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基于RT-RAPID和CRISPR-Cas12a的诺如病毒GⅡ.6亚型核酸检测方法的建立
1
作者 冉红志 樊成 +4 位作者 王雪飞 刘静 康婕 钱卫东 王婷 《动物医学进展》 北大核心 2023年第9期44-50,共7页
为建立一种特异性强、灵敏度高且简单方便的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法,下载诺如病毒GⅡ.6基因组序列,用Mega7.0对基因组进行比对分析获得高度保守序列;基于保守序列设计诺如病毒GⅡ.6的反转录重组酶和聚合酶等温检测(RT-RAPID)技... 为建立一种特异性强、灵敏度高且简单方便的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法,下载诺如病毒GⅡ.6基因组序列,用Mega7.0对基因组进行比对分析获得高度保守序列;基于保守序列设计诺如病毒GⅡ.6的反转录重组酶和聚合酶等温检测(RT-RAPID)技术扩增引物、荧光探针、crRNA和报告分子;优化RT-RAPID的反应引物、反应温度和反应时间及Cas12a检测用的crRNA,并分析RT-RAPID-Cas12a方法的特异性和灵敏度。基于RT-RAPID荧光法和RT-RAPID-Cas12a荧光法的诺如病毒GⅡ.6亚型核酸快速检测方法能在1 h内完成检测并得出结果,灵敏度分别为10 copies/μL和0.5 copies/μL,且两个方法均与诺如病毒GⅡ.17型、鼻病毒、偏肺病毒和博卡病毒无交叉反应。2个检测方法与RT-qPCR阳性样本一致率均为90%,阴性样本一致率均为100%。论文建立的基于RT-RAPID和Cas12a的诺如病毒GⅡ.6核酸快速检测方法均可高效快速地检测出诺如病毒GⅡ.6,具有灵敏度高、特异性强、操作便捷且快速等特点。 展开更多
关键词 诺如病毒gⅱ.6亚型 反转录重组酶聚合酶扩增 规律间隔成簇短回文重复序列的/相关蛋白12a 核酸检测
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诺如病毒GⅡ.4亚型新变异株全基因组序列的研究 被引量：2
2
作者 周明莉 蔡爱玲 王雪峰 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第2期231-232,共2页
目的分析诺如病毒GⅡ.4亚型新变异株的全基因组序列,了解其变异特点。方法从264例患者腹泻物中提取RNA并进行cDNA合成,对阳性样本进行PCR鉴定,扩增片段进行测序。对测序结果显示为诺如病毒序列的进行全基因组测序并分析。结果分离到新... 目的分析诺如病毒GⅡ.4亚型新变异株的全基因组序列,了解其变异特点。方法从264例患者腹泻物中提取RNA并进行cDNA合成,对阳性样本进行PCR鉴定,扩增片段进行测序。对测序结果显示为诺如病毒序列的进行全基因组测序并分析。结果分离到新的悉尼2012GⅡ.4变异株的类似株(荆州2013GⅡ.4株),全基因组序列测定发现新分离株出现了较大的变异,包括VP1基因高变区(P2区)的突变。结论悉尼2012GⅡ.4变异株的类似株已传播到中国,GⅡ.4变异株VP1进化较快。提醒应密切关注诺如病毒在中国的传播和进化情况,以助于疫苗的开发和治疗性单抗的制备。 展开更多
关键词 诺如病毒 悉尼2012 gⅱ.4变异株 全基因组序列
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多重荧光RT-PCR同时检测GⅠ型和GⅡ型诺如病毒方法的建立 被引量：15
3
作者 纪蕾 韩建康 +5 位作者 吴晓芳 徐德顺 邱妤怡 陈莉萍 沈月华 查赟峰 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期311-315,共5页
目的建立可同时检测GⅠ型和GⅡ型诺如病毒的双重荧光RT-PCR快速检测方法,并应用于临床标本的检测。方法使用针对GI型和GⅡ型诺如病毒各亚型代表株保守序列设计的特异性引物和TaqMan探针,通过调整引物、探针浓度优化最佳反应条件,建立一... 目的建立可同时检测GⅠ型和GⅡ型诺如病毒的双重荧光RT-PCR快速检测方法,并应用于临床标本的检测。方法使用针对GI型和GⅡ型诺如病毒各亚型代表株保守序列设计的特异性引物和TaqMan探针,通过调整引物、探针浓度优化最佳反应条件,建立一步法荧光RT-PCR快速检测反应体系。对该方法的灵敏度、特异性、稳定性进行评估,并对临床粪便标本进行检测,与已有的单重荧光RT-PCR方法进行比较。结果实验结果表明,该检测方法特异性强,对GⅠ型、GⅡ型诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、甲型肝炎病毒进行检测,均无交叉反应;对GⅠ型和GⅡ型诺如病毒核酸的最低检出限分别可达1pg/mL和10pg/mL,并且重复性好;对101份临床标本分别用已有的单重荧光RT-PCR和本文建立的多重荧光RT-PCR进行检测,结果显示本文建立的多重荧光RT-PCR方法对GⅠ型诺如病毒的检测能力优于前者。结论本研究建立的多重荧光RT-PCR方法能同时对GⅠ型和GⅡ型诺如病毒进行快速检测,并且灵敏度高,特异性好,可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速检测。 展开更多
关键词 诺如病毒 多重荧光RT-PCR 检测 gⅠ型 gⅱ型
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GⅡ-4型诺如病毒体外结合唾液HBGAs受体的检测与分析 被引量：8
4
作者 张绪富 戴迎春 +2 位作者 夏仁飞 周迎春 吕志平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期560-562,共3页
目的建立诺如病毒(Norovirus,NoV)结合唾液HBGAs受体的实验方法、验证2株GⅡ-4型NoV毒株与我国人群唾液HBGAs的结合方式。方法收集健康志愿者唾液标本,采用凝集抑制实验法检测唾液中HBGAs血型物质,用EIA法检测NoV VLPs、阳性毒株与HBGA... 目的建立诺如病毒(Norovirus,NoV)结合唾液HBGAs受体的实验方法、验证2株GⅡ-4型NoV毒株与我国人群唾液HBGAs的结合方式。方法收集健康志愿者唾液标本,采用凝集抑制实验法检测唾液中HBGAs血型物质,用EIA法检测NoV VLPs、阳性毒株与HBGAs的结合情况。结果63份标本检出O型21例(占33.3%),B型14例(占22.2%),A型和非分泌型各13例(分别占20.6%),AB型2例(占3.2%)。rVA387、2株GⅡ-4型毒株均能结合分泌型,与非分泌型唾液不反应。结论本研究成功建立了NoV结合唾液HBGAs受体的实验方法,通过NoV毒株与HBGAs相互作用的研究有助于了解NoV的宿主适应特性及病毒进化和流行规律;同时为筛选防治我国人群的抗NoV药物提供技术平台。 展开更多
关键词 诺如病毒 HBgAs受体 gⅱ-4型 结合方式
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创新型诺如病毒GⅠ/GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条检测效能测评 被引量：1
5
作者 李琛 廖焕金 +5 位作者 兰巧芬 盛慧英 叶玲 李亚宁 王刚 潘庆军 《标记免疫分析与临床》 CAS 2015年第6期577-580,共4页
目的评估诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条的灵敏度和特异性。方法以培养的轮状病毒等其他肠道病原体和245例具有胃肠道感染症状患者的粪便为检测标本,分别用诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条和诺如病毒... 目的评估诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条的灵敏度和特异性。方法以培养的轮状病毒等其他肠道病原体和245例具有胃肠道感染症状患者的粪便为检测标本,分别用诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条和诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原二合一彩色微球法检测试纸条检测。结果诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原荧光纳米颗粒快速联检试纸条的灵敏度显著高于诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原二合一彩色微球法检测试纸条;对常见的轮状病毒(Wa株)、肠道腺病毒(40型)、肠道病毒柯萨奇病毒(A16)、埃可病毒(30型)和肠道病毒(EV71)无交差反应。结论诺如病毒GⅠ和GⅡ抗原的荧光纳米颗粒快速联检试纸条灵敏度显著高于彩色微球法快速检测试纸条,特异性良好。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅠ和gⅱ抗原 荧光纳米颗粒 彩色微球 灵敏度 特异性
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诺如病毒GⅡ型流行病学研究进展 被引量：7
6
作者 于晓楠 王斌 《健康教育与健康促进》 2020年第6期648-651,共4页
诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒G... 诺如病毒是导致人类非细菌性急性胃肠炎的主要病原体之一,给全球的社会医疗和公众健康带来了严重负担。监测显示,全球75%~100%的诺如病毒病例都是由GⅡ型引起。诺如病毒GⅡ型急性肠胃炎已成为公共卫生领域的热点问题。本文对诺如病毒GⅡ型病原学、流行概况及流行病学特征等方面研究进行综述。 展开更多
关键词 诺如病毒gⅱ型 流行特征 研究进展
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一起诺如病毒GⅡ型引起的学校感染性腹泻聚集性疫情流行病学
7
作者 吴明雄 《医学食疗与健康》 2018年第6期120-120,共1页
2017年12月,湖北省天门市某小学发生一起其它感染性腹泻疫情.12月4日至12月10日,该校共有10名学生发病,罹患率0.78%.病原学检测结果为诺如病毒 GⅡ型.
关键词 诺如病毒gⅱ型 感染性腹泻 学校 流行病学调查.
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GⅡ.4诺如病毒P结构域单克隆抗体的制备与鉴定 被引量：1
8
作者 侯玉珍 张婷 +3 位作者 胡贵方 张绪富 郭伦爱 戴迎春 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期734-739,共6页
目的通过多个基因簇变异株联合免疫的方式制备抗GⅡ.4型诺如病毒(NoV)P结构域单克隆抗体(mAb)。方法用复合抗原GⅡ.4型NoV/1996(VA387)、2004、2006b和2010基因簇P颗粒免疫BALB/c小鼠,将成功免疫的小鼠脾细胞与SP2/0骨髓瘤细胞进行融合... 目的通过多个基因簇变异株联合免疫的方式制备抗GⅡ.4型诺如病毒(NoV)P结构域单克隆抗体(mAb)。方法用复合抗原GⅡ.4型NoV/1996(VA387)、2004、2006b和2010基因簇P颗粒免疫BALB/c小鼠,将成功免疫的小鼠脾细胞与SP2/0骨髓瘤细胞进行融合,通过ELISA筛选出阳性杂交瘤细胞,采用有限稀释法制备mAb并进行纯化,ELISA检测mAb效价和特异性,亚类试剂盒鉴定抗体亚类,NoV P颗粒-HBGA结合阻断实验检测mAb中和能力。结果筛选出13株稳定分泌抗GⅡ.4型NoV P颗粒mAb的杂交瘤细胞株,纯化后的13株mAb效价均在10-4以上,属于IgG1型,且均与不同GⅡ.4型NoV变异株具有结合能力;其中5株mAb与GⅡ.17、GⅡ.3和GⅡ.6型NoV具有结合能力,3株mAb与GⅡ.2型NoV具有结合能力且具有人类组织血型抗原(HBGA)受体阻断能力。结论通过NoV多个基因簇变异株联合免疫,成功制备出抗GⅡ.4型NoV P结构域的mAb,为基于P颗粒的GⅡ.4型NoV诊断、疫苗及抗体药物的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 gⅱ.4诺如病毒 变异株 单克隆抗体(mAb) 联合免疫
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粪便标本中诺如病毒GⅡ拷贝数定量检测方法的建立和应用 被引量：1
9
作者 赵跃丽 饶清 +1 位作者 孙强明 张兰胜 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期864-870,共7页
目的构建诺如病毒GⅡ(Norovirus GenogroupⅡ,NoV GⅡ)拷贝数标准质粒及其检测体系。方法将合成高度保守的NoV GⅡ基因序列片段克隆至pUC57载体上,构建NoV GⅡ标准质粒,采用聚合酶链反应(PCR)进行验证。通过实时荧光定量PCR扩增曲线结... 目的构建诺如病毒GⅡ(Norovirus GenogroupⅡ,NoV GⅡ)拷贝数标准质粒及其检测体系。方法将合成高度保守的NoV GⅡ基因序列片段克隆至pUC57载体上,构建NoV GⅡ标准质粒,采用聚合酶链反应(PCR)进行验证。通过实时荧光定量PCR扩增曲线结果绘制C t值与病毒拷贝数的标准曲线,求得其相应的标准曲线方程。采用建立的标准质粒及其检测体系对2018年12月昆明市儿童医院4份临床粪便标本进行检测。结果经PCR验证,NoV GⅡ拷贝数的标准质粒构建正确。采用实时荧光定量PCR的扩增曲线获得C t值与病毒拷贝数相对应的标准曲线方程为Y=-3.972X+39.03,R^2=0.991,4份粪便标本原液NoV GⅡ病毒拷贝数分别为30443.45、9468.40、53176.69、4493.12 copies/μL。结论成功建立用于检测粪便标本中NoV GⅡ病毒拷贝数的标准质粒及其检测体系,可为疾病的预防控制和相关试验研究提供有效的定量检测方法。 展开更多
关键词 诺如病毒gⅱ 病毒拷贝数 实时荧光定量PCR 标准曲线
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一起高校GⅡ.17型诺如病毒感染引起的暴发疫情调查
10
作者 徐丹丹 马兰心 +5 位作者 陈瑶 王淑虹 邓辉 韩凌燕 胡梦妍 吴晓旻 《实用预防医学》 CAS 2024年第2期198-201,共4页
目的 调查2022年湖北省武汉市某大学发生的一起急性胃肠炎暴发事件,分析病原体的来源和传播途径,并采取针对性的干预措施。方法 描述性流行病学方法统计病例的临床症状和三间分布,回顾性病例对照研究分析疫情暴发潜在的危险因素,进行环... 目的 调查2022年湖北省武汉市某大学发生的一起急性胃肠炎暴发事件,分析病原体的来源和传播途径,并采取针对性的干预措施。方法 描述性流行病学方法统计病例的临床症状和三间分布,回顾性病例对照研究分析疫情暴发潜在的危险因素,进行环境卫生学调查检查食堂工作环境,收集食堂涉疫档口的食物留样和环境样本,采集疑似病例和食堂工作人员的肛拭子进行常见致病菌和病毒检测。结果 该次疫情确诊32例学生病例,主要临床症状为呕吐(23/32,71.88%)和腹泻(14/32,43.75%);发现8名食堂工作人员隐性感染,食物留样和环境样本结果均为阴性。32名学生和8名食堂工作人员的诺如病毒核酸检测结果阳性,基因型均为GⅡ.17。病例对照研究表明,9月7日(OR=2.74,95%CI:1.09~6.92)和9月8日(OR=2.92,95%CI:1.06~8.07)在食堂自助餐窗口就餐是诺如病毒胃肠炎发病的危险因素。结论 该次急性胃肠炎暴发由GⅡ.17型诺如病毒感染引起,可能源于食物储存不当导致食物污染,并继发通过人与人接触等多途径传播引起暴发;9月7日和9月8日在食堂自助餐窗口就餐是主要危险因素。未来应进一步加强食品安全管理和校园卫生防控措施,从而杜绝食源性疾病在校园内的传播。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ.17 急性胃肠炎 暴发 高校 回顾性病例对照研究
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常规RT-PCR快速检测诺如病毒方法的建立 被引量：2
11
作者 曲莉 王洪艳 +2 位作者 李环 母润红 王艳双 《北华大学学报（自然科学版）》 CAS 2020年第2期188-190,共3页
目的建立一种可同时检测GⅠ、GⅡ型诺如病毒(Norovirus,NOV)的常规RT-PCR方法.方法针对GⅠ、GⅡ型诺如病毒RdRp区域的基因进行引物设计,优化PCR反应体系及条件,评价该方法的灵敏度、特异度.结果该引物对诺如病毒的特异度强,同一体系内的... 目的建立一种可同时检测GⅠ、GⅡ型诺如病毒(Norovirus,NOV)的常规RT-PCR方法.方法针对GⅠ、GⅡ型诺如病毒RdRp区域的基因进行引物设计,优化PCR反应体系及条件,评价该方法的灵敏度、特异度.结果该引物对诺如病毒的特异度强,同一体系内的GⅠ、GⅡ型诺如病毒相互之间无干扰,与轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒、甲型肝炎病毒同时检测无交叉反应;对GⅠ、GⅡ型诺如病毒核酸的最低检测限值是10~3拷贝/μL.结论本研究建立常规RT-PCR检测方法对GⅠ、GⅡ型诺如病毒进行快速检测,具有很好的灵敏度和特异性. 展开更多
关键词 诺如病毒 双重RT-PCR gⅠ型 gⅱ型
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2011年广州从化地区诺如病毒感染的分子流行病学研究 被引量：2
12
作者 曾军荣 王瑜玲 +1 位作者 白培胜 李榕娇 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期549-551,共3页
目的探讨广州从化地区诺如病毒分子流行病学特点,分析从化地区诺如病毒的基因型。方法收集2011年1—12月从化地区腹泻患者标本218份,采用荧光RT-PCR对临床标本进行检测,同时针对诺如病毒ORF2基因区段设计引物,随机选取5株病毒进行ORF2... 目的探讨广州从化地区诺如病毒分子流行病学特点,分析从化地区诺如病毒的基因型。方法收集2011年1—12月从化地区腹泻患者标本218份,采用荧光RT-PCR对临床标本进行检测,同时针对诺如病毒ORF2基因区段设计引物,随机选取5株病毒进行ORF2基因序列测定。用ClustalW和MEGA5.0等软件进行序列特性分析和基因型分析。结果 218份临床标本中检测到38份阳性标本,检出率为17.43%。阳性率较高的月份为9、10、11、12月,全年最低检出率的时间为6、7月份(均为0),最高检出率的时间为11月份(32%)。扩增了5株诺如病毒ORF2基因序列,序列分析发现与GenBank中GⅡ组诺如病毒的相似性为76%～98%,与GⅠ组为43%～55%,其中与GⅡ-4组Farmington Hills、Lorsdale、ShanghaiSH52009等株同源性为94%～98%,确认该5株诺如病毒属于GⅡ-4型。进一步的氨基酸序列分析发现与f亚型2006b新变株同源性为97%。结论广州从化地区诺如病毒主要流行季节是冬季,克隆的5株诺如病毒属于GⅡ-4f 2006b型。2011年从化地区以GⅡ-4f2006b新变异株为主要流行株。 展开更多
关键词 诺如病毒 流行病学 gⅱ-4基因型 广州从化地区
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2013-2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅡ.P7-GⅡ.6型诺如病毒基因特征分析 被引量：4
13
作者 纪蕾 刘光涛 +2 位作者 沈月华 查赟峰 徐德顺 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期53-58,共6页
目的分析2013—2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。方法采用荧光定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检... 目的分析2013—2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。方法采用荧光定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检粪便标本进行诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR法对核酸阳性标本的多聚酶和衣壳蛋白部分区域进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。利用在线分型工具和系统进化分析对病原序列进行基因特征分析。结果共计28份标本中分别有5、4、2、5份为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,阳性率为57.1%(16/28)。4次疫情各有1份标本测序成功;在线分型和系统进化分支分析显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P7-GⅡ.6重组型诺如病毒,但进化分支不同,其中2013年疫情标本检出GⅡ.P7-GⅡ.6c型;2014年2起疫情均为GⅡ.P7-GⅡ.6b型,2019年疫情中检出的GⅡ.P7-GⅡ.6a型。结论GⅡ.P7-GⅡ.6型重组型诺如病毒是引起湖州市2013—2019年4起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,每年毒株存在一定基因进化分支的差异。鉴于该病毒在全球范围内具有持续和广泛的流行能力,应进一步加强对该型别重组型诺如病毒的监测。 展开更多
关键词 诺如病毒 胃肠炎 暴发 gⅱ.P7-gⅱ.6型 基因特征
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2015—2016年上海地区成人门诊腹泻病例中诺如病毒GⅡ型流行特征 被引量：5
14
作者 陈海丽 杨春忆 +5 位作者 张万菊 刘祎 田棣 王蔚 易志刚 朱召芹 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期145-150,共6页
目的了解2015—2016年上海地区成人门诊急性腹泻病例中诺如病毒(norovirus,NoV)GⅡ型的基因分型及分子流行病学特征。方法收集上海地区2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本,采用一步法定量逆转录PCR方法检测NoV GⅡ型,并扩... 目的了解2015—2016年上海地区成人门诊急性腹泻病例中诺如病毒(norovirus,NoV)GⅡ型的基因分型及分子流行病学特征。方法收集上海地区2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本,采用一步法定量逆转录PCR方法检测NoV GⅡ型,并扩增开放阅读框1(open reading frame,ORF1)的聚合酶和ORF2衣壳区域进行测序分型。结果2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本NoV GⅡ型阳性检出率为17.76%(162/912),其中2015年NoV GⅡ型阳性率为15.08%(65/431),2016年阳性率为20.17%(97/481),阳性标本中针对ORF1的RdRp区域和ORF2区域5′端均分型的标本为145份,共有10种型别,分别为GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012(60份)、GⅡ.P17_GⅡ.17(45份)、GⅡ.P16_GⅡ.13(10份)、GⅡ.P12_GⅡ.3(10份)、GⅡ.P7_GⅡ.6(9份)、GⅡ.P21_GⅡ.21(5份)、GⅡ.P16_GⅡ.4 Sydney 2012(2份)、GⅡ.Pe_GⅡ.17(2份)、GⅡ.P2_GⅡ.2(1份)、GⅡ.P7_GⅡ.14(1份)。结论上海地区2015年春季主要流行GⅡ.P17_GⅡ.17,2015/2016年冬春季主要流行GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012和GⅡ.P17_GⅡ.17,而2016年秋季主要以GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012流行为主。进行持续的NoV暴发监测对于确定基因型分布的变化趋势和新毒株的发现非常重要。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ型 成人腹泻
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2016-2018年成都市GⅠ和GⅡ群诺如病毒感染疫情分析 被引量：3
15
作者 戴映雪 速丽媛 +3 位作者 刘云升 陈恒 岳勇 韩德琳 《预防医学情报杂志》 CAS 2020年第8期973-976,981,共5页
目的探索不同群别诺如病毒感染疫情的差异和相关因素。方法共纳入2016-2018年成都市227起诺如病毒感染聚集性疫情,分别采用卡方检验和t检验比较分类和连续性资料,采用二元非条件Logistic回归分析不同群别诺如疫情相关因素。结果 GⅠ群疫... 目的探索不同群别诺如病毒感染疫情的差异和相关因素。方法共纳入2016-2018年成都市227起诺如病毒感染聚集性疫情,分别采用卡方检验和t检验比较分类和连续性资料,采用二元非条件Logistic回归分析不同群别诺如疫情相关因素。结果 GⅠ群疫情20起(8.81%),GⅡ群207起(91.19%)。GⅠ群疫情占比随着年份增加而增加,2018年最高为12.82%。近郊(12.68%)的GⅠ群占比高于主城区(6.02%)。1-3月(11.48%)、4-9月(17.31%)的GⅠ群占比高于10-12月(3.51%)。GⅠ群诺如疫情的罹患率为1.82%,低于GⅡ群的3.05%。分析显示,相较于主城区,近郊区的诺如疫情更可能为GⅠ(OR=0.21,95%CI:0.06~0.73);相较于10-12月,1-3月(OR=0.16,95%CI:0.03~0.77)或4-9月(OR=0.14,95%CI:0.03~0.63)的诺如疫情更可能为GⅠ;GⅡ群诺如疫情罹患率更高(OR=1.97,95%CI:1.02~3.78)。结论成都市诺如疫情主要由GⅡ群导致,GⅠ、GⅡ群诺如疫情在时间分布、区域分布以及罹患率上存在差异。 展开更多
关键词 gⅠ群 gⅱ群 诺如病毒
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GⅡ.4 Sydney[P31]型诺如病毒GZ19株进化及其受体结合特征分析
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作者 王金冬 马亚林 段招军 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期531-536,544,共7页
目的分析我国GⅡ.4型诺如病毒(norovirus,NoV)GZ19株的进化特征,并明确其结合组织血型抗原(histoblood group antigens,HBGAs)受体的能力和方式。方法根据GZ19株中的ORF2区序列,构建进化树,并分析其在HBGAs结合位点(HBGA binding sites,... 目的分析我国GⅡ.4型诺如病毒(norovirus,NoV)GZ19株的进化特征,并明确其结合组织血型抗原(histoblood group antigens,HBGAs)受体的能力和方式。方法根据GZ19株中的ORF2区序列,构建进化树,并分析其在HBGAs结合位点(HBGA binding sites,HBSs)和关键阻断表位的氨基酸序列。采用原核表达系统表达P颗粒并进行纯化,获得的蛋白经SDS-PAGE和间接ELISA法鉴定后,采用唾液结合试验和寡糖结合试验分析P颗粒的糖结合特征。结果GZ19株属于GⅡ.4 Sydney[P31]谱系,其受体结合位点和阻断表位的氨基酸序列相对保守,与近5年其他GⅡ.4Sydney[P31]毒株具有较高的同源性,而与GⅡ.4 Sydney 2012原型株和GⅡ.4 Sydney[P16]株的差异较大。P颗粒仅与A、B、O、AB分泌型唾液和H-di寡糖结合。结论GZ19株代表目前GⅡ.4 Sydney[P31]NoV的进化方向,P颗粒的成功表达及其与HBGAs受体的结合特征分析,为研究我国GⅡ.4 NoVs的流行进化规律及疫苗开发奠定了基础。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ.4型 P颗粒 人类组织血型抗原
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一起GⅡ.4[P16]型诺如病毒感染暴发疫情调查
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作者 傅忠燕 赵梦娇 +4 位作者 张华宁 张淑 刘晓林 孙文魁 寇增强 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期794-796,共3页
目的分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。方法采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检... 目的分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。方法采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检测,对阳性样本进行基因分型。结果搜索到病例69例(9例为小区内幼儿园儿童,60例为社区居民),临床表现主要为呕吐(76.81%),腹泻(69.57%)。0~5岁儿童罹患率最高(21.18%)。17份病例标本和2份密切接触者标本GⅡ组诺如病毒阳性,基因型均为GⅡ.4[P16]。结论本次事件是由GⅡ.4[P16]型诺如病毒引起的暴发疫情,是由患病儿童呕吐物造成环境污染,社区人员密切接触导致,及时识别和妥善处置是疫情防控的关键。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ.4[P16]基因型 暴发疫情 流行病学调查 接触传播
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长沙市诺如病毒暴发疫情中GⅡ.2[P16]型全基因组分子进化特征分析
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作者 欧新华 徐明忠 +3 位作者 黄政 李灵之 肖姗 姚栋 《中国热带医学》 CAS 2022年第5期445-449,共5页
目的 对长沙市2020年急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒GⅡ.2[P16]型进行全基因组序列测定以及遗传进化特征分析。方法 采集2020年诺如病毒暴发疫情标本,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增开放阅读框(ORF)1和ORF 2连接区进行分型鉴定... 目的 对长沙市2020年急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒GⅡ.2[P16]型进行全基因组序列测定以及遗传进化特征分析。方法 采集2020年诺如病毒暴发疫情标本,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增开放阅读框(ORF)1和ORF 2连接区进行分型鉴定。GⅡ.2[P16]型阳性标本在二代测序Miseq平台进行测序。测序结果进行序列比对及进化分析。结果 2020年本市共发生诺如病毒暴发疫情29起,共采集标本277份,阳性检出率为44.04%(122/277)。分型鉴定发现诺如病毒GⅡ.2[P16]型占比45.08%(55/122)。从疫情分布月份和机构来看,9—12月为暴发高峰,疫情发生在幼儿园和学校占比89.66%(26/29)。对53份GⅡ.2[P16]型ORF1和ORF2连接区序列进行进化树分析发现毒株处于多个分支,序列之间的同源性为98.5%~100%。对4株GⅡ.2[P16]型全基因组序列进行同源性比较发现毒株之间的同源性为98.5%~99.5%,与GⅡ.2[P16]2016-2017(KY771081)毒株同源性为97.9%~98.2%,进化树处于不同亚分支。RdRp区域氨基酸位点发生T396A和T464A突变,HBGA结合位点保守未发生突变。结论 长沙地区诺如病毒暴发疫情中以GⅡ.2[P16]型突变株传播为主,毒株由GⅡ.2[P16]2016-2017持续传播进化而来,并进化为另一个分支。本地区暴发的诺如病毒疫情主要发生在学校以及幼托机构,应持续加强对诺如病毒的监测。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ.2[P16]型 全基因组序列 长沙市
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基于杆状病毒表达系统制备的诺如病毒GⅡ.17型病毒样颗粒体液免疫原性研究
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作者 王文辉 宫立孟 +5 位作者 万鑫 郭靖 孟胜利 季雅琦 王泽鋆 申硕 《中国病毒病杂志》 CAS 2023年第5期384-389,共6页
目的初步评价基于杆状病毒表达系统制备的诺如病毒(Norovirus,No V)GⅡ.17型病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)的免疫原性。方法制备并纯化No V GⅡ.17 VLPs,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecylsulfate-polyacr... 目的初步评价基于杆状病毒表达系统制备的诺如病毒(Norovirus,No V)GⅡ.17型病毒样颗粒(virus-like particles,VLPs)的免疫原性。方法制备并纯化No V GⅡ.17 VLPs,采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecylsulfate-polyacrylamide gel electrophroesis,SDS-PAGE)、免疫印迹法(Western blot)、透射电镜和粒径检测方法对其进行鉴定。GⅡ.17型VLPs采用肌内免疫途径,免疫Balb/C小鼠。研究Al(OH)_(3)佐剂组4个免疫剂量(0.4、2、10、50μg)及不使用佐剂组3个剂量(0.4、2、10μg)的免疫应答。另外,设PBS、PBS加佐剂2个对照组。将每组的5只SPF级雌性健康Balb/c小鼠(6~8周龄)分别于0、3周进行初次免疫和加强免疫。于免疫前(第0天),初次免疫后3周(第21天),加强免疫后1周(第28天)、3周(第42天)分别眼眶采血。采用ELISA检测VLP-特异性Ig G抗体,组织血型抗原(histo-blood group antigen,HBGA)受体-VLPs结合阻断试验检测50%阻断滴度(50%of block‐ing titer,BT_(50))。组间特异性Ig G抗体水平和BT_(50)水平进行对数转换后,采用Two-way ANOVA法进行统计学处理。结果成功制备No V GⅡ.17 VLPs。经SDS-PAGE检测,No V GⅡ.17 VLPs纯度为95%,Western blot分析可见特异性条带,经透射电镜和粒径分析颗粒形态完整,粒径均一。2针肌内免疫后,疫苗不同剂量组(0.4、2、10μg)产生VLP-特异性Ig G抗体水平分别为4222、67559、135118;BT_(50)抗体水平分别为12.5、57.4、174.1,Al(OH)_(3)作为佐剂的不同剂量组(0.4、2、10μg)产生VLP-特异性Ig G抗体水平分别为12800、117627、409600;BT_(50)抗体水平分别为19.0、100.0、229.7,抗体水平明显高于无佐剂组(P均<0.05)。结论Al(OH)_(3)佐剂具有显著的免疫增强作用,肌内注射作为免疫途径,2针免疫,剂量高于2μg可产生较高的抗体Ig G和BT_(50)水平。应用含铝佐剂的GⅡ.17型VLPs免疫小鼠,诱生了较好的HBGA受体结合阻断抗体,可作为诺如病毒疫苗的组分抗原。 展开更多
关键词 诺如病毒 gⅱ.17型 病毒样颗粒 单价疫苗 体液免疫
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2011年苏州地区诺如病毒GⅡ组变异株的分子特征研究 被引量：7
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作者 付建光 嵇红 +10 位作者 单军 王慎骄 李志锋 靳淼 刘成 秦圆方 田华 鲍倡俊 朱叶飞 汤奋扬 祁贤 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期178-183,共6页
目的了解苏州地区诺如病毒的感染状况及其变异株的分子特征。方法收集苏州市儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本419例，采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别，并对部分阳性标本测序分析。结果419份粪便标本中，GⅡ组诺... 目的了解苏州地区诺如病毒的感染状况及其变异株的分子特征。方法收集苏州市儿童医院疑似病毒性腹泻粪便标本419例，采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别，并对部分阳性标本测序分析。结果419份粪便标本中，GⅡ组诺如病毒为122例，阳性率为29％，未检测出GI组诺如病毒，对本地区部分诺如病毒阳性标本进行测序，A区（RdRp区）测序的25份GII标本中25株均为G11．4型；C区（N-s区）测序的26份G11标本中17株为GII．4型，8株为GⅡ．3型，1株为G11．2型；D区（P区）测序的25份GII标本中16株为G1I．4型，9株为GⅡ．3型。结论诺如病毒是本地区婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体，以诺如病毒GII．4-2006b亚型为主，此外发现有Gtl．4-2010亚型（GII．4NewOrleans株）的流行，这是国内首次对该亚型毒株进行报道，同时还检测到部分重组毒株，提示诺如病毒在本地区的遗传变异日趋复杂。 展开更多
关键词 诺如病毒 分子特征 gⅱ 4-2010亚型 重组
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