本研究旨在通过对手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的病原学标本进行肠道病毒分型鉴定,和对CVA6和CVA10开展VP1基因全长序列分析,探究广东省汕头市HFMD病原谱及CVA6和CVA10基因进化特征,为当地HFMD肠道病毒监测及预警提...本研究旨在通过对手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的病原学标本进行肠道病毒分型鉴定,和对CVA6和CVA10开展VP1基因全长序列分析,探究广东省汕头市HFMD病原谱及CVA6和CVA10基因进化特征,为当地HFMD肠道病毒监测及预警提供一定的技术支撑。将汕头市病原监测哨点医院2018-2021年的HFMD样本进行RT-PCR肠道病毒病原学分型,筛选出CVA6和CVA10样本进行VP1区全长基因扩增和测序,并通过系统进化分析、同源性和突变位点分析了解其遗传进化特征。结果显示,2018-2021年共监测到HFMD阳性样本706份,其主要病原体为CVA6和CVA10。CVA6和CVA10流行株分别属于D3和C2亚型。CVA6样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为91.37%~100.00%和92.79%~100.00%,与2010年的中国台湾株高度同源(GenBank:JQ946055.1)。CVA10样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为92.28%~100.00%和96.98%~100.00%,与2014年的广东株高度同源(GenBank:MN451243.1)。与同型别原型株相比,CVA6样本有2个高频的非同义氨基酸突变位点造成了氨基酸极性或带电性的改变(F305S、T14A),CVA10样本则有9个(D25N、A33T、F148Y、Q223L、A291S、A78T、N27E、V240E、V107T)。以上结果提示当地需密切关注病毒流行谱和动态监测HFMD患者临床症状,以防病毒蛋白结构和功能的改变,加重其毒性和感染力。展开更多
文摘本研究旨在通过对手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)病例的病原学标本进行肠道病毒分型鉴定,和对CVA6和CVA10开展VP1基因全长序列分析,探究广东省汕头市HFMD病原谱及CVA6和CVA10基因进化特征,为当地HFMD肠道病毒监测及预警提供一定的技术支撑。将汕头市病原监测哨点医院2018-2021年的HFMD样本进行RT-PCR肠道病毒病原学分型,筛选出CVA6和CVA10样本进行VP1区全长基因扩增和测序,并通过系统进化分析、同源性和突变位点分析了解其遗传进化特征。结果显示,2018-2021年共监测到HFMD阳性样本706份,其主要病原体为CVA6和CVA10。CVA6和CVA10流行株分别属于D3和C2亚型。CVA6样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为91.37%~100.00%和92.79%~100.00%,与2010年的中国台湾株高度同源(GenBank:JQ946055.1)。CVA10样本VP1核苷酸和氨基酸的相似性分别为92.28%~100.00%和96.98%~100.00%,与2014年的广东株高度同源(GenBank:MN451243.1)。与同型别原型株相比,CVA6样本有2个高频的非同义氨基酸突变位点造成了氨基酸极性或带电性的改变(F305S、T14A),CVA10样本则有9个(D25N、A33T、F148Y、Q223L、A291S、A78T、N27E、V240E、V107T)。以上结果提示当地需密切关注病毒流行谱和动态监测HFMD患者临床症状,以防病毒蛋白结构和功能的改变,加重其毒性和感染力。
