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2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析 被引量：1
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作者 王珊 杜照中 +5 位作者 尹强 韩淑琪 赵剑 江亚娟 王胜男 温红玲 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期879-886,共8页
目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征。方法采集2017-2019年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据... 目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征。方法采集2017-2019年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据库进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、疫苗抗原分析,利用IQ-TREE和Splits Tree构建系统发育树。结果2017-2019年共检测1086份健康人群咽拭子标本,分离出21株脑膜炎奈瑟菌,健康人群平均带菌率为1.93%。其中流行前期带菌率为0.93%,流行期带菌率为2.30%,流行后期带菌率为1.83%。17~19岁人群带菌率较高,3~5岁儿童及≥20岁成人中未检出阳性菌株。检出的21株菌株中,B群15株,C群1株,不可分群5株。通过基因组分析,主要的ST型为ST-12301和ST-14655,ST-17464、ST-17465、ST-17466、ST-17467和ST-17468为本研究新发现的ST型。进行基因测序的19株菌株中,有8株属于4821克隆群,其余菌株不属于确定的克隆群,有3株血清型为不可分群的菌株但其基因型为B型。结论济宁市2017-2019年健康人群中脑膜炎奈瑟菌血清群以B群为主。本研究新发现5种MLST序列型,提示近几年菌株基因组存在微进化。MLST序列型的变迁有可能导致流行模式发生改变,有必要开展持续监测。17~20岁人群带菌率高,应密切关注菌株在人群中的扩散传播,以防引起流脑病例。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 健康人群 血清群 核心基因组多位点序列分型 系统发育树 4821克隆群
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1例流行性脑脊髓膜炎死亡病例的流行病学及病原学特征分析
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作者 刘然 楼萍 +5 位作者 贺子翔 方明礼 彭水姣 向婧 湛志飞 周奇文 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期899-905,共7页
目的分析2024年湖南省衡阳市1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)死亡病例的流行病学及病原学特征分析。方法对死亡病例开展流行病学调查,采集病例及其密切接触者相关标本,进行脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)分离培养鉴定、药敏检测、... 目的分析2024年湖南省衡阳市1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)死亡病例的流行病学及病原学特征分析。方法对死亡病例开展流行病学调查,采集病例及其密切接触者相关标本,进行脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)分离培养鉴定、药敏检测、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和基因测序,分析死亡病例的流行病学和病原学特征。基于核心基因组多位点序列分型(cgMLST)进行系统进化分析。结果病例为16岁高中寄宿学生,患暴发型流脑,伴休克症状,发病24 h内死亡。从病例及其室友中分离到6株Nm,分别来自不同的2个分支。死亡病例分离株144569与密切接触者分离株144572高度同源,属于高致病CC4821 L44.1子系,其抗原式为C:P1.7-2,14:F5-101:ST4821(CC4821)。耐药基因分析显示这2株菌存在gyrA-71和penA-552,提示喹诺酮类药物、β-内酰胺酶类药物不敏感,与耐药表型相符。其他4株密切接触者分离株在同一分支,抗原式为B:P1.18-25,9-18:ST5829(UA)。结论该起死亡病例由来自高致病性CC4821 L44.1子系的C群Nm引起。该型菌株的扩散传播存在引起流脑暴发的潜在风险,应加强Nm分子流行病学的监测。青少年间多种型别Nm的传播以致其暴露风险增大,需要引起关注。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 核心基因组多位点序列分型 cc4821
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中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征 被引量：4
3
作者 赵盼 朱兵清 +4 位作者 张艾煜 徐丽 高源 余建兴 邵祝军 《疾病监测》 CAS 2020年第6期508-512,共5页
目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析... 目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。荚膜基因簇存在基因反转现象。结论Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 cc4821 荚膜基因簇 分布特征
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