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基于分子对接和网络药理学的僵蚕息风止痉作用机制分析
被引量:
8
1
作者
王巧宇
刘莹
+5 位作者
申金田
王开元
梅荣
汤建
张林松
闻崇炜
《江苏大学学报(医学版)》
CAS
2021年第5期426-430,437,共6页
目的:通过网络药理学分析和分子对接技术探讨僵蚕息风止痉作用可能的分子机制。方法:基于文献挖掘及数据库搜索获取僵蚕化学成分,利用Swiss Target Prediction数据库预测僵蚕作用靶点,应用DisGeNET数据库收集惊厥疾病相关靶点,借助Cysto...
目的:通过网络药理学分析和分子对接技术探讨僵蚕息风止痉作用可能的分子机制。方法:基于文献挖掘及数据库搜索获取僵蚕化学成分,利用Swiss Target Prediction数据库预测僵蚕作用靶点,应用DisGeNET数据库收集惊厥疾病相关靶点,借助Cystoscape软件与STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析,使用DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,同时将成分与靶点网络分析结果进行分子对接。结果:通过文献挖掘及数据库搜索共检索出僵蚕潜在活性成分18个,有效作用靶点513个,与惊厥疾病交集靶点有22个,这些靶点主要参与了细胞过程、细胞转运活性、受体活性、对刺激应答等生物过程,涉及神经活性配体受体相互作用、抗内源性大麻素信号、胆碱能突触等9条信号通路。分子对接显示,僵蚕成分与潜在靶点具有较好的结合活性。结论:本文构建了僵蚕“药物活性成分靶点”网络,为系统阐明僵蚕息风止痉作用的分子机制提供了理论参考,同时为新药研发提供了新的思路与方法。
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关键词
僵蚕
息风止痉
“
药物活性成分靶点
”网络
分子对接
网络药理
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职称材料
基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制
被引量:
4
2
作者
范吉林
朱婷婷
张世亮
《山东中医药大学学报》
2021年第3期340-346,共7页
目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理。通过在线人类孟...
目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理。通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库检索得到CHF的相关靶点,将药物活性成分靶点与疾病的相关靶点相映射,取得的交集靶点即为防己黄芪汤治疗CHF的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的“药物-成分-疾病”靶点网络图,并运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库以及Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的核心蛋白质互作(PPI)靶点网络图。利用DAVID数据库对获得的交集靶点进行基因本体论(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出的防己黄芪汤治疗CHF的活性成分有124个,相关靶点135个,与CHF相交合的靶点涉及α-1β肾上腺素受体(ADRA1B)和一氧化氮合酶3(NOS3)等。防己黄芪汤治疗CHF的GO生物过程涉及G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、药物结合、平滑肌收缩的正调控、对药物的反应等;防己黄芪汤治疗CHF可能与钙信号传导途径、神经活性配体-受体相互作用、环磷酸鸟苷酸/环磷酸鸟苷酸依赖的蛋白激酶(cGMP/PKG)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、心肌细胞中的肾上腺素信号传导等通路相关。结论:防己黄芪汤治疗CHF涉及多个靶点、生物过程与通路,提示防己黄芪汤治疗CHF的机制较为复杂。
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关键词
防己黄芪汤
慢性心力衰竭
网络药理学
药物活性成分靶点
蛋白质互作
靶
点
《金匮要略》
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职称材料
题名
基于分子对接和网络药理学的僵蚕息风止痉作用机制分析
被引量:
8
1
作者
王巧宇
刘莹
申金田
王开元
梅荣
汤建
张林松
闻崇炜
机构
江苏大学药学院
镇江市食品药品监督检验中心
亳州学院中药学院
出处
《江苏大学学报(医学版)》
CAS
2021年第5期426-430,437,共6页
基金
中央本级重大增减支项目(2060302)
镇江市社会发展项目(SH2018023)
+1 种基金
中药原料产品研发安徽普通高校重点实验室(亳州学院)建设项目(KLAHEI18032)
江苏大学第19批大学生科研课题立项资助项目(19A421)。
文摘
目的:通过网络药理学分析和分子对接技术探讨僵蚕息风止痉作用可能的分子机制。方法:基于文献挖掘及数据库搜索获取僵蚕化学成分,利用Swiss Target Prediction数据库预测僵蚕作用靶点,应用DisGeNET数据库收集惊厥疾病相关靶点,借助Cystoscape软件与STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析,使用DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,同时将成分与靶点网络分析结果进行分子对接。结果:通过文献挖掘及数据库搜索共检索出僵蚕潜在活性成分18个,有效作用靶点513个,与惊厥疾病交集靶点有22个,这些靶点主要参与了细胞过程、细胞转运活性、受体活性、对刺激应答等生物过程,涉及神经活性配体受体相互作用、抗内源性大麻素信号、胆碱能突触等9条信号通路。分子对接显示,僵蚕成分与潜在靶点具有较好的结合活性。结论:本文构建了僵蚕“药物活性成分靶点”网络,为系统阐明僵蚕息风止痉作用的分子机制提供了理论参考,同时为新药研发提供了新的思路与方法。
关键词
僵蚕
息风止痉
“
药物活性成分靶点
”网络
分子对接
网络药理
Keywords
Bombyx Batryticatus
anti-convulsant
“Drug-Active Compounds-Target”network
molecular docking
network pharmacology
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制
被引量:
4
2
作者
范吉林
朱婷婷
张世亮
机构
山东中医药大学
山东中医药大学附属医院
出处
《山东中医药大学学报》
2021年第3期340-346,共7页
基金
国家科技重大专项重大新药创制项目(编号:2017ZX09301003)。
文摘
目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理。通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库检索得到CHF的相关靶点,将药物活性成分靶点与疾病的相关靶点相映射,取得的交集靶点即为防己黄芪汤治疗CHF的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的“药物-成分-疾病”靶点网络图,并运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库以及Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的核心蛋白质互作(PPI)靶点网络图。利用DAVID数据库对获得的交集靶点进行基因本体论(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出的防己黄芪汤治疗CHF的活性成分有124个,相关靶点135个,与CHF相交合的靶点涉及α-1β肾上腺素受体(ADRA1B)和一氧化氮合酶3(NOS3)等。防己黄芪汤治疗CHF的GO生物过程涉及G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、药物结合、平滑肌收缩的正调控、对药物的反应等;防己黄芪汤治疗CHF可能与钙信号传导途径、神经活性配体-受体相互作用、环磷酸鸟苷酸/环磷酸鸟苷酸依赖的蛋白激酶(cGMP/PKG)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、心肌细胞中的肾上腺素信号传导等通路相关。结论:防己黄芪汤治疗CHF涉及多个靶点、生物过程与通路,提示防己黄芪汤治疗CHF的机制较为复杂。
关键词
防己黄芪汤
慢性心力衰竭
网络药理学
药物活性成分靶点
蛋白质互作
靶
点
《金匮要略》
Keywords
Fangji Huangqi Decoction
chronic heart failure
network pharmacology
targets of active pharmaceutical ingredients
protein interaction target
Synopsis of Golden Chamber
分类号
R256.2 [医药卫生—中医内科学]
R243 [医药卫生—中医临床基础]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子对接和网络药理学的僵蚕息风止痉作用机制分析
王巧宇
刘莹
申金田
王开元
梅荣
汤建
张林松
闻崇炜
《江苏大学学报(医学版)》
CAS
2021
8
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制
范吉林
朱婷婷
张世亮
《山东中医药大学学报》
2021
4
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职称材料
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