N6-甲基腺苷表观转录组学在原发性肝癌中的研究进展

1

作者 杨小周 赵华栋 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 CAS 2023年第2期239-242,共4页

除DNA和组蛋白外,RNA(mRNA、tRNA、snRNA等)在不同的位点存在数百种不同种类的修饰。早期对RNA修饰的研究主要集中在mRNA的5'端。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)已被认为是哺乳动物mRNA和非编码RNA中含量最丰富的化学修饰,并... 除DNA和组蛋白外,RNA(mRNA、tRNA、snRNA等)在不同的位点存在数百种不同种类的修饰。早期对RNA修饰的研究主要集中在mRNA的5'端。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)已被认为是哺乳动物mRNA和非编码RNA中含量最丰富的化学修饰,并参与调节多种细胞过程[1]。由于RNA结构和功能的复杂性,深入了解m6A生物学作用仍然极富挑战性。最近研究表明转录后的RNA修饰过程是可逆且动态变化,提示其可能具有类似于DNA和组蛋白修饰的潜在调节能力。这种可逆性修饰与DNA和组蛋白修饰类似,是调控基因表达的重要机制之一。研究这些可逆RNA修饰的前景和功能现在正成为一个新的研究前沿,被称为"RNA表观遗传学"或"表观转录组学"[2]。m6A修饰表观转录组学的研究对原发性肝癌(肝癌)的预后、治疗和术后评估有着广阔的应用前景。本篇综述重点介绍m6A修饰调节及其在肝癌发展和治疗中作用的最新进展。 展开更多

关键词 肝肿瘤 癌 肝细胞 肝内胆管细胞癌 N6-甲基腺苷 RNA甲基化 表观转录组学

原文传递

糖脂代谢表观转录调控的研究进展

2

作者 尹凯 覃金凤 《华夏医学》 CAS 2023年第1期1-10,共10页

表观转录调控是指在不改变RNA序列的前提下,通过其可逆的化学修饰参与基因转录后调控,在多种疾病及其病理生理过程中发挥重要作用。葡萄糖和脂类是人体最主要的能量来源,糖脂内源性代谢和表达水平受到机体精准调控,其调控异常与多种代... 表观转录调控是指在不改变RNA序列的前提下,通过其可逆的化学修饰参与基因转录后调控,在多种疾病及其病理生理过程中发挥重要作用。葡萄糖和脂类是人体最主要的能量来源,糖脂内源性代谢和表达水平受到机体精准调控,其调控异常与多种代谢性疾病的发生发展密切相关。近年来研究发现,表观转录修饰,如N^(6)-甲基腺苷(m^(6)A)、5-甲基胞苷(m^(5)C)等均可通过改变关键因子的RNA二级结构、剪接、降解、稳定性等,参与糖脂代谢的调控过程。本文主要综述近年来表观转录调控参与糖脂代谢及其相关疾病的研究进展,为代谢性疾病的防治提供新思路。 展开更多

关键词 表观转录组学 N^(6)-甲基腺苷 糖代谢 脂代谢 肠道菌群

下载PDF 职称材料

高脂饮食诱导的小鼠NAFLD模型肝组织中m6A甲基化修饰表达谱分析

3

作者 刘君君 逯素梅 +2 位作者 张炳杨 李永清 马万山 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1227-1235,共9页

目的·利用微阵列芯片技术检测高脂饮食诱导的小鼠非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)模型中肝组织mRNA的m6A甲基化修饰和基因表达的变化。方法·以6~8周龄雄性C57BL/6J小鼠为实验动物,高脂饲料喂养1... 目的·利用微阵列芯片技术检测高脂饮食诱导的小鼠非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)模型中肝组织mRNA的m6A甲基化修饰和基因表达的变化。方法·以6~8周龄雄性C57BL/6J小鼠为实验动物,高脂饲料喂养16周诱导建立NAFLD模型(高脂组,n=10);另设基础组(n=10)为对照,给予含10%脂肪的基础饲料喂养。苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,H-E)染色评估小鼠肝组织病理改变,判断NAFLD模型是否构建成功。运用甲基化RNA免疫共沉淀技术(methylated RNA immunoprecipitation,MeRIP)和微阵列测序技术(microarray表达谱分析)检测2组小鼠肝组织中mRNA的m6A甲基化和表达水平变化。结果·基础组小鼠肝脏呈鲜红色,少见脂肪沉积;高脂组小鼠肝脏边界黄润,H-E染色可见肝细胞中脂滴弥漫浸润且相互融合,提示高脂饲料诱导的NAFLD模型构建成功。MeRIP-微阵列芯片检测结果显示,与基础组相比,高脂组小鼠肝脏中共有320个基因m6A甲基化修饰水平变化显著(P<0.05且变化倍数>1.5),其中有108个上调基因和212个下调基因。将组间m6A甲基化水平差异显著的基因与mRNA差异表达基因取交集,发现有163个基因m6A甲基化水平和mRNA表达水平均差异显著。结论·高脂饮食诱导的小鼠NAFLD模型中肝组织mRNA的m6A修饰变化显著,且该变化与mRNA的基因表达有关。 展开更多

关键词 非酒精性脂肪性肝病 m6A甲基化修饰 mRNA 表观转录组学

下载PDF 职称材料

RNA甲基化修饰调控和规律 被引量：13

4

作者 杨莹 陈宇晟 +1 位作者 孙宝发 杨运桂 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期964-976,共13页

表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来,在DNA和蛋白质修饰基础上,可逆RNA甲基化修饰研究引领了第3次表观遗传学修饰研究的浪潮。RNA存在100余种化学修饰,甲基化是最主要的... 表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来,在DNA和蛋白质修饰基础上,可逆RNA甲基化修饰研究引领了第3次表观遗传学修饰研究的浪潮。RNA存在100余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术,是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。本文主要总结了近年来本课题组与合作团队及国内外同行在RNA甲基化表观转录组学研究中取得的主要前沿进展,包括发现了RNA去甲基酶、甲基转移酶和结合蛋白,揭示RNA甲基化修饰调控RNA加工代谢,及其调控正常生理和异常病理等重要生命进程。这些系列研究成果证明RNA甲基化修饰类似于DNA甲基化,具有可逆性,拓展了RNA甲基化表观转录组学研究新领域,完善了中心法则表观遗传学规律。 展开更多

关键词 表观转录组学 RNA甲基化 RNA加工 6-甲基腺嘌呤 5-甲基胞嘧啶

下载PDF 职称材料

let-7b-5p通过FTO/m^6 A/MYC信号通路抑制人类白血病THP-1细胞增殖 被引量：4

5

作者 吴淡森 郑彩罚 +3 位作者 曾泳萍 林晶 陈佳龙 石松菁 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1873-1879,共7页

目的:探讨let-7b-5p下调FTO并通过m^6A/MYC信号通路抑制急性髓系白血病细胞系THP-1增殖的作用。方法:选取急性髓系白血病细胞系THP-1及正常人外周血单个核细胞(PBMNC)为研究对象,采用RT-PCR检测细胞中let-7b-5p及FTO mRNA表达;Western b... 目的:探讨let-7b-5p下调FTO并通过m^6A/MYC信号通路抑制急性髓系白血病细胞系THP-1增殖的作用。方法:选取急性髓系白血病细胞系THP-1及正常人外周血单个核细胞(PBMNC)为研究对象,采用RT-PCR检测细胞中let-7b-5p及FTO mRNA表达;Western blot检测细胞中FTO蛋白表达;采用荧光素酶报告基因实验验证let-7b-5p对FTO的靶向作用。分别采用let-7b-5p mimic转染THP-1细胞和let-7b-5p inhibitor转染PBMNC,采用m^6A斑点印迹分析转染后的c-MYC mRNA m^6A富集水平变化,RT-PCR分析转染细胞let-7b-5p、FTO与c-MYC mRNA表达水平变化,Western blot进一步验证FTO、c-MYC表达,验证let-7b-5p对FTO表达的影响;采用MTT法检测转染后细胞的增殖水平。结果:与PBMNC比较,THP-1的let-7b-5p表达显著降低,而FTO表达明显增高,差异显著(P<0.05);let-7b-5p mimic联合FTO 3'-UTR使转染的THP-1细胞荧光素酶活性显著降低,而联合3'-UTR结合位点突变使转染的THP-1细胞荧光素酶活性显著增高,与阴性对照组的差异显著(P<0.05)。let-7b-5p inhibitor下调c-MYC mRNA m^6A富集水平,上调PBMNC表达FTO,差异显著(P<0.05);然而,let-7b-5p mimic上调c-MYC mRNA m^6A富集水平,下调THP-1表达FTO,细胞增殖率显著降低,与空载体组(阴性对照组)差异显著(P<0.05)。结论:人急性髓系白血病细胞系THP-1低表达let-7b-5p,通过let-7b-5p-/FTO-/m^6A轴调节c-MYC表达,进而促进白血病细胞增殖。 展开更多

关键词 急性白血病 表观转录组学 N6-甲基腺苷 信号通路 脂肪与肥胖相关基因

原文传递

RNA m^(6)A甲基化修饰在代谢综合征中的研究进展 被引量：1

6

作者 叶棣文 马万山 逯素梅 《临床检验杂志》 CAS 2022年第9期691-694,共4页

代谢综合征是以肥胖、糖尿病、高血压以及心脑血管疾病聚集发病的临床症候群。近年来,随着人民生活水平的逐渐提高,代谢综合征的发病人数也在逐年增长,寻找新的诊断和治疗代谢综合征的方法已成为医学研究领域亟待解决的问题之一。N6-甲... 代谢综合征是以肥胖、糖尿病、高血压以及心脑血管疾病聚集发病的临床症候群。近年来,随着人民生活水平的逐渐提高,代谢综合征的发病人数也在逐年增长,寻找新的诊断和治疗代谢综合征的方法已成为医学研究领域亟待解决的问题之一。N6-甲基腺嘌呤甲基化(m^(6)A)作为常见的表观遗传修饰,其动态化的可逆修饰影响着被修饰基因的表达,与机体代谢调控关系密切。该文总结了RNA m^(6)A修饰在代谢综合征中的作用及调控机制的研究进展,为m^(6)A修饰及相关的甲基化酶、去甲基化酶成为诊断和治疗代谢综合征的新靶点提供理论依据。 展开更多

关键词 代谢综合征 m^(6)A甲基化修饰 表观转录组学

下载PDF 职称材料

RNA m^(6)A甲基化与神经发育

7

作者 薛李婷 赵天 叶海虹 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期249-261,共13页

中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断... 中枢神经系统控制高级神经活动,例如知觉、运动、语言和认知等。作为人体神经系统最重要的部分,其正常的发育及功能活动在人体发育过程中至关重要。更好地了解调节神经系统发育的基本分子途径以及对大脑的基本生物学理解,可以帮助诊断和治疗各种神经疾病。RNA分子m^(6)A修饰状态的动态变化及其功能主要由m^(6)A甲基转移酶、m^(6)A去甲基化酶和m^(6)A阅读蛋白等蛋白质复合物共同调控。本文对此进行了详细介绍,并详细概述m^(6)A修饰对神经发育的影响,重点介绍表观转录组学在基因调控中的作用。此外,还强调m^(6)A修饰在神经发育过程中的生物学意义,包括神经发生、神经分化、轴突导向、突触形成及突触可塑性等。根据不同的实验原理和实验技术,本文详细介绍了最近发展的几种检测m^(6)A位点的技术,每种方法都有各自的优点,据此将能够更广泛和更深入地研究这一修饰,并选择合适的方法去研究课题。RNA m^(6)A甲基化是神经科学领域的一个新前沿。近年来,随着m^(6)A检测技术的发展,m^(6)A甲基化在神经系统发育过程中及神经疾病发生中的作用研究逐渐成为热点,具有很大潜力,为神经发育和神经疾病的研究提供了新视角。 展开更多

关键词 表观转录组学 N^(6)-腺苷酸甲基化 神经发育 神经发生 突触

原文传递

m^(6)A-RNA甲基化在急性髓系白血病中的研究进展

8

作者 全海薇 张亚丽 +4 位作者 王涵 邹雨彤 程美玉 姜贺然 夏薇 《吉林医药学院学报》 2021年第4期283-286,共4页

N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是mRNA中含量较丰富的内部修饰,可动态可逆地调节mRNA的生物学过程。表观转录组学中的RNA修饰在控制干/祖细胞分化方面起着至关重要的作用,其异常修饰与急性髓系白血病(AML)密切相关。本文综述m^(6)A各组分的功... N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是mRNA中含量较丰富的内部修饰,可动态可逆地调节mRNA的生物学过程。表观转录组学中的RNA修饰在控制干/祖细胞分化方面起着至关重要的作用,其异常修饰与急性髓系白血病(AML)密切相关。本文综述m^(6)A各组分的功能及其在AML发展中的作用,为开发基于抑制m^(6)A沉积治疗AML提供新的方案。 展开更多

关键词 m^(6)A-RNA甲基化 RNA 急性髓系白血病 表观转录组学

下载PDF 职称材料

RNA化学修饰m^6A的生物功能研究进展 被引量：3

9

作者 唐乾 张梧桐 贾桂芳 《中国科学：化学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1233-1249,共17页

N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物m RNA上含量最高的化学修饰. m6A动态可逆调控机制的发现大大推动了以m6A为首的表观转录组学的发展.多种m6A高通量测序技术及检测方法加深了对m6A的分布规律和调控机理的理解.在动物或植物体内, m6A可以被... N6-甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物m RNA上含量最高的化学修饰. m6A动态可逆调控机制的发现大大推动了以m6A为首的表观转录组学的发展.多种m6A高通量测序技术及检测方法加深了对m6A的分布规律和调控机理的理解.在动物或植物体内, m6A可以被一系列甲基转移酶、去甲基酶和结合蛋白进行修饰、去修饰和识别. m6A可以通过影响RNA加工代谢从而调控多种生物学功能.在本文中,我们总结介绍了近十年来m6A检测技术、m6A在动物和植物中的功能研究进展,为后续m6A相关领域的研究与发展提供方向与思考. 展开更多

关键词 N6-甲基腺嘌呤(m6A) 表观转录组学 RNA化学修饰

原文传递

mRNA修饰研究概况及展望 被引量：2

10

作者 孙文举 周克任 +2 位作者 杨建华 周惠 屈良鹄 《生命科学》 CSCD 2016年第5期531-538,共8页

信使RNA的核苷酸修饰主要包括2'-O-甲基化、假尿嘧啶化、m6A、m5C、m7G、m1A、5hm C等。已有的研究表明,这些修饰在m RNA稳定性、加工、遗传信息传递以及细胞的应激反应中起到重要作用。由于技术的限制,过去我们对于m RNA修饰知之... 信使RNA的核苷酸修饰主要包括2'-O-甲基化、假尿嘧啶化、m6A、m5C、m7G、m1A、5hm C等。已有的研究表明,这些修饰在m RNA稳定性、加工、遗传信息传递以及细胞的应激反应中起到重要作用。由于技术的限制,过去我们对于m RNA修饰知之甚少。近年来,一系列新技术的产生为全面地考察m RNA核苷酸修饰状况,深入地研究它们的生物学功能提供了极大的便利,并且取得了一些重要的进展。就此方面的研究概况作简要概述。 展开更多

关键词 信使RNA 核苷酸修饰 假尿嘧啶化 m6A m1A m5C 表观转录组学

原文传递

真核生物mRNA上的修饰核苷及在发育调控中的作用 被引量：1

11

作者 刘雪 张涛 +2 位作者 周笑琦 管伦 陈鹏 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1779-1793,共15页

信使RNA (Messenger RNA,mRNA)上的表观修饰对于转录本的稳定性和翻译活性有重要影响。在不同生物体的不同发育时期和不同组织器官中,特异转录本不同位点存在的核苷修饰影响mRNA的前体剪切、成熟mRNA的稳定性以及其翻译为蛋白质的效率... 信使RNA (Messenger RNA,mRNA)上的表观修饰对于转录本的稳定性和翻译活性有重要影响。在不同生物体的不同发育时期和不同组织器官中,特异转录本不同位点存在的核苷修饰影响mRNA的前体剪切、成熟mRNA的稳定性以及其翻译为蛋白质的效率。目前已知的170多种修饰核苷中在mRNA上发现的只占极少数,由于mRNA的丰度低、组织和发育特异性强等特点,研究mRNA特异位点的核苷修饰有很大的技术难度。近些年随着meRIP等技术的进步,mRNA核苷修饰功能的研究得到了长足的发展,特别是针对m6A、m5C等甲基化修饰的研究已经相当深入。文中简要回顾近年来mRNA核苷修饰领域的研究进展,对不同位点和不同类型的修饰核苷在不同物种生长发育中的调控作一总结,并对未来的研究热点和技术瓶颈展开讨论。 展开更多

关键词 信使RNA 核苷修饰 发育调控 表观转录组学 RNA表观遗传学

原文传递

RNA的N^(6)-甲基腺嘌呤甲基化在肿瘤放疗中的作用研究进展

12

作者 全睿 程光惠 武宁 《中华放射肿瘤学杂志》 2024年第5期472-478,共7页

随着表观遗传转录组学的深入探究,越来越多的研究发现N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)甲基化作为真核生物mRNA上含量最高的化学修饰,在恶性肿瘤的发生和发展中发挥了重要作用。m^(6)A RNA甲基化修饰在肿瘤放射治疗中的作用研究逐渐成为热点,... 随着表观遗传转录组学的深入探究,越来越多的研究发现N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)甲基化作为真核生物mRNA上含量最高的化学修饰,在恶性肿瘤的发生和发展中发挥了重要作用。m^(6)A RNA甲基化修饰在肿瘤放射治疗中的作用研究逐渐成为热点,其可能通过调节辐射诱导的DNA损伤修复、参与肿瘤干细胞的辐射抗性、调控肿瘤放射敏感性、影响放疗相关不良反应及优化放疗联合其他治疗的协同效应等途径,干预肿瘤放疗的疗效及预后。本文就有关RNA的m^(6)A甲基化修饰在肿瘤放射治疗中的调控机制研究进展进行综述,旨在为探索肿瘤放射治疗研究中的潜在靶点、探寻发挥增效减毒作用的关键环节提供新的思路。 展开更多

关键词 放射疗法 N^(6)-甲基腺嘌呤 表观遗传转录组学

原文传递