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A Simple and Highly Efficient Preparation of Structurally Diverse Aryl β-diketoacids as HIV-1 Integrase Inhibitors
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作者 姜晓华 龙亚秋 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2004年第9期978-983,共6页
In order to provide a facile and practical access to structurally diverse aryl -diketoacids, An improved and highly efficient oxalylation method was developed which employed commercially available and cheap reagents. ... In order to provide a facile and practical access to structurally diverse aryl -diketoacids, An improved and highly efficient oxalylation method was developed which employed commercially available and cheap reagents. The oxalylation of aryl methyl ketones, the key step to construct the pharmacophore of aryl -diketoacids, was con-siderably facilitated by a new combination of dimethyl oxalate as an oxalic source and sodium tert-butoxide as a base. A wide variety of aryl -diketoacids bearing different functional groups can be prepared rapidly in high yields at room temperature with this method, which has significant advantages over the previously reported procedures in a wider application range, much less amount of reagents, pretty higher yields and quite shorter reaction time. The bis-aryldiketoacids 3k and 3l, readily prepared by this method, displayed interesting and promising inhibitory ac-tivities against HIV-1 integrase and HIV-1 replication in cells. 展开更多
关键词 oxalylation sodium tert-butoxide dimethyl oxalate aryl -diketoacid HIV-1 integrase inhibitor bis-diketoacid
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Design, Synthesis and Cu^2+ Recognition of β-Diketoacid and Quinoxalone Derivatives Bearing Caffeoyl or Galloyl Moieties Linked by Arylamide as Potential HIV Integrase Inhibitors
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作者 徐义生 曾程初 +2 位作者 李雪梅 钟儒刚 曾毅 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2006年第8期1086-1094,共9页
An efficient procedure for the synthesis of caffeoyl- and galloyl-containing β-diketoacid derivatives linked by arylamide was reported by, in the key step, dissolving the corresponding phenyl methyl ketone in THF/DME... An efficient procedure for the synthesis of caffeoyl- and galloyl-containing β-diketoacid derivatives linked by arylamide was reported by, in the key step, dissolving the corresponding phenyl methyl ketone in THF/DME in the presence of NaOMe as base and dimethyl oxalate as oxalylation reagent, and then separating the sodium ketoenolate ester. The resulting β-diketoacids underwent further condensation reaction with o-phenylenediamine to generate quinoxalone derivatives in good yield, rather than 2-benzimidazol. The preliminary ion binding properties of quinoxalone derivatives were also investigated. UV-Vis spectra showed that these compounds could selectively recognize Cu^2 + ion in ethanol and form a 1 : 2 complex. 展开更多
关键词 diketoacid quinoxalone derivative HIV integrase inhibitor Cu^2+ recognition
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人类免疫缺陷病毒整合酶二酮酸类抑制剂的三维药效团构建 被引量:3
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作者 张小轶 刘斌 +2 位作者 何红秋 杨东 王存新 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第5期817-824,共8页
应用遗传算法相似性程序(GASP),以作用于I型人类免疫缺陷病毒(humanimmun-odeficiency virustype1,HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids,DKAs)抑制剂构建药效团模型.所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征.尝试将... 应用遗传算法相似性程序(GASP),以作用于I型人类免疫缺陷病毒(humanimmun-odeficiency virustype1,HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids,DKAs)抑制剂构建药效团模型.所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征.尝试将抑制剂与药效团叠合后的构象和抑制剂与IN的对接构象进行叠合,得到药效团模型与分子对接构象中IN残基的相对位置,并基于抑制剂的药效团模型特征与周围IN氨基酸残基位置的匹配情况进行药效团特征的修改.所得最优药效团由1个疏水特征、3对氢键特征和1个氢键供体特征组成.该药效团的命中物质量(goodness of hit,GH)为0.56,产出率(Y)达63.6%,假阳性率(FP)为0.41%.该药效团具有较好的置信度,产出率较高而假阳性率较低,可用于数据库搜索发现新的具有DKAs药效团特征的活性化合物,也可为先导化合物的改造提供帮助. 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 整合酶 二酮酸类 抑制剂 药效团 遗传算法相似性程序
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二酮酸化合物与HIV-1整合酶识别的分子模拟研究
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作者 杜文义 胡建平 +4 位作者 左柯 代田洋 刘嵬 梁立 苟小军 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期200-211,共12页
目的研究二酮酸类化合物(diketoacids,DKAs)与HIV-1整合酶(integrase,IN)的分子识别机制和二者复合物的构象变化,为预测同类化合物抑制活性提供理论支持。方法使用AutoDock程序包将10个二酮酸类化合物与整合酶进行了分子对接,... 目的研究二酮酸类化合物(diketoacids,DKAs)与HIV-1整合酶(integrase,IN)的分子识别机制和二者复合物的构象变化,为预测同类化合物抑制活性提供理论支持。方法使用AutoDock程序包将10个二酮酸类化合物与整合酶进行了分子对接,得到一系列对接复合物模型。选取其中两个抑制活性有明显差异的复合物进行了15ns的分子动力学模拟,并从能量和氢键的角度分析了二者与HIV-1整合酶识别的关键残基。结果二者特异性识别主要依靠与DDE基序形成的氢键,结合在由1141~M154,W61-L63和V77构成的口袋中,与实验数据吻合。基于分子动力学模拟轨迹做了结合自由能分解,其中范德华能项与IgIC50有较高的线性相关,结果表明该方程可用于此类化合物的活性预测。结论氢键是抑制剂维持活性及复合物稳定的重要作用力。结合自由能中的疏水作用与抑制活性有明确的相关性。对后续HIV-1整合酶抑制剂设计具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 二酮酸类 HIV-1整合酶 分子对接 分子动力学模拟 自由能分解
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芳基β-二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂研究进展
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作者 王超 赵桂森 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期801-807,共7页
关键词 人类免疫缺陷病毒 艾滋病 整合酶 整合酶抑制剂 二酮酸类
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二酮酸类HIV-1整合酶抑制剂研究进展
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作者 刘川 王超 +1 位作者 赵桂森 袁玉梅 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期598-603,共6页
整合酶是HIV-1复制过程必需的酶,而人体不存在该酶的功能类似物,因而成为抗艾滋病药物设计的较理想靶点。本文综述了近年来二酮酸类整合酶抑制剂的发展现状,为寻找新型、高效的抗艾滋病药物提供参考。
关键词 人类免疫缺陷病毒 整合酶 抑制剂 二酮酸类化合物 综述
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Synthesis and HIV-1 Integrase Inhibitory Activity of Furanone Derivatives 被引量:1
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作者 YU Sheng-hui ZHAO Si-tai LIU Chuan ZHONG Yuan ZHAO Gui-sen 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期225-229,共5页
Twenty novel furanone derivatives, based on the structure of raltegravir which was the first HIV-1 inte- grase(IN) inhibitor approved by the United States Food and Drug Administration(US FDA), were designed, synth... Twenty novel furanone derivatives, based on the structure of raltegravir which was the first HIV-1 inte- grase(IN) inhibitor approved by the United States Food and Drug Administration(US FDA), were designed, synthesized and characterized by ^1H NMR, IR and MS. The biological activities of these compounds against HIV-1 IN in vitro were evaluated. The assay results indicate that the replacement of pyrimidinone with furanone decreased the inhibitory activity of the compounds to HIV-1 IN. Compounds 3i, 3j and 3t show moderate inhibitory activity against HIV-1 IN and selectively inhibit the strand transfer reaction. 展开更多
关键词 HIV-1 integrase Diketoacid FURANONE
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可逆共价抑制剂与肠肽酶的结合机制
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作者 朱文友 张东华 +1 位作者 董方远 庄文昌 《山东化工》 CAS 2022年第4期44-50,共7页
肠肽酶(EP)是一种丝氨酸蛋白酶,可作为治疗代谢性疾病的靶点,肠肽酶的可逆共价抑制剂具有临床相关的疗效。本文以卡莫司他为小分子母体,构建了30个潜在的肠肽酶可逆共价抑制剂,运用AutoDock4.2软件,将30种抑制剂小分子对接到肠肽酶的活... 肠肽酶(EP)是一种丝氨酸蛋白酶,可作为治疗代谢性疾病的靶点,肠肽酶的可逆共价抑制剂具有临床相关的疗效。本文以卡莫司他为小分子母体,构建了30个潜在的肠肽酶可逆共价抑制剂,运用AutoDock4.2软件,将30种抑制剂小分子对接到肠肽酶的活性中心。对接结果显示肠肽酶的活性中心的Asp181、Glu210、Ser182、Ser187等残基与抑制剂小分子形成氢键,His41上的芳香性基团与抑制剂小分子上的芳香性基团形成π-π堆积,6,11,18,20,26号抑制剂小分子与肠肽酶对接的结合能分别为-9.98,-9.89,-9.89,-9.83,-9.82 kcal/mol,他们的抑制常数分别为47.96,56.08,55.94,62.58,63.3 nM,表明结合构象较稳定,其中6号抑制剂小分子的对接结果最好。 展开更多
关键词 肠肽酶 可逆共价抑制剂 分子对接 计算化学
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HIV整合酶抑制剂的研究进展 被引量:7
9
作者 郭涤亮 刘冠男 +5 位作者 周宇 李建 徐进宜 蒋华良 陈凯先 柳红 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第4期477-485,共9页
HIV整合酶是病毒DNA复制所必需的3个基本酶之一,是新批准上市的抗艾滋病药物Raltegravir(MK-0518,Isentress)的分子靶标.HIV整合酶抑制剂已经成为新一类治疗获得性免疫缺陷综合症的药物.对HIV整合酶抑制剂的研究进展进行了综述,为研究... HIV整合酶是病毒DNA复制所必需的3个基本酶之一,是新批准上市的抗艾滋病药物Raltegravir(MK-0518,Isentress)的分子靶标.HIV整合酶抑制剂已经成为新一类治疗获得性免疫缺陷综合症的药物.对HIV整合酶抑制剂的研究进展进行了综述,为研究新型人类免疫缺陷病毒整合酶抑制剂提供参考. 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 整合酶抑制剂 二酮酸类 RALTEGRAVIR
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HIV-1整合酶与芳香二酮酸类抑制剂相互作用的分子模拟研究 被引量:2
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作者 胡建平 张小轶 +1 位作者 唐典勇 常珊 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第19期2177-2183,共7页
用分子对接方法研究了一系列芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的识别及相互作用.结果表明,抑制剂结合到整合酶Asp64~Leu68,Thr115~Phe121,Gln148~Lys159和Mg2+所构成的口袋区,抑制机理与5CITEP相似.采用分子动力学模拟和MM/PBSA方法... 用分子对接方法研究了一系列芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的识别及相互作用.结果表明,抑制剂结合到整合酶Asp64~Leu68,Thr115~Phe121,Gln148~Lys159和Mg2+所构成的口袋区,抑制机理与5CITEP相似.采用分子动力学模拟和MM/PBSA方法计算了芳香二酮酸类抑制剂与整合酶之间的结合自由能,计算结果与实验值相吻合,平均绝对偏差为3.6kJ/mol,体系范德华相互作用和溶剂化效应的非极性项是利于形成复合物的主要因素.相关性分析结果表明,结合自由能值与疏水相互作用有较强的线性相关(R=0.61),基于此,用多元线性回归方法给出了一个能较强预测芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的结合自由能预测模型,为后续基于抑制剂结构的抗HIV-1药物分子设计提供指导. 展开更多
关键词 芳香二酮酸 整合酶 结合自由能 相关性 分子设计
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