文摘长双歧杆菌由于其具有的益生功能而备受关注,该文旨在基于全基因组分析,揭示长双歧杆菌W13(Bifidobacterium longum W13)的基因特性,分析其功能基因和代谢通路。结果表明,长双歧杆菌W13隶属于长亚种,通过直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes:non-supervised orthologous groups,eggNOG)数据库注释,发现氨基酸代谢、碳水化合物代谢是该菌株的主要代谢功能;通过京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库注释,发现菌株中含有较多的群体感应相关基因,表明该菌株可促进肠道稳态。通过碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)数据库注释,发现该菌株具有较高的糖合成能力。最后,通过比较基因组分析,发现长双歧杆菌长亚种的遗传多样性和稳定性较高,相较于其他长双歧杆菌长亚种,菌株W13含有其特定的功能基因。综上表明菌株W13具有一定的益生功能,有开发为益生菌的潜力。
