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杏衰退萎黄病病毒的siRNA高通量测序和RT-PCR鉴定 被引量:8
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作者 陈雅寒 马强 +2 位作者 孙平平 张磊 李正男 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期725-733,共9页
为了明确引起杏衰退萎黄病的病毒种类,利用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)高通量测序技术,结合生物信息寻找杏衰退萎黄样品中的病毒序列,发现存在亚洲李属病毒1(Asian prunus virus 1,APV1)和亚洲李属病毒3(Asian prunus virus... 为了明确引起杏衰退萎黄病的病毒种类,利用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)高通量测序技术,结合生物信息寻找杏衰退萎黄样品中的病毒序列,发现存在亚洲李属病毒1(Asian prunus virus 1,APV1)和亚洲李属病毒3(Asian prunus virus 3,APV3)。为了验证该结果,采用RT-PCR对10个待测杏样品进行APV1、APV2和APV3检测,所有样品中未检测到APV2,检出APV1和APV3的样品数分别为3和4个。对检测到病毒的外壳蛋白(coat protein,CP)进行测序和系统进化分析,分别获得了3条653 bp的APV1和4条1031 bp(或1032 bp)的APV3 CP基因片段;3条APV1 CP基因核苷酸序列一致性为99.2%~99.8%,与NCBI中已发表的26个APV1 CP基因序列一致性为44.0%~99.8%;4条APV3 CP基因序列一致性为78.5%~99.5%,与NCBI中已发表的26个APV3 CP基因序列一致性为44.7%~99.5%。 展开更多
关键词 衰退萎黄病 APV1 apv3 SIRNA
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