【目的】为了预测无关捐献者干细胞移植(HSCT)后GVHD的发生及程度和选择相容的干细胞捐献者,通过同时采用PCR-序列特异性引物扩增技术(sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR-直接碱基序列分析基因分型技术(sequence based genotyping...【目的】为了预测无关捐献者干细胞移植(HSCT)后GVHD的发生及程度和选择相容的干细胞捐献者,通过同时采用PCR-序列特异性引物扩增技术(sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR-直接碱基序列分析基因分型技术(sequence based genotyping,PCR-SBT)的方法,提高HLA基因分型的准确性和分辨水平。【方法】采用PCR-SSP和PCR-SBT分别对57份捐献者血样进行HLA-A、B和DRB1位点的高分辨等位基因分型(即识别基因的编码达到*后4位数)。【结果】PCR-SBT实验中有27份DNA的基因分析结果模棱两可,PCR-SSP实验中有10份DNA的基因分析结果模棱两可。经两种方法相互佐证实验后,57份样本均获得结果一致、清楚和精确的HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型。【结论】PCR-SSP和PCR- SBT是HLA高分辨基因分析的标准方法,两种方法具有实验互补意义,若同时应用两种方法能够有效改善HLA等位基因高分辨分型的准确性和重复一致率。展开更多
目的从基因高分辨水平，分析中国汉族人群供-受者人类白细胞抗原（human leukocyte antigens，HLA）-A、B、Cw、DRB1、DQB1各位点等位基因频率和分布的多态性；及供-受者等位基因匹配情况。方法采用基因测序分型（sequence based typing...目的从基因高分辨水平，分析中国汉族人群供-受者人类白细胞抗原（human leukocyte antigens，HLA）-A、B、Cw、DRB1、DQB1各位点等位基因频率和分布的多态性；及供-受者等位基因匹配情况。方法采用基因测序分型（sequence based typing，SBT）、序列特异性寡核苷酸探针法（sequence specific oligonucleotide probe，SSOP）和序列特异性引物法（sequence specific primer，SSP），对2540名中国汉族人的（其中1168名受者，1372名供者）DNA标本进行HLA高分辨基因分型，并作统计学处理。结果2540份样本中共检测到44种HLA-A等位基因，频率高于0．05的A＊1101、A＊2402、A＊0201、A＊0207、A＊3303、A＊0206、A＊3001共占80．4％；81种HLA-B等位基因，频率高于0．05的B＊4001、B＊4601、B＊5801、B＊1302、B＊5101共占43．0％；44种HLA-Cw等位基因，频率高于0．05的Cw＊0702、Cw＊0102、Cw＊0304、Cw＊0801、Cw＊0602、Cw＊0303、CW＊0302、Cw＊0401共占80．3％；61种HLA—DRBl等位基因，频率高于0．05的DRB1＊0901、DRB1＊1501、DRB1＊1202、DRB1＊0803、DRB1＊0701、DRB1＊0405、DRB1＊0301、DRB1＊1101共占70．1％；22种HLA-DQB1等位基因，频率高于0．05的DQB1＊0301、DQB1＊0303、DQB1＊0601、DQB1＊0602、DQB1＊0202、DQB1＊0302、DQB1＊0401、DQB1＊0502、DQB1＊0201共占87．4％。这5个位点均处于杂合子缺失状态，其中A、B、DRB1位点符合Hardy-Weinberg平衡（Hardy—Weinberg equilibrium，HWE）（P〉0．05）；Cw、DQB1位点偏离HWE（P〈0．05）；排除个别基因型观察值与期望值偏差较大外，这5个位点均符合HWE。在供一受者数据的比较中，HLA全相合（10／10）的比例仅22．4％；单个等位基因错配（9／10）的比例为24．6％；两个等位基因错配（8／10）的比例为26．3％。结论中国汉族人群高分辨水平HLA-A、B、Cw、DRB1、DQB1等位基因频率及分布特点，对非亲缘造血干细胞移植供者检索有重要参考价值；并为中华骨髓库数据入库和利用提供遗传学依据。展开更多
文摘【目的】为了预测无关捐献者干细胞移植(HSCT)后GVHD的发生及程度和选择相容的干细胞捐献者,通过同时采用PCR-序列特异性引物扩增技术(sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR-直接碱基序列分析基因分型技术(sequence based genotyping,PCR-SBT)的方法,提高HLA基因分型的准确性和分辨水平。【方法】采用PCR-SSP和PCR-SBT分别对57份捐献者血样进行HLA-A、B和DRB1位点的高分辨等位基因分型(即识别基因的编码达到*后4位数)。【结果】PCR-SBT实验中有27份DNA的基因分析结果模棱两可,PCR-SSP实验中有10份DNA的基因分析结果模棱两可。经两种方法相互佐证实验后,57份样本均获得结果一致、清楚和精确的HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型。【结论】PCR-SSP和PCR- SBT是HLA高分辨基因分析的标准方法,两种方法具有实验互补意义,若同时应用两种方法能够有效改善HLA等位基因高分辨分型的准确性和重复一致率。
文摘目的从基因高分辨水平，分析中国汉族人群供-受者人类白细胞抗原（human leukocyte antigens，HLA）-A、B、Cw、DRB1、DQB1各位点等位基因频率和分布的多态性；及供-受者等位基因匹配情况。方法采用基因测序分型（sequence based typing，SBT）、序列特异性寡核苷酸探针法（sequence specific oligonucleotide probe，SSOP）和序列特异性引物法（sequence specific primer，SSP），对2540名中国汉族人的（其中1168名受者，1372名供者）DNA标本进行HLA高分辨基因分型，并作统计学处理。结果2540份样本中共检测到44种HLA-A等位基因，频率高于0．05的A＊1101、A＊2402、A＊0201、A＊0207、A＊3303、A＊0206、A＊3001共占80．4％；81种HLA-B等位基因，频率高于0．05的B＊4001、B＊4601、B＊5801、B＊1302、B＊5101共占43．0％；44种HLA-Cw等位基因，频率高于0．05的Cw＊0702、Cw＊0102、Cw＊0304、Cw＊0801、Cw＊0602、Cw＊0303、CW＊0302、Cw＊0401共占80．3％；61种HLA—DRBl等位基因，频率高于0．05的DRB1＊0901、DRB1＊1501、DRB1＊1202、DRB1＊0803、DRB1＊0701、DRB1＊0405、DRB1＊0301、DRB1＊1101共占70．1％；22种HLA-DQB1等位基因，频率高于0．05的DQB1＊0301、DQB1＊0303、DQB1＊0601、DQB1＊0602、DQB1＊0202、DQB1＊0302、DQB1＊0401、DQB1＊0502、DQB1＊0201共占87．4％。这5个位点均处于杂合子缺失状态，其中A、B、DRB1位点符合Hardy-Weinberg平衡（Hardy—Weinberg equilibrium，HWE）（P〉0．05）；Cw、DQB1位点偏离HWE（P〈0．05）；排除个别基因型观察值与期望值偏差较大外，这5个位点均符合HWE。在供一受者数据的比较中，HLA全相合（10／10）的比例仅22．4％；单个等位基因错配（9／10）的比例为24．6％；两个等位基因错配（8／10）的比例为26．3％。结论中国汉族人群高分辨水平HLA-A、B、Cw、DRB1、DQB1等位基因频率及分布特点，对非亲缘造血干细胞移植供者检索有重要参考价值；并为中华骨髓库数据入库和利用提供遗传学依据。
