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构建非冗余EID的若干技巧
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作者 金鹰 邓小元 刘海 《华南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2009年第4期94-96,110,共4页
基于GenBank构建的外显子内含子数据库(EID)含有大量的冗余数据.为了解决冗余问题,构建了基于RefSeq的非冗余EID(non-redundantEID).RefSeq是由NCBI工作人员负责维护和更新的参考序列库,为基因组注释、基因识别、基因突变、多态性分析... 基于GenBank构建的外显子内含子数据库(EID)含有大量的冗余数据.为了解决冗余问题,构建了基于RefSeq的非冗余EID(non-redundantEID).RefSeq是由NCBI工作人员负责维护和更新的参考序列库,为基因组注释、基因识别、基因突变、多态性分析、表达研究和比对分析提供了重要的参考.该EID可用于大规模分析Exon/Intron结构和内含子剪切(Splicing)的研究,并拥有一些内部机制来控制数据质量和可能出现的错误.同时,它的新的改进是增加了基因序列中非翻译区(UTR)的数据内容.该文对构建基于RefSeq的非冗余EID的一些技巧作出说明. 展开更多
关键词 非冗余eid RefSeq 剪切 非翻译区
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