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西洋接骨木转录组SSR挖掘及荧光标记开发
被引量:
6
1
作者
姚俊修
李善文
+4 位作者
任飞
李庆华
刘学良
吴德军
燕丽萍
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期123-129,147,共8页
转录组SSR引物的开发为接骨木遗传多样性分析、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供丰富的遗传标记。以一株成年西洋接骨木的果实为实验材料,提取RNA后,采用Illumina HiSeq 2000高通量测序获得西洋接骨木转录组数据,共得到西洋接骨木转录...
转录组SSR引物的开发为接骨木遗传多样性分析、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供丰富的遗传标记。以一株成年西洋接骨木的果实为实验材料,提取RNA后,采用Illumina HiSeq 2000高通量测序获得西洋接骨木转录组数据,共得到西洋接骨木转录组的257975条Unigene,检测到64148个SSR位点,分布于51336条Unigene,SSR位点出现频率为24.87%(SSR位点数与总的Unigene数的比值),其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的51.13%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的38.63%和9.11%。A/T和AG/CT是单核酸和二核苷酸的优势重复基元。通过试验优化获得最优的两步荧光引物PCR扩增体系。加M13接头PCR扩增体系:10μL PCR体系中含DNA原液1μL,2×Mix 5μL,10μM引物各0.1μL,灭菌超纯水3.8μL;荧光引物PCR扩增体系:20μL PCR体系中含第一步扩增产物DNA原液2μL,2×Mix 10μL,10μM M13接头及反向引物各0.15μL,灭菌超纯水7.7μL。利用已筛选的100对荧光SSR引物对8个不同种接骨木个体进行SSR扩增,80对可扩增出条带,有效扩增率为80%,25对可成功扩增出多态性,多态性比率为31.25%,从25对具有多态性引物中选择14对多态性较好的引物对不同种接骨木进行遗传多样性分析,14对多态性引物共检测出67个等位基因(Na),每位点3~7个,平均等位基因4.786个;每位点有效等位基因数(Ne)1.684~6.095个,平均有效等位基因数3.413个,观测杂合度(Ho)及期望杂合度(He)分别在0~0.875和0.406~0.836之间,平均值分别为0.313、0.664;Shannon多样性指数(I)在0.736~1.862之间,平均1.310。不同种接骨木具有较高的遗传多样性,25对具有多态性荧光SSR标记开发可为接骨木分子标记辅助育种、杂种优势预测等提供理论基础。
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关键词
西洋接骨木
转录组
SSR
荧光标记
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职称材料
西洋接骨木栽培技术及在园林景观中的应用
2
作者
龙渡江
王栋
《智慧农业导刊》
2022年第9期59-61,共3页
西洋接骨木是忍冬科接骨木属落叶乔木抑或大灌木,其高度为4~10 m;幼枝上有纵条纹,2 a生枝呈黄褐色,凸起的圆形皮孔较多且较为明显;髓部发育良好,白色。羽状复叶有1~3对小叶片,2对最为常见,有短柄,卵形主要为椭圆形或椭圆状,果实呈亮黑...
西洋接骨木是忍冬科接骨木属落叶乔木抑或大灌木,其高度为4~10 m;幼枝上有纵条纹,2 a生枝呈黄褐色,凸起的圆形皮孔较多且较为明显;髓部发育良好,白色。羽状复叶有1~3对小叶片,2对最为常见,有短柄,卵形主要为椭圆形或椭圆状,果实呈亮黑色。花期为4-5月,果熟为7-8月。该品种主要分布于欧洲,此外,其在我国山东、江苏、上海等地也十分常见。民间和庭园引种栽培是一种乔木类植物,开花时,花朵呈团状分布,气味芳香。其果实呈黄白色,具有极高的观赏价值,被用于园林景观设计。作为景观植物使用时,能够为观赏者带来极佳的视觉享受。西洋接骨木是常用的药材,在我国各个地区都有栽培,还有专为园艺观赏用的接骨木。文章探讨分析接骨木形态特征、生长习性、繁育方法及园林景观应用价值。以供参考。
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关键词
西洋接骨木
栽培技巧
园林景观
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职称材料
接骨木及近缘种植物的ITS2序列分析
被引量:
1
3
作者
陈香梅
常山
+1 位作者
王胡格吉乐图
布日额
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第4期411-415,共5页
目的利用DNA条形码技术鉴定接骨木及近缘种植物。方法采用植物基因组DNA提取试剂盒从20个接骨木样本中提取总DNA,对ITS2序列进行PCR扩增并测序;从GenBank上下载接骨木近缘植物ITS2序列,共31条序列做ITS2序列分析,对ITS2序列二级结构进...
目的利用DNA条形码技术鉴定接骨木及近缘种植物。方法采用植物基因组DNA提取试剂盒从20个接骨木样本中提取总DNA,对ITS2序列进行PCR扩增并测序;从GenBank上下载接骨木近缘植物ITS2序列,共31条序列做ITS2序列分析,对ITS2序列二级结构进行对比分析;用MEGA 7.0计算其种间、种内的Kimura 2 parameter(K2P)距离,构建其Neighbor joining(NJ)树。结果ITS2序列长度均为226 bp,GC百分含量范围为57.71%~61.06%;西洋接骨木种间变异位点最多;接骨木属5种药用植物ITS2序列的二级结构极为相近,通过主环结构可以将西伯利亚接骨木与其他4个种区分开,通过Ⅰ区和Ⅲ区茎环数目和大小可有效区别接骨木、接骨草、西洋接骨木和血满草;通过NJ树分析可区分接骨木属中接骨木和西伯利亚接骨木,但未能区分其余3个近缘种。结论ITS2序列可作为接骨木及近缘种药材鉴别的DNA条形码序列。
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关键词
ITS2
接骨木
西伯利亚
接骨木
血满草
西洋接骨木
接骨
草
近缘种
分子鉴定
原文传递
接骨木的化学成分与药理作用
被引量:
5
4
作者
赵岩峰
肖峰
潘勤
《国外医药(植物药分册)》
2007年第5期198-200,共3页
西洋接骨木为欧洲的传统草药,主要含有黄酮、黄酮苷类、氰苷类等成分。近年来对该植物及同属植物的研究日趋深入,简要概述接骨木的化学组成和抗病毒、调节免疫、抗氧化、抗肿瘤等药理作用及临床研究进展。
关键词
接骨木
属
西洋接骨木
黑
接骨木
加拿大
接骨木
抗病毒
调节免疫
原文传递
几种植物的药用价值
被引量:
2
5
作者
В.Ф.KOPCYH
张丙申
任德谦
《郑州牧业工程高等专科学校学报》
1993年第1期38-39,共2页
在与传染性疾病,尤其是在与伤风感冒疾病的斗争中,合成化学已经为人类提供了许许多多的药物。然而随着时间的推移,越来越多地记录下来了这类药物的不良的副作用。不过科学不会停步不前。业已发现一些植物具有抗病毒的、抗菌的特殊物质...
在与传染性疾病,尤其是在与伤风感冒疾病的斗争中,合成化学已经为人类提供了许许多多的药物。然而随着时间的推移,越来越多地记录下来了这类药物的不良的副作用。不过科学不会停步不前。业已发现一些植物具有抗病毒的、抗菌的特殊物质。近来,专家、医生都竭力利用植物的这一特性医治流感、支气管炎等常见疾病。
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关键词
伤风感冒
抗病毒
合成化学
停步不前
百里香
吸入疗法
百里基
解热药
地椒
西洋接骨木
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职称材料
神奇的“老魔杖”
6
作者
小科
小雅
《我们爱科学》
2023年第7期12-15,共4页
终于又到植物魔法课的时间了。今天,蔷薇老师为同学们介绍的“魔法”植物是西洋接骨木。也许你之前没听说过这种植物,但你一定知道“老魔杖”这个名字。
关键词
魔法
西洋接骨木
老师
植物
原文传递
题名
西洋接骨木转录组SSR挖掘及荧光标记开发
被引量:
6
1
作者
姚俊修
李善文
任飞
李庆华
刘学良
吴德军
燕丽萍
机构
山东省林业科学研究院
山东省林木遗传改良重点实验室
山东农业大学
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期123-129,147,共8页
基金
山东省农业重大关键技术“耐盐碱林木及经济作物品种选育及示范推广”(2015ZDJS03003)
山东省农业良种工程“高抗逆药用接骨木新品种选育与示范”(2016LZGC017)
山东省林业科技创新项目“接骨木、元宝枫种质资源创新与高值化利用”(LYCX05-2018-24)
文摘
转录组SSR引物的开发为接骨木遗传多样性分析、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供丰富的遗传标记。以一株成年西洋接骨木的果实为实验材料,提取RNA后,采用Illumina HiSeq 2000高通量测序获得西洋接骨木转录组数据,共得到西洋接骨木转录组的257975条Unigene,检测到64148个SSR位点,分布于51336条Unigene,SSR位点出现频率为24.87%(SSR位点数与总的Unigene数的比值),其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的51.13%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的38.63%和9.11%。A/T和AG/CT是单核酸和二核苷酸的优势重复基元。通过试验优化获得最优的两步荧光引物PCR扩增体系。加M13接头PCR扩增体系:10μL PCR体系中含DNA原液1μL,2×Mix 5μL,10μM引物各0.1μL,灭菌超纯水3.8μL;荧光引物PCR扩增体系:20μL PCR体系中含第一步扩增产物DNA原液2μL,2×Mix 10μL,10μM M13接头及反向引物各0.15μL,灭菌超纯水7.7μL。利用已筛选的100对荧光SSR引物对8个不同种接骨木个体进行SSR扩增,80对可扩增出条带,有效扩增率为80%,25对可成功扩增出多态性,多态性比率为31.25%,从25对具有多态性引物中选择14对多态性较好的引物对不同种接骨木进行遗传多样性分析,14对多态性引物共检测出67个等位基因(Na),每位点3~7个,平均等位基因4.786个;每位点有效等位基因数(Ne)1.684~6.095个,平均有效等位基因数3.413个,观测杂合度(Ho)及期望杂合度(He)分别在0~0.875和0.406~0.836之间,平均值分别为0.313、0.664;Shannon多样性指数(I)在0.736~1.862之间,平均1.310。不同种接骨木具有较高的遗传多样性,25对具有多态性荧光SSR标记开发可为接骨木分子标记辅助育种、杂种优势预测等提供理论基础。
关键词
西洋接骨木
转录组
SSR
荧光标记
Keywords
Sambucus nigra L.
transcriptome
SSR
fluorescent marker
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
西洋接骨木栽培技术及在园林景观中的应用
2
作者
龙渡江
王栋
机构
桂林旅游学院
出处
《智慧农业导刊》
2022年第9期59-61,共3页
基金
2020年度广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2020KY22008)。
文摘
西洋接骨木是忍冬科接骨木属落叶乔木抑或大灌木,其高度为4~10 m;幼枝上有纵条纹,2 a生枝呈黄褐色,凸起的圆形皮孔较多且较为明显;髓部发育良好,白色。羽状复叶有1~3对小叶片,2对最为常见,有短柄,卵形主要为椭圆形或椭圆状,果实呈亮黑色。花期为4-5月,果熟为7-8月。该品种主要分布于欧洲,此外,其在我国山东、江苏、上海等地也十分常见。民间和庭园引种栽培是一种乔木类植物,开花时,花朵呈团状分布,气味芳香。其果实呈黄白色,具有极高的观赏价值,被用于园林景观设计。作为景观植物使用时,能够为观赏者带来极佳的视觉享受。西洋接骨木是常用的药材,在我国各个地区都有栽培,还有专为园艺观赏用的接骨木。文章探讨分析接骨木形态特征、生长习性、繁育方法及园林景观应用价值。以供参考。
关键词
西洋接骨木
栽培技巧
园林景观
Keywords
elderberry(Sambucus nigra L.)
cultivation skills
landscape
分类号
S567.19 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
接骨木及近缘种植物的ITS2序列分析
被引量:
1
3
作者
陈香梅
常山
王胡格吉乐图
布日额
机构
内蒙古民族大学蒙药研发国家地方联合工程研究中心
内蒙古民族大学人兽共患病防控自治区高等学校重点实验室
出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023年第4期411-415,共5页
基金
内蒙古自然科学基金项目(2019BS08015)
内蒙古自治区蒙医药标准化研究项目(2020MB030)。
文摘
目的利用DNA条形码技术鉴定接骨木及近缘种植物。方法采用植物基因组DNA提取试剂盒从20个接骨木样本中提取总DNA,对ITS2序列进行PCR扩增并测序;从GenBank上下载接骨木近缘植物ITS2序列,共31条序列做ITS2序列分析,对ITS2序列二级结构进行对比分析;用MEGA 7.0计算其种间、种内的Kimura 2 parameter(K2P)距离,构建其Neighbor joining(NJ)树。结果ITS2序列长度均为226 bp,GC百分含量范围为57.71%~61.06%;西洋接骨木种间变异位点最多;接骨木属5种药用植物ITS2序列的二级结构极为相近,通过主环结构可以将西伯利亚接骨木与其他4个种区分开,通过Ⅰ区和Ⅲ区茎环数目和大小可有效区别接骨木、接骨草、西洋接骨木和血满草;通过NJ树分析可区分接骨木属中接骨木和西伯利亚接骨木,但未能区分其余3个近缘种。结论ITS2序列可作为接骨木及近缘种药材鉴别的DNA条形码序列。
关键词
ITS2
接骨木
西伯利亚
接骨木
血满草
西洋接骨木
接骨
草
近缘种
分子鉴定
Keywords
ITS2
Sambucus williamsii
Sambucus sibirica
Sambucus adnate
Sambucus nigra
Sambucus chinensis
Related species
Molecular identification
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
接骨木的化学成分与药理作用
被引量:
5
4
作者
赵岩峰
肖峰
潘勤
机构
天津中医药大学中药学院
天津中新药业集团股份有限公司研究中心
出处
《国外医药(植物药分册)》
2007年第5期198-200,共3页
文摘
西洋接骨木为欧洲的传统草药,主要含有黄酮、黄酮苷类、氰苷类等成分。近年来对该植物及同属植物的研究日趋深入,简要概述接骨木的化学组成和抗病毒、调节免疫、抗氧化、抗肿瘤等药理作用及临床研究进展。
关键词
接骨木
属
西洋接骨木
黑
接骨木
加拿大
接骨木
抗病毒
调节免疫
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
几种植物的药用价值
被引量:
2
5
作者
В.Ф.KOPCYH
张丙申
任德谦
出处
《郑州牧业工程高等专科学校学报》
1993年第1期38-39,共2页
文摘
在与传染性疾病,尤其是在与伤风感冒疾病的斗争中,合成化学已经为人类提供了许许多多的药物。然而随着时间的推移,越来越多地记录下来了这类药物的不良的副作用。不过科学不会停步不前。业已发现一些植物具有抗病毒的、抗菌的特殊物质。近来,专家、医生都竭力利用植物的这一特性医治流感、支气管炎等常见疾病。
关键词
伤风感冒
抗病毒
合成化学
停步不前
百里香
吸入疗法
百里基
解热药
地椒
西洋接骨木
分类号
S8 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
神奇的“老魔杖”
6
作者
小科
小雅
机构
不详
出处
《我们爱科学》
2023年第7期12-15,共4页
文摘
终于又到植物魔法课的时间了。今天,蔷薇老师为同学们介绍的“魔法”植物是西洋接骨木。也许你之前没听说过这种植物,但你一定知道“老魔杖”这个名字。
关键词
魔法
西洋接骨木
老师
植物
分类号
G62 [文化科学—教育学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西洋接骨木转录组SSR挖掘及荧光标记开发
姚俊修
李善文
任飞
李庆华
刘学良
吴德军
燕丽萍
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
6
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职称材料
2
西洋接骨木栽培技术及在园林景观中的应用
龙渡江
王栋
《智慧农业导刊》
2022
0
下载PDF
职称材料
3
接骨木及近缘种植物的ITS2序列分析
陈香梅
常山
王胡格吉乐图
布日额
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2023
1
原文传递
4
接骨木的化学成分与药理作用
赵岩峰
肖峰
潘勤
《国外医药(植物药分册)》
2007
5
原文传递
5
几种植物的药用价值
В.Ф.KOPCYH
张丙申
任德谦
《郑州牧业工程高等专科学校学报》
1993
2
下载PDF
职称材料
6
神奇的“老魔杖”
小科
小雅
《我们爱科学》
2023
0
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