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限制性内切酶组合对阪崎克罗诺杆菌的脉冲场凝胶电泳基因分型效果的影响 被引量:2
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作者 张博 葛武鹏 +4 位作者 郭春锋 张静 王智 刘阳 郗梦露 《食品安全质量检测学报》 CAS 2018年第4期821-829,共9页
目的利用多种限制性内切酶提高脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术对阪崎克罗诺杆菌(Cronobacter Sakazakii)的分型效果,找到更多的以PFGE为基础的阪崎克罗诺杆菌分子分型信息。方法本研究选用XbaⅠ、SpeⅠ、Nh... 目的利用多种限制性内切酶提高脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术对阪崎克罗诺杆菌(Cronobacter Sakazakii)的分型效果,找到更多的以PFGE为基础的阪崎克罗诺杆菌分子分型信息。方法本研究选用XbaⅠ、SpeⅠ、NheⅠ和BlnⅠ分别酶切34株克罗诺杆菌分离株的DNA,并经PFGE得到相应的基因图谱,通过束平均数、束菌株百分比、结与菌株比值与Simpson多样性指数对各限制内切酶以及结合酶的相对分辨率进行评价。结果 NheⅠ是PFGE单酶切分型中效果最好的一种限制性内切酶;4种限制性内切酶相结合的分型方法可提高PFGE阪崎克罗诺杆菌基因分型效果。结论运用PFGE技术对菌株进行亚分型时,选用的酶种类越多,则结果越可靠,使用XbaⅠ、SpeⅠ、NheⅠ、BlnⅠ4种内切酶结合分析,可以得到理想的菌株亚分型结果。 展开更多
关键词 阪崎克罗诺杆菌 脉冲凝胶电泳 限制性内切
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脉冲场凝胶电泳检测院内产ESBLs肺炎克雷伯菌及流行病学分析 被引量:2
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作者 徐瑞龙 许健波 +2 位作者 卜黎红 单小云 泮芸 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1217-1220,共4页
目的分析院内产ESBLs肺炎克雷伯菌的感染流行株及可能的流行环节,以制定出更合理的医院感染预防措施。方法收集本院患者及环境中产ESBLs肺炎克雷伯菌共57株,用纸片法检测其对18种抗菌药物的耐药性,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行限制性内... 目的分析院内产ESBLs肺炎克雷伯菌的感染流行株及可能的流行环节,以制定出更合理的医院感染预防措施。方法收集本院患者及环境中产ESBLs肺炎克雷伯菌共57株,用纸片法检测其对18种抗菌药物的耐药性,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行限制性内切酶多态性分析。结果57株产ESBLs肺炎克雷伯菌的耐药性:亚胺培南耐药率为0,含酶抑制剂的头孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林/舒巴坦的耐药率分别为35.1%、45.6%,头孢替坦(CTH)耐药率为43.8%、头孢吡肟(FEP)38.6%,其他抗菌药物耐药率均>60%;57株产ESBLs肺炎克雷伯菌分为28个克隆株,其中33株PFGE图谱分为A、B、C、D4型:A型是主要流行株(22株),主要集中在NCU、ICU。结论本院产ESBLs肺炎克雷伯菌流行主要为A、B、C、D型,NCU和ICU是医院感染高发区域;临床应慎用头孢三代类药物,以减少药物对菌株的筛选作用;各病区应进一步加强消毒隔离措施,严格遵守无菌操作规程。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 ESBLS 限制性内切谱多态性 脉冲凝胶电泳 流行病学
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鸡沙门氏菌脉冲场凝胶电泳分型研究
3
《今日畜牧兽医》 2010年第1期68-68,共1页
为应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)从分子水平上对禽源沙门氏茵之间的差别进行分析和研究,本研究采用自动微生物鉴定仪对12株疑似鼠伤寒沙门氏菌和15株疑似鸡白痢沙门氏菌进行鉴定。以限制性核酸内切酶XbaI对其全基因组DNA进行酶切、PFGE... 为应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)从分子水平上对禽源沙门氏茵之间的差别进行分析和研究,本研究采用自动微生物鉴定仪对12株疑似鼠伤寒沙门氏菌和15株疑似鸡白痢沙门氏菌进行鉴定。以限制性核酸内切酶XbaI对其全基因组DNA进行酶切、PFGE分型,Info Quest FP聚类分析软件对电泳结果进行分析。 展开更多
关键词 脉冲凝胶电泳 鸡沙门氏菌 分型 限制性核酸内切 鸡白痢沙门氏菌 鼠伤寒沙门氏菌 基因组DNA QUEST
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猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析方法的建立 被引量:1
4
作者 王丽丽 叶长芸 +8 位作者 许彦梅 崔志刚 景怀琦 金东 杜华茂 张守印 白雪梅 赵爱兰 徐建国 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期473-477,共5页
目的建立一种可共享的猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析(PFGE)方法。方法利用PulseNet技术优化猪链球菌PFGE分子分型方法,提出新的分析方案,包括胶块的制备、内切酶的选择、电泳条件等。利用DNAStar的Mapdraw软件对猪链球菌基因组序列进... 目的建立一种可共享的猪链球菌脉冲场凝胶电泳分析(PFGE)方法。方法利用PulseNet技术优化猪链球菌PFGE分子分型方法,提出新的分析方案,包括胶块的制备、内切酶的选择、电泳条件等。利用DNAStar的Mapdraw软件对猪链球菌基因组序列进行分析,发现在242种内切酶中,SwaⅠ、SmaⅠ、ApaⅠ种酶比较适合。结果通过对34个血清型共100株菌的分析,发现使用SwaⅠ可获得59种带型,使用SmaⅠ可获得53种带型,使用ApaⅠ可获得43种带型。其中以SwaⅠ的分辨率最好。结论提出猪链球菌的SwaⅠPFGE分析方法,并对条件进行优化,较原方法所需时间短、图像清晰。更具有可重复性,基本具备推广的条件。 展开更多
关键词 猪链球菌 脉冲凝胶电泳分析 内切 血清
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利用全基因组序列优化气单胞菌脉冲场凝胶电泳分型方法 被引量:2
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作者 陈洪友 陈敏 +2 位作者 屠丽红 陈涌 张曦 《中国食品卫生杂志》 2017年第6期641-646,共6页
目的对气单胞菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法从限制性内切酶的选择和电泳条件设置上进行优化,减少片段共迁移,使片段在电泳中分布均匀且利于分析。方法利用6个种的气单胞菌的全基因组数据,通过BioEdit软件对基因组序列进行677种酶的限... 目的对气单胞菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法从限制性内切酶的选择和电泳条件设置上进行优化,减少片段共迁移,使片段在电泳中分布均匀且利于分析。方法利用6个种的气单胞菌的全基因组数据,通过BioEdit软件对基因组序列进行677种酶的限制性片段分析,选择产生片段数量适宜的、有效片段比例高的酶作为备选酶。对片段长度取以10为底的对数作为自变量,以片段在泳道中的相对迁移距离作为应变量,计算片段长度-相对位置拟合公式,并模拟备选酶的电泳效果图。利用气单胞菌分离株对备选酶进行试验验证,确定PFGE分型方法,并用其对腹泻分离株进行分型应用。结果经Bio Edit分析,根据片段数量及有效片段比例,PmeⅠ、PacⅠ、SwaⅠ比XbaⅠ更适合于气单胞菌的分型。从PFGE模拟效果及分离株试验验证看,Pac Ⅰ、PmeⅠ的限制性片段的分布比XbaⅠ和SwaⅠ更均匀,片段重叠更少。最终确定PmeⅠ、PacⅠ分别为气单胞菌PFGE分型的首选酶和次选酶,脉冲场电流转换时间为2.16~63.8 s。16株腹泻分离株PFGE分型辛普森多样性指数为99.17%。结论优化的PFGE方法使用PmeⅠ、PacⅠ作为气单胞菌PFGE分型的限制性内切酶,该方法产生的片段数量与分布都优于XbaⅠ,在腹泻分离株的分型中能获得良好的分辨率。此研究提供的优化程序可用于其他细菌PFGE方法的建立或优化。 展开更多
关键词 气单胞菌 脉冲凝胶电泳 限制性内切 全基因组序列 食源性致病菌 分型
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肺炎链球菌脉冲场凝胶电泳分型分析方法的建立与优化 被引量:1
6
作者 张永茂 贾肇一 +2 位作者 王颖童 何宝花 孙印旗 《医学动物防制》 2022年第9期915-918,共4页
目的 在河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室建立肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,Spn)脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)分型方法,为河北省肺炎链球菌引起的相关疾病的流行病学监测与调查提供可... 目的 在河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室建立肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,Spn)脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis, PFGE)分型方法,为河北省肺炎链球菌引起的相关疾病的流行病学监测与调查提供可靠的技术支撑。方法 参照美国PulseNet手册标准方法和《国家致病菌识别网技术手册》,在河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室进行肺炎链球菌PFGE分型实验,同时对缓冲液种类、限制性核酸内切酶浓度、酶切时间和电泳条件进行优化。结果 利用优化后的条件对收集到的肺炎链球菌菌株进行PFGE分型分析,所得到的酶切电泳图谱条带清晰,分辨率高。结论 河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室建立和优化了肺炎链球菌PFGE分型分析方法,今后可用于肺炎链球菌的分子特征分析。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 脉冲凝胶电泳 电泳图谱 限制性核酸内切 缓冲液 溶菌 分析
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溶藻弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型方法的优化及应用
7
作者 俞佳莉 李欣 +3 位作者 钱懿青 陈洪友 乔雪飞 盛峰松 《中国卫生检验杂志》 CAS 2021年第19期2321-2326,共6页
目的 优化溶藻弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法,并应用到食品与腹泻患者的分离菌株,分析其多样性。方法 通过Bio Edit软件对5种溶藻弧菌标准菌株全基因组序列进行677种酶的限制性片段分析,选择片段数量适中、有效片段比例高的酶... 目的 优化溶藻弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法,并应用到食品与腹泻患者的分离菌株,分析其多样性。方法 通过Bio Edit软件对5种溶藻弧菌标准菌株全基因组序列进行677种酶的限制性片段分析,选择片段数量适中、有效片段比例高的酶作为备选酶,并模拟电泳效果图。再利用溶藻弧菌标准菌株及分离菌株对备选酶进行验证试验,确定PFGE分型方法。结果 根据片段数量、有效片段比例及PFGE模拟图,显示SfiⅠ、NotⅠ、SbfⅠ和Mre I片段分布相对均匀,标准菌株和分离株验证结果显示,SfiⅠ和NotⅠ分别为溶藻弧菌PFGE分型的首选酶和备选酶,且脉冲场电流转换时间分别为2. 16 s~63. 8 s和10 s~35 s。22株食品和腹泻患者分离株PFGE分子分型辛普森多样性指数为100. 00%,获得良好的分辨率。结论 SfiⅠ是作为溶藻弧菌PFGE分子分型的最优限制性内切酶。此研究提供的程序可用于其他细菌PFGE方法的建立。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 脉冲凝胶电泳 限制性内切 全基因组序列 分子分型
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三种基因检测分型方法在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用对比观察 被引量:3
8
作者 王凤平 朱梓年 +1 位作者 张霆 张拔山 《山东医药》 CAS 2018年第31期90-92,共3页
目的比较限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和肠杆菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用情况。方法 20株耐碳青霉烯类抗生素的肺炎克雷伯菌,分别采... 目的比较限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和肠杆菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用情况。方法 20株耐碳青霉烯类抗生素的肺炎克雷伯菌,分别采用PFGE、MLVA和ERIC-PCR法,对肺炎克雷伯菌基因进行扩增并分型,并用Bio Numerics软件测算各方法 Simpson差异指数(D值,D值越趋于1表示该方法分辨力越好)。结果20株菌株共分为18个PFGE型,其中2个带型包含2株菌,其余16个带型分别只包含1株菌,分别有两组两株菌具有相同的PFGE型别;17个MLVA型,其中3个型别分别包含2株菌,其余16个型别只包含1株菌,以差异位点≤2个位点作为构建MLVA群的标准,20株菌中构建出4个MLVA克隆群;14个ERIC型,其中中优势型、次优势型分别为5、3株,其余12个型别分别只包含1株菌。PFGE、MLVA和ERIC-PCR法对耐碳青霉烯抗生素的肺炎克雷伯菌的D值分别为0.989 5、0.984 2、0.931 6。结论 PFGE、MLVA和ERIC-PCR对耐碳青霉烯抗生素的肺炎克雷伯菌的分型效果均较好。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 耐碳青霉烯抗生素的肺炎克雷伯菌 限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳 多位点可变数目串联重复序列分析 肠杆菌基因间重复序列
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云南省鼠疫菌FseI酶切分型及其流行病学意义 被引量:2
9
作者 石丽媛 叶蕊 +6 位作者 董珊珊 郭英 杨光璨 张蓉 崔志刚 李伟 王鹏 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期182-185,共4页
目的构建云南省鼠疫菌FseI酶切的脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱库并探讨其流行病学意义。方法采用限制性内切酶FseI对云南家、野鼠型及丽江玉龙鼠疫菌株进行酶切分析,并聚类分析电泳图谱。结果30株被试菌株分为16种PFGE型别,其相似性系... 目的构建云南省鼠疫菌FseI酶切的脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱库并探讨其流行病学意义。方法采用限制性内切酶FseI对云南家、野鼠型及丽江玉龙鼠疫菌株进行酶切分析,并聚类分析电泳图谱。结果30株被试菌株分为16种PFGE型别,其相似性系数为79.8%~100.O%;16种PFGE基因型可以分为4个簇,除EV76自成一簇,其余3个簇分别为家鼠型基因簇、野鼠型基因簇及玉龙基因簇。结论云南省鼠疫菌PFGE基因型与生态型、生物型相吻合,具有一定的区域聚集性,而丽江玉龙鼠疫菌为一个独立基因簇。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 脉冲凝胶电泳 FseI方法
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多杀性巴氏杆菌鉴定与特性研究的分子生物学方法 被引量:9
10
作者 曾静雯 刘慧芳 +6 位作者 沈琴芳 郑新添 余旭平 吴彤 李永明 周碧君 王开功 《中国兽药杂志》 2006年第4期41-44,31,共5页
多杀性巴氏杆菌是一种常见病原菌,其血清型众多(16种血清型),在毒力及流行病学等方面的生物学特性差异很大。分子生物学鉴定和特性分析方法能直接揭示其基因型上的差异,具有高灵敏度和可靠性。本文综述了多杀性巴氏杆菌的PCR、菌落杂交... 多杀性巴氏杆菌是一种常见病原菌,其血清型众多(16种血清型),在毒力及流行病学等方面的生物学特性差异很大。分子生物学鉴定和特性分析方法能直接揭示其基因型上的差异,具有高灵敏度和可靠性。本文综述了多杀性巴氏杆菌的PCR、菌落杂交和16S rRNA基因测序等鉴定方法以及限制性酶切分析、核糖体分型、脉冲场凝胶电泳、PCR指纹等特性分析方法。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 PCR 限制性分析 核糖体分型 脉冲凝胶电泳
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红曲霉HMW-DNA的制备 被引量:1
11
作者 周礼红 王正祥 诸葛健 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期35-38,共4页
用低熔点琼脂糖包埋浓度为1×109~1×1010个/mL红曲霉原生质体液制备得到DNA胶块。经裂解和PMFS纯化后脉冲场电泳检测,胶块中的DNA片段长度在800kb以上,每个胶块DNA含量为8~13μg。DNA胶块经脉冲场电泳去除小于600kb的非目的... 用低熔点琼脂糖包埋浓度为1×109~1×1010个/mL红曲霉原生质体液制备得到DNA胶块。经裂解和PMFS纯化后脉冲场电泳检测,胶块中的DNA片段长度在800kb以上,每个胶块DNA含量为8~13μg。DNA胶块经脉冲场电泳去除小于600kb的非目的小片段后用限制性内切酶EcoRI、BamHI、HindIII作用,结果大部分能被酶解。可以用于BAC文库等大片段基因组文库的构建,为红曲霉功能基因组的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 高分子量DNA BAC文库 DNA胶块 脉冲电泳 红曲霉 制备 DNA含量 限制性内切 电泳检测 片段长度
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产ESBLs的肺炎克雷伯菌的流行病学检测分析 被引量:1
12
作者 徐瑞龙 许健波 +2 位作者 卜黎红 单小云 泮芸 《浙江检验医学》 2005年第2期21-24,34,共5页
目的分析院内产ESBLs的肺炎克雷伯菌的感染流行株及可能的流行环节,以制定出更合理的院内感染预防措施。方法收集本院病人及环境中产ESBLs的肺炎克雷伯菌共57株,用纸片法测其对18种抗生素的耐药性,用脉冲场凝胶电泳 (PFGE)进行限制性内... 目的分析院内产ESBLs的肺炎克雷伯菌的感染流行株及可能的流行环节,以制定出更合理的院内感染预防措施。方法收集本院病人及环境中产ESBLs的肺炎克雷伯菌共57株,用纸片法测其对18种抗生素的耐药性,用脉冲场凝胶电泳 (PFGE)进行限制性内切酶多态性分析,酶切图谱差异3条带以上者为不同的类型,3条以下者为同一型中不同亚型。结果 57株产ESBLs肺炎克雷伯菌的耐药性:亚胺培南耐药率为0%,含酶抑制剂的头孢哌酮/舒巴坦、哌啦西林/舒巴坦的耐药率分别为35.1%、45.6%,头孢替坦(CTT)耐药率为43.8%、头孢吡肟(FEP)耐药率38.6%,其他抗生素耐药率均】60%。57株产 ESBLs肺炎克雷伯菌分为28个克隆株,其中33株PFGE图谱分为A、B、C、D四型:A型是主要流行株(22株),主要集中在神经科监护室(NCU)、重症监护室(ICU),其中1株来自NCU病房空气细菌培养;B型2株均来自NCU;C型7株均来自NCU,其中一株来自NCU病人床架;D型2株来自NCU和肾内科。其余24株为少见克隆株。结论本院产ESBLs的肺炎克雷伯菌流行主要为A、B、C、D型,NCU和ICU是院内感染高发区域和疫源地;临床应慎用第三代头孢类药,以减少药物对菌株的"筛选作用";各病区应进一步加强消毒隔离措施,严格遵守无菌操作规程和屏障护理,对控制院内感染的流行播散是非常重要的。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 ESBLS 限制性内切谱多态性 脉冲凝胶电泳 流行病学
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多杀性巴氏杆菌鉴定与特性分析的分子生物学方法 被引量:1
13
作者 曾静雯 吴彤 余旭平 《畜牧兽医科技信息》 2005年第9期45-48,共4页
关键词 多杀性巴氏杆菌 PCR指纹 限制性分析 核糖体分型 脉冲凝胶电泳 分子生物学方法 特性分析 鉴定 出血性败血症 分离培养
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大肠埃希菌临床分离株的基因组结构分型研究
14
作者 衣美英 高东田 +3 位作者 刘桂荣 朱永红 朱万孚 刘树林 《济宁医学院学报》 2004年第3期1-4,共4页
目的 通过基因组结构分析对临床分离的大肠埃希菌进行分型 ,并探讨型别与临床疾病的关系。方法 取临床不同疾病病人的痰、尿、血、分泌物等标本 ,分离大肠埃希菌。用I -CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后 ,根据... 目的 通过基因组结构分析对临床分离的大肠埃希菌进行分型 ,并探讨型别与临床疾病的关系。方法 取临床不同疾病病人的痰、尿、血、分泌物等标本 ,分离大肠埃希菌。用I -CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后 ,根据酶切图谱的异同进行分型。结果 从临床上分离的 6 4株大肠埃希菌中 ,6 2株有 7个I -CeuI酶切位点 ,2株有 8个I -CeuI酶切位点。菌株间I -CeuI酶切图谱差异明显。这些菌株根据基因组结构的差异分为 32个型 ,某些疾病与特定基因组型密切相关。结论 临床分离的大肠埃希菌基因组结构存在多样性 ,其与临床疾病之间存在一定的对应关系 ,但尚需大宗病例进一步研究。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 分型 基因组结构 临床分离株 临床疾病 病人 脉冲凝胶电泳 图谱 菌株 组型
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单核细胞增生李斯特菌PFGE分型与血清学分型的联合分析 被引量:6
15
作者 王冰 扈庆华 +6 位作者 兰全学 石晓路 林一曼 程锦泉 马汉武 叶长芸 阚飚 《中国卫生检验杂志》 CAS 2010年第3期459-461,共3页
目的:采用国际标准化的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析方法对单核细胞增生李斯特菌(Lm)进行基因分型,同时进行血清学分型,比较分析两种分型方法的优劣和之间的关系。方法:按照标准化的Lm-PFGE方法对17株Lm进行PFGE分型,分别用限制性内切酶Apa... 目的:采用国际标准化的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析方法对单核细胞增生李斯特菌(Lm)进行基因分型,同时进行血清学分型,比较分析两种分型方法的优劣和之间的关系。方法:按照标准化的Lm-PFGE方法对17株Lm进行PFGE分型,分别用限制性内切酶ApaI和AscI酶对菌株进行酶切,通过脉冲场凝胶电泳获得电泳图谱,利用B ioNum erics软件对图谱进行聚类分析。同时对上述菌株进行血清学分型。结果:17株Lm被内切酶ApaI分为13种带型,被内切酶AscI分为14种PFGE型。17株Lm分为5种血清型。结论:Lm-PFGE分型方法是一种高分辨力、稳定可靠的技术。PFGE的分辨力高于血清学分型,两种分型方法密切相关。聚类分析结果显示ApaI酶切分型与H抗原密切相关。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 脉冲凝胶电泳 分子分析 血清学分型 分型方法 血清型 相关 电泳图谱 菌株
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儿童肺炎链球菌耐药性与pbp2b基因RFLP和PFGE图型分析 被引量:3
16
作者 俞桑洁 胡翼云 +2 位作者 高薇 王槿芳 杨永弘 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第9期688-691,共4页
目的 监测肺炎链球菌对青霉素和其他抗生素的耐药情况 ;分析pbp2b基因扩增产物图谱与青霉素耐药性的相关性 ;对 3 1株青霉素耐药菌株进行血清分型 ;分析血清型 2 3F和血清型 6的青霉素耐药菌株的脉冲电场凝胶电泳 (PFGE)图型 ,初步了... 目的 监测肺炎链球菌对青霉素和其他抗生素的耐药情况 ;分析pbp2b基因扩增产物图谱与青霉素耐药性的相关性 ;对 3 1株青霉素耐药菌株进行血清分型 ;分析血清型 2 3F和血清型 6的青霉素耐药菌株的脉冲电场凝胶电泳 (PFGE)图型 ,初步了解北京地区耐药菌株分子流行病学上的特点。方法  ( 1)抗生素药物敏感试验 ;( 2 )用聚合酶链反应 (PCR)和限制性内切酶片段长度多态性分析 (RFLP)方法 ,分析pbp2b基因扩增产物图谱与青霉素耐药性的相关性 ;( 3 )使用乳胶凝集的方法 ,对 3 1株青霉素耐药菌株进行血清分型 ;( 4 )使用PFGE图型方法分析 6株血清型 2 3F和 3株血清型 6的青霉素耐药菌株流行病学上的基本特性。结果  ( 1)对青霉素的耐药性由 1997年 9 9%上升到 2 0 0 0年 14 6% (P >0 0 5)。对红霉素、复方磺胺甲基异唑和氯霉素耐药性分别由 1997年76 8%、74 7%和 2 2 6%上升到 2 0 0 0年的 87 4%、88 3 %和 40 8% (P <0 0 5) ;( 2 )通过PCR和RFLP方法分析青霉素耐药菌株和青霉素敏感菌株表明 ,pbp2b基因扩增图谱与青霉素耐药性之间有较好的相关性 ;( 3 )对 3 1株青霉素不敏感肺炎链球菌 (PRSP)做了血清型 2 3F和 6分型。前者为 6株 ( 19% ) ;后者为 3株 ( 9% )。 6株血清型 2 展开更多
关键词 儿童 肺炎链球菌 耐药性 pbp26基因 RFLP PFGE 脉冲凝胶电泳 限制性内切片段长度多态性分析 抗生素 聚合链反应 青霉素
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应用IRS-PCR对金黄色葡萄球菌分型的研究 被引量:4
17
作者 代文霞 沈叙庄 +6 位作者 周红 高薇 张桂荣 俞桑洁 刘艳杰 齐鸿燕 杨永弘 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期514-518,共5页
目的探讨低频限制性位点聚合酶链反应(infrequentrestrictionsitePCR,IRSPCR)在金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)基因分型中的应用价值。方法建立本实验室IRSPCR方法。同时用IRSPCR和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对金葡菌进行基因分型。根据49株社... 目的探讨低频限制性位点聚合酶链反应(infrequentrestrictionsitePCR,IRSPCR)在金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)基因分型中的应用价值。方法建立本实验室IRSPCR方法。同时用IRSPCR和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对金葡菌进行基因分型。根据49株社区感染分离菌的分型结果计算辨别力指数(ID)值估计分辨力。对其中30株社区感染菌重复实验一次估计重复性。比较两种基因分型方法的分型率、分辨力、重复性、结果的一致率及操作特点。结果建立IRSPCR对金葡菌基因分型的方法。70株金葡菌均可被2种方法分型,分型率100%。IRSPCR分为38个型,21株院内感染菌分为6个型,49株社区感染菌分为32个型,计算ID值为0.981。PFGE分为40个型,21株院内感染菌分为6个型,49株社区感染菌分为34个型,计算ID值为0.983。两种分型方法的重复性均为100%。对院内感染菌,两种方法分型的一致率为100%;对社区感染菌,两种方法分型的一致率为92%(45/49)。与PFGE相比,IRSPCR更简单、省时、易于操作、不需特殊昂贵仪器。结论IRSPCR能对金葡菌简易快速可靠分型,适合检验科对临床标本的快速有效分型,是一种有价值的分子流行病学研究工具。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 脉冲凝胶电泳 聚合链反应 基因分型方法 分子流行病学 PFGE 感染菌 金葡菌 PCR方法 感染分离菌 重复性 一致率 应用价值 方法建立 分型结果 重复实验 临床标本 研究工具 分辨力 社区 限制性 实验室
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美国新港沙门菌感染的暴发与黄瓜的关联性 被引量:1
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作者 Kristina M.Angelo Alvina Chu +16 位作者 Madhu Anand Thai-An Nguyen Lyndsay Bottichio Matthew Wise Ian Williams Sharon Seelman Rebecca Bell Marianne Fatica Susan Lance Deanna Baldwin Kyle Shannon Hannah Lee Eija Trees Errol Strain Laura Gieraltowski 罗宝章(译) 厉曙光(审校) 《上海预防医学》 CAS 2016年第5期348-350,共3页
2014年8月,美国国家食源性疾病监测分子分型网络(PulseN et)检测到一个跨州的新港沙门菌血清型感染的群组,其具有无法区分的脉冲场凝胶电泳(Pulse-Field Gel Electrophoresis,PFGE)带型(限制性内切酶XbaI,带型为JJPX01.0061。信息... 2014年8月,美国国家食源性疾病监测分子分型网络(PulseN et)检测到一个跨州的新港沙门菌血清型感染的群组,其具有无法区分的脉冲场凝胶电泳(Pulse-Field Gel Electrophoresis,PFGE)带型(限制性内切酶XbaI,带型为JJPX01.0061。信息来源http://www.cdc.gov/pulsenet)。 展开更多
关键词 沙门菌感染 新港沙门菌 美国 脉冲凝胶电泳 黄瓜 暴发 限制性内切 分子分型
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