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建立高分辨熔解曲线分析法检测SF3B1基因突变 被引量:2
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作者 杨静 姚冬明 +7 位作者 钱军 王翠竹 杨小飞 林江 李云 陈星星 肖高飞 马吉春 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2013年第1期49-52,共4页
目的:建立高分辨熔解曲线分析法(high-resolution melting analysis,HRMA),检测骨髓增生异常综合征(my-elodysplastic syndrome,MDS)患者中SF3B1基因的突变。方法:针对SF3B1基因热点突变位点(密码子E622、H662、K666和K700)设计PCR扩增... 目的:建立高分辨熔解曲线分析法(high-resolution melting analysis,HRMA),检测骨髓增生异常综合征(my-elodysplastic syndrome,MDS)患者中SF3B1基因的突变。方法:针对SF3B1基因热点突变位点(密码子E622、H662、K666和K700)设计PCR扩增引物,建立带有温度内标校准品的PCR扩增反应体系,对30例初诊MDS患者的骨髓标本进行PCR扩增,应用HRMA对相应PCR产物进行突变检测,并对HRMA检测结果进行DNA测序验证。结果:HR-MA检测发现2例MDS患者存在异常的熔解曲线,经DNA测序验证1例为K666M杂合子突变,另1例为K700E杂合子突变。所建立的HRMA技术检测SF3B1基因突变的灵敏度为0.05(5%)。结论:成功建立检测SF3B1基因突变的HRMA技术,可快速筛查MDS标本中的SF3B1基因突变。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 SF3B1 基因突变 骨髓增生异常综合征
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高分辨熔解曲线分析法检测急性髓细胞白血病IDH2基因突变
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作者 薛娣 邵睿 +8 位作者 林江 肖高飞 钱军 姚冬明 柴海彦 李云 杨静 王翠竹 陈星星 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期664-667,共4页
目的建立高分辨熔解曲线分析(HRMA)技术检测急性髓细胞白血病(AML)中可溶性异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)基因突变。方法针对IDH2突变位点设计PCR扩增引物,建立带有温度内标校准品的PCR扩增体系,对98例AML患者标本进行PCR扩增,用HRMA技术对PCR... 目的建立高分辨熔解曲线分析(HRMA)技术检测急性髓细胞白血病(AML)中可溶性异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)基因突变。方法针对IDH2突变位点设计PCR扩增引物,建立带有温度内标校准品的PCR扩增体系,对98例AML患者标本进行PCR扩增,用HRMA技术对PCR产物进行突变分析,并通过DNA测序技术对HRMA结果进行验证。结果对98例AML样本的PCR产物进行HRMA检测,发现5例存在异常熔解曲线,对此5例标本及随机选择的HRMA显示为野生型的35例IDH2标本进行DNA测序验证,结果表明,存在异常熔解曲线的5例标本为4例R140Q突变和1例R172K突变,其余35例经DNA测序证实为野生型IDH2;对不同浓度梯度的R140Q质粒HRMA检测结果表明其灵敏度为2%。结论成功建立HRMA技术检测IDH2突变,其可用于AML标本的临床检测。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 可溶性异柠檬酸脱氢酶2 基因突变 急性髓细胞白血病
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应用高分辨熔解曲线分析法检测遗传性球形红细胞增多症患者SLC4A1基因突变 被引量:1
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作者 马诗玥 廖林 +1 位作者 何本进 林发全 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1826-1830,共5页
目的:探讨高分辨熔解(HRM)曲线分析法检测遗传性球形红细胞增多症(HS)患者SLC4A1基因D38A和K56E突变位点的可行性及其意义。方法:抽取23例HS患者外周血样本进行常规检测,提取基因组DNA,针对SLC4A1基因突变位点D38A和K56E设计引物,应用HR... 目的:探讨高分辨熔解(HRM)曲线分析法检测遗传性球形红细胞增多症(HS)患者SLC4A1基因D38A和K56E突变位点的可行性及其意义。方法:抽取23例HS患者外周血样本进行常规检测,提取基因组DNA,针对SLC4A1基因突变位点D38A和K56E设计引物,应用HRM法对所有样本进行突变分析,并通过DNA测序技术对HRM结果进行验证。结果:23例HS患者中,HRM法共检测出杂合突变型基因6例,其中包括D38A突变3例,K56E突变3例。DNA测序结果与HRM法检测结果一致。结论:应用HRM法能准确检测SLC4A1基因D38A和K56E突变位点,具有高效、快速、可靠等优点,不仅可用于临床辅助诊断,还有望成为确定HS患者基因突变谱的新方法。 展开更多
关键词 遗传性球形红细胞增多症 分辨熔解曲线 带3蛋白 SLC4A1基因
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应用高分辨熔解曲线分析法检测FGFR3基因p.R248C突变
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作者 刘颖娜 李茹 李东至 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2010年第2期19-23,共5页
目的探讨高分辨熔解曲线分析法用于FGFR3基因p.R248C突变检测的可行性。方法选用经直接测序确诊基因型为p.R248C的致死性软骨发育不良Ⅰ型(type 1 thanatophoric dysplasia,TDⅠ)样本10例和30例正常对照样本,PCR扩增FGFR3基因第七外显... 目的探讨高分辨熔解曲线分析法用于FGFR3基因p.R248C突变检测的可行性。方法选用经直接测序确诊基因型为p.R248C的致死性软骨发育不良Ⅰ型(type 1 thanatophoric dysplasia,TDⅠ)样本10例和30例正常对照样本,PCR扩增FGFR3基因第七外显子中包含c.742C>T(p.R248C)位点的区域。应用LightScanner 96(Idaho Technology)对PCR扩增产物进行高分辨熔解曲线分析。结果应用高分辨熔解曲线分析法成功检测出10例FGFR3基因p.R248C杂合突变。结论高分辨熔解曲线分析法是1种具有简单、高效、廉价和高通量等优点的新的分子遗传学分析法,能对FGFR3基因的p.R248C突变进行快速基因诊断。 展开更多
关键词 FGFR3基因 致死性软骨发育不良Ⅰ型 分辨熔解曲线 基因筛查
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龟甲配方颗粒的高分辨熔解曲线技术鉴别研究
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作者 谭斯尹 宋叶 +3 位作者 刘闪闪 范耀耀 罗宇琴 李国卫 《广东药科大学学报》 CAS 2024年第3期70-75,共6页
目的建立一种龟甲配方颗粒高分辨熔解曲线(HRM)技术鉴别方法。方法根据乌龟Chinemys reevesii及其混伪品的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidase subunitⅠ,COI)基因序列上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)... 目的建立一种龟甲配方颗粒高分辨熔解曲线(HRM)技术鉴别方法。方法根据乌龟Chinemys reevesii及其混伪品的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidase subunitⅠ,COI)基因序列上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点设计鉴别引物,扩增产物直接进行HRM分析,并优化反应体系,根据最佳条件进行适用性验证。结果在模板DNA质量浓度为0.62~374.88 ng/μL、引物浓度为0.1~0.4μmol/L、退火温度为62℃、循环数为45个的条件下,龟甲饮片和配方颗粒的熔解曲线为单峰,其Tm均值分别为(82.39±0.09)、(82.38±0.05)℃,而混伪品和醋龟甲配方颗粒未有扩增。结论该研究建立的高分辨熔解曲线鉴别方法可快速鉴别龟甲原料和配方颗粒的真伪,以及区分其生品和炮制品配方颗粒,为龟甲配方颗粒的质量标准研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 龟甲 配方颗粒 分辨熔解曲线(HRM) 分子鉴定
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基于高分辨率熔解曲线分析技术探讨TNF-α基因多态性与银屑病的相关性
6
作者 王英俊 王蒙昕 +4 位作者 惠海珍 史丙俊 江雪 龚娟 戚东卫 《医学理论与实践》 2023年第2期305-307,共3页
目的:运用高分辨率熔解曲线(HRM)分析技术分析TNF-α基因rs3093662位点的多态性与银屑病的相关性。方法:应用荧光定量PCR-HRM分析技术对我院收治的426例银屑病患者(研究组)和485例健康人(对照组)的TNF-α基因位点rs3093662的基因型及等... 目的:运用高分辨率熔解曲线(HRM)分析技术分析TNF-α基因rs3093662位点的多态性与银屑病的相关性。方法:应用荧光定量PCR-HRM分析技术对我院收治的426例银屑病患者(研究组)和485例健康人(对照组)的TNF-α基因位点rs3093662的基因型及等位基因进行测定。结果:rs3093662的AG、AA、GG基因型频率在银屑病研究组和对照组分别是7.98%、92.02%、0.00%和4.54%、95.46%、0.00%,A、G等位基因频率在银屑病研究组和对照组分别是96.01%、3.99%和97.73%、2.27%,组间差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:TNF-αrs3093662的基因多态性可能与银屑病的发病相关,HRM分析技术检测基因多态性具有操作简单,敏感性高,成本低,适合在临床检测中推广应用。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析技术 银屑病 TNF-Α
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高分辨率熔解曲线分析法检测结直肠癌组织K-ras基因突变及其临床意义 被引量:4
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作者 王倩 顾页 林洁 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2015年第8期840-842,共3页
目的 K-ras基因在结直肠癌的发生、发展以及需要靶向药物治疗的药物选择方面具有重大临床意义。文中旨在探讨高分辨率熔解曲线分析法检测结直肠癌组织K-ras基因突变情况,并分析K-ras基因突变与临床病理参数的关系。方法收集179例结直肠... 目的 K-ras基因在结直肠癌的发生、发展以及需要靶向药物治疗的药物选择方面具有重大临床意义。文中旨在探讨高分辨率熔解曲线分析法检测结直肠癌组织K-ras基因突变情况,并分析K-ras基因突变与临床病理参数的关系。方法收集179例结直肠癌患者的手术标本,检测结直肠癌组织中K-ras基因第12、13位密码子的突变情况,并分析K-ras基因突变与临床病理参数的关系。结果 179例结直肠癌组织标本中,K-ras基因突变率为43.02%(77/179);在≥60岁组结直肠癌患者中K-ras基因突变率明显高于〈60岁组(55.17%vs 33.70%,P〈0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄对K-ras基因突变有显著影响(OR=1.506,95%CI:1.028~2.011)。结论结直肠癌患者K-ras基因的突变与年龄相关,与性别、分化程度、病变部位及Dukes分期无关。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 结直肠癌 K-RAS基因 突变
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高分辨率熔解曲线分析法检测牦牛脂蛋白脂酶外显子7的多态性及与生长性状相关性分析 被引量:2
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作者 扎西卓玛 郭宪 +10 位作者 阎萍 吴晓云 王宏博 刘建 杨安圈 张德虎 王照忠 王成林 完马单智 诺科加 杨应川 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第7期84-88,共5页
脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)是一个分子质量为54kb的糖蛋白,其活性受营养因素、激素水平等调节,因牦牛生存环境的特殊性,试验拟从分子水平研究天峻县牦牛脂蛋白脂酶外显子7(LPL-Exon7)基因的多态性,并与生长发育性状进行关联分... 脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)是一个分子质量为54kb的糖蛋白,其活性受营养因素、激素水平等调节,因牦牛生存环境的特殊性,试验拟从分子水平研究天峻县牦牛脂蛋白脂酶外显子7(LPL-Exon7)基因的多态性,并与生长发育性状进行关联分析,从而为牦牛营养调控、品种资源保护和遗传育种提供科学理论依据。试验采集青海省海西州天峻县牦牛抗凝血106份,提取血样DNA,并利用PCR技术和高分辨率熔解曲线分析法对候选基因LPL-Exon7进行多态性分析,并于采血的同时对牦牛体重、体斜长、体高、胸围和管围等生长性状指标进行了相关性和遗传效应分析。结果表明,高原牦牛LPL-Exon7基因在高原牦牛和野血牦牛中都表现为多态,存在3种基因型,即AA、AB和BB,由1对等位基因A和B控制,A等位基因均为优势等位基因。经χ2检验,符合哈迪—温伯格(Hardy-Weinberg)定律,处于平衡状态(P>0.05)。该位点在高原牦牛和野血牦牛群体中公、母牦牛的多态信息含量为0.3588和0.2103、0.3219和0.3343,高原牦牛母牛的多态信息含量PIC<0.25,处于低度多态,高原牦牛公牛和野血牦牛公、母牛的多态信息含量均在0.25<PIC<0.50,处于中度多态。LPL-Exon7位点多态对牦牛的体重、体高和管围存在显著影响(P<0.05),对牦牛的体斜长和胸围无显著影响(P>0.05)。因此,初步推断牦牛LPL-Exon7可以作为牦牛标记辅助选择的遗传标记之一。 展开更多
关键词 原牦牛 脂蛋白脂酶外显子7 PCR 分辨熔解曲线分析 多态性 相关性
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高分辨率熔解曲线分析技术检测BRAF基因V600E突变方法的建立及初步临床应用 被引量:2
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作者 汤俊明 刘奇 +1 位作者 王学才 乔国洪 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2017年第4期243-245,共3页
目的建立高分辨率熔解曲线分析技术(high resolution melting,HRM)检测BRAF基因V600E突变的方法,并探讨其在临床检测中的应用价值。方法用所建方法检测16例甲状腺乳头状癌患者超声引导下细针穿刺抽吸活检标本,并与测序法结果进行比较分... 目的建立高分辨率熔解曲线分析技术(high resolution melting,HRM)检测BRAF基因V600E突变的方法,并探讨其在临床检测中的应用价值。方法用所建方法检测16例甲状腺乳头状癌患者超声引导下细针穿刺抽吸活检标本,并与测序法结果进行比较分析。结果所建HRM检测方法 Ct值与Tm的CV值均较小,重复性好。HRM法BRAF基因V600E突变检测标本的结果与测序法相比较,突变检出率分别为43.75%和40.00%,敏感性为100.00%,特异性为90.00%。结论成功建立的HRM法检测BRAF基因V600E突变敏感性高,特异性强,重复性好,操作简便,节约时间,成本低,适合细针穿刺抽吸活检标本检测BRAF基因V600E突变。 展开更多
关键词 BRAF基因V600E 乳头状 甲状腺乳头状癌 分辨熔解曲线分析技术
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应用高分辨熔解曲线分析方法检测β-地中海贫血纯合突变
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作者 欧展辉 孙筱放 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2011年第3期15-18,共4页
目的探讨高分辨熔解曲线分析方法(HRM)检测β-地中海贫血纯合突变的有效性。方法应用HRM方法对中国最常见的4种β-地中海贫血(4个IVS-Ⅱ-654即HBB:c.316-197C>T,3个Codons41/42即HBB:c.126_129delCTTT,1个Codon17即HBB:c.52A>T和4... 目的探讨高分辨熔解曲线分析方法(HRM)检测β-地中海贫血纯合突变的有效性。方法应用HRM方法对中国最常见的4种β-地中海贫血(4个IVS-Ⅱ-654即HBB:c.316-197C>T,3个Codons41/42即HBB:c.126_129delCTTT,1个Codon17即HBB:c.52A>T和4个-28即HBB:c.-78A>G)纯合突变进行检测,通过直接检测和与野生型标本混合后再检测2种方法检测。结果 HRM方法可以检测出中国常见的4种β-地中海贫血纯合突变。结论 HRM方法可以对中国常见的4种β-地中海贫血纯合突变进行检测,在产前诊断上有很好的应用前景。 展开更多
关键词 Β-地中海贫血 Β-珠蛋白 纯合突变 分辨熔解曲线分析 熔解曲线
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高分辨熔解曲线分析CYP3A5基因多态性方法学的建立
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作者 钟巧玲 范雪娇 +1 位作者 何文茵 李磊 《检验医学与临床》 CAS 2020年第3期309-311,共3页
目的通过建立一种较为简单灵敏的高分辨熔解曲线(HRM)方法,对CYP3A5单核苷酸多态性(SNP)位点进行测定,从而确定CYP3A5基因型,用于指导临床他克莫司的用药剂量。方法根据CYP3A5SNP位点基因组序列设计引物,利用HRM方法检测已知基因型标本... 目的通过建立一种较为简单灵敏的高分辨熔解曲线(HRM)方法,对CYP3A5单核苷酸多态性(SNP)位点进行测定,从而确定CYP3A5基因型,用于指导临床他克莫司的用药剂量。方法根据CYP3A5SNP位点基因组序列设计引物,利用HRM方法检测已知基因型标本,选取最佳引物,并通过同测序结果比对的方式确定该方法检测CYP3A5基因型的正确度、重复性以及灵敏度。结果利用该方法可以直接判断CYP3A5基因型,其检测结果与一代测序结果完全一致,重复性好、灵敏度高。结论 HRM方法可以用于CYP3A5基因型检测,为他克莫司的个体化用药提供可靠的评估依据。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线 CYP3A5 基因多态性
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高分辨熔解曲线技术结合荧光实时PCR法同时检测鸡肉中4种食源性致病菌 被引量:8
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作者 张静 周倩 +5 位作者 唐梦君 张小燕 唐修君 陆俊贤 高玉时 顾荣 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2021年第6期296-303,共8页
建立高分辨熔解曲线技术同时快速检测鸡肉中沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌。本研究分别以上述4种菌的fimY、hly、nuc和orfC特异性基因为靶基因,建立能同时检测多种食源性致病菌的多重HRM-real time PCR检测体系,... 建立高分辨熔解曲线技术同时快速检测鸡肉中沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌。本研究分别以上述4种菌的fimY、hly、nuc和orfC特异性基因为靶基因,建立能同时检测多种食源性致病菌的多重HRM-real time PCR检测体系,并对反应的特异性、灵敏度、重复性以及在人工染菌样品进行了评价。所建立的HRM-real time PCR检测体系对沙门氏菌、单增李斯特菌、金黄色葡萄球菌和空肠弯曲菌均产生特异性熔解曲线,Tm值分别为82.2℃、78.2℃、75.5℃和73.5℃;多重HRM-real time PCR反应体系检测单一致病菌菌液的灵敏度均为102拷贝数/mL,检测多种致病菌菌液的灵敏度为102拷贝数/mL;该反应体系重复性的试验内CV值在0.03%~0.32%之间,试验间CV值在0.45%~2.12%;人工染菌样本对4种菌的检测限均能达到5 CFU/25 g。结果表明该多重HRM-real time PCR检测体系可对上述4种禽肉中常见致病菌进行有效的检测与区分,特异性强,灵敏度高,反应重复性好,有望在食源性致病菌检测分析中发挥作用。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线 食源性致病菌 荧光PCR 鸡肉
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高分辨率熔解曲线分析(HRM)及其在植物种质资源鉴定中的应用 被引量:11
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作者 朱岩芳 张炜 +3 位作者 胡晋 朱丽伟 关亚静 王建成 《种子》 CSCD 北大核心 2013年第10期57-60,共4页
饱和荧光染料、未标记探针与实时荧光PCR结合产生的高分辨率熔解曲线分析(HRM)是一种新的实时定量技术,在核苷酸差异检测速度、灵敏度和准确性上具有突出的优点,近几年来在突变检测、遗传作图和基因分型等研究中发展迅速。本文对高分辨... 饱和荧光染料、未标记探针与实时荧光PCR结合产生的高分辨率熔解曲线分析(HRM)是一种新的实时定量技术,在核苷酸差异检测速度、灵敏度和准确性上具有突出的优点,近几年来在突变检测、遗传作图和基因分型等研究中发展迅速。本文对高分辨率熔解曲线分析的原理、特点及其在植物种质资源鉴定中的应用进行了综述。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 种质鉴定 SSR SNP
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高分辨率熔解曲线分析—分子诊断的新技术 被引量:11
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作者 谭昌渊 罗九甫 任兆瑞 《生命科学研究》 CAS CSCD 2009年第3期268-271,共4页
高分辨率熔解曲线分析(High Resolution Melting,HRM)是近几年来在国际上刚兴起的单核苷酸多态性及突变研究工具.这种检测方法因其高通量、低成本、结果准确、不受检测位点的局限,并且实现了真正的闭管操作而受到普遍的关注.对HRM技术... 高分辨率熔解曲线分析(High Resolution Melting,HRM)是近几年来在国际上刚兴起的单核苷酸多态性及突变研究工具.这种检测方法因其高通量、低成本、结果准确、不受检测位点的局限,并且实现了真正的闭管操作而受到普遍的关注.对HRM技术的原理和在分子诊断上的应用进行了阐述,并对最新研究进展作一综述. 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 突变 分子诊断
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高分辨率熔解曲线分析在大肠癌筛查中的应用 被引量:5
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作者 李琛 王新颖 +1 位作者 李丙生 许岸高 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期10-13,共4页
目的探讨高分辨率熔解曲线分析(high-resolution melting,HRM)在利用粪便DNA筛查大肠癌中的作用。方法收集住院治疗的31例大肠癌患者、28例大肠腺瘤患者以及20例来医院体检的正常人新鲜粪便标本,应用HRM法检测粪便中APC、K-ras、p53基... 目的探讨高分辨率熔解曲线分析(high-resolution melting,HRM)在利用粪便DNA筛查大肠癌中的作用。方法收集住院治疗的31例大肠癌患者、28例大肠腺瘤患者以及20例来医院体检的正常人新鲜粪便标本,应用HRM法检测粪便中APC、K-ras、p53基因的突变情况。结果 31例大肠癌患者粪便中APC基因突变检出率为41.9%(13/31),K-ras基因突变检出率为35.5%(11/31),p53基因突变检出率为54.8%(17/31),3个基因联合检出率为67.7%(21/31);28例大肠腺瘤患者粪便中APC基因突变检出率为25%(7/28),K-ras基因突变检出率为14.3%(4/28),p53基因突变检出率为46.4%(13/28),3个基因联合检出率为64.3%(18/28);20例正常对照粪便中APC基因突变检出率为5%(1/20),K-ras基因突变率为0(0/20),p53基因突变率为0(0/20)。大肠癌组和大肠腺瘤组基因突变检出率均高于正常对照组(P<0.05),而大肠癌和大肠腺瘤组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论利用HRM法检测粪便中APC、K-ras和p53基因突变在大肠癌筛查中具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线分析 大肠癌 粪便DNA APC K-RAS P53
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高分辨率熔解曲线法在BIM基因2,903bp片段插入/缺失检测中的应用 被引量:2
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作者 夏金晶 白浩 +4 位作者 熊丽纹 李蓉 颜波 邵敏华 韩宝惠 《中国肺癌杂志》 CAS 北大核心 2014年第3期238-242,共5页
背景与目的 BIM基因编码的蛋白属于BCL2蛋白家族的成员,作为凋亡调控因子参与多种细胞活动。BIM基因上2,903bp的插入缺失片段与非小细胞肺癌EGFR-TKI靶向用药的获得性耐药相关。建立并优化HRM方法有助于快速、准确地检测BIM基因2,903 b... 背景与目的 BIM基因编码的蛋白属于BCL2蛋白家族的成员,作为凋亡调控因子参与多种细胞活动。BIM基因上2,903bp的插入缺失片段与非小细胞肺癌EGFR-TKI靶向用药的获得性耐药相关。建立并优化HRM方法有助于快速、准确地检测BIM基因2,903 bp片段的缺失,为临床工作提供指导性的意见。本研究建立与稳定了HRM的检测方法,并在30例肺癌样本以及30例正常对照样本中检测BIM基因缺失情况。方法设计、合成针对BIM基因片段缺失的引物,优化高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析方法。并选取部分样本通过普通PCR方法和直接测序法检测BIM基因缺失情况。野生型模板扩增产物其解链温度要高于缺失型产物的解链温度。野生型和缺失型产物的熔解曲线可见明显差异,相应的Tm值相差约2.5 oC。结果经过HRM基因突变分析方法,在30例肺癌样本中检测到1例为BIM基因纯合缺失型,7例为杂合缺失型,22例为野生型。在30例正常对照样本中检测,2例为杂合缺失型,28例为野生型。结论本研究建立的对BIM基因片段缺失的高分辨率熔解曲线法是一种,灵敏、准确、快速、高通量的方法。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线 BIM基因 肺肿瘤
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多重PCR高分辨熔解分析同时检测骨髓增殖性肿瘤JAK2,MPL及CALR基因突变的初步研究
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作者 杨晓慧 许蕾 +1 位作者 晏耀明 李建新 《现代检验医学杂志》 CAS 2023年第4期63-66,71,共5页
目的建立同时检测经典骨髓增殖性肿瘤患者中常见的Janus激酶2(Janus kinase2,JAK2)、钙网素(calreticulin,CALR)和骨髓增殖性白血病病毒(myeloproliferative leukemia virus,MPL)基因突变的多重聚合酶链式反应(polymerase chain reactio... 目的建立同时检测经典骨髓增殖性肿瘤患者中常见的Janus激酶2(Janus kinase2,JAK2)、钙网素(calreticulin,CALR)和骨髓增殖性白血病病毒(myeloproliferative leukemia virus,MPL)基因突变的多重聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)-高分辨熔解分析(high resolution melting analysis,HRM)体系。方法先以各个合成的突变等位基因片段为模板分别进行PCR和HRM分析,优化PCR体系后,在单管中进行多重PCR扩增和HRM分析,同时检测上述三个基因的8种常见突变。结果在适宜的条件下,上述三个基因的野生型和突变型均能扩增出各自的目的条带和收集到可区分的熔解峰,野生型与突变型的熔解温度差为0.3℃~2.0℃。多重PCR-HRM体系中,除JAK2外显子12相关片段,其他基因均可有效扩增,但JAK2 V617F突变型的扩增效率明显低于MPL及CALR基因。结论目前该多重PCR-HRM检测体系可鉴别MPL和CALR基因常见突变,但JAK2 V617F突变型由于扩增效率低导致突变峰与野生峰不能明显区分,JAK2V617F和外显子12的引物需重新设计。 展开更多
关键词 骨髓增殖性肿瘤 JANUS激酶2 骨髓增殖性白血病 钙网素 多重聚合酶链式反应 分辨熔解分析
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高分辨率熔解曲线法检测JAK2基因V617F突变及其应用 被引量:1
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作者 郑卫东 方伟 +3 位作者 刘艳辉 罗盈 杜欣 陈志红 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期602-604,共3页
目的探讨实时定量PCR方法和高分辨率熔解曲线法(HRM)在检测JAK2基因V617F突变中的应用。方法以JAK2基因V617F发生纯合突变的人红白血病细胞株(HEL)及不含JAK2基因V617F突变的人白血病细胞株(HL60)为阳性对照和阴性对照,优化HRM法检测条... 目的探讨实时定量PCR方法和高分辨率熔解曲线法(HRM)在检测JAK2基因V617F突变中的应用。方法以JAK2基因V617F发生纯合突变的人红白血病细胞株(HEL)及不含JAK2基因V617F突变的人白血病细胞株(HL60)为阳性对照和阴性对照,优化HRM法检测条件,分别以优化的HRM法和直接测序法对63例临床疑似骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者DNA标本进行JAK2基因V617F突变检测,评价2种检测方法结果的一致性。结果 HRM法可检出系列混合样本中5%的突变型等位基因突变,且重复性较高。以测序法为金标准,HRM法的敏感性和特异性均为100%,两种方法结果一致。结论 HRM法能够在单一闭管体系中实现对JAK2基因V617F突变的检测,具有较高的敏感性和特异性,可用于JAK2基因V617F突变的临床检测。 展开更多
关键词 分辨熔解曲线 JAK2基因 V617F突变 骨髓增殖性肿瘤
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甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析筛查大肠癌的性能评价 被引量:2
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作者 肖著军 萧著玲 +2 位作者 陈金敏 邓飞鸿 许岸高 《重庆医学》 CAS 北大核心 2015年第2期186-188,191,共4页
目的评价通过甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-HRM)检测粪便中人DNA甲基化筛查大肠癌(CRC)的性能。方法收集合格的新鲜粪便标本82例,其中CRC患者27例(CRC组)、进展期腺瘤(AA)患者25例(AA组)和结肠镜阴性的正常人30例(对照组),在Lig... 目的评价通过甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-HRM)检测粪便中人DNA甲基化筛查大肠癌(CRC)的性能。方法收集合格的新鲜粪便标本82例,其中CRC患者27例(CRC组)、进展期腺瘤(AA)患者25例(AA组)和结肠镜阴性的正常人30例(对照组),在LightCycler 480设备上应用MS-HRM技术检测上述粪便中vimentin基因的甲基化状态,并与粪便潜血试验(FOBT)的诊断性能相比较。结果 MS-HRM在CRC组、AA组和对照组中检测vimentin基因甲基化的阳性率分别为81.5%(22/27),80.0%(20/25)和6.7%(2/30)。FOBT在CRC组、AA组和对照组中的阳性率分别为37.0%(10/27),12.0%(3/25)和3.3%(1/30)。在病例组中,MS-HRM和FOBT的诊断敏感性分别为80.8%(42/52)和25.0%(13/52),前者显著高于后者(P<0.05);在对照组中两者的诊断特异性分别为93.3%(28/30)和96.7%(29/30),两者差异无统计学意义(P>0.05)。结论在CRC筛查中,MS-HRM技术检测粪便中vimentin基因甲基化状态的诊断性能明显优于FOBT,具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 甲基化 肿瘤 波形蛋白 DNA 进展期腺瘤 甲基化敏感性分辨熔解曲线分析
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Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*) 376T等位基因高分辨熔解曲线检测方法的建立及分布频率研究 被引量:1
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作者 王贞 贾双双 +5 位作者 廖志坚 莫春妍 魏玲 张润青 罗广平 姬艳丽 《中国输血杂志》 CAS 2022年第7期690-693,共4页
目的 建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法 设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标... 目的 建立针对Jr(a-)稀有血型ABCG2^(*)376T等位基因的高通量分子检测方法,并将其应用于中国人群该等位基因的分布频率研究。方法 设计针对ABCG2基因376位点的特异性引物,利用前期已获得的携带ABCG2^(*)376T等位基因的纯合子和杂合子标本作为阳性对照,不携带该突变的野生型标本作为阴性对照,建立该等位基因的高分辨熔解曲线(HRM)检测方法。应用建立的方法对广州地区献血人群的DNA标本进行筛查,对筛查出携带ABCG2^(*)376T等位基因的标本进行测序确证,以验证HRM方法的准确性。结果 成功建立可检测ABCG2^(*)376T等位基因,并可同时对纯合子及杂合子进行准确分型的HRM方法,在1 560例广州地区献血者中筛查出携带杂合型等位基因个体15例,尚未筛查出携带纯合型等位基因的个体。结论 HRM方法可用于准确筛查ABCG2^(*)376T等位基因并进行分型,该等位基因在中国人群的分布频率约为0.48%(15/3120)。 展开更多
关键词 Jr(a-)血型 ABCG2^(*)376T等位基因 分辨熔解曲线 分布频率
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