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计算机辅助药物设计技术在药物化学教学中的应用与探索
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作者 葛军 李英鹏 +2 位作者 邓雁如 牟佳佳 金志艳 《卫生职业教育》 2024年第19期44-47,共4页
以天津中医药大学为例开展可视化教学,借助新兴的计算机辅助药物设计(CADD)软件Discovery Studio,将其部分功能运用到药物化学课程教学中,使原本抽象、晦涩难懂的内容变成立体的、生动形象的图像,极大地改善了教学效果,为药物化学教学... 以天津中医药大学为例开展可视化教学,借助新兴的计算机辅助药物设计(CADD)软件Discovery Studio,将其部分功能运用到药物化学课程教学中,使原本抽象、晦涩难懂的内容变成立体的、生动形象的图像,极大地改善了教学效果,为药物化学教学研究提供了有益借鉴。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 药物化学 可视化教学
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基于网络药理学及计算机辅助药物设计方法分析雷诺嗪治疗心肌缺血再灌注损伤致心律失常的潜在靶点及机制
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作者 王绍鹏 任一鑫 《中国当代医药》 CAS 2024年第9期21-28,共8页
目的利用网络药理学方法和计算机辅助药物设计策略,分析雷诺嗪对心肌缺血再灌注损伤(MIRI)致心律失常的潜在治疗靶点及机制。方法采用Swiss Target Prediction数据库和DrugBank数据库预测雷诺嗪潜在的作用靶点。采用GeneCards数据库搜集... 目的利用网络药理学方法和计算机辅助药物设计策略,分析雷诺嗪对心肌缺血再灌注损伤(MIRI)致心律失常的潜在治疗靶点及机制。方法采用Swiss Target Prediction数据库和DrugBank数据库预测雷诺嗪潜在的作用靶点。采用GeneCards数据库搜集MIRI和心律失常疾病的靶点,检索时间为建库至2023年1月26日,将雷诺嗪、MIRI和心律失常相关靶点进行交集比对以获取雷诺嗪治疗MIRI致心律失常的关键靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件绘制靶点蛋白互相作用网络。利用DAVID数据库对靶点进行信号通路富集分析。利用Cy-toscape软件构建药物-靶点-信号通路网络。利用分子对接软件验证雷诺嗪与交集靶点结合能力。最后通过分子相似性分析及分子动力学模拟研究,验证预测靶点的准确性。结果筛选获得雷诺嗪治疗MIRI致心律失常的潜在作用靶点30个。通过蛋白互相作用分析共获得8个核心靶点,包括SRC、PIK3CA、MAPK8、MAPK14、JAK1、MAP2K1、JAK2和PIK3CG。GO生物分析共筛选出177个生物学过程,其中包括123个细胞生物过程,23个细胞组成和31个分子功能。KEGG分析发现119条相关信号通路。分子对接分析结果显示,雷诺嗪与8个核心靶蛋白均具有较好的亲和力。分子相似性分析结果显示,雷诺嗪与8个核心靶蛋白原配体都存在一定相似性。分子动力学模拟了相关性最高的3个靶点(SCR、PIK3CA和MAPK8),结果显示雷诺嗪表现出MAPK8和SCR抑制剂潜力,而对PIK3CA的抑制剂位点结合潜力相对较差,结合文献复习,推测出雷诺嗪对MIRI致心律失常治疗作用的最相关分子机制。结论雷诺嗪可通过多靶点、多途径治疗MIRI致心律失常,这对促进治疗MIRI致心律失常靶向药物的研发及临床应用具有重要意义。 展开更多
关键词 网络药理学 计算机辅助药物设计 雷诺嗪 心肌缺血再灌注损伤 心律失常
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中医药院校计算机辅助药物设计课程改革与实践
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作者 靳晓杰 《中兽医医药杂志》 CAS 2024年第4期86-90,共5页
计算机辅助药物设计(CADD)主要是以数学、药物化学、生物化学、分子生物学、结构化学等学科为基础,以量子化学、分子力学等为理论依据,借助计算机进行合理的药物设计。它不仅仅是交叉理论学科,更具有很强的实践性。计算机辅助药物设计... 计算机辅助药物设计(CADD)主要是以数学、药物化学、生物化学、分子生物学、结构化学等学科为基础,以量子化学、分子力学等为理论依据,借助计算机进行合理的药物设计。它不仅仅是交叉理论学科,更具有很强的实践性。计算机辅助药物设计技术在中药活性成分筛选、靶标发现、毒性预测、处方作用机制研究等方面已表现出独特优势。学科交叉是科技与医学高速发展的大势所趋,在传统中医药理论指导下,借助计算机辅助药物设计结合现代生物学进行中医药理、法、方、药的研究,可以促进中医药研究的广度与深度。让中医药院校学生学习计算机辅助药物设计的理论及实践知识,可为日后跨学科助力药物研发做好准备。因此,在中医药院校开展计算机辅助药物设计等交叉性强的课程有助于中医药多学科交叉复合型人才的培养,建立适合中医药院校学生的计算机辅助药物设计授课模式对深入发掘中医药宝库中的精华,加快推进中医药现代化具有极大作用。基于此,本文结合自身教学经验及时代发展特点,在计算机辅助药物设计课程的授课过程中引入注重基础、衷中参西、重视实践等教学理念,在培养中医药多学科交叉复合型人才过程中取得较为明显的效果。通过对中医药专业计算机辅助药物设计的教改和实践进行深层次、全方位探讨和总结,可提升本课程的教学效果,为培养复合型中医药人才、拓宽中医药院校大学生的就业渠道奠定基础。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 中医药院校 交叉创新 教学改革
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计算机辅助药物设计教学内容的编排 被引量:1
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作者 梁立 李思瑶 +1 位作者 唐凌凯 胡建平 《信息系统工程》 2023年第12期169-172,共4页
在人工智能技术快速发展及大数据背景下,计算机辅助药物设计(Computer-aided Drug Design,CADD)这一综合性交叉学科面临着新的发展变革。CADD在药学、生物学、化学等领域有着广泛的应用,也是高校相应专业中一门重要的课程。将针对CADD... 在人工智能技术快速发展及大数据背景下,计算机辅助药物设计(Computer-aided Drug Design,CADD)这一综合性交叉学科面临着新的发展变革。CADD在药学、生物学、化学等领域有着广泛的应用,也是高校相应专业中一门重要的课程。将针对CADD的课程特点和教学中存在的问题,对CADD课程教学内容的编排进行探索,以推动CADD课程教学改革并促进药学等领域创新,培养实用型人才。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 高校教学 内容编排 改革 人才培养
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计算机辅助药物设计在天然抗肿瘤药物研究中的应用 被引量:1
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作者 徐度玲 李鸿岩 +1 位作者 张红 柳佳娣 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第1期44-52,共9页
随着医学科技的进步,肿瘤的治疗方法及手段逐渐多样化,且效果好、副作用小的治疗方法是研究人员不断追求的目标.天然产物是抗肿瘤药物的巨大药用宝库,随着信息技术的发展,计算机辅助药物设计在天然产物的开发、优化中发挥了重要的作用,... 随着医学科技的进步,肿瘤的治疗方法及手段逐渐多样化,且效果好、副作用小的治疗方法是研究人员不断追求的目标.天然产物是抗肿瘤药物的巨大药用宝库,随着信息技术的发展,计算机辅助药物设计在天然产物的开发、优化中发挥了重要的作用,为天然抗肿瘤药物的筛选和应用提供了基础数据.论述计算机辅助药物设计在天然产物抗肿瘤研究中的应用,以期为天然抗肿瘤药物的研发提供参考. 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 天然产物 抗肿瘤
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基于计算机辅助药物设计的VEGFR2和PD-L1双靶点抑制剂的筛选
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作者 郑伟 童荣生 +1 位作者 何俊 师健友 《合成化学》 CAS 2023年第5期321-328,共8页
肝细胞癌(HCC)是世界上最具侵袭性的实体恶性肿瘤之一,尽管近几十年来在肝切除术、射频消融和肝移植等方面取得了显著进展,但HCC患者的愈后仍不乐观,主要原因是HCC的高复发率和转移率以及该疾病对化疗和靶向治疗的耐受性。VEGFR2和PD-L... 肝细胞癌(HCC)是世界上最具侵袭性的实体恶性肿瘤之一,尽管近几十年来在肝切除术、射频消融和肝移植等方面取得了显著进展,但HCC患者的愈后仍不乐观,主要原因是HCC的高复发率和转移率以及该疾病对化疗和靶向治疗的耐受性。VEGFR2和PD-L1抑制剂联合应用能对小鼠体内的HCC肿瘤进行显著抑制并延长其寿命,因此开发VEGFR2与PD-L1双靶点抑制剂对HCC的治疗具有十分重要的意义。本文基于计算机辅助药物设计(CADD),经过以分子对接为基础的虚拟筛选、MM-GBSA和ADMET评价以及QSAR模型预测,得到了一系列VEGFR2和PD-L1的双靶点活性化合物,有望为后续抑制剂的开发提供思路和方向。 展开更多
关键词 VEGFR2 PD-L1 双靶点 计算机辅助药物设计 虚拟筛选 MM-GBSA QSAR
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计算机辅助药物设计中的多维定量构效关系模型化方法 被引量:18
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作者 梁桂兆 梅虎 +1 位作者 周原 李志良 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第1期120-127,共8页
多维定量构效关系(MD QSAR)在计算机辅助药物设计中得到了广泛而成功的应用,结合本研究组的工作,本文系统综述了建立各种MD QSAR模型的方法和策略,对近年来有关的MD QSAR应用研究进展进行了回顾,并对其在新世纪药物设计中应用前景做了... 多维定量构效关系(MD QSAR)在计算机辅助药物设计中得到了广泛而成功的应用,结合本研究组的工作,本文系统综述了建立各种MD QSAR模型的方法和策略,对近年来有关的MD QSAR应用研究进展进行了回顾,并对其在新世纪药物设计中应用前景做了展望。 展开更多
关键词 多维定量构效关系 计算机辅助药物设计 模型化
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计算机辅助药物设计在中药现代化中的应用 被引量:14
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作者 杨洁 储平 +3 位作者 熊玉徽 王睿 唐于平 段金廒 《世界临床药物》 CAS 2009年第10期615-619,共5页
计算机辅助药物设计(CADD)是多学科交叉的边缘学科,在药物研发过程中起着枢纽作用,特别在先导化合物的发现和优化中发挥重要作用。中药现代化是当前我国中药产业发展之路,也是新药研发的有效途径。借助现代高新技术,特别是CADD技术,结... 计算机辅助药物设计(CADD)是多学科交叉的边缘学科,在药物研发过程中起着枢纽作用,特别在先导化合物的发现和优化中发挥重要作用。中药现代化是当前我国中药产业发展之路,也是新药研发的有效途径。借助现代高新技术,特别是CADD技术,结合传统中医药理论进行中药研发,似可为中医药发展开辟一条适合我国国情的创新道路。本文主要探讨CADD在药物作用靶点的发现与验证以及中药现代化中的应用及其前景。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 中药现代化 药物作用靶点 先导化合物
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应用型计算机辅助药物设计教学改革 被引量:9
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作者 田元新 张嘉杰 +2 位作者 伍小云 张婷婷 万山河 《药学教育》 2018年第3期41-43,51,共4页
作为一门综合性交叉学科,计算机辅助药物设计(CADD,Computer Aided Drug Design)对于拓宽药学本科生的学术视野,提高学生对知识的综合应用能力具有重要作用。大数据和"互联网+"的迅速发展,使CADD课程面临新的机遇和挑战。针对... 作为一门综合性交叉学科,计算机辅助药物设计(CADD,Computer Aided Drug Design)对于拓宽药学本科生的学术视野,提高学生对知识的综合应用能力具有重要作用。大数据和"互联网+"的迅速发展,使CADD课程面临新的机遇和挑战。针对CADD课程特点,在教学中强化应用型、信息化特色CADD课程建设,让药学专业本科生能够快速入门并学以致用,促进创新型、研究型药学人才的培养。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 应用型 信息化 教学改革
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计算机辅助药物设计中用于建模的计算方法研究进展 被引量:10
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作者 陈安进 石杰 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期407-411,共5页
通过检索国内外相关领域的大量研究文献,并结合作者的研究经验,综述了计算机辅助药物设计中计算方法的发展及其应用的最新进展,并对计算方法的选用原则进行了探讨,以期为从事CADD工作者合理选择建模计算方法提供有价值的参考。
关键词 计算机辅助药物设计(CADD) 定量构效关系(QSAR) 计算方法
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将现代教育技术应用于计算机辅助药物设计教学 被引量:14
11
作者 牛彦 雷小平 徐萍 《药学教育》 2010年第6期54-57,共4页
为培养学生的创新和实践能力,运用计算机多媒体、分子模拟软件、录屏软件、DVD视频等现代教育技术手段对计算机辅助药物设计课程的教学方法进行改革,并对教学效果展开问卷调查.调查结果显示,改革可使教学内容更加直观、形象,极大地激发... 为培养学生的创新和实践能力,运用计算机多媒体、分子模拟软件、录屏软件、DVD视频等现代教育技术手段对计算机辅助药物设计课程的教学方法进行改革,并对教学效果展开问卷调查.调查结果显示,改革可使教学内容更加直观、形象,极大地激发了学生的兴趣,收到了良好的教学效果. 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 现代教育技术 教学改革
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基于云计算的计算机辅助药物设计学课程改革 被引量:7
12
作者 欧阳勤 王懿 刘天渝 《药学教育》 2015年第4期46-49,共4页
以云计算辅助教学技术为基础,结合计算机辅助药物设计发展趋势、药学人才培养要求以及药物设计学学科自身特点,构建云计算服务网络教学平台,阐述基于云计算的计算机辅助药物设计教学构架。对计算机辅助药物设计学课程教学方法进行改革,... 以云计算辅助教学技术为基础,结合计算机辅助药物设计发展趋势、药学人才培养要求以及药物设计学学科自身特点,构建云计算服务网络教学平台,阐述基于云计算的计算机辅助药物设计教学构架。对计算机辅助药物设计学课程教学方法进行改革,探讨云计算对计算机辅助药物设计课程改革的意义。 展开更多
关键词 计算 云服务 计算机辅助药物设计 课程改革
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基于结构的计算机辅助药物设计方法学与应用研究 被引量:11
13
作者 宋云龙 陆倍倍 张万年 《药学进展》 CAS 2002年第6期359-364,共6页
基于受体结构的计算机辅助药物设计方法始见于 2 0世纪 80年代早期 ,是多学科交叉、综合的新兴产物 ,虽还不很成熟 ,但发展迅速。本文结合近年来若干成功应用实例 ,综述活性位点分析、数据库搜寻、全新药物设计。
关键词 计算机辅助药物设计 药物设计 受体结构 配体 活性位点 数据库搜寻 虚拟组合库
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计算机辅助药物设计在分子对接中的应用 被引量:7
14
作者 刘景陶 刘映雪 《科技创新与应用》 2016年第34期67-67,共1页
计算机辅助药物设计的基本出发点是针对药物作用靶点和药物分子的结构、功能及与药物作用方式,来设计作用专一、活性强、不良反应少的新药。药物分子必须分布到受体生物大分子部位并与受体结合,才有可能发挥药理作用。准确预测药物分子... 计算机辅助药物设计的基本出发点是针对药物作用靶点和药物分子的结构、功能及与药物作用方式,来设计作用专一、活性强、不良反应少的新药。药物分子必须分布到受体生物大分子部位并与受体结合,才有可能发挥药理作用。准确预测药物分子与受体生物大分子结合的复合物的结构和结合位点,是药物设计中最重要的环节,发现全新结构的先导化合物是药物发现的目标。作为药物设计的核心技术,"分子对接"是基于受体分子结构虚拟筛选的核心,是一种模拟小分子与生物大分子结合三维结构及其结合强度的计算方法,通过分子对接(docking)的方法,确定小分子与受体的结合构象,并评价其与受体的结合活性。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 药物设计 分子对接 应用
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《计算机辅助药物设计》项目式教学实践 被引量:5
15
作者 徐建凯 陈秀杰 +1 位作者 刘磊 杨瑞智 《黑龙江科技信息》 2013年第31期158-158,共1页
《计算机辅助药物设计》是现代药物研发的前沿和热门学科,它不仅是新兴的交叉理论学科,而且具有很强的实践性,因此在生物信息学本科专业开展项目式教学是专业发展的必然。本文从教学内容设计、教学方法、成绩考核等方面,对课程建设进行... 《计算机辅助药物设计》是现代药物研发的前沿和热门学科,它不仅是新兴的交叉理论学科,而且具有很强的实践性,因此在生物信息学本科专业开展项目式教学是专业发展的必然。本文从教学内容设计、教学方法、成绩考核等方面,对课程建设进行了探索与实践。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 项目式教学 教学改革
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计算机辅助药物设计的原理及应用 被引量:5
16
作者 刘景陶 刘映雪 《科技创新与应用》 2016年第33期52-52,共1页
计算机辅助药物设计(computer aided drug design CADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和生物信息学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像,根据分子匹配理论和计算化学方法,模拟和... 计算机辅助药物设计(computer aided drug design CADD)是以计算机的数值计算、逻辑判断、图形处理和数据库技术与功能为载体,运用化学和生物信息学提供的信息资源,直接模建或间接虚拟靶点图像,根据分子匹配理论和计算化学方法,模拟和计算受体与配体的相互作用,并对药物研发的各个阶段进行辅助解释和预测,设计出有效的先导物,再对先导物进行优化与改造。计算机辅助药物设计既可用于先导物的衍生,也可以用于先导物的优化,是实现基于结构和基于性质的药物设计的技术手段。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 药物设计 原理 应用
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开展计算机辅助药物设计教学的尝试 被引量:3
17
作者 乔艳 陈新焕 +1 位作者 杨婉景 宋传君 《教育教学论坛》 2016年第26期203-204,共2页
计算机辅助药物设计作为药物设计中的常规方法,已在许多药物的研究中取得成功,该方法近年来的高速发展和广泛应用使其成为生物学、化学、药学和医学等科研教学人员必须掌握的技术之一。开展计算机辅助药物设计教学,对于提升学生专业素... 计算机辅助药物设计作为药物设计中的常规方法,已在许多药物的研究中取得成功,该方法近年来的高速发展和广泛应用使其成为生物学、化学、药学和医学等科研教学人员必须掌握的技术之一。开展计算机辅助药物设计教学,对于提升学生专业素养、科研水平具有一定的意义。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 教学实践 专业素养 科研水平
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计算机辅助药物设计在中药作用靶点研究中的应用 被引量:4
18
作者 吴可柱 左颖 李爱秀 《武警医学院学报》 CAS 2012年第6期479-483,共5页
传统中药在我国有着近三千年的悠久历史,许多方剂至今仍被人们广泛用于临床。但由于中药作用机制及其靶点的不明确,阻碍了实现中药现代化的进程。计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)是随着分子生物学、计算机科学等... 传统中药在我国有着近三千年的悠久历史,许多方剂至今仍被人们广泛用于临床。但由于中药作用机制及其靶点的不明确,阻碍了实现中药现代化的进程。计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)是随着分子生物学、计算机科学等相应学科发展而研发的一种新的药物研究手段,CADD从理论角度出发,大大减少了药物研发的盲目性。本文就CADD的一些常用技术手段进行了综述,并对各项技术用于中药作用靶点研究的方法、策略以及应用实例进行了介绍。作为一种有效的技术手段,CADD在对中药作用靶点的预测以及推动中药现代化发展方面必将发挥重要作用。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 中药 靶点
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计算机辅助药物设计课程项目教学评价体系初探 被引量:2
19
作者 徐建凯 陈秀杰 +1 位作者 刘磊 杨瑞智 《黑龙江科学》 2013年第11期153-153,共1页
项目教学是国内外工科教学普遍采用的一种教学方法,是项目教学的最后一个环节,对教学有积极的促进作用。本研究结合计算机辅助药物设计课程的教学要求,对项目教学的评价体系从教和学两方面进行了探讨。
关键词 项目教学 计算机辅助药物设计 评价
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计算机辅助药物设计教学改革与探索 被引量:7
20
作者 吴晓敏 薛书蕾 +1 位作者 张海军 王光利 《安徽农学通报》 2013年第3期156-158,共3页
计算机辅助药物设计(Computer-aided drug design,CADD)是生命科学与计算机、药学、化学、物理、数学等学科全方位交叉的学科,该门课也是生物工程专业专业课教学中一门重要的应用实践课程。该文以淮北师范大学生命科学学院生物工程专业... 计算机辅助药物设计(Computer-aided drug design,CADD)是生命科学与计算机、药学、化学、物理、数学等学科全方位交叉的学科,该门课也是生物工程专业专业课教学中一门重要的应用实践课程。该文以淮北师范大学生命科学学院生物工程专业为例,从计算机辅助药物设计的授课内容改进、教学方法形象多样化、加强实际操作应用3个方面阐述本校应用型人才培养模式下的计算机辅助药物设计教学改革与探索。 展开更多
关键词 计算机辅助药物设计 应用型人才 培养模式 教学改革
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