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3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性 被引量:3
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作者 孙倪悦 陆涛 +3 位作者 陈亚东 郝兰虎 许岩 李瑞君 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第4期645-654,共10页
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA... 细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义. 展开更多
关键词 细胞周期蛋白激酶 吲哚咔唑衍生物 3D-QSAR 3d-qssr 比较分子力场分析方法 分子对接
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基于QSAR/QSSR的苯并三唑化合物选择性抑制PTP-1B的研究 被引量:1
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作者 梁娜娜 李艳妮 葛志强 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第8期735-745,共11页
蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP-1B)特异性抑制剂是近年来治疗Ⅱ型糖尿病药物研发的热点.PTP-1B与T细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(TCPTP)同源性很高,为了避免在使用PTP-1B抑制剂过程中对TCPTP产生交叉抑制,则需要设计开发对PTP-1B具有高活性和高特异选... 蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP-1B)特异性抑制剂是近年来治疗Ⅱ型糖尿病药物研发的热点.PTP-1B与T细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(TCPTP)同源性很高,为了避免在使用PTP-1B抑制剂过程中对TCPTP产生交叉抑制,则需要设计开发对PTP-1B具有高活性和高特异选择性的小分子化合物.苯并三唑类化合物对PTP-1B的抑制活性很高,并且其中一些化合物对PTP-1B表现出了较好的特异选择性,具有良好的药用开发前景.通过CoMFA和CoMSIA两种方法分别对该类化合物进行了三维定量结构-活性关系(3D-QSAR)和三维定量结构-选择性关系(3D-QSSR)研究,并建立了相关的预测模型.计算结果表明PTP-1B中的Arg24与化合物的氢键相互作用是提高选择性的重要因素,并且在R2位引入氢键供体且体积较大的强供电子基团,将有利于化合物抑制活性的提高,而在R2位取代基的末端引入氢键受体且体积较大的强吸电子基团,将有利于化合物选择性的提高. 展开更多
关键词 苯并三唑 蛋白酪氨酸磷酸酶1B T细胞蛋白酪氨酸磷酸酶 三维定量构效关系
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