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油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析
1
作者
刘美兰
谭晓风
+1 位作者
袁军
周俊琴
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期339-344,共6页
【目的】克隆油桐酸性磷酸酶(ACPase)基因的全长序列,为进一步分析油桐ACPase的功能奠定基础。【方法】根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,利用RT-PCR从油桐种子中克隆ACPase基因,对其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、...
【目的】克隆油桐酸性磷酸酶(ACPase)基因的全长序列,为进一步分析油桐ACPase的功能奠定基础。【方法】根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,利用RT-PCR从油桐种子中克隆ACPase基因,对其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、跨膜结构、二级结构及三级结构进行分析预测,同时进行多序列比对并构建系统树。【结果】克隆获得油桐ACPase基因,其开放阅读框为1152 bp,编码383个氨基酸残基,相对分子质量为40.94 kDa,理论pI为5.30,属可溶性不稳定蛋白。同源性和进化树的预测分析结果显示,油桐ACPase与毛果杨的ACPase蛋白同源性达84%。油桐ACPase存在磷酸酶基因家族的保守区域,ACPase编码蛋白的大部分氨基酸属于亲水性氨基酸。其蛋白二级结构主要由不规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成。ACPase蛋白包含1个跨膜螺旋区域,其相应氨基酸位置在136-156;包含1个疑似跨膜域,其相应氨基酸位置在255-275;每个跨膜结构域为由20个氨基酸残基组成的螺旋,同时跨膜蛋白的N端和C端位于细胞膜胞质的一侧。【结论】油桐ACPase基因的表达可能与其体内磷营养的分解利用等过程有关。
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关键词
油桐
酸性磷酸酶
acpase
克隆
生物信息学
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职称材料
重金属汞对土壤酸性磷酸酶的影响及其机理
被引量:
23
2
作者
徐冬梅
刘广深
+1 位作者
王黎明
刘维屏
《环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期865-870,共6页
通过土壤培养试验、紫外吸收光谱和荧光光谱技术 ,研究了重金属汞对土壤酸性磷酸酶催化活性、动力学性质的影响及机理 .结果表明 ,汞对土壤酸性磷酸酶活性、酶促反应动力学性质均具有显著影响 .汞对土壤酸性磷酸酶的作用可能为非竞争与...
通过土壤培养试验、紫外吸收光谱和荧光光谱技术 ,研究了重金属汞对土壤酸性磷酸酶催化活性、动力学性质的影响及机理 .结果表明 ,汞对土壤酸性磷酸酶活性、酶促反应动力学性质均具有显著影响 .汞对土壤酸性磷酸酶的作用可能为非竞争与反竞争混合的抑制类型 .而汞对麦芽酸性磷酸酶的抑制作用为反竞争性抑制 .重金属汞通过改变土壤酸性磷酸酶分子色氨酸、酪氨酸残基的微环境致使酶活性中心的构象发生变化 。
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关键词
重金属
汞
土壤
酸性磷酸酶
活性
动力学
色氨酸
acpase
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职称材料
老龄大鼠海马CA_3区神经元的酶细胞化学改变及人参茎叶皂甙的抗衰老作用
被引量:
7
3
作者
赖红
吕永利
+1 位作者
高杰
包峰
《中国组织化学与细胞化学杂志》
CAS
CSCD
1995年第2期211-215,共5页
本实验应用酶细胞化学方法观察了老龄大鼠海马CA3区神经元的琥珀酸脱氢酶(SDH),酸性磷酸酶(ACPase)的衰老变化,同时对比观察了人参茎叶皂甙的抗衰老作用。实验数据由彩色显微图像分析系统进行定量分析。实验结果提示...
本实验应用酶细胞化学方法观察了老龄大鼠海马CA3区神经元的琥珀酸脱氢酶(SDH),酸性磷酸酶(ACPase)的衰老变化,同时对比观察了人参茎叶皂甙的抗衰老作用。实验数据由彩色显微图像分析系统进行定量分析。实验结果提示老龄时海马CA3区神经元SDH酶活性减弱,ACPase活性增强。而人参茎叶皂甙具有促进神经元SDH酶活性,降低ACPase活性的作用。本结果为老龄时学习记忆能力下降及人参茎叶皂甙延缓衰老提供了一定的酶细胞化学变化的依据。
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关键词
海马CA
3
区
老龄大鼠
人参茎叶皂甙
SDH
acpase
下载PDF
职称材料
题名
油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析
1
作者
刘美兰
谭晓风
袁军
周俊琴
机构
中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期339-344,共6页
基金
国家林业公益性行业科研专项项目(200904023)
文摘
【目的】克隆油桐酸性磷酸酶(ACPase)基因的全长序列,为进一步分析油桐ACPase的功能奠定基础。【方法】根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,利用RT-PCR从油桐种子中克隆ACPase基因,对其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、跨膜结构、二级结构及三级结构进行分析预测,同时进行多序列比对并构建系统树。【结果】克隆获得油桐ACPase基因,其开放阅读框为1152 bp,编码383个氨基酸残基,相对分子质量为40.94 kDa,理论pI为5.30,属可溶性不稳定蛋白。同源性和进化树的预测分析结果显示,油桐ACPase与毛果杨的ACPase蛋白同源性达84%。油桐ACPase存在磷酸酶基因家族的保守区域,ACPase编码蛋白的大部分氨基酸属于亲水性氨基酸。其蛋白二级结构主要由不规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成。ACPase蛋白包含1个跨膜螺旋区域,其相应氨基酸位置在136-156;包含1个疑似跨膜域,其相应氨基酸位置在255-275;每个跨膜结构域为由20个氨基酸残基组成的螺旋,同时跨膜蛋白的N端和C端位于细胞膜胞质的一侧。【结论】油桐ACPase基因的表达可能与其体内磷营养的分解利用等过程有关。
关键词
油桐
酸性磷酸酶
acpase
克隆
生物信息学
Keywords
tung tree
acid phosphatase
acpase
cloning
bioinformatics analysis
分类号
S794.3 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
重金属汞对土壤酸性磷酸酶的影响及其机理
被引量:
23
2
作者
徐冬梅
刘广深
王黎明
刘维屏
机构
浙江大学环境科学研究所
出处
《环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期865-870,共6页
基金
国家重点研究发展规划 ( 973 )项目 ( 2 0 0 2CB4 1 0 80 0 )
文摘
通过土壤培养试验、紫外吸收光谱和荧光光谱技术 ,研究了重金属汞对土壤酸性磷酸酶催化活性、动力学性质的影响及机理 .结果表明 ,汞对土壤酸性磷酸酶活性、酶促反应动力学性质均具有显著影响 .汞对土壤酸性磷酸酶的作用可能为非竞争与反竞争混合的抑制类型 .而汞对麦芽酸性磷酸酶的抑制作用为反竞争性抑制 .重金属汞通过改变土壤酸性磷酸酶分子色氨酸、酪氨酸残基的微环境致使酶活性中心的构象发生变化 。
关键词
重金属
汞
土壤
酸性磷酸酶
活性
动力学
色氨酸
acpase
Keywords
acid phosphatase
activity
kinetic property
Hg^(2+)
soil
conformation in solution
分类号
X53 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
老龄大鼠海马CA_3区神经元的酶细胞化学改变及人参茎叶皂甙的抗衰老作用
被引量:
7
3
作者
赖红
吕永利
高杰
包峰
机构
中国医科大学脑研究所
出处
《中国组织化学与细胞化学杂志》
CAS
CSCD
1995年第2期211-215,共5页
文摘
本实验应用酶细胞化学方法观察了老龄大鼠海马CA3区神经元的琥珀酸脱氢酶(SDH),酸性磷酸酶(ACPase)的衰老变化,同时对比观察了人参茎叶皂甙的抗衰老作用。实验数据由彩色显微图像分析系统进行定量分析。实验结果提示老龄时海马CA3区神经元SDH酶活性减弱,ACPase活性增强。而人参茎叶皂甙具有促进神经元SDH酶活性,降低ACPase活性的作用。本结果为老龄时学习记忆能力下降及人参茎叶皂甙延缓衰老提供了一定的酶细胞化学变化的依据。
关键词
海马CA
3
区
老龄大鼠
人参茎叶皂甙
SDH
acpase
Keywords
Hippocampal CA_3
SDH
acpase
Ginsenoside
Rat
分类号
Q26 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析
刘美兰
谭晓风
袁军
周俊琴
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
下载PDF
职称材料
2
重金属汞对土壤酸性磷酸酶的影响及其机理
徐冬梅
刘广深
王黎明
刘维屏
《环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
23
下载PDF
职称材料
3
老龄大鼠海马CA_3区神经元的酶细胞化学改变及人参茎叶皂甙的抗衰老作用
赖红
吕永利
高杰
包峰
《中国组织化学与细胞化学杂志》
CAS
CSCD
1995
7
下载PDF
职称材料
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