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猪MyoG基因3′端PCR-SSCP遗传多态性及其遗传效应(英文) 被引量:10
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作者 薛慧良 周忠孝 Bo Well 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期505-508,共4页
采用PCR-SSCP方法对长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西黑猪和马身猪共636头猪的肌细胞生成素(Myogenin,简称MyoG)基因3′端的遗传多态性进行检测,分析MyoG基因对猪的初生体质量、断奶体质量、6月龄体质量和背膘厚的影响。根据已发表的猪M... 采用PCR-SSCP方法对长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西黑猪和马身猪共636头猪的肌细胞生成素(Myogenin,简称MyoG)基因3′端的遗传多态性进行检测,分析MyoG基因对猪的初生体质量、断奶体质量、6月龄体质量和背膘厚的影响。根据已发表的猪MyoG基因3′端侧翼序列设计3对引物,发现F1/R1引物对扩增的片段有多态性。统计结果发现:长白、大白、杜洛克猪种B基因为优势基因,其基因频率分别为0.8807、0.7256和0.8581;山西黑猪种A基因为优势基因,其基因频率为0.9359;马身猪种只检测到A基因。χ2独立性检验表明,基因型分布在外来猪种(长白猪、大白猪、杜洛克猪)与地方猪种(山西黑猪、马身猪)间存在极显著差异(P<0.01)。固定效应模型分析结果表明,初生体质量基因型间差异显著(P<0.05),而断奶体质量、6月龄体质量和背膘厚基因型间差异不显著(P>0.05)。最小二乘分析结果表明,BB基因型与其它2种基因型比较有较大的初生质量,同AA和AB型比较差异极显著(P<0.01)。因此,推测MyoG基因对个体的初生体质量存在一定的影响,选择带有B等位基因的个体有望提高个体的初生体质量。 展开更多
关键词 MYOG基因 pcr—sscp 遗传效应
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三个品种马PPARGC1A基因PCR-SSCP多态性分析 被引量:1
2
作者 刘婷婷 孟军 +7 位作者 王建文 姚新奎 韩煜茹 晏华春 张亚昂 曾亚琦 王宁 朱文强 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1926-1931,共6页
【目的】研究三个品种马PPARGC1A基因的多态性,为马分子育种奠定一定基础。【方法】以焉耆马、伊犁马、纯血马共161匹马为对象,用PCR-SSCP、DNA测序等技术研究分析马PPARGC1A基因的多态性。【结果】焉耆马和伊犁马PPARGC1A基因均有多态... 【目的】研究三个品种马PPARGC1A基因的多态性,为马分子育种奠定一定基础。【方法】以焉耆马、伊犁马、纯血马共161匹马为对象,用PCR-SSCP、DNA测序等技术研究分析马PPARGC1A基因的多态性。【结果】焉耆马和伊犁马PPARGC1A基因均有多态性,在75682碱基处发生G→A的突变,导致等位基因A变为等位基因B,产生从、BB、AB 3种基因型,基因频率计算结果显示,焉耆马,伊犁马处于Hardy-Weinberg非平衡状态。【结论】PPARGC1A基因在焉耆马与伊犁马中均存在多态性。 展开更多
关键词 PPARGC1A基因 pcr—sscp 遗传多态性
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秦川牛及其利秦杂种牛IGFBP3基因PCR-SSCP多态性研究 被引量:2
3
作者 刘波 陈宏 +2 位作者 蓝贤勇 雷初朝 张争锋 《中国农学通报》 CSCD 2005年第9期10-11,共2页
以IGFBP3基因作为侯选基因,对秦川牛及其利秦杂种牛群体共计114头个体IGFBP3位点进行多样性分析。结果发现,秦川牛(Q)及其利秦牛(LQ)群体IGFBP3基因座的等位基因A/B频率分别为:0.6667/0.3333和0.6829/0.3171;从位点间杂合度(He)来看,LQ&... 以IGFBP3基因作为侯选基因,对秦川牛及其利秦杂种牛群体共计114头个体IGFBP3位点进行多样性分析。结果发现,秦川牛(Q)及其利秦牛(LQ)群体IGFBP3基因座的等位基因A/B频率分别为:0.6667/0.3333和0.6829/0.3171;从位点间杂合度(He)来看,LQ>QQ;位点间有效等位基因数(Ne):QQ>LQ位点间Shannon信息熵SQQ>LQ位点间多态信息含量PICQQ> 展开更多
关键词 秦川牛 利木赞牛 IGFBP3基因 pcr—sscp IGFBP3 侯选基因 杂种牛 多态性研究 sscp Shannon信息熵
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等位基因特异PCR检测N-乙酰化转移酶遗传多态性研究 被引量:3
4
作者 杨明晶 郑伟娟 +1 位作者 奚清丽 金振国 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2001年第2期105-108,共4页
目的与方法 :改良一种适用于流行病学研究的N 乙酰化转移酶 (NAT2 )基因型的等位基因特异PCR(AS PCR)检测方法 ,分析了 3个NAT2基因突变点 :481T、5 90A、85 7A ,并用此法对 76例南京地区健康人群的NAT2基因型多态性进行了研究。从而也... 目的与方法 :改良一种适用于流行病学研究的N 乙酰化转移酶 (NAT2 )基因型的等位基因特异PCR(AS PCR)检测方法 ,分析了 3个NAT2基因突变点 :481T、5 90A、85 7A ,并用此法对 76例南京地区健康人群的NAT2基因型多态性进行了研究。从而也检验了该方法。结果 :该人群中各基因频率 :Wt(野生型 )为 0 .5 72 3:481T为 0 .0 395 ;5 90A为 0 .2 36 8;85 7A为 0 .15 13。与白种人比较差异有显著性 ,而与文献报道的亚州人群频率分布特征基本一致。结论 :南京地区健康人群中与快反应相关的NAT2基因型占多数 (82 .9% ) ;本文改良的AS PCR检测方法经验证为NAT2基因多态性研究的有效实验手段。 展开更多
关键词 等位基因特异pcr 遗传多态性 N-乙酰化转移酶
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应用PCR-测序及SSCP技术分析mtDNA序列多态性 被引量:2
5
作者 王艳 刘雅诚 +1 位作者 马万山 唐晖 《中国法医学杂志》 CSCD 2002年第2期98-100,共3页
mtDNA以其拷贝数多、呈母系遗传、进化速度快等特点,为法医检案提供了一种有效的检测项目,特别是对微量、陈旧降解检材的DNA检验.应用PCR-自动测序和PCR-SSCP检测技术分析58例太原地区无关汉族个体mtDNA nt16081-16546区间(位于HV I)序... mtDNA以其拷贝数多、呈母系遗传、进化速度快等特点,为法医检案提供了一种有效的检测项目,特别是对微量、陈旧降解检材的DNA检验.应用PCR-自动测序和PCR-SSCP检测技术分析58例太原地区无关汉族个体mtDNA nt16081-16546区间(位于HV I)序列多态性,并对其进行统计学分析. 展开更多
关键词 MTDNA 异质型 测序 变异度 pcr 检材 单倍型 单元型 碱基变异 序列 sscp 多态性 技术分析 可行性研究
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动物种群遗传多态性研究中的PCR技术 被引量:2
6
作者 宋铭晶 张知彬 徐来祥 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期93-97,共5页
基因组DNA的变异是种群遗传多态性研究的基础。PCR技术可以在反应管内经济快速地扩增特定DNA序列 ,在动物种群遗传多态性研究中的应用主要包括三个方面 :(1 )种群遗传多态位点的检测 ;(2 )基因定位或利用已经定位的单拷贝基因设计染色... 基因组DNA的变异是种群遗传多态性研究的基础。PCR技术可以在反应管内经济快速地扩增特定DNA序列 ,在动物种群遗传多态性研究中的应用主要包括三个方面 :(1 )种群遗传多态位点的检测 ;(2 )基因定位或利用已经定位的单拷贝基因设计染色体位点特异的分子标记 ;(3 )与DNA测序技术相结合 。 展开更多
关键词 pcr技术 动物种群 遗传多态性 分子标记 基因变异 基因定位 DNA测序
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PCR-SSCP法检测人类补体第八成分C8ADNA多态性研究
7
作者 杨志惠 张林 +2 位作者 周斌 王闯 贾静 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期471-473,共3页
目的建立一种检测人类补体C8ADNA多态性的新方法。方法C8A多态性的分子基础是C8A基因在第三外显子碱基发生了C→A的突变,通过特异性扩增C8A基因第三外显子,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法结合DNA序列分析检测成都地区9... 目的建立一种检测人类补体C8ADNA多态性的新方法。方法C8A多态性的分子基础是C8A基因在第三外显子碱基发生了C→A的突变,通过特异性扩增C8A基因第三外显子,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法结合DNA序列分析检测成都地区98份无血缘关系样本DNAC8A基因型。结果共发现3种基因型,C8A*AA、C8A*BB和C8A*AB,观测到的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。结论PCR-SSCP检测C8A多态性快速、简便、可靠、成本低,适用于大样本的筛选,在群体遗传学及法医学实践中有较好的应用价值。 展开更多
关键词 pcr—sscp 人类补体C8A 多态性
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MVR-PCR检测中国汉族人群D16S309基因座遗传多态性
8
作者 赵艳梅 丛斌 +3 位作者 付丽红 姚玉霞 白雪 刘颖 《第四军医大学学报》 北大核心 2007年第2期189-189,共1页
关键词 D16S309 MVR—pcr 聚丙烯酰胺凝胶电泳 遗传多态性
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荷斯坦牛Nramp1基因遗传多态性及其与乳房炎相关性的研究 被引量:11
9
作者 胡海川 王洪梅 +4 位作者 李建斌 王长法 赖松家 李秋玲 仲跻峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期57-62,共6页
利用PCR-SSCP技术检测了344头中国荷斯坦牛Nramp1基因exon 11的基因多态性,并分析了其不同基因型与乳房炎及产奶量性状的关系。结果表明:实验群体发现3种基因型AA、AB、BB,其中A等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.767,而B等位基... 利用PCR-SSCP技术检测了344头中国荷斯坦牛Nramp1基因exon 11的基因多态性,并分析了其不同基因型与乳房炎及产奶量性状的关系。结果表明:实验群体发现3种基因型AA、AB、BB,其中A等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.767,而B等位基因频率则为0.233。经X^2适合性检验,群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果显示:扩增片段分别在200 bp(C/G)和254 bp(T/G)存在碱基突变,并导致了氨基酸改变,分别为丙氨酸替换为脯氨酸(A1a356Pro)、亮氨基酸替换为蛋氨酸(Leu374Met)。通过构建最小二乘线性模型,进行Nramp1基因多态性与产奶量、体细胞评分(SCS)的相关性分析表明,AA型个体的SCS最小二乘均值显著低于BB、AB型(P<0.05),而AA型、AB个体的产奶量最小二乘均值显著高于BB型(P<0.01,P<0.05),AA基因型可作为乳房炎抗性的优良基因型。因此,可将Nramp1作为奶牛乳房炎候选基因应用于分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 Nramp1 遗传多态性:pcr—sscp 乳房炎 中国荷斯坦牛
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中国荷斯坦牛Toll样受体4基因的遗传多态性与体细胞评分的关联分析 被引量:8
10
作者 陈仁金 王珍珍 +3 位作者 杨章平 朱孝荣 冀德君 毛永江 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第11期134-138,共5页
试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公... 试验旨在研究中国荷斯坦牛Toll样受体4(toll-like receptor 4,TLR4)基因的遗传多态性及其与体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种。利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛TLR4基因进行多态性检测,用最小二乘均数法对TLR4基因的多态位点与SCS进行相关分析。结果发现,试验共检测到2个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs),TLR4基因5′侧翼区存在SNP-226G>C突变,经PCR-RFLP检测发现3种基因型:GG、GC和CC,基因型频率分别为0.208、0.482和0.310;外显子3存在SNP 1760C>T突变,经PCR-SSCP检测发现3种基因型:CC、TC和TT,基因型频率分别为0.738、0.225和0.007,以上2位点均偏离Hardy-Weinberg平衡。对于SNP-226G>C位点,基因型个体的SCS差异不显著;对于SNP 1760C>T位点,CC基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT和TC基因型个体(P<0.01)。SNP 1760C>T的CC基因型对于中国荷斯坦牛的SCS有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 Toll样受体4基因 pcr—RFLP pcr—sscp 多态性 体细胞评分
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4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传多态性分析 被引量:5
11
作者 李明娜 刘秀 +2 位作者 王继卿 李少斌 罗玉柱 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2013年第4期7-13,共7页
【目的】对中国河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊和陇东绒山羊4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传特征进行分析,为揭示绒山羊遗传特征和生产利用提供基础数据。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊及... 【目的】对中国河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊和陇东绒山羊4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传特征进行分析,为揭示绒山羊遗传特征和生产利用提供基础数据。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊及陇东绒山羊(共721只)KAP13-1基因的多态性。同时基于DA遗传距离用UP-GMA法进行聚类分析,以明确各群体间的遗传关系。【结果】基因组DNA扩增后得到491bp的扩增产物,经SSCP分析,从4个绒山羊群体KAP13-1基因中共发现6种基因型,4个等位基因中存在5个变异位点,这些多态位点主要为点突变,且均处于编码区,其中转换位点3个(占60%),颠换位点2个(占40%)。在170和197位分别发生了T→G、C→G的错义突变,导致氨基酸分别由Leu、Thr变为Arg、Ser。该基因在河西绒山羊与陇东绒山羊中均存在4个等位基因,而内蒙古绒山羊未检测到C和D等位基因,辽宁绒山羊未检测到D等位基因。聚类结果显示,河西绒山羊与陇东绒山羊之间的遗传距离较小,在系统发生树中聚为一支,辽宁绒山羊与内蒙古绒山羊聚为一支。【结论】KAP13-1基因在4个绒山羊群体中呈中度多态,群体间存在差异。生态学作用对4个绒山羊品种的进化过程有一定的影响。 展开更多
关键词 KAP13-1基因 绒山羊 pcr—sscp 遗传多态性
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中国南方汉族群体27个Y-STR基因座的遗传多态性及突变研究 被引量:15
12
作者 王瑛 张楚楚 +4 位作者 李燃 彭珊 欧雪玲 童大跃 孙宏钰 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期650-656,共7页
【目的】调查27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体的遗传多态性及突变情况。【方法】采集885名中国南方汉族无关男性个体血样和911对父子血样,采用YfilerPlus扩增体系对样本进行扩增,并进行毛细管电泳检测与分型,统计相关遗传多态性参... 【目的】调查27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体的遗传多态性及突变情况。【方法】采集885名中国南方汉族无关男性个体血样和911对父子血样,采用YfilerPlus扩增体系对样本进行扩增,并进行毛细管电泳检测与分型,统计相关遗传多态性参数,观察Y-STR基因座突变情况。【结果】885名无关男性个体中共观察到880种单倍型,其中875种单倍型为唯一单倍型,5种单倍型分别出现两次。单倍型多样性(HD)为0.999 987 2,系统识别能力(DC)为0.994 350 3。27个Y-STR基因座基因多态性(GD)在0.434 4(DYS438)-0.960 5(DYS385a/b)之间。在911个父子对共246 23次等位基因传递中共观察到113次突变事件,其中108次突变事件为一步突变,5次突变事件为二步突变。11个父子对观察到2个基因座同时突变,1个父子对发生3个基因座同时突变。平均突变率为4.6×10-3(95%CI:3.8×10-3-5.5×10-3)。【结论】YfilerPlus体系包含的27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体中具有高度遗传多态性,对于法医学实践中个体识别、父系亲缘关系鉴定等具有重要意义。 展开更多
关键词 短串联重复序列(STR) YfilerPlus pcr扩增体系 遗传多态性 突变
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中国成都地区汉族人群DHFRP_2位点的遗传多态性研究 被引量:5
13
作者 徐振波 吴梅筠 +3 位作者 孙光云 李荣华 张林 赖跃 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期15-18,共4页
用扩增片断长度多态性技术分析短串联重复序列 ( S T R) D H F R P2 位点的 D N A 多态性, 在156 个中国成都地区汉族无关个体中发现6 个等位基因, 19 种基因型, 并首次发现一重复单元数不是4的整数倍的等位... 用扩增片断长度多态性技术分析短串联重复序列 ( S T R) D H F R P2 位点的 D N A 多态性, 在156 个中国成都地区汉族无关个体中发现6 个等位基因, 19 种基因型, 并首次发现一重复单元数不是4的整数倍的等位基因, 该等位基因按孟德尔遗传规律遗传。观察的基因型分布符合 Hardy - Weinberg 定律, 其个人鉴别力 ( D P) 为087 , 杂合度为673 % , 多态性信息量 ( P I C) 为068 , 非父排除率( C E) 为455 % , 家系分析结果表明, 该位点符合孟德尔遗传法则。 展开更多
关键词 DHFRP2位点 pcr DNA 遗传多态性 汉族 成都
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鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与其体重的关系 被引量:25
14
作者 欧阳建华 孙汉 +5 位作者 李海华 邱峰芳 柳小春 施启顺 王文君 林树茂 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期525-529,共5页
对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这... 对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这3种基因型的分布呈现显著差异(P<0 05)。分析这3种基因型与其体重的关系发现,这3种基因型对初生重、30日龄体重、60日龄体重、90日龄体重及120日龄体重影响差异均不显著(P>0 05),但体现出AA型有较高体重的趋势,公母表现出一致的规律。在万载康乐黄鸡中,均呈现出杂合优势,在8周龄及18周龄时差异不显著(P>0 05),而在12周龄表现为差异显著(P<0 05)。宁都三黄鸡公母基因型分布均符合哈代 温格伯定律,而万载康乐黄鸡基因型分布不符合哈代 温格伯定律。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子-1 IGF-1 基因 遗传多态性 体重 宁都三黄鸡 万载康乐黄鸡 pcr—RFLP 调控区 遗传 变异 基因型 哈代-温格伯定律 AA型
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秦川牛和中国荷斯坦奶牛FSHβ基因SSCP多态性分析 被引量:13
15
作者 梁宏伟 昝林森 +2 位作者 孟彦 方平 田万强 《中国农学通报》 CSCD 2005年第5期81-83,共3页
利用SSCP分子标记对秦川牛和中国荷斯坦奶牛的FSHβ基因5’侧翼区进行了多态性分析。结果表明:在秦川牛中检测的FSHβ基因5’侧翼区有AA型、BB型和AB型三种基因型,在中国荷斯坦奶牛中只有AA型。秦川牛中AA基因型的频率为0.395,BB基因型... 利用SSCP分子标记对秦川牛和中国荷斯坦奶牛的FSHβ基因5’侧翼区进行了多态性分析。结果表明:在秦川牛中检测的FSHβ基因5’侧翼区有AA型、BB型和AB型三种基因型,在中国荷斯坦奶牛中只有AA型。秦川牛中AA基因型的频率为0.395,BB基因型的频率为0.026,AB基因型的频率为0.579,中国荷斯坦奶牛的AA型的频率为1。秦川牛中A的基因频率为0.6842,B的基因频率为0.3158,中国荷斯坦奶牛A的基因频率为1.0。秦川牛群体中多态信息含量为0.3389,多态性高,遗传变异大。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 FSHΒ基因 多态性分析 sscp 秦川牛 基因频率 多态信息含量 基因型 AA型 分子标记 遗传变异 AB型 BB型
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西花蓟马ISSR-PCR多态性引物及退火温度筛选 被引量:4
16
作者 李志华 蒋兴川 +3 位作者 桂富荣 刘雅婷 刘佳妮 和淑琪 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第4期1-6,共6页
西花蓟马是近年来在我国局部地区爆发成灾的重要外来入侵害虫,为进一步研究西花蓟马的遗传多样性和种群遗传结构,对100条ISSR分子标记引物对西花蓟马基因组DNA的扩增情况进行了初步筛选,并利用4个地区的西花蓟马种群研究了其扩增多态性... 西花蓟马是近年来在我国局部地区爆发成灾的重要外来入侵害虫,为进一步研究西花蓟马的遗传多样性和种群遗传结构,对100条ISSR分子标记引物对西花蓟马基因组DNA的扩增情况进行了初步筛选,并利用4个地区的西花蓟马种群研究了其扩增多态性和最佳退火温度。结果表明:100条ISSR引物中有51条引物在西花蓟马基因组DNA中有扩增产物,其中,多态性引物12条,分别为UBC815、UBC834、UBC835、UBC840、UBC844、UBC845、UBC853、UBC864、UBC868、UBC874、UBC879和UBC899,其最佳退火温度依次为48℃、56℃、52℃、50℃、54℃、58℃、50℃、52℃、48℃、58℃、44℃和56℃。12条ISSR引物在4个地区的西花蓟马种群共检测到68个扩增位点,其中,多态位点31个,多态性比率(P)为45.59%;其遗传距离变化范围为0.132~0.338;在4个地区中,昆明和玉溪的西花蓟马亲缘关系最近。 展开更多
关键词 西花蓟马 ISSR—pcr 多态性引物 退火温度 遗传多样性
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新疆巴里坤哈萨克族人群19个STR基因座的遗传多态性 被引量:6
17
作者 张丽萍 许晨波 +3 位作者 陈慧锦 周游 李飞 陈健刚 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期934-938,共5页
目的:调查新疆哈密地区巴里坤哈萨克族无关个体的19个STR基因座(D8S1179,D21S11,CSF1PO,D3S1358,D7S820,TH01,D13S317,D2S1338,D18S51,D16S539,TPOX,vWA,D19S433,D5S818,FGA,PentaD,PentaE,D6S1043,D12S391)多态性,研究其在法医学检验... 目的:调查新疆哈密地区巴里坤哈萨克族无关个体的19个STR基因座(D8S1179,D21S11,CSF1PO,D3S1358,D7S820,TH01,D13S317,D2S1338,D18S51,D16S539,TPOX,vWA,D19S433,D5S818,FGA,PentaD,PentaE,D6S1043,D12S391)多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法:用GoldeneyeTM20A五色荧光标记系统对采集的81例血样进行19个基因座的复合扩增,用ABI3130XL全自动测序仪对扩增产物进行检测,用GeneMapper v3.2软件对其进行基因分型。结果:GoldeneyeTM20A系统的19个STR基因座在哈密地区巴里坤哈萨克族人群的累积个体识别率(discrimination power,DP)值大于0.999999999,累积非父排除率(probabilities of paternity exclusion,PE)值达0.999998914。结论:该19个STR基因座可满足新疆哈密地区哈萨克族人群法医学个体识别及亲权鉴定的需要。 展开更多
关键词 法医物证学 STR基因座 pcr 遗传多态性 哈萨克族
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转化生长因子β1基因多态性对煤工尘肺遗传易感性的影响 被引量:6
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作者 姚武 郝长付 +1 位作者 王娜 赵毅波 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2006年第10期1875-1877,共3页
目的:探讨转化生长因子β1(TGF-β1)基因-509位点多态性对煤工尘肺遗传易感性的影响。方法:以110例汉族煤工尘肺患者和110例汉族煤尘接触者为研究对象,进行问卷调查,采集其外周静脉血提取DNA并应用PCR-RFLP技术检测其TGF-β1基因-509位... 目的:探讨转化生长因子β1(TGF-β1)基因-509位点多态性对煤工尘肺遗传易感性的影响。方法:以110例汉族煤工尘肺患者和110例汉族煤尘接触者为研究对象,进行问卷调查,采集其外周静脉血提取DNA并应用PCR-RFLP技术检测其TGF-β1基因-509位点多态性。结果:煤工尘肺患者中TGF-β1基因-509位点为C/T及T/T基因型的占81·8%,C/C基因型占18·2%;而煤尘接触者中则分别为53·6%和46·4%,两组之间差异有统计学意义(P<0·05)。调整接尘工龄后,C/T及T/T基因型罹患煤工尘肺危险度是C/C基因型的3·308倍(P<0·05)。logistic回归分析结果显示TGF-β1基因-509位点基因型、接尘工龄、吸烟3个因素均对罹患煤工尘肺有影响。结论:TGF-β1基因-509位点C/T及T/T基因型可能比C/C基因型者易于罹患煤工尘肺,接尘工龄、吸烟亦是煤工尘肺重要的影响因素。 展开更多
关键词 煤工尘肺 转化生长因子Β1 基因多态性 遗传易感性 pcr—RFLP
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AS-PCR方法检测中国人群CYP2C19基因多态性 被引量:7
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作者 薛丽 叶玉兴 +1 位作者 易国辉 白玉杰 《海南医学院学报》 CAS 2010年第9期1101-1105,1110,共6页
目的:建立一种快速、灵敏的细胞色素氧化酶P4502C19基因多态性检测方法。方法:分离外周血淋巴细胞基因组DNA,分别用一对等位基因特异性(allele-specific,AS)的反向引物与共用正向引物进行PCR扩增,通过电泳分析对应的PCR产物来判断CYP2C1... 目的:建立一种快速、灵敏的细胞色素氧化酶P4502C19基因多态性检测方法。方法:分离外周血淋巴细胞基因组DNA,分别用一对等位基因特异性(allele-specific,AS)的反向引物与共用正向引物进行PCR扩增,通过电泳分析对应的PCR产物来判断CYP2C19基因型。在AS引物3′端倒数第三位或第二位引入错配碱基改进特异性。采用优化后方法对278例健康人进行CYP2C19基因型分析。结果:AS-PCR可检测CYP2C19基因多态性,引入第二个错配碱基可提高检测特异性。经直接测序验证结果完全一致。结论:建立和优化的AS-PCR方法适用于CYP2C19基因多态性快速检测。 展开更多
关键词 细胞色素氧化酶2C19 遗传多态性 基因型 等位基因特异性pcr
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DGGE法检测稻田蓝细菌及硅藻的遗传多态性 被引量:4
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作者 宋铁英 包晓东 +1 位作者 郑伟文 Rasmussen Ulla 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期669-673,共5页
运用对蓝细菌和硅藻 16SrRNA特异的引物对 ,将稻田土壤中提取的总DNA进行PCR扩增后 ,通过DGGE技术对PCR产物进行分析 .结果表明 ,在水稻生长的不同时期 ,稻田蓝细菌及硅藻种群也在变化 ,田间不同位置蓝细菌及硅藻种类也有所不同 。
关键词 DGGE 蓝细菌 硅藻 遗传多态性 DGGE技术 稻田微生物群落 pcr扩增
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