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新疆冬小麦籽粒品质性状遗传差异与关联分析
1
作者 马艳明 娄鸿耀 +6 位作者 王威 孙娜 颜国荣 张胜军 刘杰 倪中福 徐麟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1394-1405,共12页
小麦籽粒品质与面粉加工的食品品质密切相关,是小麦早期品质选择的重要依据。本研究以产自新疆的134个冬小麦地方品种和54个育成品种为材料,对连续2年种植收获于新疆乌鲁木齐市、新疆伊宁市共计4个试验点的小麦籽粒进行品质检测与全基... 小麦籽粒品质与面粉加工的食品品质密切相关,是小麦早期品质选择的重要依据。本研究以产自新疆的134个冬小麦地方品种和54个育成品种为材料,对连续2年种植收获于新疆乌鲁木齐市、新疆伊宁市共计4个试验点的小麦籽粒进行品质检测与全基因组关联分析。结果表明,7个小麦籽粒品质性状的广义遗传力在62.14%~85.35%之间,由大到小排序依次为:硬度(85.35%)>湿面筋含量(78.44%)>出粉率(73.13%)>容重(72.50%)>沉降值(66.70%)>籽粒蛋白质含量(65.24%)>淀粉含量(62.14%)。在4个不同环境下,7个小麦籽粒品质性状表现为蛋白质含量、湿面筋含量、沉降值的变异相对较大,籽粒硬度的变异居中,淀粉含量、出粉率、容重的变异较小,多数籽粒品质性状间呈极显著相关性。设定阈值P<0.01,经关联分析,7个性状共检测到6605个显著性SNP标记,可解释6.021%~31.467%的变异。4个环境下检测到2个以上性状共有的多性状位点12个,可以解释6.233%~17.708%的表型变异。分别是蛋白质含量/沉降值、蛋白质含量/容重共有位点各1个,分别位于6A、2B上;蛋白质含量/湿面筋含量共有位点5个,分别位于3A、1B、6B、7B和7D上;沉降值/容重/籽粒硬度3个性状共有位点1个,位于5B上;蛋白质含量/沉降值/湿面筋含量3个性状共有位点3个,位于7A、3B和2D上,蛋白质含量/沉降值/湿面筋含量/容重4个性状共有位点1个,染色体位置未知。筛选出11个多性状、多环境品质相关基因,其中TraesCS6B01G347500编码一种储运蛋白,TraesCS1B01G395400编码碳水化合物转运蛋白/糖转运蛋白,TraesCS2D01G246500基因编码具有耐冷、耐盐、节水相关的蛋白ESKIMO1,可作为候选基因进行等位变异分析和标记开发,为小麦标记辅助选择育种提供分子工具。 展开更多
关键词 新疆 冬小麦 籽粒品质 遗传差异 关联分析
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基于叶绿体基因组解析广西裂果薯与裂果薯的遗传差异及亲缘关系
2
作者 麻云英 邓永彪 +4 位作者 吕虎强 周倩如 李景剑 陆昭岑 谢文娟 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1707-1720,共14页
蒟蒻薯属(Tacca)植物的分类一直存在很大的争议,其中广西裂果薯(Schizocapsa guangxiensis)被认为应与裂果薯(Tacca plantanginea)归并为同一物种,但也有学者根据其形态差异划分为不同的物种。为了明确广西裂果薯与裂果薯的遗传差异和... 蒟蒻薯属(Tacca)植物的分类一直存在很大的争议,其中广西裂果薯(Schizocapsa guangxiensis)被认为应与裂果薯(Tacca plantanginea)归并为同一物种,但也有学者根据其形态差异划分为不同的物种。为了明确广西裂果薯与裂果薯的遗传差异和系统发育关系,该研究对广西裂果薯进行DNA高通量测序,利用生物信息软件组装了完整的叶绿体基因组,并与已发表的裂果薯叶绿体基因组进行比较及系统发育分析。结果表明:(1)广西裂果薯和裂果薯的叶绿体基因组大小分别为162 149 bp和160 749 bp, GC含量都是36.90%,两者注释后得到的基因种类和基因数目完全一致,包含89个蛋白质编码基因、37个tRNA基因、6个rRNA基因。(2)密码子的偏好性分析显示,两物种使用的密码子频率存在一定差异,但是都偏好以A/T(U)结尾的密码子。(3)与裂果薯相比,广西裂果薯的SSC边界发生明显的扩张现象,是导致两者叶绿体基因组长度差异的主要因素。(4)广西裂果薯与裂果薯在LSC和SSC区域内存在一些序列分歧,尤其是基因间隔区,可用于开发物种特异性分子标记。(5)系统发育结果显示,广西裂果薯与裂果薯的亲缘关系较远,尽管广西裂果薯寄定在蒟蒻薯属内,但是它们属于两个不同的物种。该研究丰富了广西裂果薯叶绿体基因组遗传信息,为广西裂果薯物种分类、遗传多样性分析和物种保护提供了理论依据。 展开更多
关键词 广西裂果薯 蒟蒻薯属 叶绿体基因组 遗传差异 系统发育分析
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福建茶树种质资源群体结构及遗传差异
3
作者 杨军 张力岚 +4 位作者 张雯婧 陈林海 郑国华 李毅晶 王让剑 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期769-783,共15页
利用38对SSR荧光引物对208个福建茶树种质资源的群体遗传结构、遗传多态性、遗传分化、基因流、分子方差进行分析,并调查其叶片性状。结果表明,208个福建茶树资源的Nei’s遗传多样性指数为0.674,Shannon’s信息指数为1.444;叶面积与叶... 利用38对SSR荧光引物对208个福建茶树种质资源的群体遗传结构、遗传多态性、遗传分化、基因流、分子方差进行分析,并调查其叶片性状。结果表明,208个福建茶树资源的Nei’s遗传多样性指数为0.674,Shannon’s信息指数为1.444;叶面积与叶片长宽比平均值分别为27.442 cm^(2)和2.516;福建茶树种质资源的遗传变异主要来源于个体间遗传变异。经群体结构分析将供试材料分为8个群体,群体a、b、f、h内材料来源单一,群体c、d、e、g内材料来源复杂,不同地点间茶树群体遗传背景相似。群体a、群体b、群体e内共有40个福建茶树品种,群体a内主要为适制绿茶品种,群体b内主要为适制乌龙茶品种,群体e内代表性品种为适制绿茶品种,群体a、群体b、群体e的群体属性与适制茶类存在一定相关性;群体c内包含南靖县、云霄县与平和县资源,地理位置相对较近,群体属性与地理来源相关。群体g与群体e群体间基因流为6.321,表明群体间基因交流频繁;群体相似系数聚类显示群体d与群体b亲缘关系较近。群体h与其他群体间遗传分化明显,叶面积、叶齿数性状特征差异显著(P<0.05),群体f与其他群体间亲缘关系较远,叶齿数、叶脉对数性状特征差异显著(P<0.05),说明群体h和群体f都具有一定的独特性,需进一步鉴定。本研究结果为福建茶树种质资源的鉴定、筛选与利用提供一定的参考。 展开更多
关键词 茶树 福建 群体结构 遗传差异
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秀珍菇主栽品种遗传差异及农艺性状比较
4
作者 柯斌榕 兰清秀 +3 位作者 卢政辉 卢园萍 林弘毅 李亚茹 《东南园艺》 2023年第4期241-247,共7页
【目的】了解秀珍菇两个主栽品种‘台秀’和‘金秀’的遗传及农艺性状差异,为后续秀珍菇新品种选育提供遗传背景及农艺性状参考。【方法】采用菌落形态对比、拮抗试验、交配型因子分析、SRAP分子标记等方法,并比较菌丝生长速度及出菇农... 【目的】了解秀珍菇两个主栽品种‘台秀’和‘金秀’的遗传及农艺性状差异,为后续秀珍菇新品种选育提供遗传背景及农艺性状参考。【方法】采用菌落形态对比、拮抗试验、交配型因子分析、SRAP分子标记等方法,并比较菌丝生长速度及出菇农艺性状,进行两个品种间的遗传差异分析。【结果】台秀与金秀具有不同的菌落形态,但拮抗试验未观察到明显的拮抗现象。两个品种的菌丝生长趋势相同,菌丝适宜生长温度为20~30℃,30℃时菌丝生长速度最快。交配型因子测定分析表明二者具有相同的交配型因子。筛选得到6对引物进行SRAP-PCR扩增可以得到差异性条带。相同出菇条件下,金秀子实体菌盖更加厚实、一潮单袋产量138.86 g,台秀子实体颜色更深、一潮单袋产量126.57 g。【结论】秀珍菇主栽品种台秀与金秀之间遗传差异较小,但有着不同的农艺性状表现,可作为秀珍菇新品种选育的优良亲本。 展开更多
关键词 肺形侧耳 子实体 主栽品种 遗传差异
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全基因组选择信号解析剑白香猪和从江香猪的遗传差异 被引量：2
5
作者 袁巍 毕欢 +4 位作者 张雨丹 张依裕 顾晓龙 杨红文 陈伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3631-3641,共11页
旨在通过全基因组选择信号分析揭示剑白香猪和从江香猪的遗传差异,提高对从江香猪和剑白香猪种群的保护状况、遗传多样性、群体结构和和适应性进化的认识。本研究随机选取2岁龄从江香猪和剑白香猪各5头,并分为两组。通过全基因组重测序... 旨在通过全基因组选择信号分析揭示剑白香猪和从江香猪的遗传差异,提高对从江香猪和剑白香猪种群的保护状况、遗传多样性、群体结构和和适应性进化的认识。本研究随机选取2岁龄从江香猪和剑白香猪各5头,并分为两组。通过全基因组重测序对从江香猪和剑白香猪测序,将测序数据利用bwa软件比对到猪参考基因组Sscrofa 11.1上,随后使用GATK软件进行变异检测和SNP、INDEL过滤提取。同时,利用Plink和SNeP软件进行群体遗传多样性分析,包括群体有效大小、多态位点比例、观测杂合度、期望杂合度。使用vcftools软件分析群体选择信号,并通过KEGG和GO分析受选择区域基因。经过SNP和INDEL分析,发现从江香猪和剑白香猪群体共有的SNPs位点数为16158002个,从江香猪特有的为6863992个,剑白香猪特有的为4275660个;共有的INDEls位点数为3275375个,从江香猪特有的为1674081个,剑白香猪特有的为1114248个。从采样起算,从江香猪和剑白香猪的群体在13代前的有效大小均为18头。其中,从江香猪的多态性位点比例更高,达到了0.8757,而二者群体的观测杂合度均高于期望杂合度。剑白香猪和从江香猪的核苷酸多样性均小于0.5%,群体内选择检验Tajima’s D值均大于0,ROD值为0.5531,Fst值为0.7362。KEGG和GO富集分析表明,剑白香猪和从江香猪的遗传差异涉及多种通路和基因功能。包括涉及轴突引导、ECM与受体的相互作用、局部粘附、PI3K-Akt信号通路、硫辛酸代谢、cGMP-PKG信号通路、MAPK信号传导途径、核苷酸切除修复、阿佩林信号通路、心律失常性右室心肌病等通路。剑白香猪和从江香猪群体之间存在一定的群体多态性损失,群体分歧度较高,两亚群间存在明显的种群分化,并且二者基因组内存在大量的中等频率等位基因,需要提高从江香猪和剑白香猪群体内的遗传多样性,减少外来血缘引入导致纯种度降低的风险。 展开更多
关键词 全基因组 选择信号 香猪 遗传差异
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基于SSR标记的不同粒色大麦品种(系)的遗传差异分析
6
作者 王楠 慕芳 +3 位作者 金子航 张园 樊瑞泉 陈升位 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第5期739-745,共7页
【目的】研究不同粒色大麦品种(系)的遗传差异,为有色籽粒大麦的品种选育奠定基础。【方法】基于大麦7条染色体上的51个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记位点,分析25份不同粒色大麦品种(系)的遗传差异。【结果】在25份参... 【目的】研究不同粒色大麦品种(系)的遗传差异,为有色籽粒大麦的品种选育奠定基础。【方法】基于大麦7条染色体上的51个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)标记位点,分析25份不同粒色大麦品种(系)的遗传差异。【结果】在25份参试品种(系)基因组中,51个SSR位点发生2~16个等位变异,PIC值变幅为0.491~0.922。品种(系)间的遗传相似系数变幅为0.569~0.872,其中wn6与wn16的遗传相似系数最小,wn16与wn17的遗传相似系数最大。聚类分析结果显示:3个黑色籽粒品系(wn-16、wn-17、wn-18)聚为第1类,3个紫黑色籽粒品种(wn-13、wn-14、wn-15)和6个蓝色籽粒品种(wn-20、wn-21、wn-22、wn-23、wn-24、wn-25)聚为第2类,5个褐色籽粒品种(wn-1、wn-2、wn-3、wn-4、wn-5)、3个黄色籽粒品种(wn-6、wn-7、wn-8)和4个紫色籽粒品种(wn-9、wn-10、wn-11、wn-12)聚为第3类。【结论】相同粒色的大麦品种(系)具有较高的遗传相似性,wn-6与wn-16、wn-6与wn-18、wn-1与wn-24等配对品种(系)的遗传相似系数较低,可用作有色籽粒大麦品种选育的杂交亲本。 展开更多
关键词 大麦 粒色 简单重复序列(SSR)标记 遗传差异
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分子系统学研究中分子位点数与遗传差异信息可靠性的关系 被引量：49
7
作者 周泽扬 夏庆友 +2 位作者 鲁成 冯丽春 向仲怀 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期12-15,共4页
用桑蚕（包括不同生态地理品种５９个及野桑蚕）和桑属植物（包括１２个种和２个变种）两类截然不同的材料，探讨了分子系统学研究中ＲＡＰＤ分子位点数与遗传差异信息可靠性间的关系。发现：（１）所分析的位点数多少与所能提供系统信... 用桑蚕（包括不同生态地理品种５９个及野桑蚕）和桑属植物（包括１２个种和２个变种）两类截然不同的材料，探讨了分子系统学研究中ＲＡＰＤ分子位点数与遗传差异信息可靠性间的关系。发现：（１）所分析的位点数多少与所能提供系统信息的量及可靠性之间有明显的关系；（２）当位点数在２０以下时，得到的遗传差异的结果极不可靠，随着位点数的增加所提供的信息量及可靠性增加。当位点数超过７０个时，所提供的信息可靠性趋于稳定；（３）对桑蚕和桑属植物两种截然不同的材料的分析，均得相似结果。由此推论：在用ＲＡＰＤ进行生物系统学研究中，以分析７０个左右位点数为好；这一结论受研究对象的影响小。 展开更多
关键词 分子系统学 RAPD位点数 遗传差异 蚕 桑
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普通小麦Genomic-SSR和EST-SSR分子标记遗传差异及其与系谱遗传距离的比较研究 被引量：36
8
作者 杨新泉 刘鹏 +3 位作者 韩宗福 倪中福 刘旺清 孙其信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第4期406-416,共11页
采用Genomic SSR和EST SSR标记技术,对来自我国北方冬麦区的 18份普通小麦品种(系)的遗传多样性进行了探讨,并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现,平均每个Genomic SSR检测到的等位基因数为3 34个,明显高于EST SSR的 2 31个。遗传... 采用Genomic SSR和EST SSR标记技术,对来自我国北方冬麦区的 18份普通小麦品种(系)的遗传多样性进行了探讨,并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现,平均每个Genomic SSR检测到的等位基因数为3 34个,明显高于EST SSR的 2 31个。遗传距离(GD)计算结果显示, 18个小麦基因型之间的EST SSR平均遗传距离较小,仅为 0 3996,低于Genomic SSR的GD平均值 0 5458。尽管EST SSR揭示出的多态性明显低于Genomic SSR,但系谱分析和聚类结果均表明,与Genomic SSR相比,EST SSR标记能更准确地反映出不同小麦基因型之间的遗传和亲缘关系。据此可以认为,EST SSR是评价小麦遗传多样性的一种理想标记形式。研究还证实,一个骨干亲本与由其衍生出来的品种(系)之间的遗传差异一般较小,并对拓宽普通小麦遗传基础的策略和方法进行了讨论。 展开更多
关键词 普通小麦 遗传差异 EST-SSR Genomic—SSR 系谱
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鲂属团头鲂、三角鲂及广东鲂种间遗传关系及种内遗传差异 被引量：55
9
作者 李思发 朱泽闻 +2 位作者 邹曙明 赵金良 蔡完其 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期339-345,共7页
采用形态判别、同工酶分析和RAPD分析相结合的方法 ,从 3个层次研究分析了鲂属团头鲂、三角鲂和广东鲂的种间亲缘关系和种内遗传差异。结果表明 :(1) 3种鲂在形态可数性状上差异不显著 ,而可量性状与框架分析揭示团头鲂与三角鲂亲缘关... 采用形态判别、同工酶分析和RAPD分析相结合的方法 ,从 3个层次研究分析了鲂属团头鲂、三角鲂和广东鲂的种间亲缘关系和种内遗传差异。结果表明 :(1) 3种鲂在形态可数性状上差异不显著 ,而可量性状与框架分析揭示团头鲂与三角鲂亲缘关系较近 ,它们同广东鲂差异较大 ;(2 )团头鲂和三角鲂均具有MDH同工酶的s Mdh D位点 ,而广东鲂未见 ,引物S11扩增的结果在 3种鲂间均显示种的特异性 ,这些同工酶谱带和DNA扩增带可作为 3种鲂的种间分子标记 ;(3) 3种鲂种间亲缘关系在三个研究层面上相互吻合 :即广东鲂与团头鲂、三角鲂差异较大 ,亲缘关系较远 ,而三角鲂和团头鲂之间差异小 ,亲缘关系较近 ;(4 )同工酶和RAPD分析揭示 ,三角鲂种内遗传多样性显著地高于广东鲂和团头鲂。 展开更多
关键词 鲂属 团头鲂 三角鲂 广东鲂 种间遗传关系 种内遗传差异 同工酶 RAPD 亲缘关系
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杂交水稻亲本遗传差异及其与杂种优势关系 被引量：42
10
作者 廖伏明 周坤炉 +1 位作者 阳和华 徐秋生 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期193-199,共7页
以目前生产上大面积应用和新育成的16个籼型三系杂交水稻亲本为材料，根据11个主要农艺和经济性状进行主成分分析和聚类分析，以马氏距离为指标，研究了杂交水稻亲本间遗传差异的状况及其与杂种优势的关系。在16个亲本的120个遗传距离中... 以目前生产上大面积应用和新育成的16个籼型三系杂交水稻亲本为材料，根据11个主要农艺和经济性状进行主成分分析和聚类分析，以马氏距离为指标，研究了杂交水稻亲本间遗传差异的状况及其与杂种优势的关系。在16个亲本的120个遗传距离中，80％以上小于2；9个恢复系间的平均遗传距离仅为0．4793，7个保持系间，除湘香2号B外，平均遗传距离为0．7723。说明现有杂交稻亲本间遗传差异较小，尤其是保持系内和恢复系内遗传差异更小。对亲本间遗传距离与杂种优势的相关分析表明，现有籼型三系杂交稻亲本间遗传差异与杂种优势关系不密切，而杂交稻产量的高低与双亲产量尤其是双亲产量平均值的高低密切相关。说明亲本改良在提高杂交稻产量中极为重要。此外，还对亲本改良与杂种优势的关系、杂交相亲本改良的方法和途径以及杂交稻组合亲本选配原则进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 杂交水稻 亲本 遗传差异 杂种优势
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普通小麦、斯卑尔脱小麦、密穗小麦和轮回选择后代材料ISSR分子标记遗传差异研究 被引量：57
11
作者 杜金昆 姚颖垠 +2 位作者 倪中福 彭惠茹 孙其信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第5期445-452,共8页
首次采用ISSR(Inter SimpleSequenceRepeat)分子标记 ,对我国北方冬麦区普通小麦 (14份 )、斯卑尔脱小麦 (10份 )、密穗小麦 (11份 )和一批以外源小麦为主要血缘的优良轮回选择后代 (12份 )共 4 7份材料进行了遗传差异研究 ,以探讨拓宽... 首次采用ISSR(Inter SimpleSequenceRepeat)分子标记 ,对我国北方冬麦区普通小麦 (14份 )、斯卑尔脱小麦 (10份 )、密穗小麦 (11份 )和一批以外源小麦为主要血缘的优良轮回选择后代 (12份 )共 4 7份材料进行了遗传差异研究 ,以探讨拓宽杂交小麦育种亲本遗传基础的途径 ,并分析利用ISSR分子标记构建小麦杂种优势群的可行性。所用 11个ISSR引物在 4 7份材料中共扩增出 2 38条带 ,其中 2 0 8条具有多态性 ,占总数的 87.4 %。每个引物可以扩增出 11～ 38条多态性带 ,平均为 18.8条。比较分析发现 ,不同类型材料群体内的ISSR多态性都很高 ,其中以普通小麦最高 (80 .3% ) ,轮回选择后代次之 (78.7% ) ,斯卑尔脱小麦 (75 .0 % )和密穗小麦 (74 .9% )相对较小。遗传距离(GD)计算结果表明 ,不同类型材料群体间的平均遗传距离在 0 .3115～ 0 .344 2之间 ,明显高于不同类型材料群体内的GD平均值 (0 .2 35 1～ 0 .2 74 3) ,特别是轮回选择后代材料与普通小麦、斯卑尔脱小麦和密穗小麦之间也具有较大的遗传差异 ,平均遗传距离分别为 0 .32 17、0 .32 5 6和 0 .3198。聚类结果显示 ,普通小麦、斯卑尔脱小麦、密穗小麦和轮回选择后代材料明显划分为 4大不同类群。斯卑尔脱小麦、密穗小麦及以外源小麦 (含国内 ) 展开更多
关键词 普通小麦 斯卑尔脱小麦 密穗小麦 轮回选择后代 ISSR分子标记 遗传差异 杂种优势群
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四种十足目甲壳动物遗传差异的RAPD分析 被引量：21
12
作者 项超美 陆仁后 +2 位作者 谢浩 刘向宇 张菁 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期251-256,共6页
采用RAPD技术，对分类阶元不同的四种十足目甲壳动物：克氏原螯虾、汉水华溪蟹、日本绒螯蟹合浦亚种和中华绒螯蟹，进行了遗传多态性的研究。四个物种DNA库的扩增结果表明，随着亲缘关系由近变远，物种间的相似率依次减小，由56．1％下... 采用RAPD技术，对分类阶元不同的四种十足目甲壳动物：克氏原螯虾、汉水华溪蟹、日本绒螯蟹合浦亚种和中华绒螯蟹，进行了遗传多态性的研究。四个物种DNA库的扩增结果表明，随着亲缘关系由近变远，物种间的相似率依次减小，由56．1％下降到22．3％。用UPGMA方法作聚类分析构建出物种的系统树图，反映出四个物种对应的种、科间、科间以上遗传差异逐步增大，这与以形态标记为主的分类结果相一致。在同工酶分析难以揭示差异的两种绒螯蟹中，用RAPD分析观察到明显的种间差异。两种绒螯蟹个体的扩增图谱分析结果为，中华绒螯蟹个体间的平均相似率为56．9％，日本绒螯蟹合浦亚种个体间为661％，两种绒螯蟹个体间的平均相似率则为51.9％。日本绒螯蟹合浦亚种个体间的平均相似率显著高于中华绒螯蟹个体间的平均相似率，异种绒螯蟹个体间的平均相似率显著低于同种个体间的平均相似率． 展开更多
关键词 RAPD 十足目 多态性 甲壳动物 遗传差异
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应用RAPD标记研究不同生态区谷子品种的遗传差异 被引量：19
13
作者 杨天育 窦全文 +3 位作者 沈裕琥 黄相国 何继红 吴国忠 《西北植物学报》 CAS CSCD 2003年第5期765-770,共6页
应用RAPD标记对19份国内不同生态区的谷子品种的遗传变异进行了研究.结果表明:分子水平上,不同生态区的谷子品种间存在一定的遗传差异,但遗传差异程度并不高.11个随机引物共扩增出54条多态性带,不同引物扩增的带数差异较大,每个引物可扩... 应用RAPD标记对19份国内不同生态区的谷子品种的遗传变异进行了研究.结果表明:分子水平上,不同生态区的谷子品种间存在一定的遗传差异,但遗传差异程度并不高.11个随机引物共扩增出54条多态性带,不同引物扩增的带数差异较大,每个引物可扩增2～8条多态性带,平均每个引物扩增出4.91条多态性带.引物1050扩增的多态性带最多 8条 .聚类结果表明,基于RAPD标记分析的遗传聚类群与生态类型有很大的一致性. 展开更多
关键词 RAFD标记 生态区 谷子 品种 遗传差异
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基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异 被引量：20
14
作者 张亚东 彭婵 +2 位作者 李振芳 杨彦伶 胡兴宜 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期8-11,117,共5页
为探讨基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异,采用两种SSR标记技术对来自5个杨树不同派间不同种的15份材料进行了遗传分析,并对两种不同标记方法进行分析比较。结果表明:EST-SSR标记相比基因组SSR在杨树不同种间具有更好的... 为探讨基因组SSR与EST-SSR标记在杨树不同种间的遗传差异,采用两种SSR标记技术对来自5个杨树不同派间不同种的15份材料进行了遗传分析,并对两种不同标记方法进行分析比较。结果表明:EST-SSR标记相比基因组SSR在杨树不同种间具有更好的通用性。 展开更多
关键词 杨树 基因组SSR EST—SSR 遗传差异
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中国抗枯、黄萎病陆地棉材料分子水平的遗传差异评价 被引量：14
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作者 温小杰 马峙英 +2 位作者 王省芬 张桂寅 李喜焕 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期936-943,共8页
采用SSR和AFLP分子标记技术,对中国不同年代培育的54个抗枯、黄萎病陆地棉品种(系)分子水平的遗传差异进行了研究。22对SSR引物和20个AFLP引物组合共扩增出446个多态性标记,每个品种平均8.26个。采用SPSS11.5软件计算欧氏距离,中国抗病... 采用SSR和AFLP分子标记技术,对中国不同年代培育的54个抗枯、黄萎病陆地棉品种(系)分子水平的遗传差异进行了研究。22对SSR引物和20个AFLP引物组合共扩增出446个多态性标记,每个品种平均8.26个。采用SPSS11.5软件计算欧氏距离,中国抗病品种间欧氏距离分布在5.568～11.790之间,平均值为8.906;单一品种欧氏距离平均值为8.530～10.011,高于欧氏距离总平均值的品种共10个,占品种总数的18.52%;85.55%的品种欧氏距离值分布于7.000～10.000之间,表明中国供试抗病品种群体的遗传基础较为狭窄。作为比较对照的4个国外品种间欧氏距离变化在9.055～10.724之间。国内品种与国外品种之间的欧氏距离介于6.481～12.490,82.02%的品种欧氏距离值分布于8.000～11.000之间,表明国外品种与国内品种之间遗传差异较大。基于SSR和AFLP整合数据的聚类分析,58个品种被划分为5个SAG(SSR&AFLP-basedgroups)分子类群,SAG的划分与品种系谱来源有较强的相关性。 展开更多
关键词 中国 枯萎病 黄萎病 陆地棉 抗病种质 遗传差异 SSR AFLP
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五个紫菜品系间遗传差异的RAPD分析 被引量：25
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作者 徐涤 宋林生 +3 位作者 秦松 Alessandro Pala 费修绠 曾呈奎 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2001年第12期1-3,8,共4页
应用随机引物扩增片段多态性 (RAPD)技术对 2种紫菜的 5个品系进行遗传多样性分析。共筛选出 2 1条随机引物 ,PCR反应得到 147条扩增片段。根据共享扩增片段计算遗传相似性指数 (F)和相对遗传距离 ,利用NJ法构建系统树。结果表明 ,条斑... 应用随机引物扩增片段多态性 (RAPD)技术对 2种紫菜的 5个品系进行遗传多样性分析。共筛选出 2 1条随机引物 ,PCR反应得到 147条扩增片段。根据共享扩增片段计算遗传相似性指数 (F)和相对遗传距离 ,利用NJ法构建系统树。结果表明 ,条斑紫菜或坛紫菜的养殖品系首先聚类在一起 ,两个条斑紫菜养殖品系之间的遗传距离是0 32 ,两个坛紫菜养殖品系之间的遗传距离是 0 .31。条斑紫菜养殖品系CPY1 0 8A与坛紫菜养殖品系CPH8 83之间的遗传距离最大 ,达 0 .4 2。本文结果提示RAPD可以作为简便有效的分子工具应用于紫菜的遗传多样性和种质鉴定研究中。 展开更多
关键词 紫菜 RAPD 种质鉴定 遗传差异 遗传多样性 遗传距离 育种 品系管理
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普通小麦D染色体组微卫星分子标记遗传差异研究 被引量：22
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作者 倪中福 张义荣 +2 位作者 梁荣奇 刘广田 孙其信 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期145-151,共7页
本研究采用微卫星 (SSR)分子标记技术 ,对我国不同生态区的 6个春小麦品种 (系 )及北方冬麦区的 17个冬小麦品种 (系 ) D染色体组的遗传多样性进行了分析。结果显示 ,2 3个微卫星引物在 2 3份材料间共扩增出 6 5个等位基因 ,平均每个引... 本研究采用微卫星 (SSR)分子标记技术 ,对我国不同生态区的 6个春小麦品种 (系 )及北方冬麦区的 17个冬小麦品种 (系 ) D染色体组的遗传多样性进行了分析。结果显示 ,2 3个微卫星引物在 2 3份材料间共扩增出 6 5个等位基因 ,平均每个引物为 2 .9个。分析发现 ,冬小麦群体内检测到的等位基因数 (6 0个 )及平均遗传距离 (0 .4 5 0 4 )明显高于春小麦 (48个和 0 .344 9) ,说明冬小麦较春小麦群体内存在更大的遗传差异 ,但总体来看 ,我国普通小麦 D染色体组的遗传变异较小 ,遗传基础狭窄 ,其中以 1D染色体最为突出 ,平均每个引物仅扩增出 2个等位基因。本文对拓宽我国普通小麦 D染色体组遗传基础的策略及方法也进行了分析和讨论。 展开更多
关键词 小麦 D染色体组 微卫星分子标记 遗传差异
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罗氏沼虾浙江养殖群体与缅甸自然群体遗传差异的RAPD分析 被引量：28
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作者 李明云 张海琪 +5 位作者 朱俊杰 邬勇 黄福勇 何中央 徐晓林 杜建明 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期360-364,共5页
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对浙江省罗氏沼虾养殖群体和新引进的缅甸自然群体的遗传差异进行了比较分析,以期从分子水平了解罗氏沼虾的种群遗传多样性背景及与引种的关系。采用经筛选的22个10bp的随机引物对罗氏沼虾两群体各20尾... 利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对浙江省罗氏沼虾养殖群体和新引进的缅甸自然群体的遗传差异进行了比较分析,以期从分子水平了解罗氏沼虾的种群遗传多样性背景及与引种的关系。采用经筛选的22个10bp的随机引物对罗氏沼虾两群体各20尾进行群体RAPD分析。22个引物共检测到139个位点。养殖群体的多态位点比例为30.22％,群体平均杂合度为0.2646,Shannon多样性指数为0.0780,群体内各个体之间的遗传共享度为0.9353,遗传距离为0.0647;自然群体的多态位点比例为33.82％,群体的平均杂合度和Shannon多样性指数分别为0.2888和0.0940,群体内各个体之间的遗传共享度为0.9202,遗传距离为0.0799;两群体之间的遗传距离为0.1845。自然群体的遗传多样性水平比养殖群体要高。利用随机引物S9和S52,在罗氏沼虾两群体间扩增出2条稳定、明显的群体间特异性标记带。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 浙江养殖群体 缅甸自然群体 遗传差异 RAPD
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用微卫星DNA标记对我国杂交水稻主要恢复系遗传差异的检测分析 被引量：65
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作者 段世华 毛加宁 朱英国 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期250-254,共5页
选用分布于水稻 (OryzasativaL .) 12条染色体上的 2 5对SSR(Simplesequencerepeats)引物 ,分析了生产中广泛应用的 35个杂交水稻恢复系。在 35个杂交水稻恢复系材料间共检测出 6 5个等位基因 (alleles) ,平均每对SSR引物可检测到 2 6... 选用分布于水稻 (OryzasativaL .) 12条染色体上的 2 5对SSR(Simplesequencerepeats)引物 ,分析了生产中广泛应用的 35个杂交水稻恢复系。在 35个杂交水稻恢复系材料间共检测出 6 5个等位基因 (alleles) ,平均每对SSR引物可检测到 2 6个等位基因。PIC(Polymorphismindexcontent)值的变动范围为 0 .2 0 6～ 0 .6 82 ,平均值为 0 .4 14。聚类分析表明 ,我国杂交水稻恢复系资源比较丰富 ,但其遗传差异较小 ,遗传背景单一 ,从而在很大程度上限制了我国水稻杂种优势的利用。 展开更多
关键词 SSR 杂交水稻恢复系 遗传差异 检测 微卫星DNA标记
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应用形态、等位酶和SSR标记研究水稻矮仔占衍生品种的遗传差异 被引量：19
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作者 余汉勇 魏兴华 +2 位作者 王一平 袁筱萍 汤圣祥 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期477-482,共6页
选取我国水稻矮仔占衍生品种 2 4份 ,应用形态学、等位酶和微卫星 (SSR)标记 ,分析矮仔占衍生品种的遗传差异。聚类分析表明 3种方法在鉴别品种的遗传差异上存在较大差异。形态性状和SSR标记均能有效地鉴别 2 4份衍生品种 ,而等位酶仅... 选取我国水稻矮仔占衍生品种 2 4份 ,应用形态学、等位酶和微卫星 (SSR)标记 ,分析矮仔占衍生品种的遗传差异。聚类分析表明 3种方法在鉴别品种的遗传差异上存在较大差异。形态性状和SSR标记均能有效地鉴别 2 4份衍生品种 ,而等位酶仅能鉴别其中 17份。从形态学性状看 ,以香药糯与其他品种的遗传差异最大 ,SSR分析以香药糯、珍珠矮 11和辐陆选与其他品种的遗传差异较大 ,而等位酶分析 ,则以团结 1号与其他品种的差异最大。三类标记的遗传距离间虽存在有一定的相关性 ,但相关系数较小 (0 .2 17～ 0 .4 94 ) ,其中 ,形态学性状与SSR标记间相关极显著 (r =0 .4 94 ,P =0 0 0 2 ) ,等位酶与其他两类标记的相关性均不显著。研究结果还表明 ,系统选育和辐射选育的品种与亲本间有可能存在较大的遗传差异。 展开更多
关键词 水稻 矮仔占衍生品种 遗传差异 形态学 等位酶 微卫星标记 相关性
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