旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haplo-view4.1和PHASE2.0软件对拷贝数变异、...旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haplo-view4.1和PHASE2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现,该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block159984~73717bp)单倍型分析发现3种单倍型和6种双倍型,其中双倍型H1H2血清中IgG含量是H3H3的1.45倍(P〈0.05);Block2(102256~138076bp)内发现9种单倍型和9种常见双倍型,不同型之间差异不显著(P〉0.05)。CNV1(6471~59984bp)是稀有型拷贝数变异区;CNV2(201882~299166bp)缺失型IgG含量是增加型的1.25倍(P〈0.05)。分析挑选出8个与IgG抗体含量相关的SNP位点,结果发现Gga-rs16057310、Gga-rs15788237及Gga-rs15788101不同基因型之间差异显著(P〈0.05)。结果表明:Blockl和拷贝数变异CNV2(201882299166bp)及SNP位点Gga_rs16057310、Gga_rs15788237、Gga-rs15788101对IgG含量有显著影响,位于这些区域附近含有CD1b、TRIM27、ZNF692及MHC与免疫机能相关的重要基因。展开更多
旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异...旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。展开更多
据美国BIOCOMPARE科技新闻网(2008/1/24)报道,美国芝加哥大学、伊利诺大学以及罗斯韦尔公园癌症研究所(Roswell Park Cancer Institute)的研究人员。在第16号染色体上发现部份的微删除(microdeletion),可能是造成自闭症(aut...据美国BIOCOMPARE科技新闻网(2008/1/24)报道,美国芝加哥大学、伊利诺大学以及罗斯韦尔公园癌症研究所(Roswell Park Cancer Institute)的研究人员。在第16号染色体上发现部份的微删除(microdeletion),可能是造成自闭症(autism)的高度风险因子。展开更多
文摘旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haplo-view4.1和PHASE2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现,该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block159984~73717bp)单倍型分析发现3种单倍型和6种双倍型,其中双倍型H1H2血清中IgG含量是H3H3的1.45倍(P〈0.05);Block2(102256~138076bp)内发现9种单倍型和9种常见双倍型,不同型之间差异不显著(P〉0.05)。CNV1(6471~59984bp)是稀有型拷贝数变异区;CNV2(201882~299166bp)缺失型IgG含量是增加型的1.25倍(P〈0.05)。分析挑选出8个与IgG抗体含量相关的SNP位点,结果发现Gga-rs16057310、Gga-rs15788237及Gga-rs15788101不同基因型之间差异显著(P〈0.05)。结果表明:Blockl和拷贝数变异CNV2(201882299166bp)及SNP位点Gga_rs16057310、Gga_rs15788237、Gga-rs15788101对IgG含量有显著影响,位于这些区域附近含有CD1b、TRIM27、ZNF692及MHC与免疫机能相关的重要基因。
文摘旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。
文摘据美国BIOCOMPARE科技新闻网(2008/1/24)报道,美国芝加哥大学、伊利诺大学以及罗斯韦尔公园癌症研究所(Roswell Park Cancer Institute)的研究人员。在第16号染色体上发现部份的微删除(microdeletion),可能是造成自闭症(autism)的高度风险因子。