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南农87C-38大豆优质11S球蛋白Gy7基因克隆及序列分析
被引量:
2
1
作者
顾婷玉
李建粤
+1 位作者
米东
肖刚
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期840-846,852,共8页
大豆种子不仅富含蛋白质,而且赖氨酸含量较高,利用大豆高赖氨酸基因能够弥补谷类作物种子赖氨酸含量的不足。运用现代分子生物学技术,从高蛋白大豆南农87C-38中克隆11S球蛋白Gy7全基因及cDNA序列。经生物公司测序后,利用vectorNTI软件...
大豆种子不仅富含蛋白质,而且赖氨酸含量较高,利用大豆高赖氨酸基因能够弥补谷类作物种子赖氨酸含量的不足。运用现代分子生物学技术,从高蛋白大豆南农87C-38中克隆11S球蛋白Gy7全基因及cDNA序列。经生物公司测序后,利用vectorNTI软件将所克隆的Gy7全基因及cDNA序列与Genbank(AF319776和AF319777)报道的序列进行比对分析,同源性分别为99%和99.6%。序列比对结果显示,Gy7基因cDNA与Genbank报道的序列之间所有的核苷酸差异都位于第3外显子。由此推测,第1、第2和第4外显子编码的氨基酸对于G7多肽形成特定高级结构可能具有非常重要的作用,它们在进化过程中受到的选择压力可能比第3外显子更强。根据遗传密码表推测,克隆的Gy7与Genbank报道的cDNA序列所编码的多肽,两者存在2个氨基酸组成的差异。大豆球蛋白Gy7优质基因的获得为今后利用转基因技术改良水稻、小麦等谷类作物的营养品质奠定了基础。
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关键词
大豆
11s球蛋白gy7全基因
11
s
球蛋白
gy
7
cDNA序列
克隆
序列分析
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职称材料
大豆7S与11S球蛋白QTL元分析及候选基因挖掘
被引量:
1
2
作者
陈庆山
张泽鑫
+3 位作者
刘函西
齐照明
韩思宁
董晓慧
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1-9,19,共10页
大豆蛋白作为重要营养来源,其含量在大豆种子中约占40%。7S球蛋白(b-伴大豆球蛋白)和11S球蛋白(大豆球蛋白)约占种子总蛋白70%,其含量直接影响大豆蛋白品质及特性。因此,大豆7S与11S球蛋白含量相关QTL定位与候选基因挖掘非常重要。研究...
大豆蛋白作为重要营养来源,其含量在大豆种子中约占40%。7S球蛋白(b-伴大豆球蛋白)和11S球蛋白(大豆球蛋白)约占种子总蛋白70%,其含量直接影响大豆蛋白品质及特性。因此,大豆7S与11S球蛋白含量相关QTL定位与候选基因挖掘非常重要。研究调查国内外已报道的42个7S与11S球蛋白相关QTL数据,通过利用BioMercator ver.2.1软件对其进行元分析得到11个Meta-QTL区间。利用《京都基因与基因组百科全书》和基因本体数据库分析Meta-QTL区域基因,确定18个参与调控7S与11S球蛋白含量的相关基因作为候选基因,该候选基因分别参与植物生长发育、氨基酸生物合成等过程。其中1个基因被注释为编码2S白蛋白超家族蛋白,6个基因与蛋白质合成相关细胞器的生长发育相关,5个基因被注释为编码影响贮藏蛋白积累的转录因子家族蛋白,6个基因与贮藏蛋白运输的分子机制相关。研究结果对大豆7S和11S球蛋白相关QTL定位及分子辅助育种具有重要意义。
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关键词
大豆
7
s
球蛋白
11
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球蛋白
元分析
候选
基因
挖掘
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职称材料
大豆11S/7S球蛋白比值QTL定位及相关基因分析
被引量:
1
3
作者
武小霞
崔一凡
+4 位作者
谢建国
赵雅彬
李佳鹏
井红钰
赵莹
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期1-7,共7页
11S球蛋白与7S球蛋白是大豆贮藏蛋白主要成分,对大豆营养品质及加工特性有显著影响,且11S球蛋白对大豆营养品质及加工特性影响优于7S球蛋白,两者蛋白含量呈负相关。因此,大豆11S/7S球蛋白比值性状相关QTL位点与候选基因挖掘尤为重要。...
11S球蛋白与7S球蛋白是大豆贮藏蛋白主要成分,对大豆营养品质及加工特性有显著影响,且11S球蛋白对大豆营养品质及加工特性影响优于7S球蛋白,两者蛋白含量呈负相关。因此,大豆11S/7S球蛋白比值性状相关QTL位点与候选基因挖掘尤为重要。研究选用181个株系染色体片段代换系群体(Chromosome segment substitution lines,CSSL),采用完备区间作图法(Inclusive composite interval mapping)作11S球蛋白与7S球蛋白比值QTL定位,获得3个与大豆11S/7S球蛋白比值相关QTL。在两个共识QTL区间内,获得6个候选基因,通过实时荧光定量PCR验证,Glyma.09G015100在低、高表型材料中相对表达量均高于对照材料,表明该基因在球蛋白表达过程中有促进作用。研究结果为大豆11S球蛋白与7S球蛋白比值QTL精细定位及适用于加工品种选育提供理论依据。
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关键词
11
s
球蛋白
7
s
球蛋白
完备区间作图
B
s
A
候选
基因
挖掘
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职称材料
大豆11S球蛋白基因Gy1启动子克隆及序列分析
4
作者
米东
逯慧
+1 位作者
严琛
李建粤
《上海师范大学学报(自然科学版)》
2009年第4期414-417,共4页
以高蛋白大豆品种南农87C-38总DNA为模板,采用PCR法扩增获得约1100bp大小的DNA片段,回收该片段并克隆到pUCm-T载体上,选取阳性克隆进行PCR和酶切检测,再进行测序分析.序列分析显示该片段含1174个核苷酸,采用Vector NTI软件将试验中克隆...
以高蛋白大豆品种南农87C-38总DNA为模板,采用PCR法扩增获得约1100bp大小的DNA片段,回收该片段并克隆到pUCm-T载体上,选取阳性克隆进行PCR和酶切检测,再进行测序分析.序列分析显示该片段含1174个核苷酸,采用Vector NTI软件将试验中克隆的序列与GenBank E07850报道的Gy1启动子和GenBank X15121报道的Gy1启动子及信号肽对应序列分别进行比对,同源性分别为99.6%和99.3%,确定该片断为南农87C-38大豆11S球蛋白基因Gy1启动子及信号肽.该启动子的成功克隆,可为今后利用基因工程技术改良大豆种子营养品质研究奠定基础.
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关键词
大豆
11
s
球蛋白
基因
gy
1
启动子
克隆
下载PDF
职称材料
题名
南农87C-38大豆优质11S球蛋白Gy7基因克隆及序列分析
被引量:
2
1
作者
顾婷玉
李建粤
米东
肖刚
机构
上海师范大学生命与环境科学学院
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期840-846,852,共8页
基金
上海市科学技术委员会资助项目(063919141)
文摘
大豆种子不仅富含蛋白质,而且赖氨酸含量较高,利用大豆高赖氨酸基因能够弥补谷类作物种子赖氨酸含量的不足。运用现代分子生物学技术,从高蛋白大豆南农87C-38中克隆11S球蛋白Gy7全基因及cDNA序列。经生物公司测序后,利用vectorNTI软件将所克隆的Gy7全基因及cDNA序列与Genbank(AF319776和AF319777)报道的序列进行比对分析,同源性分别为99%和99.6%。序列比对结果显示,Gy7基因cDNA与Genbank报道的序列之间所有的核苷酸差异都位于第3外显子。由此推测,第1、第2和第4外显子编码的氨基酸对于G7多肽形成特定高级结构可能具有非常重要的作用,它们在进化过程中受到的选择压力可能比第3外显子更强。根据遗传密码表推测,克隆的Gy7与Genbank报道的cDNA序列所编码的多肽,两者存在2个氨基酸组成的差异。大豆球蛋白Gy7优质基因的获得为今后利用转基因技术改良水稻、小麦等谷类作物的营养品质奠定了基础。
关键词
大豆
11s球蛋白gy7全基因
11
s
球蛋白
gy
7
cDNA序列
克隆
序列分析
Keywords
s
oybean
11
s
glycinin
gy
7
gene
11
s
glycinin
gy
7
cDNA
Clone
s
equence analy
s
e
s
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆7S与11S球蛋白QTL元分析及候选基因挖掘
被引量:
1
2
作者
陈庆山
张泽鑫
刘函西
齐照明
韩思宁
董晓慧
机构
东北农业大学农学院
西北农林科技大学农学院
中化现代农业有限公司
黑龙江省农业科学院绥化分院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1-9,19,共10页
基金
黑龙江省优秀青年基金项目(YQ2021C011)
黑龙江博士后落户启动金(LBH-Q21011)。
文摘
大豆蛋白作为重要营养来源,其含量在大豆种子中约占40%。7S球蛋白(b-伴大豆球蛋白)和11S球蛋白(大豆球蛋白)约占种子总蛋白70%,其含量直接影响大豆蛋白品质及特性。因此,大豆7S与11S球蛋白含量相关QTL定位与候选基因挖掘非常重要。研究调查国内外已报道的42个7S与11S球蛋白相关QTL数据,通过利用BioMercator ver.2.1软件对其进行元分析得到11个Meta-QTL区间。利用《京都基因与基因组百科全书》和基因本体数据库分析Meta-QTL区域基因,确定18个参与调控7S与11S球蛋白含量的相关基因作为候选基因,该候选基因分别参与植物生长发育、氨基酸生物合成等过程。其中1个基因被注释为编码2S白蛋白超家族蛋白,6个基因与蛋白质合成相关细胞器的生长发育相关,5个基因被注释为编码影响贮藏蛋白积累的转录因子家族蛋白,6个基因与贮藏蛋白运输的分子机制相关。研究结果对大豆7S和11S球蛋白相关QTL定位及分子辅助育种具有重要意义。
关键词
大豆
7
s
球蛋白
11
s
球蛋白
元分析
候选
基因
挖掘
Keywords
s
oybean
7
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meta analy
s
i
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candidate gene mining
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆11S/7S球蛋白比值QTL定位及相关基因分析
被引量:
1
3
作者
武小霞
崔一凡
谢建国
赵雅彬
李佳鹏
井红钰
赵莹
机构
东北农业大学农学院
出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期1-7,共7页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0100201)
国家自然科学基金项目(31971899)。
文摘
11S球蛋白与7S球蛋白是大豆贮藏蛋白主要成分,对大豆营养品质及加工特性有显著影响,且11S球蛋白对大豆营养品质及加工特性影响优于7S球蛋白,两者蛋白含量呈负相关。因此,大豆11S/7S球蛋白比值性状相关QTL位点与候选基因挖掘尤为重要。研究选用181个株系染色体片段代换系群体(Chromosome segment substitution lines,CSSL),采用完备区间作图法(Inclusive composite interval mapping)作11S球蛋白与7S球蛋白比值QTL定位,获得3个与大豆11S/7S球蛋白比值相关QTL。在两个共识QTL区间内,获得6个候选基因,通过实时荧光定量PCR验证,Glyma.09G015100在低、高表型材料中相对表达量均高于对照材料,表明该基因在球蛋白表达过程中有促进作用。研究结果为大豆11S球蛋白与7S球蛋白比值QTL精细定位及适用于加工品种选育提供理论依据。
关键词
11
s
球蛋白
7
s
球蛋白
完备区间作图
B
s
A
候选
基因
挖掘
Keywords
11
s
globulin
7
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globulin
complete interval mapping
B
s
A
candidate gene mining
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大豆11S球蛋白基因Gy1启动子克隆及序列分析
4
作者
米东
逯慧
严琛
李建粤
机构
上海师范大学生命与环境科学学院
出处
《上海师范大学学报(自然科学版)》
2009年第4期414-417,共4页
基金
上海市科学技术委员会项目(063919141)
文摘
以高蛋白大豆品种南农87C-38总DNA为模板,采用PCR法扩增获得约1100bp大小的DNA片段,回收该片段并克隆到pUCm-T载体上,选取阳性克隆进行PCR和酶切检测,再进行测序分析.序列分析显示该片段含1174个核苷酸,采用Vector NTI软件将试验中克隆的序列与GenBank E07850报道的Gy1启动子和GenBank X15121报道的Gy1启动子及信号肽对应序列分别进行比对,同源性分别为99.6%和99.3%,确定该片断为南农87C-38大豆11S球蛋白基因Gy1启动子及信号肽.该启动子的成功克隆,可为今后利用基因工程技术改良大豆种子营养品质研究奠定基础.
关键词
大豆
11
s
球蛋白
基因
gy
1
启动子
克隆
Keywords
s
oybean
11
s
glycinin gene
gy
l
promoter
clone
分类号
Q943.1 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
南农87C-38大豆优质11S球蛋白Gy7基因克隆及序列分析
顾婷玉
李建粤
米东
肖刚
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2007
2
下载PDF
职称材料
2
大豆7S与11S球蛋白QTL元分析及候选基因挖掘
陈庆山
张泽鑫
刘函西
齐照明
韩思宁
董晓慧
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
3
大豆11S/7S球蛋白比值QTL定位及相关基因分析
武小霞
崔一凡
谢建国
赵雅彬
李佳鹏
井红钰
赵莹
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
下载PDF
职称材料
4
大豆11S球蛋白基因Gy1启动子克隆及序列分析
米东
逯慧
严琛
李建粤
《上海师范大学学报(自然科学版)》
2009
0
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