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Ultra-Fast Next Generation Human Genome Sequencing Data Processing Using DRAGEN<sup>TM</sup>Bio-IT Processor for Precision Medicine 被引量:3
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作者 Amit Goyal Hyuk Jung Kwon +5 位作者 Kichan Lee Reena Garg Seon Young Yun Yoon Hee Kim Sunghoon Lee Min Seob Lee 《Open Journal of Genetics》 2017年第1期9-19,共11页
Slow speed of the Next-Generation sequencing data analysis, compared to the latest high throughput sequencers such as HiSeq X system, using the current industry standard genome analysis pipeline, has been the major fa... Slow speed of the Next-Generation sequencing data analysis, compared to the latest high throughput sequencers such as HiSeq X system, using the current industry standard genome analysis pipeline, has been the major factor of data backlog which limits the real-time use of genomic data for precision medicine. This study demonstrates the DRAGEN Bio-IT Processor as a potential candidate to remove the “Big Data Bottleneck”. DRAGENTM accomplished the variant calling, for ~40× coverage WGS data in as low as ~30 minutes using a single command, achieving the over 50-fold data analysis speed while maintaining the similar or better variant calling accuracy than the standard GATK Best Practices workflow. This systematic comparison provides the faster and efficient NGS data analysis alternative to NGS-based healthcare industries and research institutes to meet the requirement for precision medicine based healthcare. 展开更多
关键词 NGS Data Analysis BWA-GATK DRAGEN bio-it PROCESSOR Genomics INDEL Mapping
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尿中萘及其代谢产物作为焦炉工生物监测指标的研究 被引量:15
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作者 冷曙光 郑玉新 +5 位作者 宋文佳 戴宇飞 潘祖飞 肖军 Stephen M.Rappaport 何凤生 《工业卫生与职业病》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期284-287,共4页
目的 探讨尿中萘及其代谢产物作为焦炉工生物监测指标的可行性。方法 在某焦化厂随机选取 2 8名焦炉工人和 2 2名对照个体 ,统一收集工作周末班后 2h尿 ,并使用调查表收集一般情况。采用顶空固相微提取结合气相色谱 -质谱联机方法 ,... 目的 探讨尿中萘及其代谢产物作为焦炉工生物监测指标的可行性。方法 在某焦化厂随机选取 2 8名焦炉工人和 2 2名对照个体 ,统一收集工作周末班后 2h尿 ,并使用调查表收集一般情况。采用顶空固相微提取结合气相色谱 -质谱联机方法 ,同时测定尿中萘和芘的水平 ,采用酶水解结合气相色谱 -质谱联机方法 ,同时测定样品中 1-萘酚、 2 -萘酚和 1-羟基芘的水平。使用多元线性回归分析不同工种和吸烟量对尿中这 5种多环芳烃生物标志物浓度的影响。结果 尿中萘、 1-萘酚、 2 -萘酚和 1-羟基芘的浓度呈炉顶工 >炉侧和炉底工 >对照个体的趋势 ,其中尿中 1-萘酚和 1-羟基芘的水平受工种的影响大于2 -萘酚 ;不同暴露水平组中 ,吸烟个体尿中 1-萘酚、 2 -萘酚和 1-羟基芘的浓度均大于不吸烟者 ,但吸烟对 2 -萘酚的影响最大。结论 尿中 1-萘酚和 2 -萘酚浓度均能够有效地反映个体短期多环芳烃暴露的内剂量水平 ,可用于焦炉工的生物监测。 展开更多
关键词 焦炉工 尿液检测 生物监测指标 顶空固相微提取法 气相色谱-质谱法
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医用镁金属材料的研究进展 被引量:22
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作者 颜廷亭 谭丽丽 +2 位作者 熊党生 张炳春 杨柯 《材料导报》 CSCD 北大核心 2008年第1期110-112,129,共4页
镁及其合金具有优良的综合力学性能、与人体良好的生物相容性能以及生物可降解吸收等特点,有望成为一类新型医用植入材料。综述了镁金属作为医用植入材料的研究发展现状,分析了其应用上的优势与不足,对医用镁金属的表面改性技术进行了... 镁及其合金具有优良的综合力学性能、与人体良好的生物相容性能以及生物可降解吸收等特点,有望成为一类新型医用植入材料。综述了镁金属作为医用植入材料的研究发展现状,分析了其应用上的优势与不足,对医用镁金属的表面改性技术进行了简单的论述,并对其作为医用植入材料的发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 镁及镁合金 医用植入材料 生物可降解 表面改性
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菲律宾生物多样性及其相关知识的立法及对中国的启示 被引量:4
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作者 陈宗波 《河北法学》 CSSCI 北大核心 2008年第11期157-162,共6页
生物多样性及其相关知识是人类生存和发展的基础,而今其保有却不断受到威胁。菲律宾不仅制定了世界上第一个规范生物勘探的法律,而且与此相适应,制定了保护生物多样性和保护传统知识的专门法律。尤其值得关注的是菲律宾生物多样性和文... 生物多样性及其相关知识是人类生存和发展的基础,而今其保有却不断受到威胁。菲律宾不仅制定了世界上第一个规范生物勘探的法律,而且与此相适应,制定了保护生物多样性和保护传统知识的专门法律。尤其值得关注的是菲律宾生物多样性和文化多样性立法形成立体交叉模式,建立了堪称世界上最为完整的生物多样性及相关知识的法律保护体系。菲律宾经验对生物多样性和文化多样性立法几近空白的中国具有深刻的启示。 展开更多
关键词 菲律宾 生物多样性及其相关知识 立法 启示
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木质素及其衍生物在提取冶金中的研究进展 被引量:5
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作者 张保平 郭美辰 +1 位作者 刘运 沈博文 《生物加工过程》 CAS 2018年第6期80-87,共8页
在介绍木质素的结构、来源、提取方法及其改性的基础上,对木质素及其衍生物在提取冶金中的应用进行综述。总结了木质素及其衍生物在去除废水中一些重金属离子(Pb^(2+)、Cu^(2+)和Cr^(3+)等)、回收溶液中有价金属离子及选择性分离特定金... 在介绍木质素的结构、来源、提取方法及其改性的基础上,对木质素及其衍生物在提取冶金中的应用进行综述。总结了木质素及其衍生物在去除废水中一些重金属离子(Pb^(2+)、Cu^(2+)和Cr^(3+)等)、回收溶液中有价金属离子及选择性分离特定金属离子的应用效果,并指出现阶段木质素及其衍生物在提取冶金中存在的问题,特别是对吸附机理、解吸机理及解吸行为的研究不够系统深入,最后展望了木质素及其衍生物在提取冶金中的应用。 展开更多
关键词 木质素及其衍生物 提取冶金 废水 贵金属 重金属 生物环境
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仿生溶液法制备Ca-P陶瓷涂层研究现状 被引量:2
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作者 王兰英 成艳 郑玉峰 《材料科学与工艺》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期732-736,共5页
近年来仿生溶液法制备Ca-P生物活性陶瓷涂层成为生物材料表面改性的重点方向,综述了采用仿生溶液法,尤其是TiO2法在钛和钛合金表面制备Ca-P生物活性陶瓷涂层的方法、形成机理以及形成Ca-P/蛋白质涂层的研究进展,提出了提高钛合金表面生... 近年来仿生溶液法制备Ca-P生物活性陶瓷涂层成为生物材料表面改性的重点方向,综述了采用仿生溶液法,尤其是TiO2法在钛和钛合金表面制备Ca-P生物活性陶瓷涂层的方法、形成机理以及形成Ca-P/蛋白质涂层的研究进展,提出了提高钛合金表面生物活性最佳途径,展望了仿生溶液法的应用前景. 展开更多
关键词 Ca-P生物活性陶瓷涂层 仿生溶液法 钛及钛合金
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医用镁合金作为骨植入材料的研究进展 被引量:1
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作者 王凤蛟 庄金鹏 +1 位作者 周磊(综述) 闫景龙(审校) 《生物医学工程学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期798-802,共5页
镁合金具有生物可降解性、骨传导性、强度可调节性等特点,可避免二次手术带来的负担,但降解速度过快成为制约其生物医用的主要瓶颈。因此,镁合金的生物降解控制至关重要。本文对医用镁合金作为骨植入材料在体内、外的降解性,生物活性,... 镁合金具有生物可降解性、骨传导性、强度可调节性等特点,可避免二次手术带来的负担,但降解速度过快成为制约其生物医用的主要瓶颈。因此,镁合金的生物降解控制至关重要。本文对医用镁合金作为骨植入材料在体内、外的降解性,生物活性,生物相容性及耐腐蚀性能改进方面研究的主要进展做以下综述,分析可能的途径来改善其耐腐蚀性,实现生物降解的可控性。 展开更多
关键词 镁合金 骨植入材料 生物降解 生物活性 生物相容性
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