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染色体微阵列芯片分析技术应用于产前诊断的关键问题探讨 被引量:16
1
作者 安宇 吴柏林 《国际生殖健康/计划生育杂志》 CAS 2014年第3期157-161,210,共6页
染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和... 染色体微阵列芯片分析(CMA)包括比较基因组杂交微阵列(array CGH)和单核苷酸多态微阵列(SNP array),可以在全基因组范围内高分辨检测染色体的微缺失和微重复,与传统染色体核型分析和荧光原位杂交(FISH)检测相比,具有高通量、高分辨率和高自动化检测的优势,同时可以一次性同步检测许多与出生缺陷和先天性疾病相关的基因组异常,近年来已经开始应用于侵入性产前诊断。回顾近年来多个大样本和多中心的临床试验对CMA技术用于产前诊断的研究结果,借鉴美国妇产科医师协会(ACOG)和母婴医学协会(SMFM)发布的CMA在产前诊断应用中的建议,对CMA在应用过程中如何选择微阵列芯片类型、检测的适用对象和检测的时期、检测结果的解释以及相关的遗传咨询等关键问题进行了详细讨论,并指出CMA在产前诊断应用中面临的机遇和挑战,以及检测前和检测后遗传咨询在实际应用中的重要性和必要性。 展开更多
关键词 芯片分析技术 微阵列分析 生殖技术 辅助 基因组 杂交 遗传 产前诊断 微缺失微重复综合征
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液相芯片分析技术检测乳腺浸润性导管癌患者血清中VEGF和MMP-9的临床意义
2
作者 张君莹 吴建中 +7 位作者 季明华 张烨 尹丽 徐涛 罗舟 马蓉 曹海霞 唐金海 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2014年第2期93-96,共4页
目的利用液相芯片分析技术检测血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)在乳腺浸润性导管癌(infiltrative ductal carcinoma,IDC)、良性乳腺纤维瘤患者和正常... 目的利用液相芯片分析技术检测血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)在乳腺浸润性导管癌(infiltrative ductal carcinoma,IDC)、良性乳腺纤维瘤患者和正常人血清中的表达,探讨其临床诊断价值。方法采用液相芯片分析技术对301例乳腺浸润性导管癌、83例乳腺良性纤维瘤患者及40例正常人血清中VEGF、MMP-9表达水平进行检测,并分析118例IDC患者手术治疗前后VEGF和MMP-9浓度变化。结果血清中VEGF和MMP-9的表达水平:乳腺浸润性导管癌患者分别为(152.76±150.28)pg/ml和(945.09±749.43)ng/ml;乳腺纤维瘤患者为(29.86±16.10)pg/ml和(563.59±183.29)ng/ml;正常人表达量为(52.45±51.39)pg/ml和(267.33±215.60)ng/ml;IDC患者显著高于乳腺纤维瘤患者和正常人(均P<0.05)。乳腺癌患者血清中VEGF、MMP-9表达水平与年龄无关(P>0.05);而与临床分期、原发灶大小及淋巴结转移相关(均P<0.01)。118例IDC患者术后复查血清VEGF、MMP-9表达量分别(135.26±131.20)pg/ml和(680.36±551.77)ng/ml,与术前相比,表达水平明显下降(均P<0.05)。结论利用液相芯片分析技术定量分析血清中VEGF和MMP-9可成为乳腺癌临床诊断和预后评估的有效指标。 展开更多
关键词 乳腺浸润性导管癌 液相芯片分析技术 血管内皮生长因子 基质金属蛋白酶9
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染色体微阵列芯片分析技术在精神运动发育迟缓患儿中的应用价值 被引量:2
3
作者 谢巧玲 叶燕霞 +3 位作者 李艳霞 梁福(钅监) 杨均秀 辛晶 《中国中西医结合儿科学》 2019年第5期387-391,共5页
目的应用染色体微阵列芯片分析技术对150例不明原因的精神运动发育迟缓患儿进行拷贝数变异(CNV)检测,探讨其基因遗传病因。方法 收集2015年1月至2019年6月我科精神运动发育迟缓患儿150例,采用Affymetrix CytoScan 750K芯片进行基因组学... 目的应用染色体微阵列芯片分析技术对150例不明原因的精神运动发育迟缓患儿进行拷贝数变异(CNV)检测,探讨其基因遗传病因。方法 收集2015年1月至2019年6月我科精神运动发育迟缓患儿150例,采用Affymetrix CytoScan 750K芯片进行基因组学分析。结果 25例患儿携带与MR/DD相关的CNVs,检出率达16.7%(25/150)。其中10例为已知综合征患者,微缺失2例,大片段缺失1例,临床致病性拷贝数改变7例,临床意义不明5例。结论 染色体微阵列芯片分析技术可以提高对不明原因精神运动发育迟缓患儿的分子病因诊断水平,对深入研究病因机制有重要意义,为患儿预后、康复决策制定、家庭再发风险评估提供指导。 展开更多
关键词 精神运动发育迟缓 染色体异常 染色体微阵列芯片分析技术 儿童
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一种简易的用于检测细胞凋亡的微流控芯片分析技术 被引量:4
4
作者 李远 肖文海 +2 位作者 廖娟 刘严 米永华 《军事医学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期430-436,共7页
目的针对微流控芯片的加工、细胞培养及细胞响应分析发展一套易于被普通生物学实验室实施的微流控芯片细胞分析技术,以天然抗癌药物重楼皂苷Ⅰ促人肺癌细胞A549凋亡作用分析对该技术进行验证。方法微流控芯片加工采用了基于感光干膜的... 目的针对微流控芯片的加工、细胞培养及细胞响应分析发展一套易于被普通生物学实验室实施的微流控芯片细胞分析技术,以天然抗癌药物重楼皂苷Ⅰ促人肺癌细胞A549凋亡作用分析对该技术进行验证。方法微流控芯片加工采用了基于感光干膜的软光刻工艺;微流控芯片结构设计为储液池加直微通道,通过ANSYS软件对芯片的流体动力学行为进行分析;细胞培养采用间歇式细胞动态培养技术;重楼皂苷Ⅰ对A549细胞的促凋亡作用通过细胞形态学改变、活/死细胞荧光染色及乳酸脱氢酶(LDH)释放进行定性和定量分析。结果感光干膜软刻工艺加工微流控芯片简单易行;储液池加微通道结构的微流控芯片适合各类贴壁细胞培养;形态学和荧光染色实验提示重楼皂苷Ⅰ具有促A549细胞凋亡作用,且促凋亡效率与浓度呈正比关系;微流控芯片上LDH释放定量分析结果与传统96孔板实验结果吻合。结论该文展示的技术操作简单、低试剂消耗,能实现定性和定量分析相结合,可在无相关微流控技术经验的生物医学实验室中推广使用。 展开更多
关键词 微流控芯片 软刻工艺 感光干膜 细胞培养 细胞凋亡 重楼皂苷Ⅰ 芯片分析技术
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基于微流控芯片的细胞-细菌相互作用光电检测技术
5
作者 谭浩兰 何红 +2 位作者 龚丽 葛闯 徐溢 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1308-1318,共11页
细胞/细菌及其相互作用研究对于生命科学、药物研发、医学诊疗等领域的研究具有重要意义。微流控芯片分析技术因微环境可控、生物相容性好、检测并行性、微型化等特性,正发展成为细胞/细菌及其相互作用研究的高效手段。本文在简要介绍... 细胞/细菌及其相互作用研究对于生命科学、药物研发、医学诊疗等领域的研究具有重要意义。微流控芯片分析技术因微环境可控、生物相容性好、检测并行性、微型化等特性,正发展成为细胞/细菌及其相互作用研究的高效手段。本文在简要介绍基于微流控芯片分析技术的细胞-细菌分析方法和技术基础之上,对微流控芯片上细胞-细菌相互作用模型的建立进行了讨论,重点针对细胞-细菌及其相互作用过程的芯片检测进行了综述,尤其对芯片集成的光电检测技术及其测试效果进行总结和比较。通过芯片集成微流体控制、多种光电传感监测模块,使微流控芯片分析技术成为细胞/细菌及其相互作用过程分析和检测的支撑平台和优势手段。最后,对微流控光电检测技术在细胞-细菌相互作用检测中面临的挑战及发展趋势进行了讨论和展望。 展开更多
关键词 细胞-细菌相互作用 细胞-细菌共培养 微流控芯片分析技术 光学检测法 电化学检测法
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基因芯片技术分析斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制 被引量:18
6
作者 胡和平 张俊平 +4 位作者 应康 肖振宇 吴红梅 毛裕民 吴孟超 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期645-649,共5页
目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、D... 目的 :研究抗癌药斑蝥素对肝癌细胞细胞毒作用的分子机制。方法 :应用基因芯片技术检测 12 .5 μmol/ L 斑蝥素作用于肝癌 QGY770 3细胞 2 4 h后基因表达谱的变化。结果 :斑蝥素抑制细胞表达参与细胞周期进程基因 (如 p 2 7、ref - 1、DN Apolymerase delta、X RCC9等 )、能量代谢基因 (如 malate dehydrogenase、ADP/ ATP translocase等 )、致瘤活性基因 (如 c- myc、tre等 )以及肿瘤特异表达基因 (如 bladder cancer related protein等 )。相反 ,斑蝥素促进了多种细胞生长抑制基因 (如 BCRA2、BTG2、dual- specificity protein phosphatase等 )以及凋亡相关基因 (如 ATL - derived PMA- responsive peptide等 )的表达。 结论 :斑蝥素改变调控细胞周期进程、细胞增殖。 展开更多
关键词 肝癌 QGY7703细胞 斑蝥素 基因芯片技术分析 基因表达谱
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应用液态基因芯片技术对132例β-地中海贫血基因检测分析 被引量:6
7
作者 罗史科 张松 +3 位作者 邹汉良 朱平安 梁汉章 赵毅 《国际检验医学杂志》 CAS 2009年第7期647-648,650,共3页
目的用液态基因芯片技术检测深圳东部地区人群中β-地中海贫血分析常见类型。方法采用液态基因芯片技术,使用Luminex100多功能悬浮点阵检测仪及Lumi2 nex Data Collectorvision1.7数据收集软件检测并通过突变标本与正常标本的莹光强度比... 目的用液态基因芯片技术检测深圳东部地区人群中β-地中海贫血分析常见类型。方法采用液态基因芯片技术,使用Luminex100多功能悬浮点阵检测仪及Lumi2 nex Data Collectorvision1.7数据收集软件检测并通过突变标本与正常标本的莹光强度比值(Mutan/Normal)分析深圳东部地区人群5 637例标本。结果发现132例携带β-地中海贫血突变基因,携带率为2.34%。其中常见点突变模式中CD41/42(TCTT)突变61例(占46.2%),IVS2 654(C→T)29例(21.9%),-25(A→G)突变14例(10.6%),13(A→T)突变11例(8.3%),CD71/72(+A)5例(3.8%),-29(A→G)突变杂合3例(2.27%),-28(A→G)复合CD41/42-TCTT突变7例,其他少见杂合点突变2例,常见单点突变β-地中海贫血患者共123例为93.18%,少见模式和多点杂合突变共9例,为6.82%。 展开更多
关键词 Β地中海贫血 芯片分析技术 基因 临床实验室技术
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液相蛋白芯片技术及其在免疫诊断和分析领域的应用进展 被引量:5
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作者 陈茹 刘林琳(综述) 许如苏(审校) 《国际检验医学杂志》 CAS 2007年第3期232-234,共3页
液相蛋白芯片技术是近年开发的新一代生物芯片技术和新型蛋白质研究平台。现简要介绍其原理、技术特点及在免疫诊断和分析领域的应用情况,并对其应用前景和存在的问题进行简要评述。
关键词 芯片分析技术 诊断
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脑类器官技术及在脑卒中治疗中的应用进展
9
作者 孙可心 肖雨倩 +4 位作者 万俊 陈淑颖 陈丽敏 王岩 白艳杰 《天津医药》 CAS 2024年第1期38-43,共6页
脑类器官是一种由胚胎干细胞(ESCs)或诱导多能干细胞(iPSCs)诱导产生的三维神经培养物,能够模拟人脑的结构和功能。随着脑类器官培养技术的不断优化,并与器官移植、基因编辑和类器官芯片等新兴技术相结合,产生了功能性血管结构和神经回... 脑类器官是一种由胚胎干细胞(ESCs)或诱导多能干细胞(iPSCs)诱导产生的三维神经培养物,能够模拟人脑的结构和功能。随着脑类器官培养技术的不断优化,并与器官移植、基因编辑和类器官芯片等新兴技术相结合,产生了功能性血管结构和神经回路等复杂脑组织结构,为研究人类大脑发育和疾病提供了新方法、新思路。就脑类器官技术的最新进展进行综述,阐述了其在神经系统疾病中的应用,以及在脑卒中建模和移植治疗中的进展。 展开更多
关键词 类器官 移植 芯片分析技术 卒中 脑类器官
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多肿瘤标志物蛋白芯片技术在人群健康体检中的应用 被引量:10
10
作者 匡红 孙晨 +7 位作者 李静 贾淑芳 曾琳 周琳瑶 孙薏 钟国成 钟梁 呼永河 《国际检验医学杂志》 CAS 2013年第9期1074-1076,1079,共4页
目的探讨多肿瘤标志物蛋白芯片技术在人群防癌普查中的应用价值。方法采用多肿瘤标志物蛋白芯片技术对4624例接受健康体检的人员进行癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、糖链抗原242(CA242)、CA199、CA125、CA153、神经元特异性烯醇化酶(NSE... 目的探讨多肿瘤标志物蛋白芯片技术在人群防癌普查中的应用价值。方法采用多肿瘤标志物蛋白芯片技术对4624例接受健康体检的人员进行癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、糖链抗原242(CA242)、CA199、CA125、CA153、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、铁蛋白、β人绒毛膜促性腺激素(β-hCG)、游离前列腺特异性抗原(fPSA)、PSA、人生长激素(hGH)12种肿瘤相关抗原物检测。结果 4624例体检人员中筛查出133例血清肿瘤标志物水平升高,其中18例经内窥镜、病理学、影像学检查确诊为早期或中期肿瘤,肿瘤检出率为0.39%。男、女受检者血清CEA、铁蛋白、β-hCG、fPSA、PSA、CA125的差异,<55岁年龄组、≥55岁年龄组受检者血清β-hCG、fPSA、PSA的差异以及肿瘤与非肿瘤受检者血清CA199、NSE、CA242、CEA、AFP、CA125的差异有统计学意义(P<0.05)。结论多肿瘤标志物蛋白芯片检测技术适用于人群的防癌普查。 展开更多
关键词 肿瘤 生物学标记 芯片分析技术 体格检查
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Luminex液相芯片技术检测6种虫媒病毒方法的建立 被引量:10
11
作者 范丽 李裕昌 +4 位作者 康晓平 林方 魏婧靖 杨银辉 熊正英 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期459-463,共5页
目的建立森林脑炎病毒(TBEV)、日本乙型脑炎病毒(JEV)、辛得比斯病毒(SINV)、西尼罗病毒(WNV)、东部马脑炎病毒(EEEV)、登革热病毒(DENV) 6种虫媒病毒的液相芯片检测技术,并对该方法进行评价。方法制备6种虫媒病毒的特异性单克隆抗体,... 目的建立森林脑炎病毒(TBEV)、日本乙型脑炎病毒(JEV)、辛得比斯病毒(SINV)、西尼罗病毒(WNV)、东部马脑炎病毒(EEEV)、登革热病毒(DENV) 6种虫媒病毒的液相芯片检测技术,并对该方法进行评价。方法制备6种虫媒病毒的特异性单克隆抗体,检测抗体标记生物素,捕获抗体偶联荧光聚苯乙烯微球,建立双抗体夹心的液相芯片检测技术,利用Luminex 200分析系统对6种虫媒病毒分别进行单一、多重液相芯片检测。结果将平均荧光强度的判定阈值定为背景对照的2倍可对上述6种虫媒病毒进行有效鉴定。多批次实验均能对6种单一病毒样本和混合病毒样本进行准确鉴定,未出现交叉反应,批次间变异系数(CV)均小于7%,表明该方法的稳定性和特异性均较好。同时对该方法的敏感性进行鉴定,结果表明检测TBEV、WNV、JEV、SINV、EEEV、DENV的敏感性分别达到25.00、781.25、781.25、390.63、781.25、1562.5pfu/ml。该方法与ELISA相比具有灵敏性高、重复性好、节省样本和时间等优点,特异性相当。结论通过制备特异性单克隆抗体,成功建立了可同时检测6种虫媒病毒的液相芯片检测技术平台。该平台对于病原体的检测具有较好的应用前景。 展开更多
关键词 芯片分析技术 虫媒病毒 敏感性与特异性
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129株非结核分枝杆菌采用两种分子检测技术行菌种鉴定的结果分析 被引量:7
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作者 刘佳文 吕红艳 +1 位作者 丁北川 张治国 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第9期999-1004,共6页
目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3... 目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3个单位129株NTM临床分离株的菌种鉴定,实验操作者之间采用双盲法,对两种鉴定方法的结果进行比较和评价。结果129株NTM菌株中,有107株进行分枝杆菌基因测序,其中59株为胞内分枝杆菌(55.1%);29株为堪萨斯分枝杆菌(27.1%);5株为龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌(4.7%);3株为鸟分枝杆菌(2.8%);2株为偶发分枝杆菌(1.9%);2株为戈登分枝杆菌(1.9%);1株为蟾蜍分枝杆菌(0.9%);1株为草分枝杆菌(0.9%);1株为瘰疬分枝杆菌(0.9%);4株为其他NTM(3.7%)。有116株进行芯片法分枝杆菌菌种鉴定,且有96株同时进行芯片法和基因测序法检测,两种方法进行菌种鉴定的符合率为88.5%(85/96)。基因测序发现有3株外来菌株,分别为明尼苏达分枝杆菌、熊本分枝杆菌、提门分枝杆菌(M.temen)。结论北京3家机构NTM菌种以胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌为主。用芯片法和基因测序对NTM临床分离株进行菌种鉴定的一致率较高。 展开更多
关键词 分枝杆菌 非典型性 生物学鉴定法 芯片分析技术 分子探针技术 寡核苷酸序列分析 结果与过程评价(卫生保健)
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基因芯片技术在阴道分泌物常规检测中的应用研究 被引量:3
13
作者 史从宁 王雅杰 +3 位作者 赵运转 康熙雄 胡敏华 张丽梅 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第15期1776-1777,1783,共3页
目的探讨基因芯片技术在阴道分泌物常规检测中的应用价值。方法选取2012年1—4月首都医科大学附属北京天坛医院妇产科门诊400例患者阴道分泌物,每份标本同时用BD Affirm VPⅢ芯片检测、显微镜镜检、细菌性阴道病(BV)甲酚蓝试剂检测和BV... 目的探讨基因芯片技术在阴道分泌物常规检测中的应用价值。方法选取2012年1—4月首都医科大学附属北京天坛医院妇产科门诊400例患者阴道分泌物,每份标本同时用BD Affirm VPⅢ芯片检测、显微镜镜检、细菌性阴道病(BV)甲酚蓝试剂检测和BV蓝试剂检测,并接种至念珠菌显色培养基和滴虫培养基培养。采用SPSS 16.0统计软件,行Kappa检验。结果以BV蓝试剂检测结果为金标准,BV甲酚蓝试剂检测和BD Affirm VPⅢ芯片检测BV的Kappa值分别为0.813和0.553。以念珠菌培养结果为金标准,显微镜镜检和BD Affirm VPⅢ芯片检测念珠菌的Kappa值分别为0.605和0.941。以滴虫培养结果为金标准,显微镜镜检和BD Affirm VPⅢ芯片检测滴虫的Kappa值分别为0.973和0.923。结论 BD Affirm VPⅢ芯片检测念珠菌和滴虫一致性较好,BD Affirm VPⅢ芯片与BV蓝或BV甲酚蓝试剂联合用于临床进行阴道分泌物检查,可以取代显微镜镜检。 展开更多
关键词 芯片分析技术 阴道排出物 显微镜检查
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组织芯片技术检测DNA甲基转移酶1、人白细胞DR抗原α在肝细胞癌组织中的表达及临床意义 被引量:2
14
作者 吕文平 董家鸿 +2 位作者 石爽 黄志强 郭德玉 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期543-547,共5页
目的:探讨肝细胞癌(hepatocelluar carcinoma,HCC)组织中DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)、人白细胞DR抗原α(HLA-DRα)的表达情况及其与临床病理特征、预后的关系。方法:选择1991年1月至2002年6月实施根治性肝... 目的:探讨肝细胞癌(hepatocelluar carcinoma,HCC)组织中DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)、人白细胞DR抗原α(HLA-DRα)的表达情况及其与临床病理特征、预后的关系。方法:选择1991年1月至2002年6月实施根治性肝切除、经病理证实的具备完整临床和随访资料的234例HCC患者,患者的随访时间为1.43-158.8个月[(30.04±26.61)个月],将患者的HCC石蜡组织制备成组织芯片,免疫组化检查采用Envision二步法,统计软件分析DNMT1和HLA-DRα的表达与临床病理特征、预后的关系。结果:HCC组织中DNMT1的阳性表达率为27.4%(64/234),其阳性表达与门静脉癌栓、甲胎球蛋白(AFP)水平、TNM分期具有明显的相关性(P〈0.05),与淋巴结侵犯无明显相关(P〉0.05)。HCC组织中HLA-DRα的阳性表达率为39.3%(92/234),HLA-DRα的阳性表达与淋巴结侵犯、TNM分期具有明显的负相关性(P〈0.05),与门静脉癌栓、AFP水平等无明显相关(P〉0.05)。DNMT1表达阳性的患者术后的中位存活时间为6.87个月,1年、3年、5年存活率分别是(38.89±6.63)%、(19.92±5.48)%、(17.58±5.31)%;DNMT1表达阴性患者的中位存活时间为40.33个月,1年、3年、5年存活率分别为(80.0±3.32)%、(51.63±4.30)%、(35.61±4.95)%(P〈0.001)。HLA-DRα表达阳性患者的术后中位存活时间为40.33个月,1年、3年、5年存活率分别为(81.01±4.41)%、(50.78±5.84)%、(38.04±6.09)%;HLA-DRα表达阴性患者的中位存活时间为12.43个月,1年、3年、5年存活率分别为(51.72±6.56)%、(26.44±5.91)%、(13.71±6.83)%(P〈0.01)。结论:DNMT1和HLA-DRα可能是影响HCC预后的重要分子,有望成为准确预测HCC预后的分子预后标记物。 展开更多
关键词 肝细胞 芯片分析技术 DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶 HLA-DR抗原 预后
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基于miRNAs芯片的喉鳞状细胞癌致癌机制的初步分析 被引量:3
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作者 廉猛 翟杰 +7 位作者 王茹 王海舟 冯凌 时倩 马泓智 房居高 刘晓琴 刘红刚 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CSCD 2016年第9期501-506,共6页
目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌... 目的 miRNA芯片筛选与喉鳞状细胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相关的差异miRNA s,结合生物信息学分析确定并进一步验证具有诊疗价值的目标miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片对5对LSCC组织及相应的癌旁组织行差异miRNAs的筛选,原始数据上传Gene Expression Omnibus数据库。采用Mev软件中配对方式t检验进行芯片探针的差异分析,经Affymetrix Analysis Center分析后将差异探针转换为差异表达的miRNAs;选择我们前期工作确定的微小染色体维持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作为核心基因,采用Mirfocus数据库生物信息学分析MCM4的调控miRNAs并结合相关文献确定目标miRNAs;采用RT-PCR在另外21对LSCC组织及相应的癌旁组织中验证目标miRNAs。结果经差异筛选分析,有127个差异表达的miRNAs,其中78个miRNAs在肿瘤组织中高表达,49个miRNAs在肿瘤组织中低表达;采用Mirfocus数据库生物信息学分析参与核心基因MCM4的调控miRNAs并结合相关文献,确定高表达的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p为与MCM4调控作用相关的目标miRNAs;hsa-miR-30a-5p为另一个潜在的目标miRNA,且在肿瘤组织中低表达;通过RTPCR验证这3个差异表达的目标miRNAs与芯片筛选结果一致。结论基于miRNAs芯片筛选分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p对LSCC的发生发展具有重要调控作用,可作为潜在的诊疗靶点。 展开更多
关键词 肿瘤 鳞状细胞 微RNAS 芯片分析技术 计算生物学
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液相芯片技术及其临床应用 被引量:14
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作者 何英 陆学东 《国际检验医学杂志》 CAS 2006年第12期1107-1108,1111,共3页
液相芯片技术是一种利用混悬在液相中的分类编码微球作为反应及信号检测载体的检测技术,它充分利用发展成熟的流式细胞术检测原理,对临床大多数生物分子(如核酸、蛋白质等)进行高通量分析,目前已在研究和临床检测中得到了广泛的应用,现... 液相芯片技术是一种利用混悬在液相中的分类编码微球作为反应及信号检测载体的检测技术,它充分利用发展成熟的流式细胞术检测原理,对临床大多数生物分子(如核酸、蛋白质等)进行高通量分析,目前已在研究和临床检测中得到了广泛的应用,现就其技术原理、特点及临床应用作简要介绍。 展开更多
关键词 芯片分析技术 流式细胞术
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新型胶颗粒芯片技术检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的研究 被引量:2
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作者 苏丹 李强 +4 位作者 车南颖 欧喜超 赵冰 赵雁林 黄海荣 《中国防痨杂志》 CAS 2018年第10期1034-1039,共6页
目的评估一种新型胶颗粒芯片技术[TruArray胶颗粒芯片(Gel element arrays),简称为“TruArray芯片”]用于痰标本中结核分枝杆菌及利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药性的检测效能。方法选取2016年8月在首都医科大学附属北京胸科医院... 目的评估一种新型胶颗粒芯片技术[TruArray胶颗粒芯片(Gel element arrays),简称为“TruArray芯片”]用于痰标本中结核分枝杆菌及利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药性的检测效能。方法选取2016年8月在首都医科大学附属北京胸科医院就诊的149例疑似肺结核患者痰标本,分别进行涂片镜检、BACTEC MGIT 960快速液体培养系统(简称“MGIT 960”)、TruArray芯片和GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)检测,对液体培养阳性菌株进行测序菌种鉴定、MGIT960药物敏感性试验(简称“药敏试验”)和耐药相关基因测序,分析TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌及其耐药性的检测效能。结果液体培养、GeneXpert和TruArray芯片对结核分枝杆菌的检出率分别为32.2%(48/149),53.7%(80/149)和57.0%(85/149),TruArray芯片和GeneXpert两种方法检出率差异无统计学意义(χ2-0.34,P-0.560),但TruArray芯片检测阳性率高于液体培养(χ^2=18.59,P〈0.01)。以MGIT960试验结果为标准,TruArray芯片检测痰标本中结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.90%(47/48)和61.4%(62/101);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为97.5%(78/80)和88.4%(61/69)。以MGIT960药敏试验结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为91.7%(11/12)和96.8%(30/31);以GeneXpert检测结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度为85.0%(17/20)和97.9%(47/48);以耐药基因测序结果为标准,TruArray芯片检测RFP耐药的敏感度和特异度分别为92.3%(12/13)和100.0%(30/30)。以MGIT960液体药敏试验结果为标准,TruArray芯片技术检测INH耐药的敏感度和特异度分别为78.6%(11/14)和93.8%(30/32);以耐药基因测序结果为判断标准,TruArray芯片检测INH耐药的敏感度和特异度分别为100.0%(11/11)和94.3%(33/35)。结论TruArray芯片检测技术快速、可靠,在结核病及耐多药结核病快速诊断方面具有非常好的应用前景。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐多药结核病 芯片分析技术 实验室技术和方法 对比研究
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应用组织芯片技术检测非小细胞肺癌中骨桥蛋白和基质金属蛋白酶-9的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 李志英 施敏骅 胡华成 《实用医学杂志》 CAS 2008年第5期746-749,共4页
目的:探讨人非小细胞肺癌(NSCLC)组织中骨桥蛋白(OPN)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)蛋白的表达及临床意义。方法:利用组织芯片技术结合免疫组化法检测48例NSCLC组织、19例癌旁组织及13例良性病变组织中OPN和MMP-9蛋白的表达。结果:OPN和MM... 目的:探讨人非小细胞肺癌(NSCLC)组织中骨桥蛋白(OPN)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)蛋白的表达及临床意义。方法:利用组织芯片技术结合免疫组化法检测48例NSCLC组织、19例癌旁组织及13例良性病变组织中OPN和MMP-9蛋白的表达。结果:OPN和MMP-9的阳性表达率在癌组织中分别是75.0%、70.8%;在癌旁组织中分别是13.8%、17.2%;在良性病变组织分别是23.1%、30.8%。NSCLC组织中OPN和MMP-9蛋白表达均显著高于癌旁组织及良性病变组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。此外,OPN和MMP-9表达率与患者组织学类型、TNM分期及淋巴结转移有密切关系(P<0.05)。OPN与MMP-9蛋白表达存在正相关(r=0.58,P<0.05)。结论:OPN和MMP-9的表达与NSCLC的发生、发展有关,联合检测有助于判断NSCLC患者的预后。 展开更多
关键词 非小细胞肺 明胶酶B 免疫组织化学 芯片分析技术 骨桥蛋白
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应用组织芯片技术研究DCC蛋白在胰腺癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 倪晓光 赵平 +2 位作者 王贵齐 刘尚梅 郭冰 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期813-816,834,共5页
目的:研究结直肠癌缺失(deleted in colorectal cancer,DCC)基因在胰腺癌中表达的意义及其与临床病理学因素的关系。方法:构建胰腺癌组织芯片,使用免疫组化法检测DCC蛋白表达情况,并分析其与肿瘤大小、分化程度、有无淋巴结转移以及TNM... 目的:研究结直肠癌缺失(deleted in colorectal cancer,DCC)基因在胰腺癌中表达的意义及其与临床病理学因素的关系。方法:构建胰腺癌组织芯片,使用免疫组化法检测DCC蛋白表达情况,并分析其与肿瘤大小、分化程度、有无淋巴结转移以及TNM分期等临床病理学因素之间的关系。结果:胰腺癌组织芯片免疫组化结果显示,DCC在胰腺癌中表达的阳性率为17%(7/41),明显低于正常胰腺组织中的表达阳性率87%(34/39)(P<0.001)。胰腺癌发生淋巴结转移时DCC蛋白的表达水平0.29±0.768明显低于无淋巴结转移的胰腺癌1.27±2.27(P=0.037)。DCC在Ⅲ和Ⅳ期胰腺癌中的表达水平0.25±0.71显著低于Ⅰ期1.39±2.63和Ⅱ期1.25±2.12胰腺癌的表达水平(P=0.032)。结论:DCC蛋白在胰腺癌中表达降低或缺失是胰腺癌发生发展过程中的一个频繁发生的事件,免疫组化法检测DCC蛋白的表达对胰腺癌的预后评估具有重要意义。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 芯片分析技术 基因 DCC 免疫组织化学
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蛋白芯片技术筛选急性髓性白血病血清标志蛋白质 被引量:2
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作者 张军 王惠芳 +2 位作者 张建中 马一盖 王建文 《军医进修学院学报》 CAS 北大核心 2006年第5期355-357,共3页
目的:利用蛋白质芯片和生物信息学方法从急性髓性白血病患者血清中筛选标志蛋白质。方法:采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(surfaced enhanced laser desorption/ion ization tim e of flightm ass spectros-copy)和弱阳离子交... 目的:利用蛋白质芯片和生物信息学方法从急性髓性白血病患者血清中筛选标志蛋白质。方法:采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(surfaced enhanced laser desorption/ion ization tim e of flightm ass spectros-copy)和弱阳离子交换(WCX2)蛋白质芯片对30例急性髓性白血病患者血清和57例健康人血清的蛋白质谱图进行了检测,使用PBSII-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用c iphergen公司的B iom arker w izard和B io-m arker Patterns System软件分析。结果:急性髓性白血病患者与正常人血清蛋白质谱相比有8个显著差异蛋白质,其中1个蛋白质在患者血清中高表达,7个蛋白质在患者血清中低表达。B iom arker Patterns System软件用8个显著差异蛋白质中的7个标志分子建立急性髓性白血病诊断的分类树模型。检测灵敏度为86.7%(26/30)、特异性为96.5%(55/57)。结论:实验证明利用蛋白质组学和生物信息学方法可以从血清中筛选出急性髓性白血病相关的标志蛋白质,而且蛋白质芯片技术对于发现和筛选血清中的急性髓性白血病标志蛋白质是一种有效、快速的工具。 展开更多
关键词 芯片分析技术 白血病 粒细胞 急性
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