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应用高速逆流色谱一次性分离白豆蔻中5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮
被引量:
3
1
作者
朱云霞
刘雯
+3 位作者
张继全
沈平孃
王玲玲
卓超
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1750-1754,共5页
目的研究高速逆流色谱分离白豆蔻中黄酮醇类活性成分的方法。方法利用高速逆流色谱技术,采用正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水作为两相溶剂系统,上相为固定相,下相为流动相,转速为900 r/min,体积流量为1.2 mL/min。结果一次性从白豆蔻黄酮醇类...
目的研究高速逆流色谱分离白豆蔻中黄酮醇类活性成分的方法。方法利用高速逆流色谱技术,采用正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水作为两相溶剂系统,上相为固定相,下相为流动相,转速为900 r/min,体积流量为1.2 mL/min。结果一次性从白豆蔻黄酮醇类物质中分离得到5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮。通过EI-MS、1H-NMR和13C-NMR鉴定,HPLC检测分析,纯度达98%以上。结论利用高速逆流色谱技术可从白豆蔻中分离制备5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮,分离度好,产物纯度较高。
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关键词
高速逆流色谱
白豆蔻
5-羟基-3
7
4'-三甲氧基黄酮
下载PDF
职称材料
豆蔻属药用植物叶绿体基因组密码子偏性分析
被引量:
23
2
作者
马孟莉
张薇
+3 位作者
孟衡玲
王田涛
李春燕
卢丙越
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3661-3670,共10页
目的明确豆蔻属药用植物叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素。方法以草果Amomum tsao-ko、阳春砂Amomum villosum、白豆蔻Amomum kravanh和爪哇白豆蔻Amomum compactum叶绿体基因组50个共有蛋白编码基因为材料,利用Codon...
目的明确豆蔻属药用植物叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素。方法以草果Amomum tsao-ko、阳春砂Amomum villosum、白豆蔻Amomum kravanh和爪哇白豆蔻Amomum compactum叶绿体基因组50个共有蛋白编码基因为材料,利用CodonW 1.4.2软件、CUSP在线程序和Excel软件等分析基因密码子使用偏性参数和核苷酸组成。结果 4个豆蔻属物种叶绿体基因组具有相似的密码子使用模式,密码子第3位碱基GC含量为37.22%~37.31%,偏向使用NNA和NNT型密码子;4个物种的有效密码子数值(ENC)均在35以上,表明豆蔻属叶绿体基因组密码子偏性较弱。综合中性分析、有效密码子数(ENC-plot)分析、奇偶偏好性(PR2-plot)分析和对应性分析的结果显示豆蔻属叶绿体基因组密码子偏性主要受选择影响,同时突变等其它因素也对密码子的偏性产生一定的作用。在草果、阳春砂、白豆蔻和爪哇白豆蔻中分别确定了18、16、16、18个最优密码子,其中共有最优密码子13个。结论豆蔻属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基偏向使用A/T结尾,密码子偏性受选择影响最大,同时还受到诸如突变等其它因素的影响。
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关键词
草果
阳春砂
白豆蔻
爪哇白豆蔻
叶绿体基因组
密码子偏性
最优密码子
原文传递
草果叶绿体基因组特征及系统发育分析
被引量:
16
3
作者
马孟莉
张薇
+1 位作者
孟衡玲
卢丙越
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第19期6023-6031,共9页
目的明确草果Amomumtsao-ko叶绿体基因组结构特征及其在姜科的进化地位。方法利用IlluminaHiseq4000测序平台对草果叶绿体基因组进行测序,通过生物信息学分析方法进行序列组装、注释和特征分析,并以绿苞闭鞘姜为外类群,通过MEGA6软件构...
目的明确草果Amomumtsao-ko叶绿体基因组结构特征及其在姜科的进化地位。方法利用IlluminaHiseq4000测序平台对草果叶绿体基因组进行测序,通过生物信息学分析方法进行序列组装、注释和特征分析,并以绿苞闭鞘姜为外类群,通过MEGA6软件构建ML系统发育树,分析姜科物种间系统发育关系。结果草果叶绿体基因组全长163 648 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶含量(guanine-cytosine content,GC)为36.0%,包括一对29 776 bp的反向重复区(IRs)、一个大单拷贝区(LSC,88 741 bp)和一个小单拷贝区(SSC,15 355 bp);共注释得到113个基因,包括4个rRNA基因、30个t RNA基因和79个蛋白编码基因;在草果叶绿体基因组中共检测到123个SSR位点,大部分SSR均由A和T组成;豆蔻属物种叶绿体基因组大小和结构相似,IR边界高度保守;聚类分析显示草果与豆蔻属的海南砂A.longiligulare、阳春砂A.villosum、绿壳砂A.villosum var. xanthioides、爪哇白豆蔻A. compactum和白豆蔻A. kravanh亲缘关系最近;适应性进化分析发现rpl20、rps11、ccsA、clpP、ycf1和ycf2 6个基因在进化过程中被正向选择。结论获得了完整的草果叶绿体基因组序列,明确了姜科物种间的亲缘关系,为研究豆蔻属植物的系统进化及物种鉴定提供科学依据。
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关键词
姜科
草果
海南砂
阳春砂
绿壳砂
爪哇白豆蔻
白豆蔻
叶绿体基因组
系统发育
原文传递
题名
应用高速逆流色谱一次性分离白豆蔻中5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮
被引量:
3
1
作者
朱云霞
刘雯
张继全
沈平孃
王玲玲
卓超
机构
华东理工大学药学院
国家中药制药工程技术研究中心
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1750-1754,共5页
基金
国家"十一五"科技支撑计划项目--已上市戒毒中药济泰片的药效物质基础
作用机制与质量标准研究(2008BAI49B05)
文摘
目的研究高速逆流色谱分离白豆蔻中黄酮醇类活性成分的方法。方法利用高速逆流色谱技术,采用正己烷-乙酸乙酯-甲醇-水作为两相溶剂系统,上相为固定相,下相为流动相,转速为900 r/min,体积流量为1.2 mL/min。结果一次性从白豆蔻黄酮醇类物质中分离得到5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮。通过EI-MS、1H-NMR和13C-NMR鉴定,HPLC检测分析,纯度达98%以上。结论利用高速逆流色谱技术可从白豆蔻中分离制备5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮,分离度好,产物纯度较高。
关键词
高速逆流色谱
白豆蔻
5-羟基-3
7
4'-三甲氧基黄酮
Keywords
high speed counter current chromatography
amomum
kravanh
pierre
ex
gagnep
5-hydroxy-3
7
4′-trimethoxyflavone
分类号
R284.2 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
豆蔻属药用植物叶绿体基因组密码子偏性分析
被引量:
23
2
作者
马孟莉
张薇
孟衡玲
王田涛
李春燕
卢丙越
机构
云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室
红河学院生物科学与农学学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3661-3670,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31460380)
云南省地方本科高校基础研究联合专项资金面上项目(202001BA070001-181)
+1 种基金
红河学院中青年学术骨干培养项目(2014GG0101)
红河学院重点学科开放基金项目(2018ZDXK02)。
文摘
目的明确豆蔻属药用植物叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素。方法以草果Amomum tsao-ko、阳春砂Amomum villosum、白豆蔻Amomum kravanh和爪哇白豆蔻Amomum compactum叶绿体基因组50个共有蛋白编码基因为材料,利用CodonW 1.4.2软件、CUSP在线程序和Excel软件等分析基因密码子使用偏性参数和核苷酸组成。结果 4个豆蔻属物种叶绿体基因组具有相似的密码子使用模式,密码子第3位碱基GC含量为37.22%~37.31%,偏向使用NNA和NNT型密码子;4个物种的有效密码子数值(ENC)均在35以上,表明豆蔻属叶绿体基因组密码子偏性较弱。综合中性分析、有效密码子数(ENC-plot)分析、奇偶偏好性(PR2-plot)分析和对应性分析的结果显示豆蔻属叶绿体基因组密码子偏性主要受选择影响,同时突变等其它因素也对密码子的偏性产生一定的作用。在草果、阳春砂、白豆蔻和爪哇白豆蔻中分别确定了18、16、16、18个最优密码子,其中共有最优密码子13个。结论豆蔻属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基偏向使用A/T结尾,密码子偏性受选择影响最大,同时还受到诸如突变等其它因素的影响。
关键词
草果
阳春砂
白豆蔻
爪哇白豆蔻
叶绿体基因组
密码子偏性
最优密码子
Keywords
amomum
tsao-ko Crevost et Lemaire
amomum
villosum Lour.
amomum kravanh pierre ex gagnep.
amomum
compactum Soland
ex
Matan
chloroplast genome
codon usage bias
optimal codons
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
草果叶绿体基因组特征及系统发育分析
被引量:
16
3
作者
马孟莉
张薇
孟衡玲
卢丙越
机构
云南省高校滇南特色生物资源研究与利用重点实验室
红河学院生物科学与农学学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第19期6023-6031,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31460380)
云南省地方本科高校基础研究联合专项资金面上项目(202001BA070001-181)
+2 种基金
云南省万人计划青年拔尖人才专项
红河学院中青年学术骨干培养项目(2014GG0101)
红河学院重点学科开放基金项目(2018ZDXK02)。
文摘
目的明确草果Amomumtsao-ko叶绿体基因组结构特征及其在姜科的进化地位。方法利用IlluminaHiseq4000测序平台对草果叶绿体基因组进行测序,通过生物信息学分析方法进行序列组装、注释和特征分析,并以绿苞闭鞘姜为外类群,通过MEGA6软件构建ML系统发育树,分析姜科物种间系统发育关系。结果草果叶绿体基因组全长163 648 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶含量(guanine-cytosine content,GC)为36.0%,包括一对29 776 bp的反向重复区(IRs)、一个大单拷贝区(LSC,88 741 bp)和一个小单拷贝区(SSC,15 355 bp);共注释得到113个基因,包括4个rRNA基因、30个t RNA基因和79个蛋白编码基因;在草果叶绿体基因组中共检测到123个SSR位点,大部分SSR均由A和T组成;豆蔻属物种叶绿体基因组大小和结构相似,IR边界高度保守;聚类分析显示草果与豆蔻属的海南砂A.longiligulare、阳春砂A.villosum、绿壳砂A.villosum var. xanthioides、爪哇白豆蔻A. compactum和白豆蔻A. kravanh亲缘关系最近;适应性进化分析发现rpl20、rps11、ccsA、clpP、ycf1和ycf2 6个基因在进化过程中被正向选择。结论获得了完整的草果叶绿体基因组序列,明确了姜科物种间的亲缘关系,为研究豆蔻属植物的系统进化及物种鉴定提供科学依据。
关键词
姜科
草果
海南砂
阳春砂
绿壳砂
爪哇白豆蔻
白豆蔻
叶绿体基因组
系统发育
Keywords
Zingiberaceae
amomum
tsao-ko Crevost et Lemarie
A.longiligulare T.L.Wu
A.villosum Lour.
A.villosum var.xanthioides(Wall.
ex
Bak.)T.L.Wu et S.J.Chen
A.compactum Sol.
ex
Maton
A.
kravanh
pierre
ex
gagnep
chloroplast genome
phylogenetic analysis
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用高速逆流色谱一次性分离白豆蔻中5-羟基-3,7,4'-三甲氧基黄酮
朱云霞
刘雯
张继全
沈平孃
王玲玲
卓超
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2011
3
下载PDF
职称材料
2
豆蔻属药用植物叶绿体基因组密码子偏性分析
马孟莉
张薇
孟衡玲
王田涛
李春燕
卢丙越
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021
23
原文传递
3
草果叶绿体基因组特征及系统发育分析
马孟莉
张薇
孟衡玲
卢丙越
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2021
16
原文传递
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