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鲤浮肿病病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立
被引量:
4
1
作者
翟立文
刘文枝
+4 位作者
许晨
范玉顶
江南
周勇
曾令兵
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1004-1013,共10页
本研究针对鲤浮肿病病毒(carp edema virus,CEV)基因组核蛋白编码基因P4a的序列,设计2对特异性引物,以克隆构建的重组质粒为标准模板,通过优化反应体系中引物浓度组合、Mg2+浓度、dNTPs浓度、反应温度和扩增时间等参数,建立了CEV环介导...
本研究针对鲤浮肿病病毒(carp edema virus,CEV)基因组核蛋白编码基因P4a的序列,设计2对特异性引物,以克隆构建的重组质粒为标准模板,通过优化反应体系中引物浓度组合、Mg2+浓度、dNTPs浓度、反应温度和扩增时间等参数,建立了CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。结果表明,CEV-LAMP方法的最佳反应温度为62℃,引物浓度组合为引物F3/B3 0.2μmol/L,引物FIP/BIP 1.2μmol/L,Betaine 0.7 mol/L,Mg2+8.0 mmol/L,dNTPs 1.2 mmol/L,反应时间60 min。反应产物经凝胶电泳呈现梯型条带,添加SYBR Green I荧光染料后,呈现明显的绿色阳性反应。CEV-LAMP法灵敏度高,最低检测限为10 copies/μL,较常规PCR法灵敏度高100倍;CEV-LAMP法特异性强,与锦鲤疱疹病毒(KHV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(CyHV-2)、鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)及鲤春病毒血症病毒(SVCV)无交叉反应。CEV-LAMP应用于患病鲤样本检测结果准确,简便快速,可为鲤浮肿病的现场诊断与防控提供技术支撑。
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关键词
鲤浮肿病病毒
核蛋白编码基因P4a
环介导等温扩增
检测
优化
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职称材料
四川地区养殖锦鲤浮肿病毒检测与系统进化分析
被引量:
5
2
作者
康慧敏
何嘉乐
+3 位作者
刘晨恺
周瑶佳
耿毅
欧阳萍
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期539-544,共6页
2017年10月,四川省某锦鲤养殖场暴发一种以嗜睡、腹部肿大、鳃肿胀和眼睛凹陷为临床特征的传染病,累计死亡率高达50%。为研究锦鲤发病病因和疾病流行规律,对病鱼解剖,进行病理组织观察、电镜观察、PCR检测和系统进化分析。结果显示,患...
2017年10月,四川省某锦鲤养殖场暴发一种以嗜睡、腹部肿大、鳃肿胀和眼睛凹陷为临床特征的传染病,累计死亡率高达50%。为研究锦鲤发病病因和疾病流行规律,对病鱼解剖,进行病理组织观察、电镜观察、PCR检测和系统进化分析。结果显示,患病锦鲤眼球浑浊,腹部肿大,鳃肿胀严重;组织病理学观察发现病鱼的鳃、肝脏、肾脏和脑组织细胞变性、坏死,出现大量炎性细胞浸润;透射电镜观察,在肾脏组织中发现病毒粒子。巢氏PCR方法检测鲤浮肿病毒(carp edema virus,CEV),出现特异性扩增产物;基于CEV P4a基因进行系统发育分析,此病毒与英国株R083同源性为99%。本研究为鲤浮肿病毒的起源进化、分类、疾病诊断和防控提供重要依据。
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关键词
鲤
浮肿
病毒
病
鲤
浮肿
病毒
病
理损伤
系统进化分析
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职称材料
天津地区养殖鲤鱼(Cyprinus carpio)鲤浮肿病毒(CEV)PCR检测与人工感染试验
被引量:
2
3
作者
刘群
韩进刚
+5 位作者
王菁
张丹
霍文慧
陈浩楠
耿绪云
孙金生
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期638-645,共8页
对2015—2016年天津地区鲤鱼养殖场采集的发生鲤浮肿病毒(CEV)/锦鲤睡眠病(KSD)的鲤鱼样品,进行套式PCR检测和人工浸泡感染试验,并测定养成期鲤鱼感染率。实验观察研究发现,所采集样品均表现为体色发黑,头部上方颅骨软组织周围皱缩,眼...
对2015—2016年天津地区鲤鱼养殖场采集的发生鲤浮肿病毒(CEV)/锦鲤睡眠病(KSD)的鲤鱼样品,进行套式PCR检测和人工浸泡感染试验,并测定养成期鲤鱼感染率。实验观察研究发现,所采集样品均表现为体色发黑,头部上方颅骨软组织周围皱缩,眼球凹陷,鳃粘脏,黏液较多,常滞游于浅水区水面。套式PCR检测结果显示全部10个样品均出现特异性目的条带,为CEV阳性。目的产物测序后经NCBI BLAST,与已报道的CEV相关序列相似性介于85%—99%;系统发育树分析显示样品编号JY1856与JY1650位于同一分支,与已知CEV病毒株亲缘关系较近,而其余8个样品位于同一分支,与已知CEV病毒株亲缘关系较远。通过人工浸泡感染健康鲤鱼,半数致死时间为55d,累计死亡率为71.1%±3.2%,并从试验感染鱼组织中检测到CEV病毒DNA。养成期鲤鱼CEV携带率为77.5%。以上结果表明,天津地区养殖鲤鱼中存在CEV感染,揭示了我国鲤鱼养殖产业可能面临新的疫情,需引起养殖业的高度重视。
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关键词
鲤
浮肿
病毒
(CEV)/锦
鲤
睡眠
病
(KSD)
套式PCR
系统发育树
人工感染试验
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职称材料
鲤浮肿病检测方法实验室间比对的结果与评价
4
作者
陈孝宇
陈鑫
+3 位作者
王津津
范引光
曾宪东
郑剑
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2019年第2期66-70,共5页
鲤浮肿病(carp edema virus disease,CEVD)是在锦鲤中发现的一种传染性病毒病,近年来在全球传播迅速,对鲤养殖业造成严重损害。本研究设计CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,进行特异性实验;选取套式...
鲤浮肿病(carp edema virus disease,CEVD)是在锦鲤中发现的一种传染性病毒病,近年来在全球传播迅速,对鲤养殖业造成严重损害。本研究设计CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,进行特异性实验;选取套式PCR、荧光PCR和LAMP三种检测方法,组织10家实验室进行室间比对测试:制备含CEV病毒核酸的测试样品,评价其均匀性和稳定性,通过测试结果分析方法检出限。结果显示,套式PCR的核酸样品检测限可达6.8×10^(-10) g。
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关键词
鲤浮肿病病毒
环介导等温扩增
实验室间比对
检出限
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职称材料
题名
鲤浮肿病病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立
被引量:
4
1
作者
翟立文
刘文枝
许晨
范玉顶
江南
周勇
曾令兵
机构
水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)
中国水产科学研究院长江水产研究所
出处
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期1004-1013,共10页
基金
国家大宗淡水鱼产业技术体系专项资金项目(CARS-45-16)
中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2017HYZD1005)
湖北省科技支撑计划项目(2015BBA234)
文摘
本研究针对鲤浮肿病病毒(carp edema virus,CEV)基因组核蛋白编码基因P4a的序列,设计2对特异性引物,以克隆构建的重组质粒为标准模板,通过优化反应体系中引物浓度组合、Mg2+浓度、dNTPs浓度、反应温度和扩增时间等参数,建立了CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。结果表明,CEV-LAMP方法的最佳反应温度为62℃,引物浓度组合为引物F3/B3 0.2μmol/L,引物FIP/BIP 1.2μmol/L,Betaine 0.7 mol/L,Mg2+8.0 mmol/L,dNTPs 1.2 mmol/L,反应时间60 min。反应产物经凝胶电泳呈现梯型条带,添加SYBR Green I荧光染料后,呈现明显的绿色阳性反应。CEV-LAMP法灵敏度高,最低检测限为10 copies/μL,较常规PCR法灵敏度高100倍;CEV-LAMP法特异性强,与锦鲤疱疹病毒(KHV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(CyHV-2)、鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)及鲤春病毒血症病毒(SVCV)无交叉反应。CEV-LAMP应用于患病鲤样本检测结果准确,简便快速,可为鲤浮肿病的现场诊断与防控提供技术支撑。
关键词
鲤浮肿病病毒
核蛋白编码基因P4a
环介导等温扩增
检测
优化
Keywords
carp edema virus
nucleus protein encoding gene P4a
loop-mediated isothermal amplification
detection
optimization
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
四川地区养殖锦鲤浮肿病毒检测与系统进化分析
被引量:
5
2
作者
康慧敏
何嘉乐
刘晨恺
周瑶佳
耿毅
欧阳萍
机构
四川农业大学动物医学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第4期539-544,共6页
基金
中国博士后科学基金(2015M582563)
四川省教育厅基础研究项目(17ZB0345)
文摘
2017年10月,四川省某锦鲤养殖场暴发一种以嗜睡、腹部肿大、鳃肿胀和眼睛凹陷为临床特征的传染病,累计死亡率高达50%。为研究锦鲤发病病因和疾病流行规律,对病鱼解剖,进行病理组织观察、电镜观察、PCR检测和系统进化分析。结果显示,患病锦鲤眼球浑浊,腹部肿大,鳃肿胀严重;组织病理学观察发现病鱼的鳃、肝脏、肾脏和脑组织细胞变性、坏死,出现大量炎性细胞浸润;透射电镜观察,在肾脏组织中发现病毒粒子。巢氏PCR方法检测鲤浮肿病毒(carp edema virus,CEV),出现特异性扩增产物;基于CEV P4a基因进行系统发育分析,此病毒与英国株R083同源性为99%。本研究为鲤浮肿病毒的起源进化、分类、疾病诊断和防控提供重要依据。
关键词
鲤
浮肿
病毒
病
鲤
浮肿
病毒
病
理损伤
系统进化分析
Keywords
carp edema virus disease(CEVD)
carp edema virus(CEV)
pathological injury
system evolution analysis
分类号
S943 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
天津地区养殖鲤鱼(Cyprinus carpio)鲤浮肿病毒(CEV)PCR检测与人工感染试验
被引量:
2
3
作者
刘群
韩进刚
王菁
张丹
霍文慧
陈浩楠
耿绪云
孙金生
机构
天津市水生动物疫病预防控制中心
天津市水产生态及养殖重点实验室天津农学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期638-645,共8页
基金
天津市水产局青年科技创新项目
J2018-07号
+1 种基金
天津市教委科研计划项目
2017KJ186号
文摘
对2015—2016年天津地区鲤鱼养殖场采集的发生鲤浮肿病毒(CEV)/锦鲤睡眠病(KSD)的鲤鱼样品,进行套式PCR检测和人工浸泡感染试验,并测定养成期鲤鱼感染率。实验观察研究发现,所采集样品均表现为体色发黑,头部上方颅骨软组织周围皱缩,眼球凹陷,鳃粘脏,黏液较多,常滞游于浅水区水面。套式PCR检测结果显示全部10个样品均出现特异性目的条带,为CEV阳性。目的产物测序后经NCBI BLAST,与已报道的CEV相关序列相似性介于85%—99%;系统发育树分析显示样品编号JY1856与JY1650位于同一分支,与已知CEV病毒株亲缘关系较近,而其余8个样品位于同一分支,与已知CEV病毒株亲缘关系较远。通过人工浸泡感染健康鲤鱼,半数致死时间为55d,累计死亡率为71.1%±3.2%,并从试验感染鱼组织中检测到CEV病毒DNA。养成期鲤鱼CEV携带率为77.5%。以上结果表明,天津地区养殖鲤鱼中存在CEV感染,揭示了我国鲤鱼养殖产业可能面临新的疫情,需引起养殖业的高度重视。
关键词
鲤
浮肿
病毒
(CEV)/锦
鲤
睡眠
病
(KSD)
套式PCR
系统发育树
人工感染试验
Keywords
CEV (carp edema virus)/KSD (koi sleepy disease)
nested-PCR
phylogenetic tree
immersion test
分类号
S941 [农业科学—水产养殖]
S965.1 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
鲤浮肿病检测方法实验室间比对的结果与评价
4
作者
陈孝宇
陈鑫
王津津
范引光
曾宪东
郑剑
机构
武汉海关
深圳海关
安徽医科大学公共卫生学院
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2019年第2期66-70,共5页
基金
国家质检总局科技计划(2016IK116
2016IK238)
文摘
鲤浮肿病(carp edema virus disease,CEVD)是在锦鲤中发现的一种传染性病毒病,近年来在全球传播迅速,对鲤养殖业造成严重损害。本研究设计CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,进行特异性实验;选取套式PCR、荧光PCR和LAMP三种检测方法,组织10家实验室进行室间比对测试:制备含CEV病毒核酸的测试样品,评价其均匀性和稳定性,通过测试结果分析方法检出限。结果显示,套式PCR的核酸样品检测限可达6.8×10^(-10) g。
关键词
鲤浮肿病病毒
环介导等温扩增
实验室间比对
检出限
Keywords
carp edema virus
loop mediated isothermal amplification
inter-laboratory comparison
detection limit.
分类号
S941.4 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲤浮肿病病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立
翟立文
刘文枝
许晨
范玉顶
江南
周勇
曾令兵
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
2
四川地区养殖锦鲤浮肿病毒检测与系统进化分析
康慧敏
何嘉乐
刘晨恺
周瑶佳
耿毅
欧阳萍
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2019
5
下载PDF
职称材料
3
天津地区养殖鲤鱼(Cyprinus carpio)鲤浮肿病毒(CEV)PCR检测与人工感染试验
刘群
韩进刚
王菁
张丹
霍文慧
陈浩楠
耿绪云
孙金生
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
下载PDF
职称材料
4
鲤浮肿病检测方法实验室间比对的结果与评价
陈孝宇
陈鑫
王津津
范引光
曾宪东
郑剑
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2019
0
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职称材料
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