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应用Q-PCR定性检测KIR基因有无方法的建立
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作者 李宇楠 甄建新 +2 位作者 梁爽 喻琼 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 2024年第6期660-665,共6页
目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性... 目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性对照、一孔阳性对照(特异性扩增人体生长激素HGH基因片段),以监控假阳性、假阴性的结果。为验证Q-PCR方法的可靠性,随机选择302份已采用KIR PCR-SSP商品化试剂盒检测的标本,采用Q-PCR方法盲检和对比。结果300人份的Q-PCR检测结果与已知的PCR-SSP检测结果相符,有2份标本结果不一致,其中1例标本的2DS5基因Q-PCR检测结果为阴性,而PCR-SSP检测结果为阳性;另一例标本2DS1基因Q-PCR检测结果为阳性,而PCR-SSP检测结果为阴性。对2份标本分别进行2DS5、2DS1基因测序分型,证实Q-PCR定性检测结果正确。结论本文建立的KIR Q-PCR方法结果准确、可靠,可用于KIR基因有无的定性检测。 展开更多
关键词 杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR) KIR基因有无 实时荧光定量-pcr 序列特异性引物-pcr 测序分型
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实时荧光定量-PCR和酶联免疫吸附法检测巨细胞病毒-IgM抗体的比较 被引量:2
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作者 范文勇 《中国医药导报》 CAS 2011年第2期83-84,共2页
目的:比较实时荧光定量-PCR和酶联免疫吸附法检测巨细胞病毒-IgM抗体水平的敏感性及准确率。方法:收集108例孕前筛查妇女,同时采用实时荧光定量-PCR和酶联免疫吸附法检测外周血巨细胞病毒-IgM抗体水平,并对这两种检测方法的阳性率进行... 目的:比较实时荧光定量-PCR和酶联免疫吸附法检测巨细胞病毒-IgM抗体水平的敏感性及准确率。方法:收集108例孕前筛查妇女,同时采用实时荧光定量-PCR和酶联免疫吸附法检测外周血巨细胞病毒-IgM抗体水平,并对这两种检测方法的阳性率进行比较。结果:实时荧光定量-PCR法阳性率为74%,酶联免疫吸附法为57%,两者差异有统计学意义(P<0.05);18例荧光定量-PCR法阳性的妇女血清巨细胞病毒-IgM拷贝数低于10-4/ml。结论:实时荧光定量-PCR与酶联免疫吸附法相比,对巨细胞病毒-IgM抗体检测具有较高的敏感性和准确率,值得临床推广使用。 展开更多
关键词 实时荧光定量-pcr 酶联免疫吸附法 巨细胞病毒-IgM抗体
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荧光定量-PCR检测乙肝患者血清HBV-DNA及其临床应用
3
作者 席向红 贾韶彤 +1 位作者 王静 高中芳 《宁夏医学杂志》 CAS 2005年第3期161-163,共3页
目的 探讨HBV -DNA基因含量与HBV -M两者的关系及其在临床中的应用。方法 采用酶联免疫吸附试验 (ELISA)和荧光定量 -PCR(FQ -PCR)法对 5 5 3例乙肝患者及无症状携带者血清进行HBV -M以及HBV -DNA定量检测。结果 乙肝患者血清HBV -DN... 目的 探讨HBV -DNA基因含量与HBV -M两者的关系及其在临床中的应用。方法 采用酶联免疫吸附试验 (ELISA)和荧光定量 -PCR(FQ -PCR)法对 5 5 3例乙肝患者及无症状携带者血清进行HBV -M以及HBV -DNA定量检测。结果 乙肝患者血清HBV -DNA阳性率和基因含量与HBV -M模式有很大关系 ,与HBeAg(+)高度相关 ,显著高于其他各组 (P <0 .0 0 1,P <0 .0 1) ,在抗 -HBe(+)组或抗 -HBs(+)组也检出了一定浓度的HBV -DNA ;不同临床类型乙型肝炎患者血清中HBV -DNA的阳性率和含量无显著性差异 (P >0 .0 5 )。结论 单凭血清免疫标志物模式难以准确判断HBV的复制程度及传染性的强弱 ,定量检测HBV -DNA能真实反映HBV的复制情况 ,对诊断、治疗乙肝患者及疗效观察具有较大的指导意义。 展开更多
关键词 乙型肝炎 荧光定量-pcr HBV-DNA HBV-M
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荧光定量-PCR检测HBV-DNA与ELISA法检测HBV-M的关系研究
4
作者 席向红 焦运 +1 位作者 贾韶彤 赵颖 《宁夏医学院学报》 2003年第5期348-349,共2页
为了探讨HBV -DNA基因含量与乙型肝炎病毒标志物 (HBV -M )两者的关系 ,用FQ -PCR检测HBV -DNA ,ELISA法检测HBV -M。发现乙肝患者血清HBV -DNA含量与HBV -M有很大关系 ,与HBeAg(+)高度相关 ,在抗 -HBe(+)组或抗 -HBs(+)组也检出了一定... 为了探讨HBV -DNA基因含量与乙型肝炎病毒标志物 (HBV -M )两者的关系 ,用FQ -PCR检测HBV -DNA ,ELISA法检测HBV -M。发现乙肝患者血清HBV -DNA含量与HBV -M有很大关系 ,与HBeAg(+)高度相关 ,在抗 -HBe(+)组或抗 -HBs(+)组也检出了一定浓度的HBV -DNA。说明FQ -PCR法检测HBV -DNA能准确反映HBV真实感染和低复制状态 ,对诊断、治疗乙肝患者具有非常重要的指导意义。FQ -PCR与各种证型的HBV 展开更多
关键词 荧光定量-pcr 检测 HBV-DNA ELISA法 HBV-M 乙型肝炎病毒标志物 乙型肝炎病毒感染
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应用荧光定量RT-PCR检测J亚群禽白血病病毒 被引量:4
5
作者 屈素洁 邹联斌 +6 位作者 陈芳芳 张步娴 胡杰 莫胜兰 施开创 李军 尹彦文 《中国动物检疫》 CAS 2015年第6期56-59,63,共5页
针对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)基因序列保守区域设计一对特异性引物和一条特异性探针,通过构建重组阳性标准质粒作为阳性标准品,建立了检测ALV-J核酸的荧光定量PCR方法。优化反应体系和条件后进行特异性、敏感性、重复性试验。结果显示... 针对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)基因序列保守区域设计一对特异性引物和一条特异性探针,通过构建重组阳性标准质粒作为阳性标准品,建立了检测ALV-J核酸的荧光定量PCR方法。优化反应体系和条件后进行特异性、敏感性、重复性试验。结果显示,该检测方法特异性强,与其它禽源病毒如A亚群禽白血病病毒(ALV-A)、B亚群禽白血病病毒(ALV-B)、新城疫病毒(NDV)、禽流感病毒(AIV)、鸡传染性贫血病毒(CIAV)和马立克病病毒(MDV)均不发生交叉反应;该方法可检测到3.2×102拷贝/μL的病毒核酸,与常规RT-PCR相比,敏感性高100倍;重复性试验的变异系数小于2%。研究结果表明,建立的Real-time RT-PCR检测方法特异性强、灵敏度高、可重复性好,可用于ALV-J的定量检测。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 TAQMAN探针
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沙门氏菌荧光实时定量PCR检测试剂的研制及应用 被引量:27
6
作者 李光伟 邱杨 +8 位作者 肖性龙 詹少彤 兰敏 黄伟 周润华 姚小文 冯小军 林涛 梅艳群 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期496-499,共4页
荧光实时定量PCR技术是近年来广泛应用于沙门氏菌快速检测的现代方法之一,本研究建立了检测沙门氏菌快速、敏感、特异以及准确定量的FQ-PCR方法。采用沙门氏菌fimY基因序列,设计特异引物和探针,通过对Taq酶、Mg2+和引物探针浓度等反应... 荧光实时定量PCR技术是近年来广泛应用于沙门氏菌快速检测的现代方法之一,本研究建立了检测沙门氏菌快速、敏感、特异以及准确定量的FQ-PCR方法。采用沙门氏菌fimY基因序列,设计特异引物和探针,通过对Taq酶、Mg2+和引物探针浓度等反应体系和条件的优化,然后进行特异性和适用性实验。最优化结果为:Taq酶用量2.5U;Mg2+浓度为3.75×10-3mol/L;引物浓度为0.65×10-6mol/L,探针浓度为0.30×10-6mol/L;循环条件为step1:95℃2min,step2:95℃5s,60℃40s,40cycles。结果表明该FQ-PCR检测试剂具有快速、简单、灵敏度高、特异性强和适用范围广等优点,可应用于食品卫生监管、商品检验检疫以及临床诊断等领域。 展开更多
关键词 沙门氏菌 荧光实时定量-pcr 检测 研制
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H3、H9亚型禽流感病毒双重荧光定量PCR方法的建立及初步应用 被引量:7
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作者 申伟霞 田巧珍 +7 位作者 陈圆 胡涛 闫丽萍 李国新 李雪松 滕巧泱 赵宇军 李泽君 《中国动物传染病学报》 CAS 2014年第1期16-24,共9页
虽然H3、H9亚型禽流感病毒(Avian influenza virus, AIV)是低致病性禽流感病毒,但其具有跨宿主感染哺乳动物的能力,对社会公共卫生安全具有重大的潜在危害,因而对这些亚型病毒的监测极其重要。通过比对GenBank上H3、H9亚型禽流感病... 虽然H3、H9亚型禽流感病毒(Avian influenza virus, AIV)是低致病性禽流感病毒,但其具有跨宿主感染哺乳动物的能力,对社会公共卫生安全具有重大的潜在危害,因而对这些亚型病毒的监测极其重要。通过比对GenBank上H3、H9亚型禽流感病毒HA基因序列,设计了分别针对H3 AIV和H9 AIV的特异性探针。特异性试验和标准曲线试验的结果显示,这两个探针仅分别特异性识别H3、H9亚型AIV,且具有较好的扩增效率。通过重组质粒pMD19-T-H3HA和pMD19-T-H9HA 10倍梯度稀释液为模板,进行敏感性实验。结果表明,本研究所建立的荧光定量PCR方法能检测到100个DNA拷贝数H3 AIV和10个DNA拷贝数的H9 AIV,比传统PCR方法敏感性分别提高了100倍和1000倍。此外,本方法还能检测到10 EID50的H3亚型AIV或H9亚型AIV,比传统PCR方法检测敏感性均提高了1000倍。批间和批内试验的变异系数均小于3%,表明本研究建立的方法具有较好的重复性。此外,与传统PCR方法相比,用H3、H9亚型AIV双重荧光定量PCR方法检测人工感染动物的肺组织时,针对H3 AIV的敏感性提高了10~100倍,针对H9 AIV的敏感性提高了100倍。综上所述,本研究所建立的H3、H9亚型禽流感病毒双重荧光定量PCR方法具有较高的特异性和敏感性,对H3、H9亚型禽流感病毒监测具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 H3 H9 禽流感病毒
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汉城病毒的TaqMan-BHO探针实时荧光定量检测方法的建立 被引量:4
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作者 刘纯成 杨鹏飞 +1 位作者 燕清丽 时玉军 《国际检验医学杂志》 CAS 2014年第24期3332-3333,共2页
目的建立一种汉城病毒实时荧光定量RT-PCR快速的检测方法。方法用专业软件设计引物和TaqMan-BHQ探针,以人工合成L基因的片段作为模板,进行实时荧光定量RT-PCR研究。结果模板的Ct值与模板稀释浓度的对数存在良好的线性关系,标准曲线为Y=-... 目的建立一种汉城病毒实时荧光定量RT-PCR快速的检测方法。方法用专业软件设计引物和TaqMan-BHQ探针,以人工合成L基因的片段作为模板,进行实时荧光定量RT-PCR研究。结果模板的Ct值与模板稀释浓度的对数存在良好的线性关系,标准曲线为Y=-3.607 X+41.84,r2=0.998,PCR扩增效率为108.1%,其最低检出限为53.2copies/μL。结论应用TaqMan-BHQ1探针的实时荧光RT-PCR检测汉城病毒核酸,具有耗时短、灵敏度高等特点。 展开更多
关键词 TaqMan-BHQ探针 汉城病毒 定量检测
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乳腺癌患者c-erBb-2基因荧光定量PCR方法的研究 被引量:1
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作者 刘东海 张乐鸣 +2 位作者 张顺 毛联钢 冯伟云 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期380-383,共4页
目的:建立乳腺癌中c-erbB-2基因的荧光定量PCR(FQ-PCR)方法。方法:乳腺癌细胞中的c-erbB-2基因与质粒PGEM-Teasy vector重组,转化大肠杆菌E.coliDH5α,获得克隆的c-erbB-2基因标准模板。用ABI PRISM7700PCR仪检测FQ-PCR扩增产物制成标... 目的:建立乳腺癌中c-erbB-2基因的荧光定量PCR(FQ-PCR)方法。方法:乳腺癌细胞中的c-erbB-2基因与质粒PGEM-Teasy vector重组,转化大肠杆菌E.coliDH5α,获得克隆的c-erbB-2基因标准模板。用ABI PRISM7700PCR仪检测FQ-PCR扩增产物制成标准曲线来检测未知标本中c-erbB-2的含量。结果:FQ-PCR扩增产物呈“S”形动力学曲线;ct(循环阈值)与PCR体系中起始模板拷贝数的对数值之间存在严格的线性关系,显示了FQ-PCR定量的准确性。结论:FQ-PCR是一种快速、简便、灵敏、准确的定量c-erbB-2基因的方法。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 基因 c—erbB-2 荧光定量-pcr
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鹿布鲁氏菌实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:3
10
作者 郝俊伟 张云 +6 位作者 杨宇航 刘红娜 王文玉 张秀丽 时坤 李建明 杜锐 《中国动物检疫》 CAS 2014年第2期71-76,共6页
本研究依据布鲁氏菌的特异性基因Omp25c的部分片段作为靶基因,设计探针引物,且优化了反应体系,筛选出引物、探针的最优浓度配比。将扩增产物连接到PGEM-T载体上,制备标准品及标准曲线,建立鹿布鲁氏菌荧光定量PCR检测方法,并对其特异性... 本研究依据布鲁氏菌的特异性基因Omp25c的部分片段作为靶基因,设计探针引物,且优化了反应体系,筛选出引物、探针的最优浓度配比。将扩增产物连接到PGEM-T载体上,制备标准品及标准曲线,建立鹿布鲁氏菌荧光定量PCR检测方法,并对其特异性、稳定性、敏感性进行评价。由标准曲线可知该方法的最低检测浓度可达到36拷贝/μL,比常规PCR灵敏度高出很多。 展开更多
关键词 鹿 布鲁氏菌
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实时荧光定量PCR检测皱纹盘鲍Δ5脂肪酸去饱和酶基因表达方法的建立及应用 被引量:2
11
作者 李明珠 麦康森 +3 位作者 何艮 艾庆辉 徐玮 张文兵 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期328-334,共7页
研究以皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)体内存在的2条Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)为目的基因,β-肌动蛋白(β-actin)和核糖体蛋白S9(Ribosomal protein S9,RPS9)为内参基因,应用2–ΔΔCt方法建立了实时荧光定量PCR(Real-Time quan... 研究以皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)体内存在的2条Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)为目的基因,β-肌动蛋白(β-actin)和核糖体蛋白S9(Ribosomal protein S9,RPS9)为内参基因,应用2–ΔΔCt方法建立了实时荧光定量PCR(Real-Time quantitative PCR,RT-qPCR)检测体系,并应用此体系分析了鲍鱼肌肉组织Δ5 Fad在不同饲料处理下的表达差异。实验饲料含有不同的脂肪源,分别是棕榈酸甘油酯(Tripalmitin,TP饲料)、富含二十碳四烯酸(Arachidonic acid,ARA)的油脂(AO饲料)和富含二十碳五烯酸(Eicosapentaenoic acid,EPA)的油脂(EO饲料)。结果表明:针对Hdhfad1、Hdhfad2、β-actin和RPS9所设计的引物特异性强。各引物对的PCR扩增效率(Efficiency,E)分别为1.05、0.99、0.97和0.98,满足2–ΔΔCt方法对E的要求。当退火温度为52℃,反应体积为25μL时,RT-qPCR的扩增效果最好。所建立的体系能够准确定量Δ5 Fad的基因表达。利用该方法分析Δ5 Fad在不同饲料处理下的表达结果显示,与TP对照组相比,EO和AO饲料显著降低了鲍鱼肌肉组织Δ5 Fad(Hdhfad1和Hdhfad2)的表达量。 展开更多
关键词 脂肪酸去饱和酶 鲍鱼 基因表达
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乙型肝炎病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立及临床应用 被引量:6
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作者 何维娜 吕东月 +3 位作者 刘和录 韩杰辉 何玥 李培培 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第3期98-101,共4页
目的建立 SYBR Green I实时荧光定量 PCR检测乙型肝炎病毒 DNA的快速方法,并探讨其临床应用价值。方法根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR,并对反应体系和扩增程序进行优化。... 目的建立 SYBR Green I实时荧光定量 PCR检测乙型肝炎病毒 DNA的快速方法,并探讨其临床应用价值。方法根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR,并对反应体系和扩增程序进行优化。定量标准品通过基因克隆方法获得,同时以浙江省夸克公司 HBV DNA定量检测试剂盒作对照,应用于随机选取的100份乙型肝炎患者血清检测。结果 SYBR Green I 实时荧光定量 PCR 检出限范围为5&#215;102 copies/ml~5&#215;108 copies/ml,HBV DNA浓度与CT值有良好线性关系,无交叉反应,整个过程仅需2.5 h。在随机抽取的100份临床标本应用中,与浙江省夸克公司的 HBV荧光定量 PCR检测试剂相比,建立的 SYBR Green I实时荧光定量PCR体系灵敏度100%,特异度92.5%。结论 SYBR Green实时荧光定量PCR快速、简便、灵敏度高、特异度强,可用于乙型肝炎患者病情监测,有效指导临床用药,准确评价 HBV感染者的病情。 展开更多
关键词 SYBR Green I实时荧光定量PCR 乙型肝炎病毒DNA 快速检测 公司产品对比
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荧光定量—PCR检测HBV—DNA 被引量:1
13
作者 魏军 赵颖 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第A07期70-71,共2页
关键词 乙型肝炎 HBV-DNA检测 荧光定量-pcr
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实时荧光定量PCR在EB病毒检测的临床应用 被引量:1
14
作者 罗振元 徐晓婧 +2 位作者 李媛媛 余姝妮 王茹蕾 《贵州医药》 CAS 2018年第3期354-354,共1页
EB病毒在人群中广泛感染,中国3-5岁儿童EB病毒VCA-IgG抗体阳性率达90%以上,幼儿感染后多数无明显症状,或引起轻症咽炎和上呼吸道感染,青年期发生原发感染,约有50%出现传染性单核细胞增多症。主要通过唾液传播,也可经输血传染。EB病毒在... EB病毒在人群中广泛感染,中国3-5岁儿童EB病毒VCA-IgG抗体阳性率达90%以上,幼儿感染后多数无明显症状,或引起轻症咽炎和上呼吸道感染,青年期发生原发感染,约有50%出现传染性单核细胞增多症。主要通过唾液传播,也可经输血传染。EB病毒在口咽部上皮细胞内增值,然后感染B淋巴细胞,这些细胞大量进入血液循环而造成全身性感染。 展开更多
关键词 实时荧光定量-pcr EB病毒 临床应用
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越冬白头鹤粪便毛细线虫卵荧光PCR分子检测方法的建立
15
作者 李博 周立志 《生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第6期20-24,共5页
寄生虫感染是濒危水鸟保护关注的热点,简便、快速、准确的寄生虫检测方法是濒危野生水鸟寄生虫学研究亟待解决的问题。为探索粪便寄生虫卵快速准确的鉴别方法,在越冬白头鹤粪便样品中寄生虫卵分离的基础上,通过对虫卵分别进行液氮/85℃... 寄生虫感染是濒危水鸟保护关注的热点,简便、快速、准确的寄生虫检测方法是濒危野生水鸟寄生虫学研究亟待解决的问题。为探索粪便寄生虫卵快速准确的鉴别方法,在越冬白头鹤粪便样品中寄生虫卵分离的基础上,通过对虫卵分别进行液氮/85℃水浴、超声破碎、裂解液消化等3种前处理,进行荧光PCR分子检测,建立粪便毛细线虫卵分子检测方法。结果显示裂解液消化法处理效果最好,此方法使虫卵经一步预处理即可满足分子检测的需要,处理方法简便而有效,检测结果稳定而敏感。此检测方法可为今后毛细线虫的分子检测提供可靠手段,也可以为濒危野生鸟类的寄生虫感染调查提供便捷的方法。 展开更多
关键词 白头鹤 粪便 荧光PCR 毛细线虫卵
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多通道Taqman-探针荧光定量PCR鉴定MRSA方法的建立
16
作者 陈昌国 李艳君 +5 位作者 郭建巍 陈秋圆 刘敏 马志家 郝秀红 赵强元 《现代检验医学杂志》 CAS 2016年第3期22-25,共4页
目的建立基于mec A/nuc/fem B三基因联合的 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法。方法以常规检验标本中分离和采用 VITEK 2 Compact微生物分析仪鉴定为凝固酶阳性的 MRSA为研究对象,通过PrimerPremi... 目的建立基于mec A/nuc/fem B三基因联合的 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法。方法以常规检验标本中分离和采用 VITEK 2 Compact微生物分析仪鉴定为凝固酶阳性的 MRSA为研究对象,通过PrimerPremier5.0和Beacon Designer 7软件设计针对mec A/nuc/fem B特异性PCR引物及Taqman荧光探针,荧光探针5’端分别采用 FAM,HEX及 ROX标记,3’端采用BHQ1标记,在荧光定量PCR仪进行检测。结果①1 g/dl凝胶电泳结果显示mec A/nuc/fem B三个基因引物特异性较好,扩增出的条带分子量与预期分子量一致且未见非特异性扩增;②在单管单通道及单管多通道的 PCR检测中 mec A/nuc/fem B均获得特异性扩增,且三个基因在单管多通道的PCR扩增效果与单管单通道的相类似。结论成功建立了多通道 Taqman-探针荧光定量 PCR鉴定 MRSA的方法, mec A/nuc/fem B三种基因联合检测可有效区分凝固酶阴性和阳性的 MRSA,提高鉴定 MRSA的准确率。 展开更多
关键词 Taqman-探针 耐甲氧西里金黄色葡萄球菌 基因 联合检测
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不同荧光定量PCR对于HBVcccDNA水平的检测差异对比
17
作者 肖春花 张春兰 +1 位作者 陈伟烈 魏绍静 《安徽医药》 CAS 2015年第6期1103-1106,共4页
目的研究对比不同荧光定量聚合酶链反应PCR对于乙型肝炎病毒HBVccc DNA水平的检测差异。方法选择20例从2007—2008年在广州市第八人民医院接受住院治疗的乙肝患者作为研究对象。提取其血清及肝组织进行实验分析,另取2份不含HBV感染的患... 目的研究对比不同荧光定量聚合酶链反应PCR对于乙型肝炎病毒HBVccc DNA水平的检测差异。方法选择20例从2007—2008年在广州市第八人民医院接受住院治疗的乙肝患者作为研究对象。提取其血清及肝组织进行实验分析,另取2份不含HBV感染的患者血清和肝组织作阴性对照组。将其中经或未经脱氧核糖核酸酶DNase处理的样本分别使用HBVccc DNA跨单缺口PCR和跨双缺口PCR检测。分析Taq Man探针跨单缺口PCR测定HBVccc DNA的结果,对比跨单、双缺口PCR测定结果以及不同荧光定量PCR的测定结果。分析血清和肝组织中HBVDNA与HBVccc DNA病毒载量的关系。结果血清及肝组织经过DNase消化后的有关拷贝数显著低于未消化者。血清和肝组织跨双缺口PCR测定结果较跨单缺口PCR测定结果均显著降低。血清中的HBVDNA及ccc DNA实验结果均显著低于在肝组织中的测定结果,差异均有统计学意义(均P<0.05)。阴性对照组经四种荧光定量PCR检测后均呈阴性。20例E抗原呈阳性的乙肝病人,其机体病毒载量总体趋势为血清HBVDNA的载量较肝组织更低,差异显著。结论 DNase可有效减少HBVccc DNA在检测过程中的假阳性情况,经DNase处理后的跨双缺口PCR检测特异性最高。同时,血清中基本不含ccc DNA。 展开更多
关键词 荧光定量PCR HBVcccDNA水平 检测差异 对比
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From Phenotypes to Molecules: Revolutionizing Gut Microbiota Identification Methods
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作者 WANG Xuan LV Chang-Long ZHAI Jing-Bo 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1065-1077,共13页
The gut microbiota is a complex ecosystem composed of many bacteria and their metabolites.It plays an irreplaceable role in human digestion,nutrient absorption,energy supply,fat metabolism,immune regulation,and many o... The gut microbiota is a complex ecosystem composed of many bacteria and their metabolites.It plays an irreplaceable role in human digestion,nutrient absorption,energy supply,fat metabolism,immune regulation,and many other aspects.Exploring the structure and function of the gut microbiota,as well as their key genes and metabolites,will enable the early diagnosis and auxiliary diagnosis of diseases,new treatment methods,better effects of drug treatments,and better guidance in the use of antibiotics.The identification of gut microbiota plays an important role in clinical diagnosis and treatment,as well as in drug research and development.Therefore,it is necessary to conduct a comprehensive review of this rapidly evolving topic.Traditional identification methods cannot comprehensively capture the diversity of gut microbiota.Currently,with the rapid development of molecular biology,the classification and identification methods for gut microbiota have evolved from the initial phenotypic and chemical identification to identification at the molecular level.This review integrates the main methods of gut microbiota identification and evaluates their application.We pay special attention to the research progress on molecular biological methods and focus on the application of high-throughput sequencing technology in the identification of gut microbiota.This revolutionary method for intestinal flora identification heralds a new chapter in our understanding of the microbial world. 展开更多
关键词 gut microbiota 16S rRNA real-time fluorescent qPCR high-throughput sequencing mass spectrum
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荧光定量PCR检测志贺菌方法的建立 被引量:1
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作者 高春燕 高庆双 +3 位作者 刘树平 许林骥 王晶晶 郑建霞 《转化医学电子杂志》 2014年第4期38-40,共3页
目的:建立一种检测志贺菌属快速敏感的荧光定量PCR方法.方法:根据志贺菌属侵袭性质粒抗原H (ipaH)编码基因序列,设计1对PCR引物特异性靶基因片段,通过检测3株志贺菌属菌株和9株非志贺菌属菌株来评价该方法的特异性;对福氏志贺... 目的:建立一种检测志贺菌属快速敏感的荧光定量PCR方法.方法:根据志贺菌属侵袭性质粒抗原H (ipaH)编码基因序列,设计1对PCR引物特异性靶基因片段,通过检测3株志贺菌属菌株和9株非志贺菌属菌株来评价该方法的特异性;对福氏志贺菌菌液做一系列10倍稀释后进行荧光定量PCR分析敏感性,PCR 扩增产物经电泳和测序鉴定.结果:3株志贺菌属菌株出现特定大小的目的条带,9株非志贺菌属菌株未出现目的条带;测序也证实了PCR产物的特异性;荧光定量PCR检测福氏志贺菌ipaH基因的下限为200拷贝/mL.结论:本研究建立的方法快速、特异、敏感. 展开更多
关键词 志贺菌属
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荧光PCR技术在从业人员伤寒痢疾快速筛查中的应用 被引量:3
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作者 陈玲 魏丽娜 +2 位作者 吴步东 冯贞玉 王巍 《中国卫生产业》 2016年第2期104-106,共3页
目的评价实时荧光PCR技术开展作为快速检测从业人员体检肠道致病菌(伤寒、痢疾)检测工作方法的适用性,以替代落后的细菌培养法检测手段的可行性。方法对一定时间从业人员体检的肛拭子,同时用PCR筛查法和传统培养法进行志贺菌和沙门菌对... 目的评价实时荧光PCR技术开展作为快速检测从业人员体检肠道致病菌(伤寒、痢疾)检测工作方法的适用性,以替代落后的细菌培养法检测手段的可行性。方法对一定时间从业人员体检的肛拭子,同时用PCR筛查法和传统培养法进行志贺菌和沙门菌对比检测,充分比较两者的检出率、灵敏度、特异性、工作效率、人力成本和耗材成本。结果 PCR筛查法阳性检出率1.6‰;传统培养法阳性检出率0.76‰;PCR筛查法的灵敏度和特异性分别为100%和99.97%,具有操作安全简便、结果客观性强、方法便于规范统一、质量控制措施可操作性强等特点。结论 PCR筛查法检测技术对健康体检人员的肠道致病菌进行快速筛查可以使检验的时间得以缩短,而且特异度强、灵敏度高,兼具时效性与客观性。更适合基层实验室规范统一地开展健康带菌检测工作。 展开更多
关键词 伤寒痢疾 快速筛查
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