. 展开更多
关键词 农村污水 垂直流人工湿地 电场耦合 细菌群落结构 环境因子
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不同基质配比下黄瓜根际细菌群落结构及多样性分析
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作者 陈宏昊 唐小付 +4 位作者 聂圣贤 林佳佳 魏西 刘婷 任昊奎 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期641-652,共12页
分析菇渣、锯末不同比例配比下黄瓜植株根际细菌群落结构特征发现,菇渣和锯末复配基质可替代常规商品基质泥炭(CK)栽培黄瓜,为新型基质栽培模式的应用提供依据。与CK相比,用菇渣、锯末按照3种不同比例复配组成的基质栽培黄瓜,其产量、... 分析菇渣、锯末不同比例配比下黄瓜植株根际细菌群落结构特征发现,菇渣和锯末复配基质可替代常规商品基质泥炭(CK)栽培黄瓜,为新型基质栽培模式的应用提供依据。与CK相比,用菇渣、锯末按照3种不同比例复配组成的基质栽培黄瓜,其产量、根际细菌多样性和丰富度指数间均显著提高,同时还影响根际细菌的代谢功能,其中菇渣与锯末比例为1∶1时(T2)表现最佳。在门分类水平上,菇渣、锯末复配基质栽培条件下黄瓜植株根际中变形菌门(Proteobacteria)细菌丰度占比均低于CK,但拟杆菌门(Bacteroidota)细菌丰度占比均高于CK,且拟杆菌门(Bacteroidota)是菇渣、锯末复配基质栽培共有的优势细菌门类。在属分类水平上,unclassified_c__Gammaproteobacteria、利姆诺杆菌属(Limnobacter)和朱氏杆菌属(Chujaibacter)是CK条件下黄瓜植株根系特有的优势细菌属;慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、短波单胞菌属(Brevundimonas)、Dokdonella属是菇渣与锯末比例为1∶3(T1)处理下特有的优势细菌属;菇渣与锯末比例分别为1∶1(T2)和3∶1(T3)条件下黄瓜植株根际未发现特有的优势细菌属。通过物种Venn分析,在种分类水平上,菇渣与锯末复配比例在1∶3(T1)、1∶1(T2)和3∶1(T3)处理下均增加了黄瓜植株根际细菌种分类水平数量,提升了根际细菌丰富度和多样性。 展开更多
关键词 黄瓜 高通量测序 细菌群落结构 功能预测
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间作刺槐对魔芋根际细菌群落结构及软腐病发生的影响
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作者 何斐 刘欢 +5 位作者 李川 崔鸣 魏梦琳 丁龙飞 刘斌 段杉 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期755-766,共12页
为研究间作刺槐对魔芋根际细菌群落结构的影响及其与软腐病的关系,以深入理解特定作物间作模式下的根际微生态特征。本试验设置塑料膜全隔(单作)、尼龙网网隔(半间作)和无隔(间作)3种刺槐‖魔芋根系分隔处理,采用高通量测序和荧光实时定... 为研究间作刺槐对魔芋根际细菌群落结构的影响及其与软腐病的关系,以深入理解特定作物间作模式下的根际微生态特征。本试验设置塑料膜全隔(单作)、尼龙网网隔(半间作)和无隔(间作)3种刺槐‖魔芋根系分隔处理,采用高通量测序和荧光实时定量PCR(qRT-PCR)技术分析不同处理魔芋根系和根际土壤细菌多样性、群落组成和土壤氮循环相关基因表达丰度。结果表明,魔芋根系和根际土壤细菌α多样性指数均随着根系互作加强而明显提高。无隔处理根际细菌群落β多样性与全隔处理有明显差异。戴沃斯菌属(Devosia)、极地所菌属(Pricia)、藤黄单胞菌属(Luteimonas)、链霉菌属(Streptomyces)及溶杆菌属(Lysobacter)相对丰度值在所有处理根系和土壤中均较大;原小单孢菌属(Promicromonospora)相对丰度在网隔处理土壤中最高;链霉菌属、根瘤菌属(Rhizobium)和溶杆菌属相对丰度在网隔和无隔魔芋根系和土壤中较大。与全隔相比,无隔处理显著提高了土壤氮循环相关固氮酶基因(nifH)、亚硝酸还原酶基因(nirS)、氧化亚氮还原酶基因(nosZ)和氨单加氧酶基因(AOA amoA)拷贝数。无隔和网隔处理魔芋软腐病病情指数较全隔处理分别降低100.0%和50.0%~100.0%。综上,间作刺槐通过增加魔芋根际细菌多样性改变了群落结构,并增加了有益细菌丰度和氮循环相关基因拷贝数,从而降低了软腐病的发病率。本研究结果对通过间作等农业措施修复魔芋农田的土壤微生态和防控土传病害具有指导意义。 展开更多
关键词 魔芋软腐病 刺槐 间作 细菌群落结构 氮循环
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浓香大曲发酵期理化指标及细菌群落结构变化研究
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作者 何平 肖琴 +3 位作者 周瑞平 刘超 罗明有 赵金松 《酿酒科技》 2024年第1期48-53,共6页
为解析浓香大曲发酵过程中理化指标及细菌群落结构的演替规律,采用高通量测序技术对制曲各阶段的曲醅微生物信息进行了研究。结果表明:大曲刚入房时酸度最低,糖化力最高,一翻时酸度最高,糖化力最低;液化力起初为零,后逐渐上升;温度先上... 为解析浓香大曲发酵过程中理化指标及细菌群落结构的演替规律,采用高通量测序技术对制曲各阶段的曲醅微生物信息进行了研究。结果表明:大曲刚入房时酸度最低,糖化力最高,一翻时酸度最高,糖化力最低;液化力起初为零,后逐渐上升;温度先上升后缓落,顶温可达60℃;各阶段共有的核心微生物有69个属,入房时以链形植物(Streptophyta)、假单胞菌属(Pseudomonas)、魏斯氏菌属(Weissel-la)为优势菌属,出房时以链形植物(Streptophyta)、魏斯氏菌属(Weissella)、葡萄球菌属(Staphylococcus)为优势菌属。此研究揭示了浓香大曲发酵过程中理化指标与细菌群落结构的变化规律,有助于探究浓香大曲细菌多样性的形成机理,为进一步剖析浓香大曲提供数据参考。 展开更多
关键词 浓香大曲 理化指标 细菌群落结构 高通量测序
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龙脑樟根际土壤理化性质及细菌群落结构分析
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作者 郭依萍 吴和春 +5 位作者 吕强 倪旭东 庄少勇 庄少标 肖德明 文超 《轻工科技》 2024年第2期128-132,共5页
选取4处长期采收龙脑樟的林地,基于土壤成分分析与高通量测序技术,比较不同品质龙脑樟根际土壤的理化性质和细菌群落组成、分布等特点。结果表明,龙脑樟生长指标最好的林地,虽然根际土壤有机质和大量元素含量不高,但是硼、锰、铜、锌、... 选取4处长期采收龙脑樟的林地,基于土壤成分分析与高通量测序技术,比较不同品质龙脑樟根际土壤的理化性质和细菌群落组成、分布等特点。结果表明,龙脑樟生长指标最好的林地,虽然根际土壤有机质和大量元素含量不高,但是硼、锰、铜、锌、钼等微量元素含量均普遍高于其它样地,并且细菌群落丰富度和多样性指数最高,f_Koribacteracea、Candidatus_Koribacter、Candidatus_Solibacter等酸杆菌门细菌丰度最高。 展开更多
关键词 龙脑樟 根际土壤 土壤理化性质 细菌群落结构
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施用堆肥污泥对土壤细菌群落结构及朝天椒生长的影响
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作者 钟俏君 韦柳江 +2 位作者 庄炜东 杨小霞 赵志娟 《南宁师范大学学报(自然科学版)》 2024年第1期161-168,共8页
通过研究不同比例(0%、5%、10%、20%)堆肥污泥处理下土壤细菌多样性和群落结构、部分土壤理化性质以及朝天椒生长性状的变化,以期为污泥减量化、无害化和资源化利用提供理论依据。结果表明,作物种植前施用堆肥污泥提高了放线菌门(Actino... 通过研究不同比例(0%、5%、10%、20%)堆肥污泥处理下土壤细菌多样性和群落结构、部分土壤理化性质以及朝天椒生长性状的变化,以期为污泥减量化、无害化和资源化利用提供理论依据。结果表明,作物种植前施用堆肥污泥提高了放线菌门(Actinobacteriota)、厚壁菌门(Firmicutes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、糖单孢菌属(Saccharomonospora)、嗜热裂孢菌属(Thermobifida)、链霉菌属(Streptomyces)、清野氏菌属(Planifilum)、节杆菌属(Arthrobacter)和芽孢杆菌属(Bacillus)的相对丰度,降低了变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteriota)的相对丰度。相关性分析表明放线菌门、糖单孢菌属和嗜热裂孢菌属与朝天椒生长性状呈显著正相关;变形菌门和酸杆菌门与朝天椒生长性状呈显著负相关。pH、阳离子交换量和全氮与部分门水平细菌群落存在显著相关性;阳离子交换量和有机质与部分属水平细菌群落存在显著相关性。由朝天椒生长状况可知,施用比例5%、20%的堆肥污泥能显著提高朝天椒果实数量和果实重量。 展开更多
关键词 堆肥污泥 细菌多样性 细菌群落结构 土壤理化性质
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镉污染对山区水库消落带湿地土壤细菌群落结构及多样性的影响
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作者 陈海生 姜伟 +6 位作者 徐蒋来 刘守平 罗文 高永胜 蔡林生 方昉 姚金兰 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第10期2273-2280,共8页
【目的】研究镉(Cd)污染对浙江省山区水库消落带湿地土壤细菌群落结构及多样性的影响,探求有利于Cd污染湿地土壤修复的耐Cd细菌菌落。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd污染对消落带湿地建群种植物落羽杉根际土壤细菌群... 【目的】研究镉(Cd)污染对浙江省山区水库消落带湿地土壤细菌群落结构及多样性的影响,探求有利于Cd污染湿地土壤修复的耐Cd细菌菌落。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd污染对消落带湿地建群种植物落羽杉根际土壤细菌群落结构和多样性指数的影响。Cd处理浓度分别为0、100和400 mg/kg,并分别标记为Cd0、Cd100和Cd400。【结果】研究区所有土壤样品共有34门、96纲、202目、313科、502属土壤细菌。低浓度Cd污染时,消落带湿地植物落羽杉根际土壤细菌Chao1指数和Shannon指数与对照相比大幅升高,而高浓度Cd污染时,其Chao1指数和Shannon指数大幅下降。各处理特有的细菌OTUs也呈同样的趋势。不同程度Cd污染条件下,消落带湿地落羽杉根际土壤细菌群落结构在门和属水平上发生明显变化。随着Cd污染程度的加剧,消落带湿地土壤放线菌门和浮霉菌门相对丰度呈持续下降趋势,拟杆菌门和芽单胞菌门相对丰度呈持续升高趋势。土壤变形菌门和髌骨菌门相对丰度呈先下降后上升趋势,而土壤酸杆菌门、棒状杆菌门、疣微菌门、硝化螺旋菌门和厚壁菌门相对丰度呈先上升后下降趋势。变形菌门、拟杆菌门、髌骨菌门、芽单胞菌门在高浓度Cd污染下为湿地土壤细菌群落的主体。土壤罗思河小杆菌属相对丰度在低浓度Cd污染时呈下降趋势,而在高浓度Cd污染时呈升高趋势,土壤鞘氨醇单胞菌属的相对丰度在低浓度Cd污染时呈上升趋势,在高浓度Cd污染时呈下降趋势。土壤假节杆菌属、黏液杆菌属以及红假单胞菌属的相对丰度随着Cd浓度的增加一直呈下降趋势。土壤黄杆菌属的相对丰度随着Cd污染程度加剧呈持续升高趋势。【结论】在Cd400处理组中有大量的细菌罗思河小杆菌属、Gemmatimonadaceae-unclassified、马赛菌属、Candidate-Adlerbacteria-unclassified、Chitinophagaceae-unclassified、Alphaproteobacteria-unclassified、黄杆菌属、杜擀氏菌属,这些可以被认为是消落带湿地土壤高抗Cd污染的细菌菌属。研究结果可为我国南方山地水库消落带湿地采用微生物技术进行生态恢复提供依据。 展开更多
关键词 消落带湿地 细菌群落结构 高通量测序 落羽杉
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双砧木嫁接对西瓜根际土壤生物学性状及细菌群落结构的影响
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作者 郭松 于蓉 +2 位作者 董瑞 李程 田梅 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2023年第12期59-63,共5页
为提高嫁接西瓜品质及连作土传病害的抗性,揭示双砧木嫁接增强植株抗性的机制,以西瓜单砧嫁接为对照,基于高通量测序技术分析双砧嫁接、中间砧嫁接根际土壤的生物学性状及细菌群落结构特征。结果表明,与对照相比,双砧嫁接处理有助于富... 为提高嫁接西瓜品质及连作土传病害的抗性,揭示双砧木嫁接增强植株抗性的机制,以西瓜单砧嫁接为对照,基于高通量测序技术分析双砧嫁接、中间砧嫁接根际土壤的生物学性状及细菌群落结构特征。结果表明,与对照相比,双砧嫁接处理有助于富集根际土壤中碳、氮、磷3种微生物生物量;根际土壤中的放线菌数量显著提高36.64%;根际土壤β-葡糖苷酶、氨肽酶、磷酸酶活性分别显著提高9.01%、16.07%和13.14%;其拥有丰富的特有分类操作单元OTU(Operational Taxonomic Unit)数量及不同占比的共有优势细菌门属,显著提高变形菌门(Proteobacteria)、螺旋体菌门(Saccharibacteria)等的占比。双砧嫁接处理有助于提高土壤微环境中相关酶活性、微生物数量等,通过砧穗间相互调节作用缓解胁迫因子的伤害,同时增强了嫁接西瓜的抗性,为进一步利用双砧嫁接技术提供了理论依据。 展开更多
关键词 西瓜 中间砧 双砧嫁接 土壤生物学性状 细菌群落结构
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浙江省鳌江流域河岸植被缓冲带湿地土壤细菌群落结构特征分析
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作者 陈海生 陈韬略 +5 位作者 蔡林生 李振宇 陈少平 朱友聪 黄霄宇 李晨阳 《江西农业学报》 CAS 2023年第4期69-73,共5页
研究了浙江省鳌江流域河岸缓冲带湿地植物根际土壤细菌群落结构及其多样性,以当地河岸缓冲带湿地3种乡土禾本科植物荻草、牛筋草和白芧根际土壤样品中提取的总DNA为模板,运用Illumina Miseq高通量测序技术,对细菌16S rDNA基因V4+V5进行... 研究了浙江省鳌江流域河岸缓冲带湿地植物根际土壤细菌群落结构及其多样性,以当地河岸缓冲带湿地3种乡土禾本科植物荻草、牛筋草和白芧根际土壤样品中提取的总DNA为模板,运用Illumina Miseq高通量测序技术,对细菌16S rDNA基因V4+V5进行了测序和分析。结果表明,从3种植物根际土壤样品中共测得28门、87纲、168目、296科、696属土壤细菌,其中荻草根际土壤样品的Chao1指数和Shannon指数为最高,其次是白茅根际土壤样品的,牛筋草根际土壤样品的最低。各植物根际土壤细菌群落组成均以变形菌门、酸杆菌门为主,其次为相对丰度较高的放线菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门、疣微菌门。从纲水平来看,3种植物根际土壤细菌菌群均以α-变形菌纲,β-变形菌纲及γ-变形菌纲为优势菌纲,其他相对丰度较高的菌纲包括放线菌纲、δ-变形菌纲、芽孢杆菌纲、芽单胞菌纲。3种植物中,变形菌门和硝化螺旋菌门的相对丰度以荻草根际土壤样品的最高,说明荻草在缓冲带湿地脱氮除磷方面可能发挥着更重要的作用,绿弯菌门和酸杆菌门的相对丰度以牛筋草根际土壤样品的最高,说明该植物在缓冲带湿地中能起到更明显的降解河流污染物的作用。 展开更多
关键词 鳌江 河岸植被缓冲带 细菌群落结构 细菌多样性 高通量测序
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根系分泌碳输入对刺槐凋落叶细菌群落结构的影响
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作者 胡凯 王微 《土壤科学》 2023年第3期157-167,共11页
为深入理解根系分泌碳输入对凋落物分解细菌群落的调节作用,在刺槐凋落叶分解环境中添加不同浓度的模拟根系分泌物碳溶液(每g土壤添加CK 0 mg、L 0.27 mg、M 0.54 mg、H 1.08 mg碳),通过45 d的室内培养后,采用16S rRNA测序研究外源根系... 为深入理解根系分泌碳输入对凋落物分解细菌群落的调节作用,在刺槐凋落叶分解环境中添加不同浓度的模拟根系分泌物碳溶液(每g土壤添加CK 0 mg、L 0.27 mg、M 0.54 mg、H 1.08 mg碳),通过45 d的室内培养后,采用16S rRNA测序研究外源根系分泌碳对刺槐凋落叶表面细菌群落的影响。结果表明:1) 各处理间细菌群落的丰富度无差异,但中、高浓度(M和H)的分泌碳输入显著提高了其多样性。2) 变形菌门(Proteobacteria)、浮霉状菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和酸杆菌门(Acidobacteria)是刺槐凋落物的主要分解细菌类群。3) 变形菌门和放线菌门的丰度对于分泌碳输入浓度的响应特征具有低促高抑的现象;同时较高浓度的根系分泌碳输入处理(H)促进了拟杆菌门的繁殖。4) 刺槐凋落叶表面细菌功能群以化学异养和好氧化学异养为主,固氮类、碳氢化合物降解类和纤维素分解类功能基因的丰度随着输入分泌碳浓度的增加而逐步提高。研究结果有助于理解根系分泌物对凋落物降解细菌群落的影响机制,为深入揭示根系–微生物–凋落物降解互作效应提供一定理论依据。 展开更多
关键词 根系分泌碳 凋落叶 分解 细菌群落结构
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不同发酵顶温大曲中细菌群落结构的差异性分析 被引量:2
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作者 杨阳 禄凌飞 +6 位作者 刘光钱 张芮 温福丽 沈才洪 董异 王小军 王松涛 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第13期70-77,共8页
该研究以优质白酒核心产区的中温大曲及高温大曲为对象,运用高通量测序技术对不同发酵顶温大曲样品细菌群落结构进行分析与比较。结果表明,相较于顶温类型,厂家来源对大曲细菌群落结构影响较小;中温大曲与高温大曲细菌群落差异主要体现... 该研究以优质白酒核心产区的中温大曲及高温大曲为对象,运用高通量测序技术对不同发酵顶温大曲样品细菌群落结构进行分析与比较。结果表明,相较于顶温类型,厂家来源对大曲细菌群落结构影响较小;中温大曲与高温大曲细菌群落差异主要体现在物种组成上,物种数量、群落稳定性(由α-多样性指数表征)无显著性差异;以Weissella、Lactobacillus等为主的乳酸菌以及包括Kroppenstedtia、Virgibacillus、Oceanobacillus等在内的芽孢杆菌目细菌分别构成了中温大曲与高温大曲的细菌优势类群;多种芽孢杆菌与多种乳酸菌之间多呈显著负相关,同时这两大类细菌内部种群之间多呈显著正相关,这些互斥和互促关系能够对大曲菌群网络的整体稳定性产生正面影响。该研究结果进一步证实了温度这一环境因素对成品大曲菌群的重要影响,并通过Spearman相关性分析解析主要菌群互作规律,可为中、高温大曲制作工艺的改进及品质提升提供理论基础。 展开更多
关键词 大曲 温度 自然发酵 理化性质 细菌群落结构 扩增子测序 相关性分析
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烤烟全生育期覆膜栽培对植烟土壤理化性质及细菌群落结构的影响 被引量:1
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作者 郭冲 曾淑华 +6 位作者 刘雅洁 杨懿德 杨洋 鄢敏 陈佛源 韩伟 刘雷 《广东农业科学》 CAS 2023年第8期21-30,共10页
【目的】地膜覆盖会改变植烟土壤环境,进而影响土壤微生物群落结构和烤烟的生长发育,本研究旨在探究全生育期覆膜对植烟土壤理化性质和细菌群落结构的影响。【方法】应用16S rDNA测序,通过多种分析方法比较不同处理细菌群落结构的差异... 【目的】地膜覆盖会改变植烟土壤环境,进而影响土壤微生物群落结构和烤烟的生长发育,本研究旨在探究全生育期覆膜对植烟土壤理化性质和细菌群落结构的影响。【方法】应用16S rDNA测序,通过多种分析方法比较不同处理细菌群落结构的差异及多样性,并结合土壤理化性质进行冗余分析(RDA),以求明确土壤理化性质和细菌群落之间的关系。【结果】全生育期覆膜显著提高了烤烟产值量,双色(SY)、黑色(HY)、白色地膜覆盖(BY)处理产量分别较对照(CK)提高13.33%、18.24%、21.36%;产值较对照提高20.26%、15.87%、13.28%。同时,覆膜还会提高植烟土壤温度、总钾、总磷、总铁和有效铜含量,降低土壤pH值、碱解氮、有效铁、总铜和总锌含量。其中,全磷和有效铜含量增幅最为明显,分别为3.11%~27.33%和4.76%~19.05%,碱解氮、有效铁和全锌含量降幅最为显著,分别为10.45%~14.50%、3.36%~13.43%和7.69%~10.01%。全生育期覆膜对细菌群落丰度有一定抑制作用,对照的丰度指数Chao 1显著高于3个覆膜处理,且分别较白色、双色、黑色地膜覆盖处理高14.09%、24.20%、24.81%。冗余分析表明,影响细菌门水平群落结构的主要土壤理化因素是土壤温度、碱解氮、有效铁、总铁、有效铜和总铜含量。白色、双色地膜覆盖处理中存在3个共有与对照丰度明显不同的菌属,分别属于变形菌门(Proteobacteria)中的鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、伯克霍尔德菌科(Burkholderaceae)和黄单胞菌科(Xanthomonadaceae)3个科。【结论】烤烟全生育期覆膜栽培会显著影响植烟土壤理化性质和细菌群落结构,提高烤烟产值量,适宜搭配的地膜颜色为黑白双色膜。 展开更多
关键词 全生育期覆膜 植烟土壤 理化性质 细菌群落结构 产值量 冗余分析
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青藏高原东北部湖泊细菌群落结构特征季节性差异及驱动机制 被引量:2
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作者 王丹丹 黄跃飞 杨海娇 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第1期267-278,I0010-I0013,共16页
微生物是湖泊生态系统重要的有机组分。了解不同时期青藏高原湖泊细菌群落特征、环境驱动因子及其群落构建过程的差异,对高原湖泊水生态管理具有重要的指导意义。分别于2020年6和12月采集青藏高原东北部5个湖泊水样,基于高通量测序技术... 微生物是湖泊生态系统重要的有机组分。了解不同时期青藏高原湖泊细菌群落特征、环境驱动因子及其群落构建过程的差异,对高原湖泊水生态管理具有重要的指导意义。分别于2020年6和12月采集青藏高原东北部5个湖泊水样,基于高通量测序技术、统计分析和模型分析,解析高原湖泊群在非冰封期和冰封期细菌群落结构、环境驱动因子和中性过程、确定性过程以及随机性过程在细菌群落构建过程的贡献。结果表明:(1)非冰封期湖泊细菌群落的Chao1丰度指数、Simpson和Shannon多样性指数低于冰封期,Spearman相关性分析结果表明非冰封期细菌群落的Chao1丰度指数和多样性指数与水温和海拔显著相关,而冰封期细菌群落的Chao1指数和多样性指数与总氮显著相关;(2)水体细菌群落的优势门均为变形菌门(Proteobacteria),非冰封期细菌中拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)的平均相对丰度明显高于冰封期。另外,主坐标分析和相似性分析结果表明非冰封期和冰封期的细菌群落组成差异极显著;(3)冗余分析结果表明不同时期湖泊群细菌群落结构的驱动因子不同,非冰封期环境因子影响的大小顺序为:总氮>纬度>总溶解固体>经度>溶解有机碳,冰封期为:海拔>溶解氧>溶解有机碳>pH;(4)Sloan中性模型计算结果表明冰封期高原湖泊细菌群落比非冰封期更易受到中性过程的驱动,并且冰封期细菌群落的迁移率也大于非冰封期(冰封期:0.289;非冰封期:0.130),反映冰封期细菌菌群扩散能力较强。随机性的扩散限制过程是非冰封期(贡献率=54.74%)和冰封期(贡献率=55.56%)湖泊细菌群落的主要构建过程。本文解析了不同时期高原湖泊细菌群落特征及其驱动机制,为高原湖泊水资源保护和管理以及深入理解细菌群落构建过程提供了基础。 展开更多
关键词 青藏高原 湖泊 细菌群落结构 驱动因子 中性模型 零模型
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福建三沙湾海域细菌群落结构及其形成机制 被引量:1
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作者 王飞鹏 杨靖煜 +6 位作者 蔡尊栋 陈锦源 田淼 王路 李荣茂 刘炜 穆景利 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期84-96,共13页
细菌群落在水生生态系统中起着非常关键的作用。基于DNA和RNA高通量测序技术研究了福建三沙湾海域细菌的群落结构及其形成机制。结果发现:(1)三沙湾海域中共检测到细菌1476个操作分类单元(OTUs),其中γ-变形菌、α-变形菌、蓝细菌和拟... 细菌群落在水生生态系统中起着非常关键的作用。基于DNA和RNA高通量测序技术研究了福建三沙湾海域细菌的群落结构及其形成机制。结果发现:(1)三沙湾海域中共检测到细菌1476个操作分类单元(OTUs),其中γ-变形菌、α-变形菌、蓝细菌和拟杆菌为多样性最高的类群;(2)基于DNA和RNA高通量测序技术均发现这4种类群同时也是该海域细菌群落中的优势类群,但其代谢活性处于不同的状态,主要受到盐度、总氮、亚硝氮和无机磷酸盐浓度的调控;(3)三沙湾细菌群落结构在空间尺度上的分布存在差异,表现为地理位置上越相近的海区其细菌群落结构越相似。中性模型进一步分析发现,三沙湾海域细菌群落的形成主要受到中性过程的调控。本研究结果可为深入理解福建三沙湾海域中细菌群落结构及其形成机制提供理论依据。 展开更多
关键词 细菌群落结构 高通量测序 代谢活性 群落形成机制 三沙湾
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哈茨木霉配施高碳基肥对植烟土壤理化性质和细菌群落结构的影响
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作者 任志超 穆耀辉 +5 位作者 匡志豪 李淑娥 张永峰 任天宝 殷全玉 刘国顺 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第8期223-231,共9页
探究哈茨木霉配施高碳基肥对根际土壤细菌群落结构及理化性质的影响,为调控烟草微环境及改善土壤提供理论依据。采用大田试验方法,设置4个处理:T1(哈茨木霉菌剂750 kg/hm2+常规施肥)、T2(高碳基肥750 kg/hm^(2)+常规施肥)、T3(哈茨木霉... 探究哈茨木霉配施高碳基肥对根际土壤细菌群落结构及理化性质的影响,为调控烟草微环境及改善土壤提供理论依据。采用大田试验方法,设置4个处理:T1(哈茨木霉菌剂750 kg/hm2+常规施肥)、T2(高碳基肥750 kg/hm^(2)+常规施肥)、T3(哈茨木霉菌剂750 kg/hm2+高碳基肥750 kg/hm^(2)+常规施肥)和CK(常规施肥),通过高通量测序技术探究哈茨木霉配施高碳基肥对根际土的细菌群落结构和土壤理化性质的影响。结果表明:(1)不同施肥处理改善根际土壤理化性质的效果总体表现为T3处理>T1处理>T2处理,T3处理显著提高了土壤的pH值、全氮含量、全碳含量、硝态氮含量、铵态氮含量、速效磷含量和速效钾含量(P<0.05),增幅分别为7.63%、41.67%、20.80%、63.70%、28.98%、15.07%和9.51%;(2)烤烟根际土细菌群落结构α多样性指数在哈茨木霉菌剂和高碳基肥间存在显著互作效应,哈茨木霉菌剂处理的根际土细菌多样性指数相对较低,而CK较高且与T2处理和T3处理差异不显著;(3)LefSe分析结果表明,不同施肥处理的根际土关键微生物类群存在明显差异,且对不同施肥处理的响应也存在差异;(4)β多样性分析结果表明,3个施肥处理的根际土细菌群落结构与对照组土壤呈现明显的分离效应,高碳基肥处理的响应模式与T3处理相似,但响应程度不及后者。说明哈茨木霉菌剂和高碳基肥间存在显著互作效应。在生产中,可利用哈茨木霉配施高碳基肥改良土壤和烟草微生态环境。 展开更多
关键词 哈茨木霉 高碳基肥料 植烟土壤 理化性质 细菌群落结构
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浓香型白酒窖池中细菌群落结构的研究 被引量:6
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作者 翟磊 刘瑞娜 +5 位作者 张京涛 郑佳 奚文韬 张天圆 赵东 姚粟 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第13期78-84,共7页
为探究浓香型白酒窖池中细菌群落结构和多样性变化,采用HiSeq高通量测序技术,对6个窖池样品中的细菌16S rRNA基因V3~V4区进行测序分析,比较了窖泥和酒醅中的细菌物种组成和丰度,解析了窖泥和酒醅中共有的细菌物种和关键差异物种,探究了... 为探究浓香型白酒窖池中细菌群落结构和多样性变化,采用HiSeq高通量测序技术,对6个窖池样品中的细菌16S rRNA基因V3~V4区进行测序分析,比较了窖泥和酒醅中的细菌物种组成和丰度,解析了窖泥和酒醅中共有的细菌物种和关键差异物种,探究了浓香型白酒窖池中潜在的关键细菌菌种。研究结果表明,3个窖泥样品共注释到1009个OTUs,主要分布于厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidete),其中厚壁菌门菌株的丰度超过了60%;3个酒醅样品共注释518个OTUs,主要分布于厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。窖泥样品中的细菌物种总数和多样性均高于酒醅样品,窖泥样品中关键的细菌菌种主要来自梭菌属(Clostridium IV)、岩石单胞菌属(Petrimonas)、沉积物棒菌属(Sedimentibacter)、嗜蛋白菌属(Proteiniphilum)和喜热菌属(Caloramator);酒醅样品中关键的细菌菌种主要来自乳杆菌属(Lactobacillus)、丙酸杆菌属(Propionibacterium)、梭菌属(Clostridium sensu stricto)和埃希氏菌属(Escherichia)。该研究为浓香型白酒窖池中特征性菌种的定向筛选和微生物可培养组的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 浓香型白酒 窖泥 酒醅 细菌群落结构
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福建典型茶园土壤养分及其计量比对细菌群落结构的影响
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作者 杨发峻 王维奇 +6 位作者 吴梓炜 许宏达 葛茂泉 林少颖 李先德 张永勋 吴传惠 《水土保持学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期209-218,共10页
为研究茶园土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)、钾(K)含量及其生态化学计量比对土壤微生物群落结构的影响,以福建省福鼎市茶叶主产地茶园为研究对象,系统测定和分析土壤养分与计量比,分析其对细菌群落特征的影响。结果表明:(1)茶园土壤C、N、P、... 为研究茶园土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)、钾(K)含量及其生态化学计量比对土壤微生物群落结构的影响,以福建省福鼎市茶叶主产地茶园为研究对象,系统测定和分析土壤养分与计量比,分析其对细菌群落特征的影响。结果表明:(1)茶园土壤C、N、P、K含量均值分别为18.39,1.96,0.91,15.57 g/kg,土壤C∶N、C∶P、C∶K、N∶P、N∶K、P∶K均值分别为9.24,30.96,1.24,3.32,0.13,22.39;(2)土壤中的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Actinobacteria)、放线菌门(Acidobacteria);优势菌属为Paludibaculum、分枝杆菌属(Mycobacterium)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),不同茶园土壤中细菌群落组成及结构相似,但细菌多样性指数差异显著(p<0.05);(3)属水平上茶园土壤细菌与养分及其计量比的相关性分析结果显示,K与热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio)、盖氏菌属(Gaiella)呈显著正相关(p<0.01),P与梭菌属(Clostridium)、罗思河小杆菌属(Rhodanobacter)、地杆菌属(Geobacter)呈显著正相关(p<0.01),而N与假单胞菌属(Pseudomonas)呈显著负相关(p<0.01),K与北孢里菌属(Kitasatospora)、苯基杆菌属(Phenylobacterium)呈显著负相关(p<0.01);土壤C∶N、C∶P、N∶P、P∶K与西索恩氏菌属(Chthoniobacter)、网团菌属(Dictyobacter)、伯克霍尔德菌属(Paraburkholderia)、芽孢杆菌属(Bacillus)呈显著正相关(p<0.05),与慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、Vicinamibacter、盖氏菌属(Gaiella)、假单胞菌属(Pseudomonas)等呈显著负相关(p<0.001);(4)功能预测结果显示,茶园细菌的预测功能中以代谢活动为主的功能居多,对茶园土壤养分循环以及通过代谢活动提高土壤固碳效率有着积极作用。研究结果对基于养分管理的茶园土壤微生物多样性功能研究具有指导意义。 展开更多
关键词 生态化学计量比 细菌群落结构 PICRUSt功能预测 茶园 福鼎市
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深旋耕配施有机肥对盐碱地玉米根际土壤细菌群落结构及其功能的影响
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作者 麻仲花 刘吉利 +3 位作者 吴娜 杨永森 胡永琪 者永清 《中国农业气象》 CSCD 北大核心 2023年第6期479-491,共13页
采用16SrRNA基因高通量测序技术,分析不同耕作方式(A1传统翻耕、A2深旋耕)和有机肥水平(B1:0kg·hm^(-2)、B2:7500kg·hm^(-2)、B3:15000kg·hm^(-2)、B4:22500kg·hm^(-2))对玉米根际盐碱土壤细菌群落结构的影响,并对... 采用16SrRNA基因高通量测序技术,分析不同耕作方式(A1传统翻耕、A2深旋耕)和有机肥水平(B1:0kg·hm^(-2)、B2:7500kg·hm^(-2)、B3:15000kg·hm^(-2)、B4:22500kg·hm^(-2))对玉米根际盐碱土壤细菌群落结构的影响,并对其功能进行预测分析。结果表明:(1)深旋耕和增施有机肥两因素交互效应显著提高了土壤Observed指数、Chao1指数、ACE指数及香浓指数(P<0.05)。(2)玉米根际细菌群落主要由变形菌门(37.4%~54.4%)、酸杆菌门(8.6%~12.9%)、放线菌门(5.2%~13.3%)等31个门及497个属的细菌组成,细菌群落分析表明不同耕作方式间细菌群落结构较为相似,各有机肥施用水平间丰度表现出差异性。(3)相关分析表明,土壤pH值与ACE指数、Observed指数及Chao1指数呈极显著负相关(r=-0.56,P=0.004);蔗糖酶(IA)活性与ACE指数、Observed指数及Chao1指数呈显著正相关(r=0.52,P=0.01)。冗余分析发现,碱解氮、有效磷、速效钾、有机质、碱性磷酸酶、蔗糖酶及pH值是影响玉米农田土壤细菌群落结构的关键环境因子。(4)深旋耕配施有机肥明显提高了碳水化合物代谢、氨基酸代谢、其他氨基酸代谢、聚糖生物合成与代谢、辅助因子和维生素的代谢等玉米农田根际土壤细菌信号转导功能基因丰度,以A2B3处理下土壤细菌各功能基因丰度均最高。本研究中,深翻耕和有机肥施用量为15000kg·hm^(-2)处理,对改善玉米农田的细菌多样性和功能最有利。 展开更多
关键词 深旋耕 有机肥 盐碱地 细菌群落结构 玉米
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