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特发性肺纤维化肺内相关共病异病同证基因组生物信息学分析
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作者 刘勇明 吕晓东 +6 位作者 庞立健 臧凝子 梁元钰 王靖宇 王佳然 邹吉宇 盛野 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2024年第12期20-26,共7页
目的通过基因组生物信息学分析探讨特发性肺纤维化(IPF)肺内相关共病(肺动脉高压、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、慢性阻塞性肺疾病、肺癌)异病同证生物学基础。方法下载GSE110147、GSE113439、GSE135917、GSE106986和GSE118370数据集,筛... 目的通过基因组生物信息学分析探讨特发性肺纤维化(IPF)肺内相关共病(肺动脉高压、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、慢性阻塞性肺疾病、肺癌)异病同证生物学基础。方法下载GSE110147、GSE113439、GSE135917、GSE106986和GSE118370数据集,筛选各病例组与对照组的差异基因,运用Cytoscape3.10.0软件进行拓扑分析以筛选核心基因,运用OmicShare平台对核心基因进行GO和KEGG通路富集分析。结果共筛选出IPF肺内相关共病核心基因23个。GO富集分析显示,核心基因生物过程主要富集于细胞进程、代谢进程、生物调控/生物进程调控、发育进程、底物定位进程、刺激反应、免疫系统进程、信号转导,细胞组分主要富集于细胞解剖实体、含蛋白复合物,分子功能主要富集于结合途径、酶催化活性、结构分子活性、分子适配器活性、分子功能调节因子、转录调控因子活性;KEGG通路富集分析显示,核心基因主要富集于真核生物核糖体的生物合成、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、Th17细胞分化、JAK-STAT信号通路、RNA聚合酶、中性粒细胞胞外诱捕网形成等信号通路。结论运用基因组生物信息学分析探讨IPF肺内相关共病核心基因及信号通路,可在一定程度上揭示IPF肺内相关共病异病同证作用机制。 展开更多
关键词 特发性肺纤维化 肺内相关共病 异病同证 基因组学 生物信息学
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