提出了一种基于双层双向长短时记忆网络(bi-directional long short term memory,BiLSTM)和自注意力(self-attention)机制的药物-药物相互作用(drug-drug interactions,DDIs)预测方法SA-BiLSTM。首先,利用FP3指纹、MACCS指纹、Pubchem...提出了一种基于双层双向长短时记忆网络(bi-directional long short term memory,BiLSTM)和自注意力(self-attention)机制的药物-药物相互作用(drug-drug interactions,DDIs)预测方法SA-BiLSTM。首先,利用FP3指纹、MACCS指纹、Pubchem指纹和PaDEL分子描述符对药物特征信息进行提取。其次,使用套索回归(least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)方法消除对分类无关的特征,并利用重复编辑最近邻(repeated edited nearest neighbors,RENN)方法对数据进行平衡处理,得到最优特征向量。最后,将最优特征向量输入结合自注意力机制和双向长短时记忆网络的分类器预测DDIs。基于五折交叉验证,同时与其它预测方法进行比较,本工作所提出的方法在两个数据集上获得较高的预测准确率。为了综合评价SA-BiLSTM的性能,对药物-药物相互作用网络进行验证。实验结果表明,SA-BiLSTM表现出优秀的预测能力,可以为DDIs的预测提供一种新的思路。展开更多
随着中西医结合模式的推广,中西药联用的合理性与安全性话题引起医药界乃至社会各界的广泛关注。面对中西药联用的临床获益-风险证据不足、科学内涵尚不明确的现状,探索基于临床实践的中西药相互作用(Chinese and western medicine inte...随着中西医结合模式的推广,中西药联用的合理性与安全性话题引起医药界乃至社会各界的广泛关注。面对中西药联用的临床获益-风险证据不足、科学内涵尚不明确的现状,探索基于临床实践的中西药相互作用(Chinese and western medicine interactions,CWI)研究路径,有助于回答中西药联用的合理性与安全性。据此提出以临床获益-风险为导向的CWI发现和评价的研究策略:(1)构建以临床获益-风险信号为主、以物质体内暴露信号为辅的CWI发现路径;(2)探索以代谢酶、转运体等药动学靶标及功效靶标为突破点的相互作用评价路径;(3)形成以临床价值为导向的CWI发现及评价的证据体系。旨在优化并推广合理的中西药联用方案,揭示中西药联用有效性与安全性的科学内涵,助力提高中西医结合临床水平。展开更多
文摘提出了一种基于双层双向长短时记忆网络(bi-directional long short term memory,BiLSTM)和自注意力(self-attention)机制的药物-药物相互作用(drug-drug interactions,DDIs)预测方法SA-BiLSTM。首先,利用FP3指纹、MACCS指纹、Pubchem指纹和PaDEL分子描述符对药物特征信息进行提取。其次,使用套索回归(least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)方法消除对分类无关的特征,并利用重复编辑最近邻(repeated edited nearest neighbors,RENN)方法对数据进行平衡处理,得到最优特征向量。最后,将最优特征向量输入结合自注意力机制和双向长短时记忆网络的分类器预测DDIs。基于五折交叉验证,同时与其它预测方法进行比较,本工作所提出的方法在两个数据集上获得较高的预测准确率。为了综合评价SA-BiLSTM的性能,对药物-药物相互作用网络进行验证。实验结果表明,SA-BiLSTM表现出优秀的预测能力,可以为DDIs的预测提供一种新的思路。
文摘目的基于构建生理药动学(physiologically-based pharmacokinetics,PBPK)模型的方法,对五味子甲素与西罗莫司之间的药物-药物相互作用(drug-drug interaction,DDI)特征进行研究。方法应用PK-Sim®软件,建立西罗莫司、五味子甲素的PBPK模型,经验证用于预测成人及儿童中的DDI。结果联用五味子甲素时,成人中西罗莫司的最大血浆药物浓度(maximum concentration,Cmax)和血药浓度-时间曲线下面积(area under the plasma concentration-time curve,AUC)分别升高至1.0、1.3倍。0~6岁的儿童群体DDI较成人更加显著,Cmax和AUC的变化比率分别为1.63和4.59,且随着年龄逐渐增加,最终与成人DDI程度持平。结论五味子甲素可增加西罗莫司的疗效,且与年龄有关。临床使用五味子甲素与西罗莫司的联用时,应重视血药浓度监测并及时进行剂量调整,尤其是在儿童群体中。
文摘随着中西医结合模式的推广,中西药联用的合理性与安全性话题引起医药界乃至社会各界的广泛关注。面对中西药联用的临床获益-风险证据不足、科学内涵尚不明确的现状,探索基于临床实践的中西药相互作用(Chinese and western medicine interactions,CWI)研究路径,有助于回答中西药联用的合理性与安全性。据此提出以临床获益-风险为导向的CWI发现和评价的研究策略:(1)构建以临床获益-风险信号为主、以物质体内暴露信号为辅的CWI发现路径;(2)探索以代谢酶、转运体等药动学靶标及功效靶标为突破点的相互作用评价路径;(3)形成以临床价值为导向的CWI发现及评价的证据体系。旨在优化并推广合理的中西药联用方案,揭示中西药联用有效性与安全性的科学内涵,助力提高中西医结合临床水平。
