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小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析
被引量:
1
1
作者
邢鲲
康晨
+1 位作者
赵晓军
赵飞
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期142-154,共13页
为了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系。本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12种长...
为了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系。本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组核苷酸序列的系统发育树。小长蝽线粒体基因组全长为16 330 bp(GenBank登录号:MW465654),基因组包括13个蛋白编码基因(PCGs),22个tRNA基因,2个rRNA基因和1段非编码控制区。11个蛋白质编码基因的起始密码子为典型的ATN;cox1,nad4l的起始密码子为TTG。cob的终止密码子为TAG,其余蛋白编码基因的终止密码子为TAA。只有trnS1缺少DHU臂,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组序列构建的昆虫系统发育树结果显示,小长蝽与Nysius plebeius具有更近的亲缘关系,且与传统形态学分类基本一致。小长蝽线粒体基因组符合长蝽总科线粒体基因组的一般特征。结果表明小长蝽与N.plebeius的亲缘关系更近。
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关键词
小长
蝽
半翅目
背孔长蝽亚科
线粒体基因组
系统发育
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职称材料
题名
小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析
被引量:
1
1
作者
邢鲲
康晨
赵晓军
赵飞
机构
山西农业大学植物保护学院
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023年第1期142-154,共13页
基金
山西省现代农业产业技术体系建设项目上(2022-03)
山西省重点研发计划(201903D221014)
+2 种基金
山西省农业科学院农业科技创新研究课题(YCX2018D2T02)
山西省现代农业(杂粮)产业技术体系建设专项资金资助(2022-03)
有机旱作农业标准创建项目(BZ0103)。
文摘
为了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系。本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组核苷酸序列的系统发育树。小长蝽线粒体基因组全长为16 330 bp(GenBank登录号:MW465654),基因组包括13个蛋白编码基因(PCGs),22个tRNA基因,2个rRNA基因和1段非编码控制区。11个蛋白质编码基因的起始密码子为典型的ATN;cox1,nad4l的起始密码子为TTG。cob的终止密码子为TAG,其余蛋白编码基因的终止密码子为TAA。只有trnS1缺少DHU臂,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组序列构建的昆虫系统发育树结果显示,小长蝽与Nysius plebeius具有更近的亲缘关系,且与传统形态学分类基本一致。小长蝽线粒体基因组符合长蝽总科线粒体基因组的一般特征。结果表明小长蝽与N.plebeius的亲缘关系更近。
关键词
小长
蝽
半翅目
背孔长蝽亚科
线粒体基因组
系统发育
Keywords
Nysius ericae
Hemiptera
Orsillinae
mitochondrial genome
phylogeny
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析
邢鲲
康晨
赵晓军
赵飞
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2023
1
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