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CVA6型手足口病流行病学特征分析 被引量:3
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作者 张晓丽 郑振喜 +1 位作者 钟晓 汪东篱 《临床医学工程》 2015年第8期1000-1001,共2页
目的分析柯萨奇病毒A6型(CVA6)手足口病的流行病学特征。方法随机选取2014年在本院就诊疑似手足口病患者480例,分析患者的性别、年龄、临床特点、治疗效果等。采用荧光定量RT-PCR法判断患者病毒感染类型,研究CVA6型手足口病在本地区... 目的分析柯萨奇病毒A6型(CVA6)手足口病的流行病学特征。方法随机选取2014年在本院就诊疑似手足口病患者480例,分析患者的性别、年龄、临床特点、治疗效果等。采用荧光定量RT-PCR法判断患者病毒感染类型,研究CVA6型手足口病在本地区的流行特征。结果 480例疑似手足口病患者中424例被确诊,其中CVA6型186例(43.87%),EV71型87例(20.52%),CVA16型85例(20.05%),CVA10型12例(2.83%),CVA4型4例(0.94%),其它肠道病毒50例(11.79%)。CVA6型手足口病发病率在5-8月最高,为86.02%,与其他各月份发病率比较,差异有统计学意义(P〈0.05)。CVA6型手足口病中男性患者较女性多,发病年龄多在5岁以下,临床症状以发热为主,且对其他系统都有一定损伤,经正规治疗均能得到痊愈,后遗症较少。结论 CVA6型手足口病是本地区最易见的类型,男性更易患有该病,且多发生在5岁以下,多在5-8月发生,每年该时间均应加大预防力度。 展开更多
关键词 手足口病 cva6 流行病学特征
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咳嗽型哮喘发病机制及治疗进展
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作者 程恒杰 王欣 罗建江 《临床医学进展》 2023年第3期2911-2917,共7页
咳嗽型哮喘(cough variant asthma, CVA)是一种不典型的哮喘,以慢性咳嗽,常伴有明显的夜间刺激性咳嗽为主要特征。其不典型的临床表现,极易造成误诊错失最佳治疗时间,最终导致病情转变为典型哮喘。本篇综述将对近年来咳嗽型哮喘最新的... 咳嗽型哮喘(cough variant asthma, CVA)是一种不典型的哮喘,以慢性咳嗽,常伴有明显的夜间刺激性咳嗽为主要特征。其不典型的临床表现,极易造成误诊错失最佳治疗时间,最终导致病情转变为典型哮喘。本篇综述将对近年来咳嗽型哮喘最新的发病机制、诊断及治疗情况进行简要总结和归纳。 展开更多
关键词 咳嗽哮喘(cva) 哮喘(CA) 气道炎症 气道高反应性 咳嗽 综述
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湖北2013年部分柯萨奇A16型肠道病毒VP1基因分子特征分析 被引量:5
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作者 李静 占建波 +3 位作者 杨朝晖 雷亚克 张婷 李国明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期320-324,共5页
目的全面研究和了解2013年湖北省柯萨奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型别及分子进化分析。方法对2013年湖北省21株CVA16病毒流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析... 目的全面研究和了解2013年湖北省柯萨奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型别及分子进化分析。方法对2013年湖北省21株CVA16病毒流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析。结果2013年湖北省21株CVA16型病毒流行株的VP1区核苷酸序列全长均为891bp,VP1区核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为90.0%~100.0%和96.3%~100.0%。VP1区基因系统进化分析表明,湖北CVA16流行株主要位于ligeage1和3分支上,分属于B1a和B1b基因亚型。结论 2013年湖北省21株CVA16型流行株主要为B1b基因亚型,其次为B1a基因亚型,在同一地区有两种基因亚型的CVA 16病毒同时存在,在不同的地区存在同一种亚型的CVA16病毒。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒cva16 VP1区 基因特征
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2012年江苏省柯萨奇病毒A组14型分离株全基因序列分析 被引量:2
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作者 姚昕 卞莲莲 +3 位作者 毛群颖 叶强 朱凤才 梁争论 《微生物学免疫学进展》 2015年第1期13-16,共4页
目的探讨2012年江苏省手足口病(HFMD)病原体CVA14病毒的全基因序列特点。方法采集江苏省邳州市2012年HFMD患儿的咽拭子或肛拭子样本,分离培养得到2株CVA14病毒,利用RT-PCR扩增CVA14全长基因。利用DNAStar软件包的Meg Align进行核苷酸序... 目的探讨2012年江苏省手足口病(HFMD)病原体CVA14病毒的全基因序列特点。方法采集江苏省邳州市2012年HFMD患儿的咽拭子或肛拭子样本,分离培养得到2株CVA14病毒,利用RT-PCR扩增CVA14全长基因。利用DNAStar软件包的Meg Align进行核苷酸序列分析,构建系统进化树。结果扩增得到覆盖CVA14全基因组的3个片段,拼接后为CVA14全基因组,分别命名为PZ05Y/JS/2012和PZ15G/JS/2012。同源性分析结果显示,这2株分离株之间同源性为99.4%,原型株(G-14)的核苷酸同源性为84.4%。进化树结果显示,所有的CVA14形成A、B和C共3个分支。结论获得了江苏省CVA14的全基因序列,分析了该毒株的进化特点,补充了中国CVA14病毒的基因信息。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组14(cva14) 基因
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柯萨奇病毒A组16型VP1蛋白的原核表达及纯化
5
作者 潘朋歌 李克生 +1 位作者 杜惠芬 曾潮宁 《安徽农业科学》 CAS 2018年第30期99-101,共3页
[目的]原核表达并纯化柯萨奇病毒A组16型(CVA16) VP1蛋白。[方法]根据Gen Bank CVA16 VP1基因序列,合成VP1全基因,连接到载体p ET30a,构建原核表达质粒p ET30a-CVA16-VP1。将测序正确的重组质粒转化至大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导蛋白表... [目的]原核表达并纯化柯萨奇病毒A组16型(CVA16) VP1蛋白。[方法]根据Gen Bank CVA16 VP1基因序列,合成VP1全基因,连接到载体p ET30a,构建原核表达质粒p ET30a-CVA16-VP1。将测序正确的重组质粒转化至大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导蛋白表达,Ni-NTA亲和层析纯化,SDS-PAGE和Western Blot鉴定重组蛋白。[结果]成功构建重组质粒p ET30a-CVA16-VP1,表达蛋白经SDS-PAGE显示分子量约为38.7 k Da,目的蛋白以包涵体形式存在,蛋白经复性、纯化,纯度达90%以上;经Western Blot检测,证实表达的蛋白为VP1蛋白。[结论]成功获得了高纯度的VP1蛋白,为此抗原用于临床诊断打下了基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16(cva16) VP1蛋白 原核表达 纯化
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厦门市11株柯萨奇病毒A4型分离株全基因组序列分析
6
作者 张建梅 温娟 +2 位作者 张荣秋 陈泽辉 徐雪荣 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第6期665-670,共6页
目的通过分析11株CVA4病毒毒株的全基因序列,揭示其基因进化及变异特征。方法将PCR检测阳性且Ct值<25的样本进行病毒分离培养,获得的毒株提取核酸(RNA)后采用高通量宏基因组测序方法进行序列测定,将质控合格的测序数据进行基因组组装... 目的通过分析11株CVA4病毒毒株的全基因序列,揭示其基因进化及变异特征。方法将PCR检测阳性且Ct值<25的样本进行病毒分离培养,获得的毒株提取核酸(RNA)后采用高通量宏基因组测序方法进行序列测定,将质控合格的测序数据进行基因组组装;获得的基因组序列提交至肠道病毒分型网站获得毒株血清型,同时与公共数据库下载的其他国家或地区的CVA4毒株序列通过MegAlign、Mega X、Simplot3.5.1软件分别进行相似性分析、系统进化树分析和重组分析。结果11株毒株全基因组序列长度在7434~7419 bp之间,血清型均为CVA4,核苷酸与氨基酸序列相似性分别为91.7%~99.3%和98%~100%;与原型株序列相比,核苷酸序列何氨基酸序列相似性分别在84.3%~84.7%和97.1%~97.3%之间;与其他参考序列相比,核苷酸与氨基酸序列相似性分别为80.8%~98.8%和96.9%~99.6%;全基因组遗传进化分析表明,其与中国其他地区CVA4毒株序列属同一遗传分枝;根据VP1基因进化树分析,本研究的毒株与中国其他地区毒株属于C基因型中的C2亚型;重组分析结果显示,11株CVA4与其他毒株无明显重组特征,但其中1株的部分区段序列与CVA2毒株序列一致性可达97.2%,剩余毒株与既往重组株相似度可高达98.6%。结论11株CVA4毒株为中国主要流行基因型,虽然与其他毒株无重组现象,但是与其他型别及以往重组株相似性较高,故在工作中需加强毒株重组监测,为手足口病的预防控制工作提供数据支撑。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组4(cva4) 全基因组 基因测序 基因重组
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颅内病变致心肌梗死样心电图改变12例分析
7
作者 王征 徐定修 《实用医学杂志》 CAS 2004年第7期738-738,共1页
关键词 颅内病变 心肌梗死 心电图 cva型 心肌缺血
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2010~2013年聊城地区肠道病毒A组CVA16型VP1基因特征及手足口病流行特点分析 被引量:4
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作者 杜银菊 张芙蓉 +6 位作者 刘莉 徐可心 赵宪敬 王飞 王建醒 裴耀文 丁淑军 《预防医学论坛》 2015年第11期801-805,808,共6页
目的对引起聊城地区手足口病(HFMD)流行的肠道病毒CVA16进行生物学分析,掌握其基因特征,为聊城地区手足口病的防控提供病原学资料。方法对2010~2013年聊城市各辖区采集手足口病患儿标本采用Real-time PCR法检测肠道病毒CVA16,用人横... 目的对引起聊城地区手足口病(HFMD)流行的肠道病毒CVA16进行生物学分析,掌握其基因特征,为聊城地区手足口病的防控提供病原学资料。方法对2010~2013年聊城市各辖区采集手足口病患儿标本采用Real-time PCR法检测肠道病毒CVA16,用人横纹肌瘤(RD)细胞对核酸检测阳性标本进行病毒分离,对分离到的CVA16病毒分离株采用RT-PCR方法进行VP1区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定,利用DNAStar和MEGA 4.0分析软件进行同源性分析和构建系统进化树。结果 2010~2013年聊城市各辖区共送检手足口病标本862份,639份标本检测为通用肠道病毒核酸阳性,其中CVA16阳性标本181份,分离到109株毒株;对毒株进行基因序列分析显示,2010~2013年聊城市流行的CVA16病毒株为B1基因型,2010和2011年为B1a和B1b两种基因亚型共循环,2012和2013年为B1b型,不同毒株VP1区基因序列在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为91.0%~97.0%和98.3%~100%,与近源的亚型代表株相比,聊城市优势毒株的氨基酸变异一般发生在VP1第23位(L→M)。结论聊城市2010~2013年手足口病CVA16流行毒株为B1基因型,存在B1a、B1b两个基因亚型,同源性分析表明辖区部分CVA16分离株B1a亚型与我国台湾及周边国家的分离株关系较近,B1b亚型与来自国内北方分离株形成进化树上关系较近的一群。聊城市存在不同的传播链,流行的CVA16相对保守,但已出现一定程度的变异。 展开更多
关键词 手足口病 cva16肠道病毒 VP1基因 流行特征
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废纸浆尾渣筛浆机
9
作者 肖明祯 《纸和造纸》 1997年第5期25-25,共1页
关键词 废纸浆 尾渣筛浆机 cva型
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2018-2021年广东汕头手足口病病原谱及CVA6/CVA10基因特征分析 被引量:1
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作者 陈爽 张鸿 +2 位作者 黄洁 曾汉日 陈敬鸿 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1285-1296,共12页
本研究旨在通过对手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的病原学标本进行肠道病毒分型鉴定,和对CVA6和CVA10开展VP1基因全长序列分析,探究广东省汕头市HFMD病原谱及CVA6和CVA10基因进化特征,为当地HFMD肠道病毒监测及预警提... 本研究旨在通过对手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的病原学标本进行肠道病毒分型鉴定,和对CVA6和CVA10开展VP1基因全长序列分析,探究广东省汕头市HFMD病原谱及CVA6和CVA10基因进化特征,为当地HFMD肠道病毒监测及预警提供一定的技术支撑。将汕头市病原监测哨点医院2018-2021年的HFMD样本进行RT-PCR肠道病毒病原学分型,筛选出CVA6和CVA10样本进行VP1区全长基因扩增和测序,并通过系统进化分析、同源性和突变位点分析了解其遗传进化特征。结果显示,2018-2021年共监测到HFMD阳性样本706份,其主要病原体为CVA6和CVA10。CVA6和CVA10流行株分别属于D3和C2亚型。CVA6样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为91.37%~100.00%和92.79%~100.00%,与2010年的中国台湾株高度同源(GenBank:JQ946055.1)。CVA10样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为92.28%~100.00%和96.98%~100.00%,与2014年的广东株高度同源(GenBank:MN451243.1)。与同型别原型株相比,CVA6样本有2个高频的非同义氨基酸突变位点造成了氨基酸极性或带电性的改变(F305S、T14A),CVA10样本则有9个(D25N、A33T、F148Y、Q223L、A291S、A78T、N27E、V240E、V107T)。以上结果提示当地需密切关注病毒流行谱和动态监测HFMD患者临床症状,以防病毒蛋白结构和功能的改变,加重其毒性和感染力。 展开更多
关键词 肠道病毒 手足口病 柯萨奇病毒A6(cva6) 柯萨奇病毒A10(cva10) VP1
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2009-2019年中国大陆柯萨奇病毒A14型基因特征分析 被引量:1
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作者 于力恒 郭琴 +14 位作者 卫海燕 童文彬 刘莹莹 祝双利 王东艳 杨倩 冀天娇 肖金波 路环环 刘莹 李冀琛 王雯慧 张勇 许文波 严冬梅 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1570-1577,共8页
柯萨奇病毒A14型属于肠道病毒A组,可引起手足口病和无菌性脑膜炎等疾病,但目前全球对CVA14的分子流行病学研究较少,尚无对CVA14基于全长VP1区进行明确分型的相关研究。因得到中国手足口病监测网络的技术支持,本研究获得2009-2019年在中... 柯萨奇病毒A14型属于肠道病毒A组,可引起手足口病和无菌性脑膜炎等疾病,但目前全球对CVA14的分子流行病学研究较少,尚无对CVA14基于全长VP1区进行明确分型的相关研究。因得到中国手足口病监测网络的技术支持,本研究获得2009-2019年在中国大陆分离到的15株CVA14,应用RT-PCR对其全长VP1区进行扩增、测序和分析,并与GenBank中下载的22条CVA14全长VP1序列共同构建系统发育树。结果显示,2009-2019年中国大陆分离的15株CVA14与原型株G-14的核苷酸与氨基酸相似性分别为81.8%~82.9%与95.6%~96.9%,15株CVA14之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~99.7%与98.3%~100%。中国大陆所有的22条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为91.7%~100.0%与98.3%~100.0%。中国大陆所有的CVA14与国外8条CVA14序列之间的核苷酸与氨基酸相似性分别为80.7%~86.0%与94.9%~97.9%。基于全长VP1系统发育树,全球CVA14可划分为A-G七个基因型,目前全球范围内流行的CVA14的基因型主要为G基因型,中国大陆流行的基因型全部为G基因型。本研究建立了全球CVA14基于全长VP1的基因分型方法,揭示了CVA14在中国大陆及全球范围内的分子流行特征,为CVA14的致病机制研究提供了分子流行病学方面的基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A14(cva14) 手足口病(HFMD) 基因 分子流行病学
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东莞市2015—2016年柯萨奇病毒A6型流行情况及特征分析 被引量:5
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作者 李艳芬 黄勇 +2 位作者 张莉萍 陈永迪 曾汉日 《中国热带医学》 CAS 2018年第2期116-120,共5页
目的研究东莞市2015—2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征。方法采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列。从G... 目的研究东莞市2015—2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征。方法采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列。从GenBank中选取其他CVA6代表株进行参考比对,利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树。结果在1 145份标本中检出CVA6阳性标本580份,阳性率为50.66%(580/1 145)。序列比对显示,20株CVA6分离株VP1基因之间核苷酸同源性为93.6%~100.0%,氨基酸同源性为97.7%~100.0%。东莞市CVA6分离株VP1与近年来全球各地流行株核苷酸和氨基酸的同源性分别为93.4%~98.5%和97.0%~99.7%,与CVA6原型株Gdula以及我国山东省1996年分离株核苷酸和氨基酸相似性仅为82.5%~85.8%和94.1%~96.4%。系统进化树分析显示,2015—2016年东莞地区CVA6与近年来流行于世界各地的CVA6分离株同源性较高,而与原型株进化距离较远。结论 2015—2016年东莞市HFMD病原以CVA6为主,流行株为近年来流行于全国各地的CVA6新变种。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6(cva6) 进化分析
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柯萨奇病毒A组9型的基因分型方法的建立 被引量:3
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作者 赵鹤鹤 冀天娇 +10 位作者 杨倩 肖金波 祝双利 王东艳 王建醒 陈建华 路环环 韩振志 张勇 许文波 严冬梅 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期264-270,共7页
血清型别鉴定及基因分型分析是开展肠道病毒(Enterovirus,EV)分子进化特征研究的重要内容。目前为止,国内外对柯萨奇病毒A组9型(Coxsackievirus A9,CVA9)的研究主要集中在衣壳蛋白区的细胞受体结合位点及其基因特性分析,而基于全长VP1... 血清型别鉴定及基因分型分析是开展肠道病毒(Enterovirus,EV)分子进化特征研究的重要内容。目前为止,国内外对柯萨奇病毒A组9型(Coxsackievirus A9,CVA9)的研究主要集中在衣壳蛋白区的细胞受体结合位点及其基因特性分析,而基于全长VP1序列的基因型划分结果尚未明确。本研究依托国家手足口病监测网络,对2010-2019年全国31个省级行政区(省、自治区、直辖市)上送的18 238份手足口病样本中分离出的24株CVA9进行全长VP1区序列测定,并与GenBank中所有全长VP1区序列一起进行基因型划分研究。测序结果显示24株CVA9分离株VP1全长为906bp,编码302个氨基酸,与CVA9原型株(Griggs)核苷酸和氨基酸相似性分别为80.5%~97.6%和92.3%~99.6%。结合系统进化树和同一血清型内不同基因型的核苷酸差异界值为15%~25%,将全球CVA9划分为A-H八个基因型。进化树显示B、C和D基因型在病毒进化过程中已消失,而E、F和G基因型呈现共循环的趋势,其中G基因型包含了亚洲、北美洲、大洋洲和欧洲等9个国家的毒株,是CVA9的优势基因型。大部分中国株属于G基因型,与世界流行趋势一致。但在2018年新疆一例手足口病患儿体内分离到的CVA9毒株却与俄罗斯有很近的亲缘关系,被划分为F基因型,推测该毒株为俄罗斯输入株。CVA9虽具有明显的地理聚性,但G基因型中包含的多国家和多时间段的毒株也提示CVA9病毒可能存在远距离的传播和流行。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组9(cva9) 基因分 分子进化
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CVA16感染对m^6A甲基化相关蛋白表达和定位的影响 被引量:4
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作者 李卫宇 蒋曦 +7 位作者 郑雪麟 朱文兵 刘卓航 李慧 张雪梅 吴忠香 宋杰 董少忠 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期530-537,共8页
目的本研究旨在探究柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A 16,CVA16)感染后是否会影响N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)甲基化相关蛋白在人呼吸道上皮细胞(16HBE)、ICR乳鼠和SCARB2人源化小鼠中的表达,以及在细胞中的定位。方法病... 目的本研究旨在探究柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A 16,CVA16)感染后是否会影响N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)甲基化相关蛋白在人呼吸道上皮细胞(16HBE)、ICR乳鼠和SCARB2人源化小鼠中的表达,以及在细胞中的定位。方法病毒分别以感染复数(MOI)=0.1感染16HBE和107 CCID50/ml感染小鼠,Western blot分析甲基转移酶、去甲基化酶和甲基化阅读蛋白的表达变化,免疫荧光观察这些蛋白质在细胞中的定位。结果研究结果发现,随着CVA16病毒感染时间的增加,m6A甲基化相关蛋白在细胞中表达水平逐渐下调,在ICR乳鼠和SCARB2小鼠中无明显变化;病毒感染后,m6A甲基化相关蛋白在细胞核与细胞质中重新分布,甚至发生降解。结论CVA16在宿主细胞中复制时可以改变m6A甲基化修饰相关蛋白的表达和细胞定位。本研究结果提示m6A修饰可能是肠道病毒治疗的潜在新靶点。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16(cva16) m^6A甲基化相关蛋白
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柯萨奇病毒A9型山东地方株的进化遗传学特征 被引量:1
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作者 黄蓉蓉 林小娟 +5 位作者 李漫时 刘尧 熊萍 赵晨旭 陶泽新 徐爱强 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1333-1340,共8页
柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病。为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序... 柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病。为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序列一并进行系统发生学和进化遗传学分析。结果显示全球CVA9可分为I-XII 12个基因型,优势基因型为VII,包括山东株在内的所有中国分离株均属于该基因型。进化遗传学研究显示,CVA9 VP1区序列的每年每个碱基的平均进化速率约为6.25×10^(-3),共同祖先起源于1919年。CVA9 VP1区的基因多样性在2003年以前无明显变化,2003年以后出现明显波动。本研究为我们了解CVA9的流行趋势和遗传变异提供了数据,对CVA9相关疾病的防控和诊断试剂的研发具有重要的现实意义。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A9(cva9) 系统发生学 进化遗传学 无菌性脑膜炎(AM)
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昆明市2018—2021年手足口病病例中柯萨奇病毒A组4型流行情况及VP1编码序列基因特征分析 被引量:2
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作者 刘艳艳 周永明 +5 位作者 赵云珍 颜军 刘如锦 杨春丽 伏晓庆 侯敏 《中国病毒病杂志》 CAS 2022年第5期364-370,共7页
目的 分析昆明市2018—2021年手足口病病原构成,研究柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CVA4)的流行特点及VP1编码序列系统进化与氨基酸变异情况。方法 采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcript-polymerase chai... 目的 分析昆明市2018—2021年手足口病病原构成,研究柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CVA4)的流行特点及VP1编码序列系统进化与氨基酸变异情况。方法 采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(real-time reverse transcript-polymerase chain reaction, real time RT-PCR)对2018—2021年昆明市疾病预防控制中心监测到的昆明市手足口病病例标本3 553份进行肠道病毒核酸检测,描述CVA4的流行情况,并进行VP1编码序列全长测序、氨基酸位点变异及系统进化分析。结果 共检出肠道病毒阳性标本2 531份,阳性率71.24%,其中CVA16、EV-A71及其他肠道病毒(非EV-A71、非CVA16)占阳性样本的构成比分别为38.05%(963/2 531)、4.11%(104/2 531)和57.84%(1 464/2 531)。CVA4阳性52份,其高发区域为昆明市区及东南部,涉及5个县区,阳性数占CVA4病例总数的73.08%(38/52),高发时间为8—12月,占CVA4病例总数的71.15%(37/52),高危人群为1~3岁儿童,占86.54%(45/52),男性多于女性,多引起轻症。CVA4共测序成功51份,核苷酸相似性为90.90%~100.00%,氨基酸相似性为97.30%~100.00%,均为C基因型C2亚型,分为3个传播链(cluster),clusterⅠ以2019年昆明市毒株为主,clusterⅡ以2020和2021年昆明市毒株为主,clusterⅠ、Ⅱ包含了98.04%(50/51)昆明市毒株。与原型株High Point(AF081295)VP1区氨基酸序列相比,有R18K、T23V、A34T、S102A、A200T、I262V、R274K和Y285H共8个高频氨基酸变异位点。结论 2018—2021年昆明市手足口病病原谱中其他肠道病毒(非EV-A71、非CVA16)占主导地位,CVA4作为其中的一个重要类型,属于C2亚型。应针对昆明市主城区及东南部区县、8—12月和1~3岁儿童等因素合理配置防控资源,做好CVA4防控工作。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组4(cva4) 病原学 流行 VP1编码序列 系统发育
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手足口病常规检测方法改进分析 被引量:3
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作者 马建敏 黄学勇 吴妮莉 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期754-757,共4页
目的为提高RT-PCR的检出水平,进一步改进手足口病的检测方法提供参考依据。方法同时采用RT-PCR和real-time RT-PCR方法检测2011年2—5月河南省新乡市各级医院临床诊断为手足口病患者的100份粪便标本及50份非肠道病人粪便标本中肠道病毒... 目的为提高RT-PCR的检出水平,进一步改进手足口病的检测方法提供参考依据。方法同时采用RT-PCR和real-time RT-PCR方法检测2011年2—5月河南省新乡市各级医院临床诊断为手足口病患者的100份粪便标本及50份非肠道病人粪便标本中肠道病毒通用型(PE)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)和肠道病毒71型(EV71)核酸;改进引物,RT-PCR检测CVA16;在NCBI中对RT-PCR使用的各组引物进行BLAST比对,并使用Primer Premier 6.0及Oligo 6.62软件分析各引物。结果 Real-time RT-PCR法检出CVA16、EV71和PE阳性率分别为36%、33%和71%,常规RT-PCR法分别检出20%、27%和64%,2者的PE、EV71检出率无统计学差异,而CVA16的检出率差异有统计学意义(χ2=6.349,P<0.05);改进引物后,RT-PCR法CVA16阳性检出率提高到35%(χ2=5.643,P<0.05),与临床诊断的符合率增加10%,接近real-time RT-PCR检测水平;2种方法的特异性、漏诊率及误诊率无明显差异。结论常规RT-PCR法对CVA16的检出率较低,采用改进后的引物,其检出率达到real-time RT-PCR水平。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒通用(PE) 柯萨奇病毒A组16(cva16) 肠道病毒71(EV71) 检出率
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疑似重症手足口病病原学检测及流行病学分析 被引量:2
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作者 王守贞 高会军 +1 位作者 赵贝贝 尹艳梅 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第14期2948-2950,共3页
目的对2011年山东省滨州市采集的疑似重症手足口病病例样本进行实验室检测分析,从而为本地区手足口病的综合防治提供参考资料。方法采集2011年滨州市366例疑似重症手足口病病例的咽拭、粪便、肛拭样本,应用realtime RT—PCR技术检测... 目的对2011年山东省滨州市采集的疑似重症手足口病病例样本进行实验室检测分析,从而为本地区手足口病的综合防治提供参考资料。方法采集2011年滨州市366例疑似重症手足口病病例的咽拭、粪便、肛拭样本,应用realtime RT—PCR技术检测肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)、肠道病毒普通型(EV)。结果707份不同类型的样本中,粪便样本的检测阳性率最高,咽拭最低(P〈0.01)。366例疑似重症手足口病病例中,EV71病毒、CVA16病毒、非EV71和非CVA16的EV病毒阳性率分别为81.42%、4.64%、5.74%;病例人群男性高于女性(1.49:1),1岁-4岁年龄段病例数最多,5月-7月份为高发月份。结论EV71型是2011年本地区手足口病流行的主要致病病毒类型,其流行具有明显的年龄、季节性。 展开更多
关键词 手足口病 EV71 cva16
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