目的:基于网络药理学方法探讨巴元明治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)核心药物的作用机制。方法:通过中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMI...目的:基于网络药理学方法探讨巴元明治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)核心药物的作用机制。方法:通过中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)V2.0数据库检索巴元明治疗CRF核心药物(黄芪、党参、生地黄、山药、山茱萸、茯苓、白茅根、茜草、金樱子、芡实、黄柏、穿山龙)的化学成分,进而筛选核心药物的作用靶点。从TCMIP V2.0数据库获取CRF疾病靶点,将核心药物作用靶点与CRF疾病靶点进行匹配,所得靶点即为核心靶点。通过TCMIP V2.0数据库构建核心药物作用靶点与CRF疾病靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,计算网络拓扑特征值从而筛选关键靶点。构建“核心药物-活性成分-关键靶点”的多维关系网络,采用David v 6.7数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:12个核心药物含有356个活性成分,CRF相关疾病靶点13个;将核心药物作用靶点与CRF疾病靶点进行匹配,得到136个核心靶点;经过拓扑分析筛选得到62个关键靶点,包括腺苷酸环化酶1、多巴胺D2受体、蛋白激酶B1等;GO分析共获得170个功能(P<0.01),包括信号转导、凋亡过程负调控、细胞色素C氧化酶活性等;KEGG分析共获得105条通路(P<0.05),包括神经活性配体-受体相互作用、近端小管对钠离子的重吸收、代谢通路、Ras信号通路等。结论:巴元明治疗CRF的核心药物具有多成分、多靶点、多途径的作用特点,其可作用于腺苷酸环化酶1、多巴胺D2受体、热休克蛋白αA1等靶点,调控近端小管对钠离子的重吸收、代谢通路、Ras信号通路等通路。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨巴元明治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)核心药物的作用机制。方法:通过中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)V2.0数据库检索巴元明治疗CRF核心药物(黄芪、党参、生地黄、山药、山茱萸、茯苓、白茅根、茜草、金樱子、芡实、黄柏、穿山龙)的化学成分,进而筛选核心药物的作用靶点。从TCMIP V2.0数据库获取CRF疾病靶点,将核心药物作用靶点与CRF疾病靶点进行匹配,所得靶点即为核心靶点。通过TCMIP V2.0数据库构建核心药物作用靶点与CRF疾病靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,计算网络拓扑特征值从而筛选关键靶点。构建“核心药物-活性成分-关键靶点”的多维关系网络,采用David v 6.7数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:12个核心药物含有356个活性成分,CRF相关疾病靶点13个;将核心药物作用靶点与CRF疾病靶点进行匹配,得到136个核心靶点;经过拓扑分析筛选得到62个关键靶点,包括腺苷酸环化酶1、多巴胺D2受体、蛋白激酶B1等;GO分析共获得170个功能(P<0.01),包括信号转导、凋亡过程负调控、细胞色素C氧化酶活性等;KEGG分析共获得105条通路(P<0.05),包括神经活性配体-受体相互作用、近端小管对钠离子的重吸收、代谢通路、Ras信号通路等。结论:巴元明治疗CRF的核心药物具有多成分、多靶点、多途径的作用特点,其可作用于腺苷酸环化酶1、多巴胺D2受体、热休克蛋白αA1等靶点,调控近端小管对钠离子的重吸收、代谢通路、Ras信号通路等通路。
