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海洋细菌Agarivorans sp.HZ105的琼胶降解酶系 被引量:3
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作者 林伯坤 陆国永 +3 位作者 宋燕 谢锐权 陈鸿霖 胡忠 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期160-166,共7页
通过克隆得到菌株Agarivorans sp.HZ105中3个琼胶酶基因,长度分别为2 988 bp、1 437 bp和1 362 bp,分别编码琼胶酶HZ1、HZ3和HZ4,分别属于糖苷水解酶GH50、GH118和GH16家族。将这些琼胶酶基因与质粒p ET-32(a)构建重组表达载体,转化大... 通过克隆得到菌株Agarivorans sp.HZ105中3个琼胶酶基因,长度分别为2 988 bp、1 437 bp和1 362 bp,分别编码琼胶酶HZ1、HZ3和HZ4,分别属于糖苷水解酶GH50、GH118和GH16家族。将这些琼胶酶基因与质粒p ET-32(a)构建重组表达载体,转化大肠杆菌BL21(DE3),实现了琼胶酶基因的重组原核表达,制备了重组酶,研究了琼胶酶的酶解产物。琼胶酶HZ1降解琼脂糖以及高聚合度新琼寡糖(聚合度为8、10、12和14)得到新琼二糖和新琼四糖;琼胶酶HZ3降解琼脂糖的终产物是高聚合度新琼寡糖;琼胶酶HZ4降解琼脂糖和高聚合度新琼寡糖为新琼四糖和新琼六糖。因此推测菌株HZ105主要先用琼胶酶HZ3和HZ4降解琼脂糖为较高聚合度的新琼寡糖,随后这些寡糖被琼胶酶HZ1和HZ2(课题组先前报道的另一个琼胶酶)降解为低聚合度新琼寡糖。首次研究报道了Agarivorans属中能产生4个琼胶酶的细菌菌株及其琼胶降解酶系,丰富了有关细菌降解琼胶酶体系及其中各琼胶酶作用的研究和认识,也有利于菌株HZ105琼胶酶的有效开发应用。 展开更多
关键词 琼胶酶 基因克隆 agarivorans 酶系 降解产物
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白色噬琼胶菌QM38 β-琼胶酶基因agaD02的克隆与表达 被引量:6
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作者 王静 马吉飞 +2 位作者 苗婷婷 李兆杰 杜宗军 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期6-10,40,共6页
从白色噬琼胶菌(Agarivorans albus)QM38基因组中扩增到一段编码β-琼胶酶的DNA序列,命名为agaD02。序列相似性分析的结果表明,基因agaD02和弧菌Vibrio sp.JT0107及Vibrio sp.PO-303的琼胶酶基因具有同源性,其相似性程度分别为98.7%和97... 从白色噬琼胶菌(Agarivorans albus)QM38基因组中扩增到一段编码β-琼胶酶的DNA序列,命名为agaD02。序列相似性分析的结果表明,基因agaD02和弧菌Vibrio sp.JT0107及Vibrio sp.PO-303的琼胶酶基因具有同源性,其相似性程度分别为98.7%和97.4%,而同GenBank中的其他序列同源性很低。对此基因的序列进行了分析,结果表明,其开放阅读框长度为2 868 bp,编码的蛋白质包含955个氨基酸,在蛋白数据库中的编号为ABM90422,推测其分子质量为106 ku,等电点为4.87。利用网上数据库资源和生物学软件对预测的琼胶酶蛋白序列进行了同源性分析和结构分析。设计两端含酶切位点的特定引物,克隆agaD02基因,构建入表达载体pET24a(+),转化大肠杆菌BL21(DE3),转化后提取质粒进行酶切和电泳验证,转化后的大肠杆菌经诱导可产生胞外琼胶酶。 展开更多
关键词 琼胶酶 白色噬琼胶菌(agarivorans albus) 克隆 序列分析 表达
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新型产琼胶酶海洋细菌的筛选和鉴定 被引量:5
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作者 刘丽莉 祖国仁 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第20期4831-4834,共4页
从大连沿海的50份石花菜中筛选出相对酶活较高的83株产琼胶酶菌株(酶活力测定采用3,5-二硝基水杨酸法),挑选琼胶酶活力最高的菌株并通过形态学特征、生理生化特征及16S r RNA基因序列分析研究其分类地位。结果表明,该菌株(暂命名为ZGR-... 从大连沿海的50份石花菜中筛选出相对酶活较高的83株产琼胶酶菌株(酶活力测定采用3,5-二硝基水杨酸法),挑选琼胶酶活力最高的菌株并通过形态学特征、生理生化特征及16S r RNA基因序列分析研究其分类地位。结果表明,该菌株(暂命名为ZGR-26)为革兰氏阴性杆菌,与食琼胶弧菌(Vibrio agarivorans)序列同源性达到99%,两者生理生化特性基本相符,可初步确定为食琼胶弧菌(Vibrio agarivorans)。筛选得到了新型的产琼胶酶海洋细菌——食琼胶弧菌(Vibrio agarivorans),分泌琼胶酶活力较高(32.1 U/m L),为微生物降解法生产琼胶寡糖提供了新的出发菌株。 展开更多
关键词 琼胶酶 筛选与鉴定 16S RRNA 食琼胶弧菌(Vibrio agarivorans)
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Identification and preliminary characterization of novel B3-type metallo-β-lactamases
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作者 Manfredi Miraula Conor SBrunton +1 位作者 Gerhard Schenk Natasa Mitić 《American Journal of Molecular Biology》 2013年第4期198-203,共6页
Antibiotic resistance has emerged as a major global threat to human health. Among the strategies employed by pathogens to acquire resistance the use of metallo-β-lactamases (MBLs), a family of dinuclear metalloenzyme... Antibiotic resistance has emerged as a major global threat to human health. Among the strategies employed by pathogens to acquire resistance the use of metallo-β-lactamases (MBLs), a family of dinuclear metalloenzymes, is among the most potent. MBLs are subdivided into three groups (i.e. B1, B2 and B3) with most of the virulence factors belonging to the B1 group. The recent discovery of AIM-1, a B3-type MBL, however, has illustrated the potential health threat of this group of MBLs. Here, we employed a bioinformatics approach to identify and characterize novel B3-type MBLs from Novosphingobium pentaromativorans and Simiduia agarivorans. These enzymes may not yet pose a direct risk to human health, but their structures and function may provide important insight into the design and synthesis of a still elusive universal MBL inhibitor. 展开更多
关键词 Antibiotic Resistance β-Lactam Antibiotics Metallo-β-Lactamases Sequence Homology Novosphingobium Pentaromativorans Simiduia agarivorans
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