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RITA体外选择性抑制BAP1缺失的皮肤黑色素瘤细胞的生长
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作者 石文惠 刘小莲 +4 位作者 张贵明 叶林萱 周润华 李亦蕾 余乐 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期710-717,共8页
目的构建抑癌基因BAP1敲除的皮肤黑色素瘤细胞模型,筛选对BAP1缺失的皮肤黑色素瘤细胞具有选择性抑制活性的小分子化合物。方法选择表达野生型BAP1的皮肤黑色素瘤细胞利用CRISPR-Cas9系统敲除BAP1基因,获得与亲代细胞同基因型的BAP1敲... 目的构建抑癌基因BAP1敲除的皮肤黑色素瘤细胞模型,筛选对BAP1缺失的皮肤黑色素瘤细胞具有选择性抑制活性的小分子化合物。方法选择表达野生型BAP1的皮肤黑色素瘤细胞利用CRISPR-Cas9系统敲除BAP1基因,获得与亲代细胞同基因型的BAP1敲除克隆,通过MTT法筛选化合物库中对BAP1敲除细胞具有选择性抑制活性的小分子化合物。通过挽救实验,明确BAP1敲除细胞对化合物的敏感性是否与BAP1蛋白缺失直接相关。流式细胞术检测化合物对细胞周期和凋亡的影响。Western blotting检测化合物对蛋白表达的影响。结果化合物库中的p53激活剂RITA选择性抑制BAP1敲除细胞的细胞活力。过表达野生型BAP1能够逆转BAP1敲除细胞对RITA的敏感性,而过表达去泛素化酶失活的突变型BAP1(C91S)没有挽救作用。与BAP1野生型对照细胞相比,BAP1敲除细胞对RITA引起的细胞周期阻滞和凋亡更为敏感(P<0.0001)。BAP1敲除增加了细胞p53蛋白的基础水平,而RITA处理后进一步增加p53蛋白表达(P<0.0001)。结论BAP1缺失导致皮肤黑色素瘤细胞对p53激活剂RITA敏感。BAP1的去泛素化酶活性与细胞对RITA的敏感性直接相关。BAP1敲除导致p53蛋白增加可能是细胞对RITA敏感的一个关键原因。 展开更多
关键词 皮肤黑色素瘤 bap1 RITA P53 细胞周期 细胞凋亡
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p16基因与BAP1蛋白表达缺失在腹膜恶性间皮瘤诊断和鉴别诊断中的作用
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作者 高志斌 王兆平 +1 位作者 徐瑛 傅家欣 《中国现代医生》 2019年第27期131-134,I0002,共5页
目的探讨p16基因及BRCA相关蛋白1(BAP1)表达缺失在腹膜恶性间皮瘤(PMM)病理诊断和鉴别诊断中的应用价值.方法选取我院2010年1月~2018年12月确诊为PMM的40例以及各30例卵巢浆液性癌和反应性间皮细胞增生病例作为研究对象.采用荧光原位杂... 目的探讨p16基因及BRCA相关蛋白1(BAP1)表达缺失在腹膜恶性间皮瘤(PMM)病理诊断和鉴别诊断中的应用价值.方法选取我院2010年1月~2018年12月确诊为PMM的40例以及各30例卵巢浆液性癌和反应性间皮细胞增生病例作为研究对象.采用荧光原位杂交(FISH)方法检测p16基因在PMM和反应性间皮细胞增生中表达缺失,以及免疫组织化学方法检测BAP1在PMM、卵巢浆液性癌及反应性间皮细胞增生中的表达缺失,分析两者在PMM病理诊断和鉴别诊断中的作用.结果 PMM标本中p16基因表达缺失率为45%,反应性间皮细胞增生标本中缺失率为0.PMM标本中p16基因表达缺失率高于反应性间皮细胞增生,差异有统计学意义(P<0.01).BAP1在PMM、卵巢浆液性癌、反应性间皮细胞增生标本中的表达缺失率分别为65%、0和0,BAP1在PMM与卵巢浆液性癌和反应性间皮细胞增生的表达缺失率差异有统计学意义(均P<0.01).结论 p16基因表达缺失在诊断和鉴别诊断PMM时有明确的诊断价值.BAP1在PMM与反应性间皮细胞增生和卵巢浆液性癌进行鉴别诊断时,也有确切的诊断价值,可作为又一项重要的免疫组化诊断指标. 展开更多
关键词 腹膜恶性间皮瘤 卵巢浆液性癌 反应性间皮细胞增生 免疫组织化学 P16 bap1
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BAP1及其抑癌作用研究新进展 被引量:6
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作者 李则 任尊 +3 位作者 涂鸿鹄 简政 余健秀 邓蓉 《上海交通大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2017年第5期689-693,共5页
BAP1是泛素羧基末端水解酶家族中的一员,其基本功能是去除底物蛋白质的泛素化修饰。BAP1还是多种细胞功能调控的关键分子,通过依赖或不依赖其去泛素化功能,调节基因表达、细胞周期、细胞分化、细胞凋亡和DNA损伤应答等。由于BAP1在细胞... BAP1是泛素羧基末端水解酶家族中的一员,其基本功能是去除底物蛋白质的泛素化修饰。BAP1还是多种细胞功能调控的关键分子,通过依赖或不依赖其去泛素化功能,调节基因表达、细胞周期、细胞分化、细胞凋亡和DNA损伤应答等。由于BAP1在细胞内的重要作用,其基因突变或表达水平的下调能够显著提高多种肿瘤的易患性,但具体的致病机制目前尚不清楚,有待进一步的研究,这也为未来肿瘤治疗带来新的契机。 展开更多
关键词 bap1 去泛素化 肿瘤
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卵巢癌和卵巢良性肿瘤患者血清IFN-γ和IL-4水平及病灶组织中MUC1和BAP1表达的差异性分析 被引量:3
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作者 阿艳妮 王晓燕 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1074-1079,共6页
目的 分析卵巢癌和卵巢良性肿瘤患者血清Th1型细胞因子IFN-γ和Th2型细胞因子IL-4水平及病灶黏蛋白-1糖蛋白(MUC1)和病灶组织中乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)表达的差异。方法 选取2015年至2022年青岛市妇女儿童医院收治的60例卵巢癌患... 目的 分析卵巢癌和卵巢良性肿瘤患者血清Th1型细胞因子IFN-γ和Th2型细胞因子IL-4水平及病灶黏蛋白-1糖蛋白(MUC1)和病灶组织中乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)表达的差异。方法 选取2015年至2022年青岛市妇女儿童医院收治的60例卵巢癌患者,另选同期手术治疗且经病理确诊的50例卵巢良性肿瘤患者,再选同期体检的40例健康妇女为研究对象。酶联免疫吸附法检测IFN-γ和IL-4的水平,免疫组织化学法检测病灶组织中MUC1和BAP1表达;ROC曲线分析IFN-γ和IL-4对卵巢癌诊断价值,收集术后病理组织,检测MUC1和BAP1阳性表达情况并分析其与病理特征之间的关系,采用Spearman法分析其与肿瘤恶性程度关系。结果 卵巢癌组患者血清IFN-γ水平低于卵巢良性肿瘤组与健康组,IL-4水平高于卵巢良性肿瘤组与健康组(P<0.05);卵巢良性肿瘤组与健康组IFN-γ和IL-4水平无统计学意义(P>0.05)。ROC曲线显示,IFN-γ和IL-4的AUC分别为0.748和0.796,灵敏度分别为98.2%和80.9%,特异度分别为40.0%和62.5%。卵巢癌组织中MUC1和BAP1阳性表达率高于卵巢良性肿瘤(P<0.05)。MUC1和BAP1阳性表达在年龄、肿瘤直径方面无统计学意义(P>0.05),在FIGO分期、病理分级、淋巴结转移方面,差异具有统计学意义(P<0.05)。Spearman法分析显示,MUC1和BAP1表达与FIGO分期、病理分级和淋巴结转移呈正相关(P<0.05)。结论 血清中IFN-γ和IL-4水平及病灶组织中的MUC1和BAP1的阳性程度或可作为卵巢癌的辅助诊断指标。 展开更多
关键词 卵巢癌 卵巢良性肿瘤 IFN-Γ IL-4 MUC1 bap1
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去泛素化酶BAP1在肝细胞癌发展中的功能研究 被引量:3
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作者 仲彤 王艳双 +4 位作者 王婵娟 张晓莉 王泽 张令强 崔春萍 《中国医药生物技术》 2021年第5期407-418,共12页
目的探索BAP1及其突变体参与调控肝癌细胞生长转移的功能,为发现肝癌治疗的新靶点奠定基础。方法从TCGA数据库中获得了375例肝细胞癌(HCC)样本,共44845例体细胞突变数据,并下载肝癌临床指标数据及术后生存期数据,利用软件具体数据分析,... 目的探索BAP1及其突变体参与调控肝癌细胞生长转移的功能,为发现肝癌治疗的新靶点奠定基础。方法从TCGA数据库中获得了375例肝细胞癌(HCC)样本,共44845例体细胞突变数据,并下载肝癌临床指标数据及术后生存期数据,利用软件具体数据分析,通过BAP1的RNA表达量进行数据分析,建立了BAP1稳定敲除和过表达的肝癌细胞系,分析BAP1生物学特性的影响,建立了裸鼠皮下移植瘤模型。结果BAP1为DUBs家族中突变率最高的基因,突变率约为5.31%,与正常肝组织相比,HCC组织中BAP1突变差异显著,BAP1突变与病人较好的预后密切相关,BAP1 mRNA高表达与病人较差的预后密切相关,BAP1敲低显著抑制肝癌细胞的生长和转移,BAP1G45R和W196G位点突变显著抑制肿瘤生长。结论BAP1突变与HCC病人较好的预后密切相关,BAP1敲低及其突变能够显著抑制肝癌细胞增殖、迁移以及裸鼠的成瘤能力。 展开更多
关键词 去泛素化酶 肝细胞癌 bap1 突变 功能研究
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BAP1及其对透明细胞肾细胞癌的抑制作用 被引量:3
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作者 吴莹 李学英 潘有福 《遵义医科大学学报》 2019年第5期594-601,共8页
肾癌在泌尿系统肿瘤中位居第三,其中约有80%的肾癌是透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。BAP1(BRCA1-associated protein 1)是一个重要的肿瘤抑制因子,通过去泛素化作用发挥多方面的功能,如参与转录调控、表观... 肾癌在泌尿系统肿瘤中位居第三,其中约有80%的肾癌是透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。BAP1(BRCA1-associated protein 1)是一个重要的肿瘤抑制因子,通过去泛素化作用发挥多方面的功能,如参与转录调控、表观遗传调控、DNA损伤修复等。最近,研究发现体细胞BAP 1突变可能促成ccRCC细胞中程序性细胞死亡配体1(programmed cell death-Ligand 1,PD-L1)的表达。本文综述了BAP1的结构功能及BAP 1突变在ccRCC发生发展中的作用的相关进展,以期深入了解ccRCC的发生发展机制。 展开更多
关键词 bap1 透明细胞肾细胞癌 去泛素化
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乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)在胃癌组织中的表达及临床意义 被引量:2
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作者 孟化民 《吉林医学》 CAS 2021年第10期2484-2485,共2页
目的:探讨乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)在胃癌组织中的表达及临床意义。方法:选取胃癌患者70例作为研究对象,采用实时荧光定量PCR和免疫组化实验检测患者癌组织和癌旁组织中乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)的相对表达水平。结果:免疫... 目的:探讨乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)在胃癌组织中的表达及临床意义。方法:选取胃癌患者70例作为研究对象,采用实时荧光定量PCR和免疫组化实验检测患者癌组织和癌旁组织中乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)的相对表达水平。结果:免疫组化显示癌组织中BAP1高表达27例(38.57%),而癌旁组织中BAP1高表达47例(67.14%),BAP1在胃癌患者癌组织中表达水平低于癌旁组织,差异存在统计学意义(P<0.05)。荧光定量PCR显示BAP1基因mRNA在癌组织中的表达水平为(1.189±0.342),癌旁组织中为(3.387±0.872),癌组织显著低于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:乳腺癌易感基因相关蛋白1(BAP1)在胃癌组织中表达水平显著降低,可能参与了胃癌的发生与发展过程。 展开更多
关键词 bap1 胃癌 免疫组化 表达 临床意义
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口腔癌变组织中BAP1蛋白的表达研究
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作者 陈月沙 雷争辉 +1 位作者 刘斌杰 陈珺 《全科口腔医学电子杂志》 2016年第18期68-70,共3页
目的研究BAP1蛋白在人口腔癌与正常口腔组织中的表达差异及分布,探究其在口腔癌发病中的作用。方法采用免疫组织化学(免疫酶标)方法,检测20例口腔癌组织标本与20例正常口腔组织标本中BAP1蛋白表达情况,利用半定量分析方法判断BAP1表达... 目的研究BAP1蛋白在人口腔癌与正常口腔组织中的表达差异及分布,探究其在口腔癌发病中的作用。方法采用免疫组织化学(免疫酶标)方法,检测20例口腔癌组织标本与20例正常口腔组织标本中BAP1蛋白表达情况,利用半定量分析方法判断BAP1表达强弱。结果 BAP1在口腔癌组织中呈低表达,在正常口腔组织中表达水平较高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 BAP1蛋白在口腔癌变组织中表达下降,其在口腔癌的发生中具有重要作用。 展开更多
关键词 bap1蛋白 口腔癌 免疫组化 半定量分析
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Pharmacological inhibition of BAP1 recruits HERC2 to competitively dissociate BRCA1-BARD1, suppresses DNA repair and sensitizes CRC to radiotherapy 被引量:1
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作者 Xin Yue Tingyu Liu +18 位作者 Xuecen Wang Weijian Wu Gesi Wen Yang Yi Jiaxin Wu Ziyang Wang Weixiang Zhan Ruirui Wu Yuan Meng Zhirui Cao Liyuan Le Wenyan Qiu Xiaoyue Zhang Zhenyu Li Yong Chen Guohui Wan Xianzhang Bu Zhenwei Peng Ran-yi Liu 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2023年第8期3382-3399,共18页
Radiotherapy is widely used in the management of advanced colorectal cancer(CRC).However,the clinical efficacy is limited by the safe irradiated dose.Sensitizing tumor cells to radiotherapy via interrupting DNA repair... Radiotherapy is widely used in the management of advanced colorectal cancer(CRC).However,the clinical efficacy is limited by the safe irradiated dose.Sensitizing tumor cells to radiotherapy via interrupting DNA repair is a promising approach to conquering the limitation.The BRCA1-BARD1 complex has been demonstrated to play a critical role in homologous recombination(HR)DSB repair,and its functions may be affected by HERC2 or BAP1.Accumulated evidence illustrates that the ubiquitination-deubiquitination balance is involved in these processes;however,the precise mechanism for the cross-talk among these proteins in HR repair following radiation hasn’t been defined.Through activity-based profiling,we identified PT33 as an active entity for HR repair suppression.Subsequently,we revealed that BAP1 serves as a novel molecular target of PT33 via a CRISPR-based deubiquitinase screen.Mechanistically,pharmacological covalent inhibition of BAP1 with PT33 recruits HERC2 to compete with BARD1 for BRCA1 interaction,interrupting HR repair.Consequently,PT33 treatment can substantially enhance the sensitivity of CRC cells to radiotherapy in vitro and in vivo.Overall,these findings provide a mechanistic basis for PT33-induced HR suppression and may guide an effective strategy to improve therapeutic gain. 展开更多
关键词 Pharmacological inhibition bap1 HERC2recruitment BRCA1 BARD1 Competitively dissociation HR-Mediated DNArepair CRCradiosensitization
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Tumor-derived neomorphic mutations in ASXL1 impairs the BAP1-ASXL1-FOXK1/K2 transcription network 被引量:6
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作者 Yu-Kun Xia Yi-Rong Zeng +16 位作者 Meng-Li Zhang Peng Liu Fang Liu Hao Zhang Chen-Xi He Yi-Ping Sun Jin-Ye Zhang Cheng Zhang Lei Song Chen Ding Yu-Jie Tang Zhen Yang Chen Yang Pu Wang Kun-Liang Guan Yue Xiong Dan Ye 《Protein & Cell》 SCIE CSCD 2021年第7期557-577,共21页
Additional sex combs-like 1(ASXL1)interacts with BRCA1-associated protein 1(BAP1)deubiquitinase to oppose the polycomb repressive complex 1(PRC1)-mediated histone H2A ubiquitylation.Germline BAP1 mutations are found i... Additional sex combs-like 1(ASXL1)interacts with BRCA1-associated protein 1(BAP1)deubiquitinase to oppose the polycomb repressive complex 1(PRC1)-mediated histone H2A ubiquitylation.Germline BAP1 mutations are found in a spectrum of human malignancies,while ASXL1 mutations recurrently occur in myeloid neoplasm and are associated with poor prognosis.Nearly all ASXL1 mutations are heterozygous frameshift or nonsense mutations in the middle or to a less extent the C-terminal region,resulting in the production of C-terminally truncated mutant ASXL1 proteins.How ASXL1 regulates specific target genes and how the C-terminal truncation of ASXL1 promotes leukemogen-esis are unclear.Here,we report that ASXL1 interacts with forkhead transcription factors FOXK1 and FOXK2 to regulate a subset of FOXK1/K2 target genes.We show that the C-terminally truncated mutant ASXL1 proteins are expressed at much higher levels than the wild-type protein in ASXL1 heterozygous leukemia cells,and lose the ability to interact with FOXK1/K2.Specific deletion of the mutant allele eliminates the expression of C-termi-nally truncated ASXL1 and increases the association of wild-type ASXL1 with BAP1,thereby restoring the expression of BAP1-ASXL1-FOXK1/K2 target genes,particularly those involved in glucose metabolism,oxygen sensing,and JAK-STAT3 signaling pathways.In addition to FOXK1/K2,we also identify other DNA-bind-ing transcription regulators including transcription factors(TFs)which interact with wild-type ASXL1,but not C-terminally truncated mutant.Our results suggest that ASXL1 mutations result in neomorphic alleles that contribute to leukemogenesis at least in part through dominantly inhibiting the wild-type ASXL1 from interacting with BAP1 and thereby impairing the function of ASXL1-BAP1-TF in regulating target genes and leukemia cell growth. 展开更多
关键词 ASXL1 bap1 FOXK1/K2 LEUKEMIA EPIGENETICS
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BAP1基因在皮肤恶性黑色素瘤临床预后中的作用
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作者 宋毓平 李瑞 +5 位作者 龚丹妮 曹晨 杜小芳 靳平 田训 肖艳萍 《重庆医学》 CAS 2022年第10期1766-1768,1773,共4页
目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)基因在皮肤恶性黑色素瘤临床预后中的作用。方法运用GEO数据库数据分析比较BAP1 mRNA在正常皮肤组织、良性痣组织、恶性黑色素瘤组织中的表达差异,并进一步运用不同的在线数据库分析BAP1 mRNA水平与皮肤恶... 目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)基因在皮肤恶性黑色素瘤临床预后中的作用。方法运用GEO数据库数据分析比较BAP1 mRNA在正常皮肤组织、良性痣组织、恶性黑色素瘤组织中的表达差异,并进一步运用不同的在线数据库分析BAP1 mRNA水平与皮肤恶性黑色素瘤的预后之间的关系。结果BAP1在皮肤恶性黑色素瘤中mRNA水平明显高于正常皮肤组织及良性痣组织,差异有统计学意义(P<0.05);BAP1的mRNA高表达水平的皮肤恶性黑色素瘤的预后较差(P<0.05)。结论BAP1 mRNA水平与皮肤恶性黑色素瘤临床预后密切相关,可以为皮肤恶性黑色素瘤治疗提供潜在靶点。 展开更多
关键词 bap1 预后 皮肤恶性黑色素瘤 生物标记物
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BAP1及TET2蛋白在慢性粒-单核细胞白血病患者骨髓中的表达及其意义 被引量:1
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作者 马晶晶 林之光 +3 位作者 马燕 康惠 陈波斌 王小钦 《白血病.淋巴瘤》 CAS 2019年第1期25-29,共5页
目的探讨BAP1与TET2蛋白在慢性粒-单核细胞白血病(CMML)患者骨髓中的表达及其与CMML预后的关系。方法收集2003年9月至2007年5月上海市中美联合白血病协作组确诊的41例成年CMML患者现存的骨髓石蜡标本,采取石蜡切片免疫组织化学法重新检... 目的探讨BAP1与TET2蛋白在慢性粒-单核细胞白血病(CMML)患者骨髓中的表达及其与CMML预后的关系。方法收集2003年9月至2007年5月上海市中美联合白血病协作组确诊的41例成年CMML患者现存的骨髓石蜡标本,采取石蜡切片免疫组织化学法重新检测BAP1和TET2蛋白表达,同时收集同期确诊的40例成年急性粒-单核细胞白血病(AMML)患者和20例缺铁性贫血(IDA)患者现存的骨髓石蜡标本作为对照,采用相同方法检测TET2和BAP1蛋白表达情况。采用回顾性队列研究方法分析41例CMML患者的临床资料,计数资料的比较采用χ^2检验,采用Pearson相关分析法分析BAP1和TET2蛋白表达间的关系,应用Log-rank检验进行单因素分析,应用Kaplan-Meier法进行生存分析。结果41例CMML患者中,BAP1阳性表达率为31.7%(13/41),其中CMML-1型患者为28.6%(8/28),CMML-2型为38.5%(5/13);TET2阳性表达率为41.5%(17/41),其中CMML-1型患者为39.3%(11/28),CMML-2型患者为46.2%(6/13)。40例AMML患者中,BAP1阳性表达率为32.5%(13/40),TET2阳性表达率为35.0%(14/40)。20例IDA患者中,BAP1阳性表达率为5.0%(1/20),TET2无阳性表达。CMML-1型和CMML-2型患者间BAP1和TET2阳性表达率差异均无统计学意义(χ^2=0.40,P=0.53;χ^2=0.17,P=0.68)。CMML与AMML患者间BAP1和TET2阳性表达率差异均无统计学意义(χ^2=0.01,P=0.94;χ^2=0.36,P=0.64)。血液系统肿瘤性疾病(CMML+AMML)和血液系统非肿瘤性疾病(IDA)间BAP1和TET2阳性表达率差异均有统计学意义(χ^2=6.01,P<0.05;χ^2=11.04,P<0.01)。Pearson相关分析显示,BAP1和TET2表达之间无相关性(r=0.35,P=0.27)。单因素分析显示,重度贫血(血红蛋白<60 g/L)、单核细胞计数≥2.0×10^9/L、中性粒细胞计数<1.5×10^9/L、染色体异常核型是CMML不良预后因素。BAP1和TET2表达均与CMML患者的预后无关(χ^2=0.28,P=0.600;χ^2=0.53,P=0.460)。结论BAP1及TET2蛋白在CMML患者中均有较高阳性表达率,但其表达均与患者预后无关。 展开更多
关键词 白血病 粒-单核细胞 慢性 bap1蛋白 TET2蛋白 预后
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乳腺癌1号基因相关蛋白在肾透明细胞癌中的表达及与临床特征及预后的关系 被引量:3
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作者 蒙浩 张辉 陈铭 《广东医学》 CAS 2018年第22期3335-3338,共4页
目的探讨乳腺癌1号基因相关蛋白(BAP1)在肾透明细胞癌中的表达及与临床特征及预后的关系。方法选取肾透明细胞癌样本共136例,采用免疫组化染色的方法检测样本中的BAP1表达情况,分析BAP1表达与患者临床资料的关系,采用Kaplan-Meier生存... 目的探讨乳腺癌1号基因相关蛋白(BAP1)在肾透明细胞癌中的表达及与临床特征及预后的关系。方法选取肾透明细胞癌样本共136例,采用免疫组化染色的方法检测样本中的BAP1表达情况,分析BAP1表达与患者临床资料的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线评估BAP1表达与肾透明细胞癌患者预后的关系。结果癌组织中BAP1表达阳性率为54. 4%,癌旁组织的BAP1表达阳性率为69. 1%,癌旁组织的BAP1阳性率显著高于癌组织(χ~2=6. 227,P=0. 013),肾透明细胞癌组织BAP1表达阴性的患者其肿瘤最大径> 4 cm、pT_(3~4)、TNM分期Ⅲ~Ⅴ期和Fuhrman分级3~4级的比例显著高于癌组织BAP1表达阳性的患者(P <0. 05),BAP1表达阳性的患者其预后显著优于表达阴性的患者,差异有统计学意义(HR=0. 382,95CI%:0. 193~0. 755,P=0. 005 6)。结论 BAP1在肾透明细胞癌患者病情进展中具有重要作用,BAP1表达与临床分期及生物学行为密切相关,且其癌组织中阳性表达患者与预后不良相关。 展开更多
关键词 bap1 肾透明细胞癌 表达 预后 去泛素化
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葡萄膜黑色素瘤高转移相关基因的筛选和分析 被引量:2
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作者 聂爱芹 谢宁 +1 位作者 李强 李伟 《山西医药杂志》 CAS 2019年第13期1523-1526,共4页
目的探讨葡萄膜黑色素原位瘤与转移瘤差异表达基因及其作用;探索乳腺癌1号基因相关蛋白1(BAP1)缺失的葡萄膜黑色素瘤(UM)差异表达基因以及预测BAP1靶标,探讨BAP1缺失对UM转移作用及其机制。方法生信分析筛选UM转移差异表达基因及其功能... 目的探讨葡萄膜黑色素原位瘤与转移瘤差异表达基因及其作用;探索乳腺癌1号基因相关蛋白1(BAP1)缺失的葡萄膜黑色素瘤(UM)差异表达基因以及预测BAP1靶标,探讨BAP1缺失对UM转移作用及其机制。方法生信分析筛选UM转移差异表达基因及其功能,对公共数据库GEO中的数据集GSE27831,GSE48863以及GSE39171中芯片数据以2为底数进行对数转换以及标准化(P<0.05,|logFC|>1)等预处理。为了进一步捕捉术语之间的关系,选择丰富的术语的子集,并将其作为网络图绘制,其中相似性>0.3的项由边缘连接。我们从20个簇中的每个簇中选择具有最佳P值的项,约束每个集群不超过15个术语,总共不超过250个术语。该网络用CytoSCAPE可视化插件,其中每个节点表示1个丰富的术语,并用其簇的名称着色。对于每个给定的基因列表,利用以下数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用富集分析:BioGrid、InWeb_IM、OmniPath。所得到的网络至少包含与另一个列表成员形成交互的蛋白质子集。如果网络中包含3~500个蛋白质,则进一步应用分子复合检测(MCODE)算法来识别紧密连接的网络组件。路径和过程富集分析被独立地应用于每个MCODE组件,并且保留3个最佳评分(按P值,P<0.05,FDR<0.001生物途径视为有价值)术语作为对应组件的功能描述。结果我们运用生物信息学技术对转移性和非转移性UM组织样本和BAP1沉默和正常表达UM细胞样本基于微阵列对基因组数据进行基因本体富集(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,结果显示差异基因主要富集在补体凝血级联途径。结论 BAP1在转移性UM的异常低表达,UM中BAP1突变可能通过影响肿瘤血管生成促进肿瘤浸润转移。 展开更多
关键词 肿瘤转移 bap1缺失 葡萄膜黑色素瘤 生信分析
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二代测序技术检测鼻咽癌相关基因突变与临床病理特征关系分析 被引量:1
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作者 陈彦竹 何倩 +4 位作者 马宏志 刘林 张琳 韩亚骞 刘峰 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第8期1314-1319,共6页
目的:以二代测序(NGS)为基础分析鼻咽癌相关基因突变及突变功能区域,探讨突变基因与临床特征之间的关系及临床应用价值。方法:收集2018年2月-2018年11月中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院/湖南省肿瘤医院头颈放疗二科28例初治鼻咽癌患者,... 目的:以二代测序(NGS)为基础分析鼻咽癌相关基因突变及突变功能区域,探讨突变基因与临床特征之间的关系及临床应用价值。方法:收集2018年2月-2018年11月中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院/湖南省肿瘤医院头颈放疗二科28例初治鼻咽癌患者,采用基因测序平台Illumina NextSeqCN500进行全基因测序,描述基因检测结果,统计分析高频突变基因与临床病理特征之间的关系。结果:本研究共检测到93个基因及115个突变功能区域,因部分基因突变频率较低未纳入统计,纳入统计共20个突变基因及14个突变功能区域,其中泛素羧基末端水解酶1(BAP1)和肿瘤抑制因子(CYLD)基因的突变频率均为9.8%(5/51),肿瘤蛋白p53(TP53)基因突变频率为7.8%(4/51)。结论:Illumina NextSeqCN500测序平台可作为鼻咽癌多基因突变检测手段,BAP1、CYLD及TP53在鼻咽癌中突变频率较高,对深入研究鼻咽癌发病机制及靶向药物治疗方面具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 鼻咽癌 二代测序 bap1 CYLD TP53
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Long-term survival of a patient with pancreatic cancer and lung metastasis:A case report and review of literature
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作者 Wen-Wei Yang Lin Yang +1 位作者 Hai-Zhen Lu Yong-Kun Sun 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2021年第30期9134-9143,共10页
BACKGROUND Pancreatic cancer(PC)is a leading cause of cancer-related death,given its poor prognosis and the limited benefits of traditional therapies.As tumors become more genetically disorganized as they progress,gen... BACKGROUND Pancreatic cancer(PC)is a leading cause of cancer-related death,given its poor prognosis and the limited benefits of traditional therapies.As tumors become more genetically disorganized as they progress,genetic mutations might become new markers for us to predict their behavior.Nowadays,many inhibitors can selectively target gene products as a form of targeted therapy,with some showing promise as treatment for various types of cancer.CASE SUMMARY We describe a rare case of a PC patient with long-term survival of more than 8 yr.The patient was diagnosed with pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC)with BAP1 and PIK3CA gene mutations and Raf1 fusion and achieved partial response twice after treatment with apatinib in combination with chemotherapy.CONCLUSION BAP1,PIK3CA mutations,and Raf1 fusion are rare in PDAC.Patients with these three gene alterations of PDAC may achieve long-term survival with apatinib.Further research in other contexts is needed to determine whether apatinib has ideal efficacy for PC treatment. 展开更多
关键词 Pancreatic cancer bap1 mutation PIK3CA mutation Raf1 fusion Apatinib Case report
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运动抑制Fis1/Bap31信号通路蛋白表达减少海马神经元凋亡并改善抑郁大鼠活力
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作者 钱博文 钟志廷 +1 位作者 刘春艳 王皓 《皖南医学院学报》 CAS 2022年第1期15-18,共4页
目的:探讨运动对大鼠海马神经元凋亡的影响与改善大鼠抑郁样行为的机制。方法:48只SD大鼠,随机分为对照组、慢性温和不可预测性应激(CUMS)组、运动+CUMS组、运动+CUMS+运动组,每组12只。应激与孤养造模前,各运动组大鼠持续运动锻炼。10... 目的:探讨运动对大鼠海马神经元凋亡的影响与改善大鼠抑郁样行为的机制。方法:48只SD大鼠,随机分为对照组、慢性温和不可预测性应激(CUMS)组、运动+CUMS组、运动+CUMS+运动组,每组12只。应激与孤养造模前,各运动组大鼠持续运动锻炼。10周后,各CUMS组大鼠构建抑郁样行为模型,且运动+CUMS+运动组大鼠持续锻炼,共3周。模型构建后开展行为学测试,取脑组织用于Nissl染色,取海马组织用于Western blot检测。结果:与对照组相比,CUMS组大鼠糖水摄取率降低,旷场实验得分增加且强迫游泳不动时间增多;与CUMS组相比,持续运动增加了大鼠糖水摄取率,降低了旷场实验得分,减少了强迫游泳不动时间。Nissl染色结果显示持续运动逆转了抑郁样行为大鼠海马CA1区尼氏体数量。此外,与对照组相比,CUMS组大鼠海马组织中Fis1、Bap31、Caspase-8蛋白表达增多,且Cleaved-Caspase-3表达增加,Bcl-2/Bax表达比例降低,持续运动则有效地降低了这部分蛋白表达。结论:持续运动可能通过Fis1/Bap31通路调控海马组织神经元凋亡,发挥预防及改善CUMS/孤养诱导的大鼠抑郁样行为的作用。 展开更多
关键词 抑郁症 慢性应激 运动 神经元凋亡 Fis1/Bap31通路
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葡萄膜黑色素瘤分子机制及靶向治疗新进展 被引量:3
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作者 王祯莲 周晓鹰 《中华眼视光学与视觉科学杂志》 CAS CSCD 2015年第11期702-704,共3页
葡萄膜黑色素瘤是成人眼内最常见的肿瘤。半数以上的原发性葡萄膜黑色素瘤会发生转移。但目前对于转移性葡萄膜黑色素瘤还没有有效的治疗方法。研究葡萄膜黑色素瘤转移、生长、增殖、存活相关的基因突变可以更好地了解其发病机理及转移... 葡萄膜黑色素瘤是成人眼内最常见的肿瘤。半数以上的原发性葡萄膜黑色素瘤会发生转移。但目前对于转移性葡萄膜黑色素瘤还没有有效的治疗方法。研究葡萄膜黑色素瘤转移、生长、增殖、存活相关的基因突变可以更好地了解其发病机理及转移机制,并基于此开展有效的治疗。本综述对葡萄膜黑色素瘤的分子机制、相应的治疗策略及研究前景进行了总结。 展开更多
关键词 葡萄膜黑色素瘤 基因表达谱 bap1 SF3B1 靶向治疗
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BRCA1相关蛋白1对肾癌增殖和侵袭的实验研究 被引量:1
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作者 李明梓 邓铮 +2 位作者 陈暮霖 王一州 凡杰 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第24期4612-4616,共5页
目的:研究BRCA1相关蛋白(BRCA1-associated protein-1,BAP1)对肾癌细胞增殖和侵袭的影响。方法:通过含有不同BAP1和HAT1载体的慢病毒感染后用嘌呤霉素筛选的方法在肾癌细胞系中构建BAP1稳定低表达、HAT1稳定高表达、HAT1稳定低表达以及B... 目的:研究BRCA1相关蛋白(BRCA1-associated protein-1,BAP1)对肾癌细胞增殖和侵袭的影响。方法:通过含有不同BAP1和HAT1载体的慢病毒感染后用嘌呤霉素筛选的方法在肾癌细胞系中构建BAP1稳定低表达、HAT1稳定高表达、HAT1稳定低表达以及BAP1低表达且HAT1低表达的慢病毒细胞稳转株。通过WB和PCR验证BAP1在肾癌细胞系中对于HAT1的调控。使用CCK-8细胞增殖和TRANSWELL侵袭实验检测对于肾癌细胞增殖和侵袭能力的影响。利用免疫组化和临床回访数据分析其临床意义。结果:肾癌细胞系中BAP1表达降低后HAT1表达升高。BAP1低表达部分通过了HAT1表达升高促进肾癌的增殖和侵袭能力。在肾癌组织中BAP1的表达与HAT1表达具有相关性(P<0.05)。结论:BAP1敲低的肾癌细胞中HAT1特异性的高表达可能是导致肾癌细胞增殖和侵袭能力增强的原因。BAP1与HAT1在肾癌组织中的表达具有显著相关性。 展开更多
关键词 肾癌 bap1 HAT1 细胞增殖 细胞侵袭
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NUMB enhances Notch signaling by repressing ubiquitination of NOTCH1 intracellular domain 被引量:2
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作者 Zhiyuan Luo Lili Mu +6 位作者 Yue Zheng Wenchen Shen Jiali Li Lichao Xu Bo Zhong Ying Liu Yan Zhou 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2020年第5期345-358,共14页
The release and nuclear translocation of the intracellular domain of Notch receptor(NICD)is the prerequisite for Notch signaling-mediated transcriptional activation.NICD is subjected to various posttranslational modif... The release and nuclear translocation of the intracellular domain of Notch receptor(NICD)is the prerequisite for Notch signaling-mediated transcriptional activation.NICD is subjected to various posttranslational modifications including ubiquitination.Here,we surprisingly found that NUMB proteins stabilize the intracellular domain of NOTCH1 receptor(N1ICD)by regulating the ubiquitin–proteasome machinery,which is independent of NUMB’s role in modulating endocytosis.BAP1,a deubiquitinating enzyme(DUB),was further identified as a positive N1ICD regulator,and NUMB facilitates the association between N1ICD and BAP1 to stabilize N1ICD.Intriguingly,BAP1 stabilizes N1ICD independent of its DUB activity but relying on the BRCA1-inhibiting function.BAP1 strengthens Notch signaling and maintains stem-like properties of cortical neural progenitor cells.Thus,NUMB enhances Notch signaling by regulating the ubiquitinating activity of the BAP1–BRCA1 complex. 展开更多
关键词 NUMB Notch INTRACELLULAR domain bap1 UBIQUITINATION neural PROGENITOR cells
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