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β-细辛醚治疗帕金森病抑郁的网络药理学作用机制分析
被引量:
2
1
作者
王志芳
宁百乐
+4 位作者
贺邵华
康健
王南卜
方永奇
李翎
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期228-234,共7页
目的基于网络药理学分析β-细辛醚治疗帕金森病抑郁(DPD)的作用机制。方法利用TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库检索得到β-细辛醚的作用靶点,通过Genecard数据库和OMIM数据库检索DPD的疾病相关靶点,并通过UniProt数...
目的基于网络药理学分析β-细辛醚治疗帕金森病抑郁(DPD)的作用机制。方法利用TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库检索得到β-细辛醚的作用靶点,通过Genecard数据库和OMIM数据库检索DPD的疾病相关靶点,并通过UniProt数据库进行标准化。构建β-细辛醚和DPD的共有靶点韦恩图,对共有靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析,以获取关键靶点信息;对共有靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析;建立"药物-疾病-靶点-通路"网络,展示β-细辛醚治疗DPD过程中疾病-靶点-通路的关系。结果共得到β-细辛醚和DPD的共有靶点64个,包括ALB、c-FOS、EGFR、JUN、CASP3、PTGS2、IGF1、ESR1、APP等多个关键靶点。共有靶点涉及学习或记忆、突触后膜的内在成分、神经递质受体活性、突触后神经递质受体活动等与突触间神经递质及其受体密切相关的生物过程、分子功能及细胞组成,以及5-HT能神经突触、DA能神经突触和神经活性配体受体相互作用等信号通路。结论β-细辛醚可能通过对c-FOS、JUN、ALB、EGFR、CASP3、MAP2K1、MAPK14等靶点及相关通路的作用,进而影响5-HT能神经突触和DA能神经突触的损伤修复,发挥治疗DPD的作用。
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关键词
Β
-
细辛醚
帕金森病抑郁
网络药理学
多巴
胺
能突触
通路
5-羟色胺能突触
通路
原文传递
奥氮平连续处理后大鼠中缝背核组织差异表达蛋白的生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
黄平
朱晶
+3 位作者
李华
王艳召
汤益民
刘强
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1221-1229,共9页
目的分析奥氮平连续处理的大鼠中缝背核蛋白的差异表达,探究奥氮平使用早期导致代谢障碍可能的中枢5-HT机制。方法将40只SD大鼠随机分配到奥氮平组[灌胃奥氮平1.2 mg/(kg·d)]和对照组(灌胃等量0.9%氯化钠溶液),两组各分配10只雌性...
目的分析奥氮平连续处理的大鼠中缝背核蛋白的差异表达,探究奥氮平使用早期导致代谢障碍可能的中枢5-HT机制。方法将40只SD大鼠随机分配到奥氮平组[灌胃奥氮平1.2 mg/(kg·d)]和对照组(灌胃等量0.9%氯化钠溶液),两组各分配10只雌性大鼠、10只雄性大鼠。给药1次/d,连续28 d。最后一次给药1 h后处理大鼠,并取大脑中缝背核样本。利用绝对和相对定量同位素标记技术联合液相色谱-串联质谱技术对大鼠中缝背核组织进行蛋白质组学分析,进一步对差异表达蛋白进行GO、KEGG通路、COG、蛋白互作网络分析。另将24只大鼠随机分为4组:2个奥氮平组和2个对照组(6只/组),类似方法得到大鼠中缝背核样本,根据蛋白质组学数据选择目标基因的表达进行qRT-PCR和Western blot验证。结果筛选出奥氮平组与对照组大鼠中缝背核差异表达蛋白有72种上调、142种下调。GO注释分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白参与细胞过程、生物调节、代谢过程、应激反应、多细胞生物过程以及结合、催化活性、分子功能调节、转录调节活性等分子功能。KEGG富集分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白主要参与流体剪切应力与动脉粥样硬化、5-羟色胺能突触、丁酸代谢、甲状腺激素合成和IL-17信号通路等;PPI分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白Hmgcs2、Cav1、Hsp90b1、Canx、Gnai1、MAPK9和LOC685513(Gng14)位于蛋白质互作网络的节点。q RT-PCR和Western blot结果显示,丁酸代谢和5-羟色胺(5-HT)能突触通路4个基因及其蛋白,其中丁酸代谢的关键调节基因Hmgcs2及其蛋白在药物处理组明显下调(P<0.01),5-羟色胺2受体调控的Slc6a4、Gnai1基因及其蛋白在药物处理组均出现显著高表达(P<0.05)。结论奥氮平使用早期可能主要通过调控中缝背核组织Hmgcs2、Cav1、Hsp90b1、Canx、Gnai1、Slc6a4、MAPK9和Gng14等差异表达蛋白以及5-HT能突触通路等,参与大鼠机体代谢障碍的中枢5-HT作用机制。
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关键词
奥氮平
定量同位素标记技术
生物信息学
代谢障碍
中缝背核
5-羟色胺能突触
通路
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职称材料
基于网络药理学分析参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用机制
被引量:
4
3
作者
陆昌彬
《中国医药科学》
2022年第23期27-30,共4页
目的 应用网络药理学的研究方法,探究参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称“冠心病”)的潜在作用机制。方法 筛选参松养心胶囊的主要活性成分(数据来源于BATMAN-TCM和TCMSP数据库),进行靶点预测。收集冠心病相关疾病靶点(数...
目的 应用网络药理学的研究方法,探究参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称“冠心病”)的潜在作用机制。方法 筛选参松养心胶囊的主要活性成分(数据来源于BATMAN-TCM和TCMSP数据库),进行靶点预测。收集冠心病相关疾病靶点(数据来源于Drugbank),获取药物活性成分与疾病靶点对应的靶基因(Uniprot),同时筛选得到二者的共同作用靶点。构建药物活性成分-靶点-疾病相互作用的网络关系(Cytoscape)。通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果 参松养心胶囊的活性化合物共有185个,包括531个作用靶点,冠状动脉粥样硬化性心脏病相关疾病靶点有216个。筛选出二者共同靶点44个,其中涉及2条主要信号通路,包括5-羟色胺能突触、钙离子信号通路。HTR2A、NOS3可能是参松养心胶囊治疗冠心病的关键靶点。结论 参松养心胶囊治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,其作用机制可能是通过5-羟色胺能突触、钙离子信号通路发挥作用。
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关键词
网络药理学
参松养心胶囊
冠状动脉粥样硬化性心脏病
5-羟色胺能突触
钙离子信号通路
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职称材料
题名
β-细辛醚治疗帕金森病抑郁的网络药理学作用机制分析
被引量:
2
1
作者
王志芳
宁百乐
贺邵华
康健
王南卜
方永奇
李翎
机构
广州中医药大学
广州中医药大学第二附属医院
广州中医药大学第一附属医院
出处
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期228-234,共7页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(81804166)
广东省科技计划项目(2016A030303053)
广东省中医药局中医药科研项目(20211146)。
文摘
目的基于网络药理学分析β-细辛醚治疗帕金森病抑郁(DPD)的作用机制。方法利用TCMSP、Swiss Target Prediciton和PharmMapper数据库检索得到β-细辛醚的作用靶点,通过Genecard数据库和OMIM数据库检索DPD的疾病相关靶点,并通过UniProt数据库进行标准化。构建β-细辛醚和DPD的共有靶点韦恩图,对共有靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析,以获取关键靶点信息;对共有靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析;建立"药物-疾病-靶点-通路"网络,展示β-细辛醚治疗DPD过程中疾病-靶点-通路的关系。结果共得到β-细辛醚和DPD的共有靶点64个,包括ALB、c-FOS、EGFR、JUN、CASP3、PTGS2、IGF1、ESR1、APP等多个关键靶点。共有靶点涉及学习或记忆、突触后膜的内在成分、神经递质受体活性、突触后神经递质受体活动等与突触间神经递质及其受体密切相关的生物过程、分子功能及细胞组成,以及5-HT能神经突触、DA能神经突触和神经活性配体受体相互作用等信号通路。结论β-细辛醚可能通过对c-FOS、JUN、ALB、EGFR、CASP3、MAP2K1、MAPK14等靶点及相关通路的作用,进而影响5-HT能神经突触和DA能神经突触的损伤修复,发挥治疗DPD的作用。
关键词
Β
-
细辛醚
帕金森病抑郁
网络药理学
多巴
胺
能突触
通路
5-羟色胺能突触
通路
Keywords
β
-
asarone
depression in Parkinson’s disease
network pharmacology
dopaminergic synapse pathway
serotonergic synapse pathway
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]
原文传递
题名
奥氮平连续处理后大鼠中缝背核组织差异表达蛋白的生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
黄平
朱晶
李华
王艳召
汤益民
刘强
机构
九江市第五人民医院内分泌科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1221-1229,共9页
基金
九江市“双百双千”人才工程(360400228888010000783)。
文摘
目的分析奥氮平连续处理的大鼠中缝背核蛋白的差异表达,探究奥氮平使用早期导致代谢障碍可能的中枢5-HT机制。方法将40只SD大鼠随机分配到奥氮平组[灌胃奥氮平1.2 mg/(kg·d)]和对照组(灌胃等量0.9%氯化钠溶液),两组各分配10只雌性大鼠、10只雄性大鼠。给药1次/d,连续28 d。最后一次给药1 h后处理大鼠,并取大脑中缝背核样本。利用绝对和相对定量同位素标记技术联合液相色谱-串联质谱技术对大鼠中缝背核组织进行蛋白质组学分析,进一步对差异表达蛋白进行GO、KEGG通路、COG、蛋白互作网络分析。另将24只大鼠随机分为4组:2个奥氮平组和2个对照组(6只/组),类似方法得到大鼠中缝背核样本,根据蛋白质组学数据选择目标基因的表达进行qRT-PCR和Western blot验证。结果筛选出奥氮平组与对照组大鼠中缝背核差异表达蛋白有72种上调、142种下调。GO注释分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白参与细胞过程、生物调节、代谢过程、应激反应、多细胞生物过程以及结合、催化活性、分子功能调节、转录调节活性等分子功能。KEGG富集分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白主要参与流体剪切应力与动脉粥样硬化、5-羟色胺能突触、丁酸代谢、甲状腺激素合成和IL-17信号通路等;PPI分析显示,涉及奥氮平的差异表达蛋白Hmgcs2、Cav1、Hsp90b1、Canx、Gnai1、MAPK9和LOC685513(Gng14)位于蛋白质互作网络的节点。q RT-PCR和Western blot结果显示,丁酸代谢和5-羟色胺(5-HT)能突触通路4个基因及其蛋白,其中丁酸代谢的关键调节基因Hmgcs2及其蛋白在药物处理组明显下调(P<0.01),5-羟色胺2受体调控的Slc6a4、Gnai1基因及其蛋白在药物处理组均出现显著高表达(P<0.05)。结论奥氮平使用早期可能主要通过调控中缝背核组织Hmgcs2、Cav1、Hsp90b1、Canx、Gnai1、Slc6a4、MAPK9和Gng14等差异表达蛋白以及5-HT能突触通路等,参与大鼠机体代谢障碍的中枢5-HT作用机制。
关键词
奥氮平
定量同位素标记技术
生物信息学
代谢障碍
中缝背核
5-羟色胺能突触
通路
Keywords
olanzapine
iTRAQ technology
bioinformatics
metabolic disorders
dorsal raphe nucleus
serotonergic synapse pathway
分类号
R965 [医药卫生—药理学]
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学分析参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用机制
被引量:
4
3
作者
陆昌彬
机构
复旦大学附属中山医院厦门医院心内科
出处
《中国医药科学》
2022年第23期27-30,共4页
文摘
目的 应用网络药理学的研究方法,探究参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称“冠心病”)的潜在作用机制。方法 筛选参松养心胶囊的主要活性成分(数据来源于BATMAN-TCM和TCMSP数据库),进行靶点预测。收集冠心病相关疾病靶点(数据来源于Drugbank),获取药物活性成分与疾病靶点对应的靶基因(Uniprot),同时筛选得到二者的共同作用靶点。构建药物活性成分-靶点-疾病相互作用的网络关系(Cytoscape)。通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果 参松养心胶囊的活性化合物共有185个,包括531个作用靶点,冠状动脉粥样硬化性心脏病相关疾病靶点有216个。筛选出二者共同靶点44个,其中涉及2条主要信号通路,包括5-羟色胺能突触、钙离子信号通路。HTR2A、NOS3可能是参松养心胶囊治疗冠心病的关键靶点。结论 参松养心胶囊治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,其作用机制可能是通过5-羟色胺能突触、钙离子信号通路发挥作用。
关键词
网络药理学
参松养心胶囊
冠状动脉粥样硬化性心脏病
5-羟色胺能突触
钙离子信号通路
Keywords
Network pharmacology
Shensong Yangxin Capsule
Coronary atherosclerotic heart disease
Serotonergic synapse
Calcium ion signaling pathway
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
β-细辛醚治疗帕金森病抑郁的网络药理学作用机制分析
王志芳
宁百乐
贺邵华
康健
王南卜
方永奇
李翎
《中药新药与临床药理》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
2
奥氮平连续处理后大鼠中缝背核组织差异表达蛋白的生物信息学分析
黄平
朱晶
李华
王艳召
汤益民
刘强
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
3
基于网络药理学分析参松养心胶囊治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用机制
陆昌彬
《中国医药科学》
2022
4
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职称材料
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