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口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析 被引量：2
1
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期496-500,共5页
以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸... 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 china/99p2区 核苷酸序列 比较分析
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口蹄疫病毒株China/99 P3区一级结构及与参考毒株的比较分析 被引量：3
2
作者 张显升 赵启祖 +6 位作者 刘在新 江鹏斐 常惠芸 陈应理 李冬 魏怀录 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期606-610,共5页
用RT -PCR法 ,以口蹄疫病毒China/ 99感染的牛舌水泡皮为材料 ,扩增目的cDNA ,与pGEM TEasy载体连接并转化JM1 0 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,猪源毒在 3A基因内缺失 1 0个密码子 ,与牛源毒... 用RT -PCR法 ,以口蹄疫病毒China/ 99感染的牛舌水泡皮为材料 ,扩增目的cDNA ,与pGEM TEasy载体连接并转化JM1 0 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,猪源毒在 3A基因内缺失 1 0个密码子 ,与牛源毒的核苷酸和氨基酸序列差异较大。A G和T C的转换率较高 ,而且A G转换导致氨基酸变异的几率大于T C转换 ,它们是影响氨基酸稳定的因素之一。China/ 99P3区编码产物在第 8、1 2 0、1 2 1、1 2 7、1 32、1 93、493、50 1和 538位具有特征性氨基酸 ,可能与该毒株的表型如毒力等有关。 3A基因突变率较高 ,3B、3C和 3D较低 ,3D最为保守 ,这对维持 3C和 3D蛋白酶和 展开更多
关键词 口蹄疫 病毒株 china/99 p3区 一级结构 参考毒株
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