fv-gs6:一个与金针菇菌柄伸长相关的葡聚糖合酶基因 被引量：1

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作者 龙莹 严俊杰 +5 位作者 仝宗军 刘媛媛 苗娟 陶永新 江玉姬 谢宝贵 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第6期698-704,共7页

根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:... 根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:fv-gs6编码蛋白(Fv-GS6)具有β-1,6-葡聚糖合酶的保守motif,且与担子菌的β-1,6-葡聚糖合酶聚在同一个分支.生物信息学分析表明:该蛋白具备信号肽、亚细胞定位于细胞外,属于分泌蛋白;推测Fv-GS6蛋白可能直接在细胞外催化β-1,6-葡聚糖的合成.通过qRT-PCR方法检测该基因在子实体不同发育时期的表达量,结果显示:fv-gs6在菌柄上高表达,且在伸长期菌柄表达量最高;其中,菌柄的伸长区段表达量是不伸长区段的5.42倍.根据β-1,6-葡聚糖合酶在真菌细胞壁合成中的功能,推测fv-gs6的高表达可能促进细胞壁合成,参与金针菇菌柄的伸长过程. 展开更多

关键词 金针菇 β-1 6-葡聚糖合酶 基因结构 细胞壁合成 菌柄伸长 差异表达

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金针菇细胞色素c过氧化物酶基因(ffccp)及其在菌柄伸长的差异表达初步分析 被引量：4

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作者 王瑞清 严俊杰 +5 位作者 李依宁 杨环 马新斌 王朦 陶永新 谢宝贵 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期993-1005,共13页

细胞色素c过氧化物酶(cytochrome C peroxidase,Cc P)是细胞内H2O2的主要降解酶,参与真菌的氧化应答过程。本研究基于基因组数据获得一个金针菇细胞色素c过氧化物酶编码基因,命名为ffccp。该基因全长1 913bp,包含一个1 098bp的完整开放... 细胞色素c过氧化物酶(cytochrome C peroxidase,Cc P)是细胞内H2O2的主要降解酶,参与真菌的氧化应答过程。本研究基于基因组数据获得一个金针菇细胞色素c过氧化物酶编码基因,命名为ffccp。该基因全长1 913bp,包含一个1 098bp的完整开放阅读框,编码365个氨基酸。生物信息学分析结果显示,该基因编码的蛋白质(Ff Cc P)无跨膜结构和信号肽,不形成二硫键结构,亚细胞定位于线粒体上,具备血红素结合蛋白的保守位点。序列比对和进化分析结果显示,金针菇与糙皮侧耳Pleurotus ostreatus等大型真菌的Cc P序列高度相似(相似度均超过70%),属于Cc P家族蛋白。RT-q PCR的检测结果显示,氧化胁迫和损伤胁迫均能诱导ffccp基因上调表达,但两种胁迫对ffccp表达的调控机制可能并不相同。进一步检测ffccp在子实体发育过程中的差异表达情况,发现ffccp在伸长期菌柄出现显著上调表达,且表达量与菌柄伸长速度的相关性达到0.998,为极强正相关。推测ffccp的上调表达可能有利于菌柄的伸长。 展开更多

关键词 血红素过氧化物酶 子实体发育 菌柄伸长 胁迫应答 基因表达

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金针菇细胞周期蛋白编码基因fvccnl的鉴定及表达分析

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作者 黄千慧 汤熙 +3 位作者 周冰心 林冬梅 张维瑞 郑世仲 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期43-50,共8页

为探索细胞周期蛋白在食用菌生长发育过程中的作用,基于金针菇(Flammulina filiformis)的基因组和转录组数据筛选得到一个假定细胞周期蛋白编码基因fvccnl,并对其基因结构、蛋白质基本性质、分子进化、蛋白质比对与表达模式进行分析。... 为探索细胞周期蛋白在食用菌生长发育过程中的作用,基于金针菇(Flammulina filiformis)的基因组和转录组数据筛选得到一个假定细胞周期蛋白编码基因fvccnl,并对其基因结构、蛋白质基本性质、分子进化、蛋白质比对与表达模式进行分析。结果表明,fvccnl基因全长1767 bp,含有5个外显子及4个内含子,CDS长度为1563 bp,编码蛋白含520个氨基酸,预测分子量为59099.95 Da,等电点为5.01。保守域与分子进化分析结果显示,Fvccnl蛋白具有Cyclin_N与CYCLIN两个保守结构域,均系典型的细胞周期蛋白保守域,属于细胞周期蛋白超家族成员;Fvccnl与子囊菌和动物的B类细胞周期蛋白进化关系较近,而与动物D类和子囊菌CLN型细胞周期蛋白关系较远。实时荧光定量PCR结果表明,fvccnl在原基、菌柄和菌盖中的表达量分别是菌丝的3.2、9.1和4.2倍,在菌柄伸长部位的表达量是非伸长部位的11倍,推测fvccnl对金针菇子实体的发育,尤其是对菌柄的伸长具有重要作用。 展开更多

关键词 细胞周期蛋白 子实体发育 金针菇 菌柄伸长 细胞周期蛋白依赖性激酶

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金针菇小G蛋白Ran的序列特征与表达分析 被引量：5

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作者 张磊 仝宗军 +5 位作者 严俊杰 黄蓉梅 刘媛媛 李冰玉 汪健芳 谢宝贵 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期13-19,F0003,共8页

基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组和转录组数据,运用本地BLAST方法,找到一个小G蛋白Ran的编码基因,命名为FvRan1。运用生物信息学方法进行分析,结果显示:该基因全长为1337bp,编码区长度为1079bp,包含7个外显子和6个内含子,其中4... 基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组和转录组数据,运用本地BLAST方法,找到一个小G蛋白Ran的编码基因,命名为FvRan1。运用生物信息学方法进行分析,结果显示:该基因全长为1337bp,编码区长度为1079bp,包含7个外显子和6个内含子,其中4个内含子(I1、I2、I3、I6)在mRNA加工过程中存在可变剪切现象。通过氨基酸序列同源比对和系统发育分析发现,FvRan1具有5个G-Box保守结构域和2个效应器开关,与担子菌中Moniliophthora roreri以及Trametes versicolor的亲缘关系最近。采用RT-qPCR研究FvRan1在不同生长时期及部位、伸长期菌柄的不同部位以及竖直、微重力(旋转)、水平3个不同处理条件下的表达量,结果表明,FvRan1在成熟期菌柄中的表达量最高;在金针菇伸长区段的表达量显著高于生长点和非伸长区段;在模拟微重力条件下,FvRan1呈显著上调表达。FvRan1基因在金针菇菌柄伸长与重力应答过程中可能具有正调控作用。 展开更多

关键词 金针菇 Ran蛋白 菌柄伸长 重力刺激 荧光定量PCR

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草菇VEGF信号通路中vv-SPK基因的结构与表达分析 被引量：3

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作者 王健 万芳 +3 位作者 李肖 严俊杰 黄李琳 谢宝贵 《福建农业学报》 CAS 北大核心 2017年第3期263-267,共5页

VEGF通路是一条调控细胞增殖、分化、迁移、应激反应以及生存的信号通路。本研究从草菇基因组中获得1个在VEGF通路中编码SPK蛋白的基因,将其命名为vv-SPK,并对该基因进行结构分析,结果显示:基因vv-SPK全长1 996bp,包含11个内含子;ORF长... VEGF通路是一条调控细胞增殖、分化、迁移、应激反应以及生存的信号通路。本研究从草菇基因组中获得1个在VEGF通路中编码SPK蛋白的基因,将其命名为vv-SPK,并对该基因进行结构分析,结果显示:基因vv-SPK全长1 996bp,包含11个内含子;ORF长为1 401bp,编码466个氨基酸。通过BLASTP比对显示,vv-SPK基因与纹缘盔孢伞、双色蜡蘑以及紫蜡蘑的相似度最高;经过荧光定量PCR验证后发现,SPK蛋白的基因表达量与菌柄的伸长有关。根据SPK在VEGF通路中参与的细胞增殖途径以及SPK蛋白本身的激酶特性,推测其对草菇菌柄生长过程的细胞分裂和伸长有显著的促进作用,且草菇中可能存在SPK激酶介导的促进细胞增殖、伸长的信号通路。 展开更多

关键词 VEGF通路 草菇 菌柄伸长 促进增殖

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草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达 被引量：1

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作者 汪健芳 徐志周 +4 位作者 严俊杰 李肖 张磊 黄李琳 谢宝贵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期381-385,共5页

【目的】分析草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达,为进一步探究草菇生长发育及子实体开伞分子调控机理提供参考。【方法】通过生物信息学分析确定Vv-CNA基因的组成及保守结构,将ORF Finder预测的草菇CNA氨基酸序列与从NCBI下... 【目的】分析草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达,为进一步探究草菇生长发育及子实体开伞分子调控机理提供参考。【方法】通过生物信息学分析确定Vv-CNA基因的组成及保守结构,将ORF Finder预测的草菇CNA氨基酸序列与从NCBI下载的其他真菌CNA氨基酸序列进行比对,并通过荧光定量PCR检测Vv-CNA基因在草菇不同生长时期的相对表达量。【结果】Vv-CNA基因编码区为2503 bp,包含10个内含子(其中I2、I8、I9和I10存在内含子保留现象),编码610个氨基酸,Gen Bank登录号KX463514。将Vv-CNA氨基酸序列与动物(人、小鼠)、植物(拟南芥、水稻)和真菌(曲霉、酵母等)的CNA氨基酸序列进行同源比对分析,结果发现Vv-CNA蛋白有3个最保守的结构域,与密褐褶菌(Gloeophyllum trabeum)的亲缘关系最近。Vv-CNA基因在草菇子实体的蛋形期和伸长期高表达,以蛋形期的相对表达量最高。【结论】Vv-CNA基因编码钙调磷酸酶催化亚基,其高表达有利于草菇菌柄的伸长。 展开更多

关键词 草菇 钙调磷酸酶催化亚基(CNA) 基因结构 表达分析 菌柄伸长

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金针菇类扩张蛋白fvexpl2鉴定及其表达模式分析 被引量：2

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作者 温蝶 武鑫 +3 位作者 黄千慧 陈屹耒 谢宝贵 温志强 《北方园艺》 CAS 北大核心 2020年第12期135-141,共7页

基于金针菇基因组与转录组数据,利用在线软件BLAST鉴定了一个扩张蛋白类似物编码基因,命名为fvexpl2,并对其基因结构进行了鉴定,通过构建进化树的方法分析了fvexpl2与担子菌、子囊菌扩张蛋白类似物以及植物扩张蛋白之间的亲缘关系。结... 基于金针菇基因组与转录组数据,利用在线软件BLAST鉴定了一个扩张蛋白类似物编码基因,命名为fvexpl2,并对其基因结构进行了鉴定,通过构建进化树的方法分析了fvexpl2与担子菌、子囊菌扩张蛋白类似物以及植物扩张蛋白之间的亲缘关系。结果表明:扩张蛋白类似物外显子的数目为4个,内含子的数目为3个,并且CDS的长度是438 bp,分子量为15 746.88 Da,等电点为4.93;进化树图显示fvexpl2与担子菌类扩张蛋白处于同一亚支,亲缘关系较近。实时荧光定量PCR结果则表明fvexpl2在菌柄伸长部位具有较高的表达水平,其表达水平远远高于菌盖、原基以及菌丝部位的表达水平,且其在伸长较快部位表达水平显著高于伸长较慢部位表达水平,所以fvexpl2可能对菌柄伸长起重要作用。 展开更多

关键词 扩张蛋白 形态发生 菌柄伸长 进化树 荧光定量PCR

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金针菇假定蛋白E3泛素连接酶基因的鉴定与表达分析

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作者 武鑫 温蝶 +2 位作者 黄千慧 谢宝贵 温志强 《北方园艺》 CAS 北大核心 2020年第5期129-137,共9页

以金针菇基因组与转录组数据为基础,通过本地BLAST方法鉴定金针菇假定蛋白E3泛素连接酶基因,命名为GENE5116,并对其结构、编码蛋白的基本性质与表达模式进行了分析,以期了解其在金针菇子实体生长发育过程中的作用。结果表明:该基因有9... 以金针菇基因组与转录组数据为基础,通过本地BLAST方法鉴定金针菇假定蛋白E3泛素连接酶基因,命名为GENE5116,并对其结构、编码蛋白的基本性质与表达模式进行了分析,以期了解其在金针菇子实体生长发育过程中的作用。结果表明:该基因有9个外显子,8个内含子,基因总长为1998 bp,共编码438个氨基酸残基,相对分子质量为48987.36,等电点8.83;系统进化分析结果表明该基因与真菌E3泛素连接酶具有高度同源性,与陶兰柱担菌(Cylindrobasidium torrendii)亲缘关系最近;实时荧光定量PCR结果表明该基因在菌柄的表达量最高且菌柄上部基因表达量显著高于下部,在菌丝的表达量最低,所以推测该基因可能与子实体菌柄伸长有关。 展开更多

关键词 E3泛素连接酶 荧光定量PCR 表达量 菌柄伸长

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聚丙烯和PBAT树脂共混薄膜对金针菇的贮藏保鲜效果 被引量：2

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作者 额尔敦巴雅尔 春艳 +2 位作者 白鹤飞 徐董 董同力嘎 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2021年第19期329-335,共7页

本研究选择具有耐化学性、耐热性、高强度机械性能和高耐磨加工性能的聚丙烯(PP)作为基材与具有较高的透湿性的生物可降解材料PBAT树脂进行共混,共混后选用改性效果最好的比例(PP80%/PBAT20%)制成PPT2共混薄膜,对金针菇进行PPT2真空包装... 本研究选择具有耐化学性、耐热性、高强度机械性能和高耐磨加工性能的聚丙烯(PP)作为基材与具有较高的透湿性的生物可降解材料PBAT树脂进行共混,共混后选用改性效果最好的比例(PP80%/PBAT20%)制成PPT2共混薄膜,对金针菇进行PPT2真空包装和PPT2密封包装,通过对比无包装空白组、市场包装组、PPT2密封组和PPT2真空组后,发现无包装组在第3 d时出现萎蔫腐烂现象失去食用价值,市场包装组在18 d时可溶性固形物含量下降并在包装袋上出现结露和涨包现象失去食用价值,PPT2密封包装组由于前期对气氛控制不稳定,呼吸旺盛时可溶性固形物含量出现骤然上升的假象。PPT2真空包装组金针菇失重率、Vc含量变化、可溶性固形物含量下降的比较平缓,未出现涨包结露等现象,保存至27 d时才出现萎蔫腐烂现象失去食用价值,保鲜效果与其它三组相比较为优异。因此,PPT2共混薄膜结合真空包装能有效控制金针菇后生长引起的菌柄伸长现象,从而延长货架期。 展开更多

关键词 金针菇 后生长 真空包装 菌柄伸长 贮藏保鲜 聚丙烯 PBAT 树脂

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4种鬼伞β-1,3-葡聚糖转移酶的生物信息学分析

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作者 牛鑫 柴倩囡 +4 位作者 冯九海 单华佳 柯善文 汉佳昕 魏生龙 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第6期33-39,共7页

鬼伞是一类菌柄能在短时间内快速伸长并且伞盖易自溶形成墨汁的蘑菇,菌柄在伸长过程中细胞壁以伸长生长为主,细胞壁组分β-1,3-葡聚糖发生重构修饰,GH72家族的β-1,3-葡聚糖转移酶能够将较低聚合度的寡糖转化生成更高聚合度的糖链。β-1... 鬼伞是一类菌柄能在短时间内快速伸长并且伞盖易自溶形成墨汁的蘑菇,菌柄在伸长过程中细胞壁以伸长生长为主,细胞壁组分β-1,3-葡聚糖发生重构修饰,GH72家族的β-1,3-葡聚糖转移酶能够将较低聚合度的寡糖转化生成更高聚合度的糖链。β-1,3-葡聚糖转移酶可能参与鬼伞菌柄细胞壁中β-葡聚糖组分的重构修饰。以完成测序并有注释信息的灰盖拟鬼伞(Coprinopsis cinerea)、拟鬼伞(Coprinopsis marcescibilis)、晶粒小鬼伞(Coprinellus micaceus)和小脆柄菇(Psathyrella aberdarensis)等4种鬼伞的β-1,3-葡聚糖转移酶的氨基酸序列为基础,采用TargetP、WOLF PSORT、SignalP、Sompa、TMHMM 2.0、Big-PI Fungal Predictor、MEME和SISS-MODEL等生物信息学分析工具对其开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、跨膜螺旋、糖基化磷脂酰肌醇(GPI)锚定位点、基序以及三级结构等进行分析,同时对上述序列开展遗传进化关系分析。研究结果可为进一步深入开展该蛋白在菌柄伸长过程中细胞壁β-葡聚糖组分的重构修饰研究作基础。 展开更多

关键词 真菌细胞壁 菌柄伸长 Β-1 3-葡聚糖 细胞壁重构 多序列比对 生物信息学

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金针菇外切-β-1,3-葡聚糖酶家族基因鉴定及在不同发育时期的差异表达 被引量：4

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作者 陶永新 段静怡 +3 位作者 仝宗军 严俊杰 宋寒冰 谢宝贵 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1661-1670,共10页

金针菇具有很高的营养与保健价值,菌柄长短决定金针菇的产量与品质,而菌柄伸长的相关作用酶及分子机理尚不清楚。前期草菇中发现外切-β-1,3-葡聚糖酶基因(exg2)可能与菌柄伸长相关,但在金针菇中尚没有exg基因的相关报道。本研究首先在... 金针菇具有很高的营养与保健价值,菌柄长短决定金针菇的产量与品质,而菌柄伸长的相关作用酶及分子机理尚不清楚。前期草菇中发现外切-β-1,3-葡聚糖酶基因(exg2)可能与菌柄伸长相关,但在金针菇中尚没有exg基因的相关报道。本研究首先在金针菇全基因组中鉴定到3个外切-β-1,3-葡聚糖酶家族基因(分别命名为:Ffexg1、Ffexg2、Ffexg3),并进行了克隆验证。进一步采用定量PCR对3个基因在金针菇不同发育时期及组织部位的差异性表达进行了分析。结果显示:Ffexg1只在菌柄中高表达,Ffexg2与Ffexg3在菌柄中表达量先上升后下降,在菌盖中呈逐渐上升趋势。3个Ffexg基因均在菌柄发生伸长的部位表达量较高,且在菇体水平放置后菌柄弯曲程度较大的部位表达量较高。结果显示金针菇exg家族3个基因存在时空差异性表达,在菌柄中伸长较快的时期及部位伴随着Ffexg基因的高表达。结合其功能预测,Ffexg家族基因可能作用于细胞壁成分β-1,3-葡聚糖链,从而在金针菇菌柄及菌盖发育中起作用。 展开更多

关键词 真菌形态建成 菌柄伸长 细胞壁作用酶 表达模式

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