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狼毒大戟调节AGE-RAGE信号通路对肝硬化大鼠炎症反应和纤维化的影响
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作者 刘露 刘占奎 +1 位作者 吴雪 鲍婷琦 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第15期3800-3804,共5页
目的探讨狼毒大戟对肝硬化大鼠炎症反应和纤维化的影响及对晚期糖基化终产物-细胞表面受体-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)信号通路的调节机制。方法将SPF级SD大鼠分为对照组、模型组、阳性组、狼毒大戟组,每组15只。检测大鼠血清中肝功能... 目的探讨狼毒大戟对肝硬化大鼠炎症反应和纤维化的影响及对晚期糖基化终产物-细胞表面受体-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)信号通路的调节机制。方法将SPF级SD大鼠分为对照组、模型组、阳性组、狼毒大戟组,每组15只。检测大鼠血清中肝功能酶-丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)及肝纤维化指标-透明质酸(HA)、Ⅳ型胶原(CⅣ)、层黏蛋白(LN)和Ⅲ型前胶原(PCⅢ)的含量;检测大鼠血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6和IL-8含量;苏木素-伊红(HE)染色观察肝组织的病理形态变化;实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测肝组织中α-平滑肌动蛋白(SMA)和Ⅰ型胶原(ColⅠ)mRNA的水平;Western印迹检测肝组织中AGE、RAGE蛋白的表达。结果与对照组相比,模型组血清中ALT、AST含量、肝纤维4项HA、CIV、LN和PCⅢ含量、促炎因子TNF-α、IL-6、IL-8含量及肝组织中α-SMA、ColⅠmRNA水平、AGE、RAGE蛋白表达均明显升高(P<0.05);与模型组相比,阳性组和狼毒大戟组血清中ALT、AST含量、肝纤维4项HA、CIV、LN和PCⅢ含量、促炎因子TNF-α、IL-6、IL-8含量及肝组织中α-SMA、ColⅠmRNA水平、AGE、RAGE蛋白表达均明显降低(P<0.05)。结论狼毒大戟可能通过抑制AGE-RAGE信号通路来减轻肝硬化大鼠的炎症反应和纤维化程度。 展开更多
关键词 狼毒大戟 晚期糖基化终产物-细胞表面受体-糖基化终产物受体(age-rage)信号通路 肝硬化 炎症反应 纤维化
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治未病思想在AGE-RAGE信号通路介导的糖尿病性视网膜病变防治中的应用 被引量:7
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作者 汤子珍 王文峰 +4 位作者 王奕然 李悦 武东燕 李钦青 柴金苗 《中国民间疗法》 2021年第10期6-8,共3页
治未病是中医防治疾病发生发展的重要思想,晚期糖基化产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路对糖尿病性视网膜病变(DR)的发生、发展有重要作用。该文从"未病先防、既病防变"角度出发,阐明AGE-RAGE信号通路在DR发生... 治未病是中医防治疾病发生发展的重要思想,晚期糖基化产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路对糖尿病性视网膜病变(DR)的发生、发展有重要作用。该文从"未病先防、既病防变"角度出发,阐明AGE-RAGE信号通路在DR发生、发展中的作用,以寻找新的治疗思路,对DR的防治具有重要意义。 展开更多
关键词 糖尿病性视网膜病变 age-rage信号通路 治未病
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基于AGE-RAGE信号通路探讨坤泰胶囊治疗多囊卵巢综合征模型大鼠的作用机制
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作者 黄进格 张健 +4 位作者 项瑞君 吴元元 何田玉 赵梦妮 王芳 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1082-1090,共9页
旨在探讨坤泰胶囊(Kuntai Capsules,KTC)对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)模型大鼠的影响及可能的作用机制。将50只雌性SD大鼠随机分为5组:对照组,模型组,KTC低、中、高剂量组,每组10只。除对照组外,其余各组采用颈背... 旨在探讨坤泰胶囊(Kuntai Capsules,KTC)对多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)模型大鼠的影响及可能的作用机制。将50只雌性SD大鼠随机分为5组:对照组,模型组,KTC低、中、高剂量组,每组10只。除对照组外,其余各组采用颈背部皮肤注射脱氢表雄酮(dehydroepiandrosterone,DHEA)联合高脂饮食(high-fat diet,HFD)诱导PCOS大鼠模型,造模28 d。将KTC溶于等量生理盐水,分别予以低(0.315 g·kg^(-1)·d^(-1))、中(0.63 g·kg^(-1)·d^(-1))、高(1.26 g·kg^(-1)·d^(-1))剂量进行灌胃,对照组和模型组均给予等量生理盐水,持续灌胃15 d。给药结束后,血糖仪测定空腹血糖(FBG);酶联免疫吸附法(ELISA)测定血清空腹胰岛素(FINS)、黄体生成素(LH)、睾酮(T)、卵泡刺激素(FSH),计算LH/FSH比值和胰岛素抵抗指数(HOMA-IR);苏木素-伊红(HE)染色观察卵巢组织病理形态;蛋白免疫印迹法(Western blot)和免疫荧光法检测Ⅲ型胶原α1链(COL3A1)、凋亡因子Bcl-2关联X的蛋白(Bcl-2 associated X,Bax)和B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)蛋白表达水平;实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time PCR,RT-PCR)检测卵巢组织中COL3A1、Bax、Bcl-2 mRNA表达水平。结果显示,与对照组相比,模型组大鼠体质量、FBG、FINS、LH、T、LH/FSH、HOMA-IR水平均升高(P<0.05或P<0.01),FSH水平下降(P<0.05),其阴道脱落细胞可见大量白细胞,以动情间期为主;卵巢表面囊性突起较多,颗粒细胞层厚度减少,卵母细胞缺失;卵巢组织中COL3A1、Bax蛋白表达水平上升(P<0.01),Bcl-2蛋白表达水平降低(P<0.01),卵巢组织中COL3A1、Bax mRNA表达水平上升(P<0.05)。与模型组相比,KTC低、中、高剂量组大鼠体质量、FBG、FINS、LH、T、LH/FSH、HOMA-IR水平均下降(P<0.05或P<0.01),KTC中、高剂量组FSH水平升高(P<0.05或P<0.01);KTC低、中、高剂量组大鼠逐渐出现稳定的动情周期;卵巢表面较光滑,卵巢组织可见卵母细胞及成熟卵泡,颗粒细胞层厚度增加;KTC低、中剂量组COL3A1蛋白表达水平下降(P<0.05或P<0.01),KTC低剂量组Bax蛋白表达水平下降(P<0.05或P<0.01)、Bcl-2蛋白表达水平上升(P<0.01);KTC低剂量组COL3A1、Bax mRNA表达水平下降(P<0.05),Bcl-2 mRNA表达水平上升(P<0.05)。综上所述,KTC通过调节AGE-RAGE信号通路,抑制卵巢颗粒细胞凋亡,减少卵泡闭锁,促进胰岛素分泌,降低血糖和体质量,恢复血清激素水平,改善PCOS的症状,减轻卵巢形态学损伤,恢复卵巢功能,对PCOS的治疗具有重要价值。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 坤泰胶囊 age-rage信号通路 药物治疗
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基于AGEs-RAGE信号通路研究中药复方益糖康改善大鼠骨骼肌胰岛素抵抗的作用机制 被引量:20
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作者 于嘉祥 张瀚文 +7 位作者 杨宇峰 张文顺 冀天威 曲超 姜楠 吕雪辉 于睿 石岩 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第6期25-30,I0014-I0024,共17页
目的研究益糖康改善大鼠骨骼肌胰岛素抵抗的效果及作用机制。方法8周龄健康雄性Wistar大鼠96只,分别设置空白对照组、模型对照组、益糖康高剂量组、益糖康中剂量组、益糖康低剂量组、西药对照组(盐酸吡格列酮),剂量分别为(40 g/kg、20 g... 目的研究益糖康改善大鼠骨骼肌胰岛素抵抗的效果及作用机制。方法8周龄健康雄性Wistar大鼠96只,分别设置空白对照组、模型对照组、益糖康高剂量组、益糖康中剂量组、益糖康低剂量组、西药对照组(盐酸吡格列酮),剂量分别为(40 g/kg、20 g/kg、10 g/kg、1.35 mg/kg),运用高糖高脂糖尿病模型诱导饲料联合小剂量链唑霉素(STZ)腹腔注射建立胰岛素抵抗动物模型并运用高胰岛素-正葡萄糖钳实验验证,模型判定成功后对各组大鼠按要求进行灌胃给药干预。用稳态胰岛素抵抗指数及胰岛素抗体水平评价给药干预后各组大鼠胰岛素抵抗的变化情况,运用免疫组化及免疫蛋白印迹法对AGEs-RAGE信号通路核心蛋白进行验证。结果胰岛素抵抗动物模型建立成功,药物干预后益糖康高剂量组、中剂量组和西药对照组的稳态胰岛素抵抗指数、胰岛素抗体水平显著降低(P<0.01)。免疫组化与免疫蛋白印迹法结果提示,与空白对照组相比,模型对照组骨骼肌组织的AGEs、RAGE、PKCβⅡ、Egr-1、JNK、JAK2、STAT1、STAT3的蛋白表达水平显著升高;与模型对照组相比,益糖康高剂量组、中剂量组和西药对照组骨骼肌组织中上述蛋白的表达水平显著降低(P<0.01)。结论益糖康可能通过抑制AGE-RAGE通路中的AGEs、RAGE、PKCβⅡ、Egr-1、JNK、JAK2、STAT1、STAT3蛋白的表达水平来发挥抗炎、抑制氧化应激和细胞凋亡的作用,进而改善胰岛素抵抗。 展开更多
关键词 益糖康 胰岛素抵抗 骨骼肌 age-rage信号通路 免疫组化与免疫蛋白印迹法
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神经生长因子改善糖尿病大鼠随意皮瓣缺血坏死的机制
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作者 王晓武 朱仙懂 +4 位作者 王永强 吴志炫 温知楷 吴大洲 陈吉彩 《温州医科大学学报》 CAS 2024年第2期87-98,共12页
目的:探讨神经生长因子(NGF)改善糖尿病大鼠随意皮瓣缺血坏死的分子机制。方法:①建立Wistar大鼠I型糖尿病模型,将这些大鼠随机分为模型组(DM组)和实验组(DM+NGF组)两组,设计9 cm×3 cm的改良McFarlane皮瓣并进行皮瓣移植,观察两组... 目的:探讨神经生长因子(NGF)改善糖尿病大鼠随意皮瓣缺血坏死的分子机制。方法:①建立Wistar大鼠I型糖尿病模型,将这些大鼠随机分为模型组(DM组)和实验组(DM+NGF组)两组,设计9 cm×3 cm的改良McFarlane皮瓣并进行皮瓣移植,观察两组皮瓣的存活情况并统计存活面积。采集大鼠皮瓣组织,利用HE染色和免疫组化染色研究皮瓣存活与血管生成的关系,通过Western blot实验研究两组CD31、VEGF血管指标蛋白表达差异以及AGE-RAGE/MAPK-ERK1/2信号通路的变化。②利用建立的高糖人脐静脉内皮细胞(HUVEC)模型,将细胞实验分为细胞模型组(DM组)和细胞实验组(DM+NGF)组两组,通过CCK-8增殖实验、MCM2+细胞免疫荧光实验、细胞划痕实验、Transwell实验和血管成管实验,分析在高糖环境下NGF对HUVEC细胞的增殖、迁移和血管形成的影响。利用STRING数据库探讨NGF对VEGF、SDF1α、HIF-1α、PDGFA、TGF-β1等常见血管生成相关因子的互作情况以及功能富极化分析;通过RT-qPCR和Western blot验证NGF对其表达的影响。通过RNA-seq测序和Western blot分析NGF对HUVEC的影响机制。结果:动物实验方面:DM+NGF组比DM组皮瓣存活面积多(P<0.01);CD31免疫组化染色发现DM+NGF组CD31阳性微血管密度比DM组高(P<0.01),且DM+NGF组CD31和VEGF表达均较DM组高(P<0.05);而皮瓣组织AGE-RAGE/MAPK-ERK1/2信号通路的RAGE下降(P<0.05),而p-ERK1/2上调(P<0.05)。细胞实验方面:成功建立了25 mmol/L高糖模型,100 ng/mL NGF能促进HUVEC的增殖(P<0.01);与DM组比,DM+NGF组的细胞迁移和细胞血管生成能力明显加强(P<0.01),且DM+NGF组的VEGF、PDGFA、HIF-1α、Arg-1和bFGF相对表达量更高(P<0.05),而KEGG和GO功能富集化富集结果主要与血管形成和AGE-RAGE/MAPK-ERK1/2信号通路途径等相关。结论:NGF可能通过影响AGE-RAGE/MAPK-ERK1/2信号通路促进糖尿病大鼠内皮细胞血管生成,从而改善随意皮瓣的缺血坏死。 展开更多
关键词 缺血皮瓣 转录组学 神经生长因子 age-rage信号通路 血管生成
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基于网络药理学方法分析丁香酚治疗心肌缺血再灌注损伤的作用靶点及相关通路 被引量:1
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作者 韩运祺 石佳琦 +3 位作者 朱秋梦 钱新宇 肖云峰 李文妍 《山东医药》 CAS 2022年第23期15-18,共4页
目的 基于网络药理学方法分析丁香酚治疗心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用靶点及相关通路。方法 将丁香酚“Eugenol”输入TCMSP数据库检索丁香酚作用靶点,将“Myocardial Ischemia Reperfusion Injury”输入GeneCards、OMIM数据库检索MIR... 目的 基于网络药理学方法分析丁香酚治疗心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用靶点及相关通路。方法 将丁香酚“Eugenol”输入TCMSP数据库检索丁香酚作用靶点,将“Myocardial Ischemia Reperfusion Injury”输入GeneCards、OMIM数据库检索MIRI相关靶点;将两者交集后获得丁香酚-MIRI共同靶点,导入String数据库建立蛋白质互作网络(PPI)图,导入Cytoscape3.7.2软件进行聚类分析并寻找核心靶点;将丁香酚-MIRI共同靶点导入Matescape基因富集分析在线工具数据平台,进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 共得到不重复的丁香酚作用靶点100个、MIRI相关靶点1 085个、丁香酚-MIRI共同靶点33个。丁香酚-MIRI共同靶点的PPI图显示每个活性成分平均节点度7.09,PPI富集P值为1×10^(-16)。基于聚类分析的核心靶点筛选结果显示共得到2个基因簇和2个核心基因,核心基因分别为蛋白激酶B-α(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。丁香酚-MIRI共同靶点的GO生物功能富集分析结果显示,其主要涉及的生物学过程包括蛋白质磷酸化的正向调节、离子平衡、细胞迁移等,主要涉及的细胞成分包括突触后膜、膜筏、微膜区等,主要涉及的分子功能包括蛋白激酶活性、血红素结合、转录因子等。丁香酚-MIRI共同靶点的KEGG富集通路共有177条,主要包括晚期糖基化终末产物(AGE)—糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路等。结论 丁香酚治疗MIRI的核心靶点主要有Akt1、VEGFA,主要涉及AGE-RAGE、MAPK、TLR等相关通路。 展开更多
关键词 心肌缺血再灌注损伤 丁香酚 网络药理学 AKT1 VEGFA age-rage信号通路 MAPK信号通路
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基于网络药理学的三黄汤治疗湿疹作用机制研究 被引量:2
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作者 李敏 高燕妮 +1 位作者 杨富金 刘德明 《中药与临床》 2023年第1期54-59,共6页
目的:基于网络药理学方法并结合体外THP-1巨噬细胞炎症模型预测三黄汤治疗湿疹的有效成分及可能作用机制。方法:采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选三黄汤中的活性化学成分,通过GeneCard数据库查找化合物与湿疹共有靶点;采用C... 目的:基于网络药理学方法并结合体外THP-1巨噬细胞炎症模型预测三黄汤治疗湿疹的有效成分及可能作用机制。方法:采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选三黄汤中的活性化学成分,通过GeneCard数据库查找化合物与湿疹共有靶点;采用Cytoscape软件构建“成分-靶点-疾病”网络,利用STRING数据库进行蛋白互作(PPI)网络分析,用DAVID数据库进行基因功能注释分析(GO)和信号通路富集分析(KEGG),预测三黄汤治疗湿疹的作用机制。使用PMA联合脂多糖(LPS)刺激THP-1细胞,同时三黄汤干预,荧光定量(qRT-PCR)、酶联免疫吸附(Elisa)分别检测细胞炎症因子表达,蛋白质印迹法(Western blot)检测相关蛋白表达。结果:共筛选出42个活性化合物,74个共有靶点,分析出91条生物过程,包括细胞因子受体结合、受体配体活性、受体调节活性、转录因子活性调节序列特异性DNA结合、核受体的活动、辅因子结合等。密切相关的通路有AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、人巨细胞病毒感染、C型凝集素受体信号通路、Th17细胞分化等;细胞实验表明三黄汤能够下调PI3K、AKT蛋白表达。结论:本研究揭示了三黄汤通过AGE-RAGE信号通路调控IL-1β、IL-6、IFN-γ等细胞因子发挥治疗湿疹的作用,为探讨三黄汤治疗湿疹的物质基础、作用机制等提供参考。 展开更多
关键词 三黄汤 网络药理学 湿疹 age-rage信号通路
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RNA结合蛋白LIN28对糖尿病肾病的保护机制研究
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作者 王艳丽 李雁 +6 位作者 叶芳 孙燕 侯俊霞 程洁萍 艾比班 李金峰 张新菊 《局解手术学杂志》 2023年第12期1048-1053,共6页
目的探索RNA结合蛋白LIN28对糖尿病肾病(DN)的保护机制。方法在HEK 293T细胞中通过腺病毒介导过表达或敲低LIN28。通过RNA-Seq转录组测序和生物信息学分析获得过表达LIN28后显著改变的基因和功能信号通路。体外过表达LIN28实验分组为Con... 目的探索RNA结合蛋白LIN28对糖尿病肾病(DN)的保护机制。方法在HEK 293T细胞中通过腺病毒介导过表达或敲低LIN28。通过RNA-Seq转录组测序和生物信息学分析获得过表达LIN28后显著改变的基因和功能信号通路。体外过表达LIN28实验分组为Control组、Treatment组、Adv-LIN28-OE+D-核糖组和Adv-LIN28-NC+D-核糖组;敲低LIN28实验分组为Control组、Treatment组、Adv-shRNA LIN28+D-核糖组和Adv-shRNA NT+D-核糖组。通过ELISA法测定上述各组细胞上清液人晚期糖基化终产物(AGEs)的水平。通过Western blot法测定上述各组细胞内RAGE、NF-κB和MMP-2的表达水平。结果RNA-Seq转录组测序和GO分析及KEGG分析结果显示,过表达LIN28导致HEK 293T细胞内AGE-RAGE信号通路显著下调(P<0.05)。ELISA结果显示,与Control组相比,Treatment组细胞产生大量AGEs(P<0.05);与Treatment组相比,Adv-LIN28-OE+D-核糖组细胞AGEs水平明显降低(P<0.05),Adv-shRNA LIN28+D-核糖组细胞AGEs水平显著升高(P<0.05)。Western blot结果显示,与Control组相比,Treatment组细胞内RAGE、NF-κB和MMP-2的表达水平显著升高(P<0.05);与Treatment组相比,Adv-LIN28-OE+D-核糖组细胞内RAGE、NF-κB和MMP-2的表达水平显著降低(P<0.05),Adv-shRNA LIN28+D-核糖组细胞内RAGE、NF-κB和MMP-2的表达水平则显著升高(P<0.05)。结论在体外细胞水平上通过腺病毒过表达LIN28,能够导致数千种基因发生显著性差异表达,特别是能够抑制在DN疾病进展中十分关键的糖尿病-并发症相关AGE-RAGE信号通路,发挥保护DN的作用。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 LIN28 腺病毒 age-rage信号通路 NF-ΚB MMP-2
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基于网络药理学和动物实验探讨黄芪葛根汤治疗糖尿病肾病的作用
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作者 于官正 李鸿 +3 位作者 涂星 刘音贝 罗骞 张燕 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3097-3103,共7页
目的基于网络药理学和动物实验探讨黄芪葛根汤治疗糖尿病肾病的作用。方法分别采用GEO数据库与TCMSP、TCMID、TCMIP数据库筛选DN差异基因和复方有效成分与靶点,构建调控网络,筛选核心基因,进行KEGG和GO富集分析。将大鼠随机分为正常组... 目的基于网络药理学和动物实验探讨黄芪葛根汤治疗糖尿病肾病的作用。方法分别采用GEO数据库与TCMSP、TCMID、TCMIP数据库筛选DN差异基因和复方有效成分与靶点,构建调控网络,筛选核心基因,进行KEGG和GO富集分析。将大鼠随机分为正常组、模型组、盐酸二甲双胍组(0.15 g/kg)和黄芪葛根汤低、中、高剂量组(2.5、5、10 g/kg),采用高脂高糖饮食联合链脲佐菌素腹腔注射建立DN大鼠模型,并分别给予相应药物干预。给药8周后测定FBG、BUN、Scr和UA水平,HE染色观察肾组织形态学,ELISA法检测TNF-α、AGEs、VCAM-1、MCP-1水平及肾组织VCAM-1、NF-κB p65水平,免疫组化法检测RAGE蛋白阳性表达率。结果网络药理学获得黄芪葛根汤活性成分23个,靶点191个;DN差异基因638个;复方与疾病交集基因21个;PPI核心基因为CASP3、VEGFA等;涉及AGE-RAGE通路、HIF-1等信号通路。动物实验显示,与模型组比较,黄芪葛根汤高剂量组大鼠FBG,血清BUN、Scr、UA、AGEs、TNF-α、VCAM-1、MCP-1水平,肾组织VCAM-1、NF-κB p65水平及RAGE蛋白阳性表达均降低(P<0.05);透射电镜可见各给药组大鼠肾小球基底增厚和足细胞足突融合情况均有不同程度的减轻,以黄芪葛根汤高剂量组尤为显著。结论黄芪葛根汤可能通过调节AGE-RAGE信号通路减轻DN大鼠肾脏损伤,发挥治疗作用。 展开更多
关键词 黄芪葛根汤 糖尿病肾病 网络药理学 GEO基因芯片 age-rage信号通路
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三七配伍生蒲黄治疗糖尿病视网膜病变的网络药理学分析 被引量:7
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作者 于坷鑫 邓夏烨 +3 位作者 孙河 董霏雪 张雪松 薛晓蕊 《中国中医眼科杂志》 2022年第2期157-163,共7页
目的运用网络药理学分析方法,初步探讨三七配伍生蒲黄抗糖尿病视网膜病变(DR)的潜在作用机制。方法通过TCMSP检索并筛选三七与生蒲黄的活性成分及药物靶点。借助多个数据库检索获得DR相关靶点。通过Venny2.1.0工具获得药物与疾病的交集... 目的运用网络药理学分析方法,初步探讨三七配伍生蒲黄抗糖尿病视网膜病变(DR)的潜在作用机制。方法通过TCMSP检索并筛选三七与生蒲黄的活性成分及药物靶点。借助多个数据库检索获得DR相关靶点。通过Venny2.1.0工具获得药物与疾病的交集靶点。利用Cytoscape3.7.2软件绘制蛋白互作网络图及药物-活性成分-靶点-疾病网络图,并进行网络拓扑学分析;利用R软件Bioconductor的工具包进行基因本体学(GO)功能分析和Kyoto基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,得到关键靶点及潜在作用通路。结果筛选出三七与生蒲黄中148个化合物、330个相应作用靶点,预测出与DR相关靶点159个,GO功能富集分析得到93个关键基因,KEGG通路富集分析得到154条信号通路。结论三七配伍生蒲黄防治DR的作用机制,主要涉及GAPDH、INS、CAT、IL-6、VEGFA等靶点基因,可能通过调控AGE-RAGE、HIF-1等信号通路,改善DR的糖/脂/蛋白代谢异常、氧化应激以及炎症反应。 展开更多
关键词 三七 生蒲黄 糖尿病视网膜病变 网络药理学 age-rage信号通路
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基于网络药理学探究温补固肾方治疗糖尿病肾病的作用机制及实验验证 被引量:3
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作者 禹静 刘续春 李振华 《中医药信息》 2022年第12期27-34,共8页
目的:基于网络药理学探讨温补固肾方(WBGSF)治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选WBGSF有效活性成分及潜在靶点,在GeneCard、OMIM和TTD数据库中寻找DN相关靶点基因,选取WBGSF靶点基因与D... 目的:基于网络药理学探讨温补固肾方(WBGSF)治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选WBGSF有效活性成分及潜在靶点,在GeneCard、OMIM和TTD数据库中寻找DN相关靶点基因,选取WBGSF靶点基因与DN相关靶点基因的共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“WBGSF活性成分-潜在靶点-DN”网络图。运用STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络图。对潜在靶点基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。SD大鼠随机分为对照组(Control)、糖尿病肾病组(DN)和WBGSF低、中、高剂量组。采用链脲佐菌素腹腔注射构建DN模型大鼠。模型构建成功后WBGSF各剂量组大鼠分别给予0.92、1.84、3.68g/kgWBGSF灌胃,每日1次,连续给药12周;Control组和DN组大鼠采用生理盐水灌胃,每日1次,连续给药12周。12周后检测各组大鼠血糖、尿素氮、肌酐、24 h尿蛋白和肾脏组织病理学变化、肾组织AGEs和RAGE含量以及RAGE蛋白表达。结果:数据库筛选得到WBGSF有效活性成分81个,与DN相关潜在作用靶基因148个,KEGG富集通路分析主要包括脂质-动脉粥样硬化信号通路、AGE-RAGE信号通路以及流体剪切应力和动脉粥样硬化通路等。与Control组相比,DN大鼠血糖、尿素氮、肌酐以及24h尿蛋白含量均明显升高(P<0.01),肾组织出现明显的病理学改变,肾组织AGEs和RAGE含量升高,RAGE蛋白表达增加(P<0.01)。与DN组相比,WBGSF各剂量组大鼠血清相关生化指标降低,肾组织损伤得到明显恢复,AGEs和RAGE含量降低、RAGE蛋白表达降低(P<0.05或P<0.01)。结论:WBGSF具有多种活性成分,能通过多靶点、多通路发挥DN肾保护作用;动物实验证实,WBGSF能够改善DN肾损伤,其机制与调控AGE-RAGE信号通路相关。 展开更多
关键词 网络药理学 温补固肾方 糖尿病肾病 作用机制 age-rage信号通路
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基因表达差异在糖尿病肾脏疾病发生和发展中的作用 被引量:2
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作者 陈利婷 岳锐 +1 位作者 王喜悦 孔凡武 《临床肾脏病杂志》 2021年第10期811-818,共8页
目的糖尿病肾脏疾病(dabetic kidney disease,DKD)的发病机制较为复杂,是一种涉及多基因、多步骤的异常代谢过程。因此需要寻找对DKD发生和发展起到关键作用的基因。方法用生物信息技术,选取DKD相关数据,用R软件对数据进行差异基因筛选... 目的糖尿病肾脏疾病(dabetic kidney disease,DKD)的发病机制较为复杂,是一种涉及多基因、多步骤的异常代谢过程。因此需要寻找对DKD发生和发展起到关键作用的基因。方法用生物信息技术,选取DKD相关数据,用R软件对数据进行差异基因筛选,找出影响DKD的关键基因。结果在GSE30528中我们筛选的差异基因有133个,GSE1009数据中有704个差异基因,GSE30529中有134个差异基因。并且,这些基因多与肾脏发育、胶原三聚体聚集、补体和凝血级联反应以及AGE-RAGE信号通路相关。结论(1)参与肾小球滤过细胞分化的基因VEGFA、MAGI2、NPHS1影响DKD肾小球结构改变;(2)参与肾小管及小管间质炎症细胞活化和胶原形成的基因S100A9、FCER1G、C3AR1、CXCL1、ITGB2、COL1A2、LUM影响DKD肾小管间质纤维化;(3)AGE-RAGE信号通路的COL4A3及其家族基因以及补体和凝血级联反应的F2R、F5、F3、C3等基因参与DKD的发展。 展开更多
关键词 糖尿病肾脏疾病 GEO数据库 基因表达谱 age-rage信号通路
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苍附导痰汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征的网络药理学研究 被引量:9
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作者 蔡孟成 金永生 +1 位作者 俞超芹 程雯 《Digital Chinese Medicine》 2020年第3期148-162,共15页
目的应用网络药理学和生物信息学方法,探讨苍附导痰汤干预肥胖型多囊卵巢综合征的作用机制。方法从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索苍附导痰汤的活性成分和靶点,从GeneCard数据库中检索肥胖型多囊卵巢综合征的靶点,利用STR... 目的应用网络药理学和生物信息学方法,探讨苍附导痰汤干预肥胖型多囊卵巢综合征的作用机制。方法从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索苍附导痰汤的活性成分和靶点,从GeneCard数据库中检索肥胖型多囊卵巢综合征的靶点,利用STRING软件构建苍附导痰汤成分靶点与疾病靶点交集的蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Bioconductor数据库进行GO和KEGG富集分析。结果根据口服生物利用度(OB)和药物相似性(DL),共筛选出114种活性成分及328个与活性成分相关的靶点,从GeneCard数据库中获得2559个与肥胖型多囊卵巢综合征相关的靶点,将两部分交集所得的82个基因构建PPI网络。这些基因主要与甾体激素、营养水平、脂多糖等生物过程有关;它们的分子功能主要与核受体活性、磷酸酶结合和细胞因子活性有关,并主要富集在细胞质、细胞膜部位。结论苍附导痰汤中的114种活性成分是其药效的重要基础,它们通过调节AGE-RAGE、膀胱癌、乙型肝炎信号通路发挥效应,以上发现为苍附导痰汤治疗肥胖型多囊卵巢综合征提供了一定理论依据。 展开更多
关键词 苍附导痰汤 多囊卵巢综合征 网络药理学 槲皮素 age-rage信号通路
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基于网络药理学和动物实验研究麝香通心滴丸防治糖尿病心肌病的作用机制
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作者 白亚利 崔鑫钰 +4 位作者 袁悦莹 张雨婷 王伟 刘天华 吴晏 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1905-1914,共10页
通过网络药理学、分子对接及动物实验探究麝香通心滴丸(Shexiang Tongxin Dropping Pills,STDP)防治糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)的作用机制。借助BATMAN、TCMSP、GeneCards等数据库筛选STDP防治DCM的活性成分及作用靶点... 通过网络药理学、分子对接及动物实验探究麝香通心滴丸(Shexiang Tongxin Dropping Pills,STDP)防治糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)的作用机制。借助BATMAN、TCMSP、GeneCards等数据库筛选STDP防治DCM的活性成分及作用靶点,利用STRING数据库及Cytoscape软件构建STDP防治DCM作用靶点的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein inte-raction,PPI)网络及“药物-活性成分-靶点”网络,通过DAVID数据库对作用靶点进行GO和KEGG富集分析,采用AutoDock Vina软件对关键信号通路核心受体蛋白与其对应活性成分进行分子对接验证。采用高脂喂养联合腹腔注射链脲佐菌素的方法建立DCM大鼠模型,分为对照组、模型组、STDP低剂量组(20 mg·kg^(-1))、STDP高剂量组(40 mg·kg^(-1))、二甲双胍组(200 mg·kg^(-1));连续给药8周后超声心动图检测各组大鼠心功能,苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察各组大鼠心肌病理改变,天狼猩红染色检测各组大鼠心肌胶原纤维沉积,WGA染色检测心肌肥大程度,蛋白免疫印迹法检测各组大鼠心肌组织中p38丝裂原活化蛋白激酶(p38 mitogen-activated protein kinase,p38)、磷酸化p38(phosphorylation-p38,p-p38)、c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK)、磷酸化JNK(phosphorylation-JNK,p-JNK)、caspase-3及C-caspase-3蛋白的表达。网络药理学筛选得到STDP活性成分199种,对应靶点1655个,与463个DCM疾病靶点取交集,得到134个STDP防治DCM的潜在作用靶点,并筛选出糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路;分子对接结果显示miltirone、dehydromiltirone和tryptanthrin与RAGE均有较好的结合力。动物实验结果证实,STDP可有效保护DCM大鼠心功能,与模型组比较,STDP低、高剂量组p-p38、p-JNK、C-caspase-3蛋白表达水平均显著降低。综上,SDTP可能通过影响AGE-RAGE信号通路发挥对DCM大鼠心功能的保护作用。 展开更多
关键词 麝香通心滴丸 糖尿病心肌病 网络药理学 分子对接 动物实验 age-rage信号通路 心功能
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基于UPLC-Q-orbitrap-MS技术探究西黄丸抗乳腺增生的作用机制
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作者 王婧瑞 陶蕊 +2 位作者 马学莉 王俊亮 韩涛 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期214-224,共11页
基于UPLC-Q-orbitrap-MS与生物网络分析工具系统分析西黄丸改善乳腺组织增生的作用机制。肌注苯甲酸雌二醇和黄体酮建立乳腺增生大鼠模型,采用LC-MS的组织代谢组学探索西黄丸改善乳腺组织增生的关键代谢物和代谢途径。整合生物网络分析... 基于UPLC-Q-orbitrap-MS与生物网络分析工具系统分析西黄丸改善乳腺组织增生的作用机制。肌注苯甲酸雌二醇和黄体酮建立乳腺增生大鼠模型,采用LC-MS的组织代谢组学探索西黄丸改善乳腺组织增生的关键代谢物和代谢途径。整合生物网络分析工具对西黄丸调节的关键代谢物进行网络分析,聚焦关键代谢通路,挖掘西黄丸改善乳腺组织增生的潜在靶点。与空白组比,模型组大鼠组织中有49种差异代谢物含量有显著差异(P<0.05),西黄丸能显著回调L-丙氨酸、苏氨酸、吲哚-3-羧酸醛、赖氨酸、精氨酸、丙氨酰亮氨酸、甘氨酰络氨酸、γ-谷氨酰亮氨酸、维生素B3、丝氨酰亮氨酸、苏氨酰亮氨酸、异亮氨酰谷氨酸、γ-谷氨酰酪氨酸、癸酰-L-肉碱、2,6,8-三羟基嘌呤、亮氨酰亮氨酸、S-腺苷-蛋氨酸等17种代谢物。对西黄丸调控的关键代谢物进一步网络分析及文献研究表明,晚期糖基化终末产物(AGE)-晚期糖基化终产物受体(RAGE)信号通路可能是西黄丸改善乳腺组织增生的重要通路之一,AGE-RAGE信号通路上的STAT3、MAPK1、EGFR、CASP3、CASP8、PRKCA、JUN等7个蛋白可能为西黄丸改善乳腺组织增生的潜在作用靶点。本文涉及的动物实验操作均遵循甘肃中医药大学动物伦理委员会的规定并通过动物实验伦理审查(批号:2022-705)。 展开更多
关键词 乳腺增生 UPLC-Q-orbitrap-MS age-rage信号通路 西黄丸
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姚娓治疗不寐的经验总结及潜在新方作用机制研究
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作者 鞠文雪 姚娓 《中国中医基础医学杂志》 CAS 2024年第5期857-864,共8页
目的基于中医传承辅助平台挖掘姚娓教授治疗不寐的用药规律,探究潜在新方治疗不寐的作用机制。方法收集门诊不寐病例200例,运用中医传承辅助平台建立数据库并对处方药物进行四气五味、归经、频次统计、组方规律、潜在新方等分析,挖掘姚... 目的基于中医传承辅助平台挖掘姚娓教授治疗不寐的用药规律,探究潜在新方治疗不寐的作用机制。方法收集门诊不寐病例200例,运用中医传承辅助平台建立数据库并对处方药物进行四气五味、归经、频次统计、组方规律、潜在新方等分析,挖掘姚娓教授的用药规律及组方思想,利用网络药理学方法探究潜在新方的有效成分、靶点及信号通路。结果200个处方共涉及59个方剂和168味药物,分析得到核心药组为“炙甘草-半夏-茯苓-枳实-党参-陈皮-柴胡-黄芩”,选取潜在新方“木香-佛手-白术-藿香-青皮-诃子-五味子-厚朴”进行网络药理学研究,筛选后得到44个有效活性成分,得到104个“异病同治”的作用靶点,关键活性成分包括槲皮素、柚皮素、豆甾醇、川陈皮素、鸢尾素等,在蛋白互作网络中可筛选出包括白介素(interleukin,IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(protein kinasesB,PKB,又称AKT1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白介素(interleukin,IL)-1β、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGFA)、胱天蛋白酶(recombinant caspase,CASP)3、过氧化物酶体增生激活受体γ(peroxisome proliferative activated receptor gamma,PPARG)、IL-8(又称趋化因子CXCL8)等频次较高(均高于50)的靶蛋白,并对以上关键靶点进行基因本体(geneontology,GO)功能富集分析和京都基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genesand genome,KEGG)通路富集分析,发现潜在新方治疗不寐与糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等有关。结论姚娓教授认为不寐的核心病机为“脾虚肝郁,气血不和,神魂不安”,治疗注重调畅气机、调脾之本、心肝同治等,潜在新方可能通过AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等发挥治疗不寐的作用。 展开更多
关键词 姚娓 不寐 异病同治 age-rage信号通路
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基于网络药理学的肿节风治疗前列腺癌的作用机制探讨 被引量:2
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作者 李晓 李灿楦 +2 位作者 林晏廷 徐争光 陈洁 《现代药物与临床》 CAS 2021年第7期1354-1360,共7页
目的利用网络药理学方法探讨肿节风治疗前列腺癌的可能作用机制。方法通过TCMSP、Uniprot、GeneCards在线数据库筛选肿节风活性化合物治疗前列腺癌的潜在靶点,利用Cytoscape软件构建前列腺癌-肿节风-靶点网络图,然后结合STRING数据库和C... 目的利用网络药理学方法探讨肿节风治疗前列腺癌的可能作用机制。方法通过TCMSP、Uniprot、GeneCards在线数据库筛选肿节风活性化合物治疗前列腺癌的潜在靶点,利用Cytoscape软件构建前列腺癌-肿节风-靶点网络图,然后结合STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络;最后利用R软件对靶点进行GO分类富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制,并构建靶点通路网络。结果从肿节风中筛选出活性成分10个,其与前列腺癌共同作用靶点170个,GO功能分析发现靶点主要与膜伐、对氧水平、泛素样蛋白连接酶结合等有关。KEGG通路分析发现肿节风治疗前列腺癌主要与糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、前列腺癌(PCa)、流体剪切应力(FSS)与动脉粥样硬化(AS)等通路密切相关。结论肿节风活性成分可能通过多靶点、多通路达到治疗及辅助治疗前列腺癌的目的。 展开更多
关键词 肿节风 前列腺癌 网络药理学 信号通路 age-rage信号通路
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基于网络药理学探讨薤白治疗肺癌的作用机制 被引量:3
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作者 卢可 方刚 《湖南中医杂志》 2020年第6期142-147,158,共7页
目的:运用网络药理学预测薤白治疗肺癌有效成分的作用靶点及通路。方法:通过TCMSP数据库获取薤白有效成分及作用靶点,并运用Cytoscape 3.7.1软件构建靶点间相互作用网络并进行关联分析,R×643.5.3软件及相应脚本筛选出薤白治疗肺癌... 目的:运用网络药理学预测薤白治疗肺癌有效成分的作用靶点及通路。方法:通过TCMSP数据库获取薤白有效成分及作用靶点,并运用Cytoscape 3.7.1软件构建靶点间相互作用网络并进行关联分析,R×643.5.3软件及相应脚本筛选出薤白治疗肺癌的有效成分及作用靶点,生物信息学技术富集通路及生物过程。结果:预测得到薤白治疗肺癌有效成分11个和有效靶点30个,并推断其作用机制可能与AGE-RAGE、PI3K-Akt等信号通路有关,且JUN、MAPK1、MAPK3等靶点基因可能起着关键性的作用。结论:基于网络药理学探讨了薤白治疗肺癌多成分-多靶点-多通路的作用特点,为进一步开展薤白治疗肺癌作用机制的研究提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 薤白 网络药理学 肺癌 age-rage信号通路 PI3K-AKT信号通路
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花椒治疗抑郁作用机制的网络药理学研究
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作者 魏媛媛 陈宛璐 +7 位作者 曾世杰 苏君怡 李睿琪 王一然 胡浩 孙瑞阳 陈瀚锐 王丽凤 《医药论坛杂志》 2022年第3期9-15,共7页
目的运用网络药理学预测花椒抗抑郁症有效成分的作用靶点及通路。方法通过TCMSP数据库结合文献获取花椒有效成分,通过SwissTarget、Targetnet数据库获取花椒的作用靶点。GeneCards、OMIM、TTD数据库获取花椒治疗抑郁症的相关基因。运用S... 目的运用网络药理学预测花椒抗抑郁症有效成分的作用靶点及通路。方法通过TCMSP数据库结合文献获取花椒有效成分,通过SwissTarget、Targetnet数据库获取花椒的作用靶点。GeneCards、OMIM、TTD数据库获取花椒治疗抑郁症的相关基因。运用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络。通过Cytoscape软件进行拓扑分析,筛选出关键靶点。使用Metascape数据库对关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。运用Chem3D、PyMOL和AutoDock Vina软件对花椒活性成分和关键靶点进行分子对接。结果预测获取花椒治疗抑郁症的有效成分12个和有效靶点78个。推测其作用机制可能与MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等有关,TP53、MAPK1、AKT1等靶点基因可能起着关键性作用。分子对接显示花椒的4个主要活性成分:槲皮素、香叶木素、香柑内酯、脱肠草素与有效靶点有较好的结合能力。结论基于网络药理学探讨了花椒治疗抑郁症多成分-多靶点-多通路的作用特点,为进一步开展花椒治疗抑郁症作用机制研究提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 花椒 网络药理学 抑郁症 MAPK信号通路 age-rage信号通路 IL-17信号通路
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