目的探究着丝粒蛋白F(centromere protein F,CENPF)在胰腺导管腺癌(pancreatic ductual adenocarcinoma,PDAC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法基于美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,N...目的探究着丝粒蛋白F(centromere protein F,CENPF)在胰腺导管腺癌(pancreatic ductual adenocarcinoma,PDAC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法基于美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的微阵列/基因谱公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),运用GEO2R、维恩、Cytoscape及GEPIA软件筛选出PDAC中可疑差异基因CENPF;基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)及基因组织表达数据库(The Genotype-Tissue Expression,GTEx),通过NCBI网络、GEPIA、Ualcan、Oncomine、TIMER软件及Kaplan-Meier在线生存分析工具,从信使核糖核酸(messenger RNA)层面分析其表达与免疫细胞浸润的关系及其可能的分子机制。同时收集2007~2021年间经福建医科大学附属第一医院病理科确诊的胰腺导管腺癌手术标本121例,从组织蛋白层面分析CENPF与PDAC临床病理特征及预后的关系。结果CENPF基因在人类多种癌症中表达异常,在PDAC中,癌组织中的表达水平显著高于癌旁正常胰腺组织(P<0.05),并且与PDAC组织学分级(P<0.05)、预后(P=0.0038)有关。免疫组化显示CENPF的表达与PDAC的神经侵犯(P=0.036)、TNM分期(P=0.041)、淋巴结转移(P=0.023)、分化程度(P=0.020)、总生存期有关(Log-rank=18.608,P=0.000016),CENPF高表达(HR=2.654,95%CI=1.373~5.131,P=0.004)是PDAC患者预后差的独立危险因素。CENPF联合其他关键模块基因在PDAC中,主要富集于外泌体、细胞外基质等,并与丝氨酸内肽酶活性、金属肽链内切酶活性有关等。CENPF在胰腺导管腺癌中的作用通路主要与细胞周期、P53通路、泛素介导的蛋白水解等相关,并与P53、MDM2在PDAC中联合发挥作用。免疫浸润研究表明CENPF表达与CD4+T淋巴细胞浸润负相关、与树突细胞的浸润正相关(均P<0.05)。结论CENPF可能参与PDAC疾病的进程,其高表达与PDAC预后不良相关,该研究有望为胰腺导管腺癌的防治提供更多科学基础。展开更多
文摘目的联合常规MRI及表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)图的影像组学特征构建多参数MRI影像组学模型术前预测胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)淋巴结转移(lymph node metastasis,LNM),并与建立的常规MRI影像组学模型和临床模型比较预测效能,探索基于ADC图影像组学的附加价值。材料与方法218例PDAC按照7∶3的比例随机分为训练集和验证集。纳入临床及常规影像特征构建临床影像学模型。提取常规MRI图像(T1WI、T2WI、动脉期图像及门静脉期图像)及ADC图的影像组学特征。在训练集中采用最小绝对收缩和选择算子筛选出与LNM最相关的特征用于模型构建。构建基于常规MRI影像组学模型(影像组学模型1)和联合常规MRI和ADC图的影像组学模型(影像组学模型2)。使用受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)评估模型预测效能。采用DeLong检验比较模型间的AUC值的差异是否有统计学意义。校准曲线评估模型的准确性。决策曲线分析评估模型的临床价值。结果临床影像学模型、影像组学模型1、影像组学模型2术前预测LNM的AUC值在训练集和验证集中分别是0.741和0.674、0.818和0.702、0.854和0.839。影像组学模型2术前预测LNM的AUC值高于临床影像学模型(训练集P=0.009,验证集P=0.023)及影像组学模型1(训练集P=0.044,验证集P=0.041),差异均具有统计学意义。影像组学模型1的预测效能与临床影像学模型相比,差异不具有统计学意义(训练集P=0.095,验证集P=0.759)。三个模型的校准曲线均显示预测值与实际值具有较好的一致性。决策曲线显示影像组学模型2比影像组学模型1和临床影像学模型具有更高的净效益。结论联合常规MRI及ADC图构建的多参数MRI影像组学模型具有术前预测PDAC患者LNM的潜能,且其效能优于常规MRI影像组学模型及临床影像学模型。
文摘目的探究着丝粒蛋白F(centromere protein F,CENPF)在胰腺导管腺癌(pancreatic ductual adenocarcinoma,PDAC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法基于美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的微阵列/基因谱公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO),运用GEO2R、维恩、Cytoscape及GEPIA软件筛选出PDAC中可疑差异基因CENPF;基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)及基因组织表达数据库(The Genotype-Tissue Expression,GTEx),通过NCBI网络、GEPIA、Ualcan、Oncomine、TIMER软件及Kaplan-Meier在线生存分析工具,从信使核糖核酸(messenger RNA)层面分析其表达与免疫细胞浸润的关系及其可能的分子机制。同时收集2007~2021年间经福建医科大学附属第一医院病理科确诊的胰腺导管腺癌手术标本121例,从组织蛋白层面分析CENPF与PDAC临床病理特征及预后的关系。结果CENPF基因在人类多种癌症中表达异常,在PDAC中,癌组织中的表达水平显著高于癌旁正常胰腺组织(P<0.05),并且与PDAC组织学分级(P<0.05)、预后(P=0.0038)有关。免疫组化显示CENPF的表达与PDAC的神经侵犯(P=0.036)、TNM分期(P=0.041)、淋巴结转移(P=0.023)、分化程度(P=0.020)、总生存期有关(Log-rank=18.608,P=0.000016),CENPF高表达(HR=2.654,95%CI=1.373~5.131,P=0.004)是PDAC患者预后差的独立危险因素。CENPF联合其他关键模块基因在PDAC中,主要富集于外泌体、细胞外基质等,并与丝氨酸内肽酶活性、金属肽链内切酶活性有关等。CENPF在胰腺导管腺癌中的作用通路主要与细胞周期、P53通路、泛素介导的蛋白水解等相关,并与P53、MDM2在PDAC中联合发挥作用。免疫浸润研究表明CENPF表达与CD4+T淋巴细胞浸润负相关、与树突细胞的浸润正相关(均P<0.05)。结论CENPF可能参与PDAC疾病的进程,其高表达与PDAC预后不良相关,该研究有望为胰腺导管腺癌的防治提供更多科学基础。
