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EV-D68 VP1蛋白的生物信息学分析和候选疫苗表位肽段预测及筛选 被引量:9
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作者 陈俊伊 唐弘 +3 位作者 庄稀尧 熊雨菡 唐霞 杨春(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第15期1809-1813,1818,共6页
目的:通过对人肠道病毒D68型(EV-D68)衣壳蛋白VP1理化性质、结构功能和B细胞表位分析,获取候选疫苗肽段用于后期疫苗研制。方法:应用Bioedit软件、Netphos和ExPASy等在线工具分析EV-D68 VP1蛋白氨基酸序列。结果:EV-D68 VP1蛋白是等电点... 目的:通过对人肠道病毒D68型(EV-D68)衣壳蛋白VP1理化性质、结构功能和B细胞表位分析,获取候选疫苗肽段用于后期疫苗研制。方法:应用Bioedit软件、Netphos和ExPASy等在线工具分析EV-D68 VP1蛋白氨基酸序列。结果:EV-D68 VP1蛋白是等电点为8.73、相对分子量34.0 kD的亲水性蛋白质,具有35个可能的磷酸化位点,无信号肽和跨膜区,二级结构中不规则卷区有最高比例,α-螺旋和β-折叠散落在蛋白中;预测VP1蛋白具有多个可能的B细胞表位。结论:本研究分析了EV-D68 VP1的基本理化性质,结构功能和可能的B细胞表位,筛选了B细胞表位肽段,为EV-D68的进一步研究和疫苗的制备奠定基础。 展开更多
关键词 肠道病毒d68 VP1蛋白 B细胞表位 生物信息学
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ARRDC3在D68型肠道病毒感染A549细胞中的功能研究
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作者 李华怡 傅慧超 +1 位作者 司俊卓 杨春 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第14期1539-1546,共8页
目的探索含a-Arrestin结构域蛋白3(a-Arrestin-domain-containing-3,ARRDC3)在肠道病毒D组68型(enterovirus D species,EV-D68)感染A549中的表达以及对A549细胞株生物学行为的影响。方法对EV-D68感染宿主细胞前后的样本进行全转录组高... 目的探索含a-Arrestin结构域蛋白3(a-Arrestin-domain-containing-3,ARRDC3)在肠道病毒D组68型(enterovirus D species,EV-D68)感染A549中的表达以及对A549细胞株生物学行为的影响。方法对EV-D68感染宿主细胞前后的样本进行全转录组高通量测序分析,通过生物信息学分析筛选出差异表达基因ARRDC3;RT-qPCR和Western blot验证ARRDC3的表达水平;设计实验分组4组,对照组(未感染EV-D68的A549细胞)、感染组(感染EV-D68的A549细胞)、敲低ARRDC3感染组(感染EV-D68的A549细胞转染ARRDC3-SiRNA-干扰片段)、敲低对照感染组(感染EV-D68的A549细胞转染NC-SiRNA-干扰片段),通过流式细胞术、CCK-8、Transwell实验检测ARRDC3在EV-D68感染模型中对A549细胞周期、增殖、迁移的影响。结果从测序结果中共筛选出差异表达2倍以上的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)239个,其中上调基因135个,下调基因104个,ARRDC3是差异表达基因之一。EV-D68感染A549后,通过RT-qPCR和Western blot结果发现ARRDC3的表达水平显著增加(P<0.05)。细胞周期明显缩短,抑制细胞迁移。进一步通过转染成功干扰ARRDC3表达载体,沉默ARRDC3可以增强EV-D68感染A549细胞,沉默ARRDC3细胞周期DNA合成期延长(P<0.05),虽然对宿主细胞增殖无显著影响,但沉默ARRDC3可引起细胞迁移能力增强(P<0.05)。结论ARRDC3在EV-D68感染A549后表达明显上调,通过阻滞宿主细胞DNA合成期,抑制宿主细胞迁移等作用来发挥对宿主细胞的影响。 展开更多
关键词 ARRdC3 肠道病毒d68 A549 细胞周期 细胞增殖和迁移
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肠道病毒EV-D68的研究进展
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作者 黄浩 《大医生》 2021年第10期101-104,共4页
肠道病毒D68(EV-D68)是一种酸敏感的肠道病毒,可在人体呼吸道中复制并引起呼吸道感染疾病。1962年EV-D68首次于在美国加州分离,至今出现多个亚型和分支。EV-D68自发现原型株以来经历了重大的遗传变化。主要变异区域包括1类衣壳蛋白(VP1)... 肠道病毒D68(EV-D68)是一种酸敏感的肠道病毒,可在人体呼吸道中复制并引起呼吸道感染疾病。1962年EV-D68首次于在美国加州分离,至今出现多个亚型和分支。EV-D68自发现原型株以来经历了重大的遗传变化。主要变异区域包括1类衣壳蛋白(VP1)、5’非转译区(five prime untranslated region,5’UTR)和一些非结构蛋白。目前EV-D68在世界各地均有流行,人群的血清阳性率提示其感染率较高。对于EV-D68感染的相关受体及引起神经系统疾病、急性弛缓性脊髓炎(Acute flaccid myelitis,AFM)等严重症状的机理,都有待通过进一步的研究和建立完善监测网络来给出答案。 展开更多
关键词 肠道病毒d68 呼吸道感染 感染机理 疾病预防控制
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CD68和Sema 4D蛋白在胃癌组织中的表达相关性及临床意义 被引量:3
4
作者 李军 孙玉宝 +5 位作者 王春雷 李志芳 李峰 王金申 靖昌庆 牟林军 《中国现代普通外科进展》 CAS 2016年第6期433-437,共5页
目的:比较肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)标记抗原CD68和轴突导向因子4D(Sema4D)在胃癌组织和正常组织中的表达,探讨两者之间的相关性及临床意义。方法:采用免疫组织化学SP法检测86例胃癌组织和癌旁正常组织中CD68和Sema4D的表达,并分析其与临... 目的:比较肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)标记抗原CD68和轴突导向因子4D(Sema4D)在胃癌组织和正常组织中的表达,探讨两者之间的相关性及临床意义。方法:采用免疫组织化学SP法检测86例胃癌组织和癌旁正常组织中CD68和Sema4D的表达,并分析其与临床病理特征的关系。结果:胃癌组织中CD68和Sema4D蛋白阳性表达率显著高于癌旁组织(72.1%vs23.3%和74.4%vs29.1%,均P<0.01)。CD68和Sema4D蛋白与胃癌组织分化类型、TNM分期和淋巴结转移明显相关(P<0.05),且两者表达呈正相关(r=0.467,P<0.01)。结论:胃癌组织中CD68和Sema4D表达明显增高,且呈显著正相关,两者的联合检测有助于预测胃癌的发展趋势。 展开更多
关键词 胃肿瘤 肿瘤相关巨噬细胞 Cd 68 SEMA 4d
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人肠道病毒D68型在儿童急性呼吸道感染中的临床特征与分子生物学特征分析 被引量:6
5
作者 郝金斗 李明珠 刘培辉 《分子诊断与治疗杂志》 2017年第3期173-177,共5页
目的了解人肠病毒D68(EV-D68)在儿童急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARTI)中的临床特征及分子流行病学特征。方法采集2014年3月至2016年3月年深圳市妇幼保健院住院及门诊年龄1月至14岁符合急性呼吸道感染(ARTI)患儿... 目的了解人肠病毒D68(EV-D68)在儿童急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARTI)中的临床特征及分子流行病学特征。方法采集2014年3月至2016年3月年深圳市妇幼保健院住院及门诊年龄1月至14岁符合急性呼吸道感染(ARTI)患儿共13 472份咽拭子分泌物,使用EV通用核酸试剂盒进行肠道病毒检测,EV病毒通用核酸阳性标本通过RT-PCR扩增并测序分型。结果在13 472份鼻咽部拭子标本中,EV阳性病例1 222例,阳性率为9.10%,EV-D68感染患儿7例,阳性率0.05%,其VP1扩增序列分离的5株D68均与进化簇1病毒序列具有高同源性,2例与进化簇2有高同源性。结论 EV-D68可能是急性呼吸道感染的一种新的主要病原体,感染高峰季节可能在秋冬季节,以急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infections,ALRTI)为主要表现。 展开更多
关键词 肠道病毒 急性呼吸道感染 肠道病毒d68
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DLBCL患者CD68、cyclin D1蛋白表达和BCL-6基因重排及与生存期的相关性分析 被引量:3
6
作者 陈坚 李苗 +1 位作者 段相会 叶小卫 《临床和实验医学杂志》 2019年第8期811-815,共5页
目的分析弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、CD68蛋白表达和B淋巴细胞瘤-6(BCL-6)基因重排及与生存期的相关性。方法回顾性选取98例均获随访的DLBCL患者石蜡标本,通过免疫组化法对其cyclin D1、CD68和BCL-6进行... 目的分析弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、CD68蛋白表达和B淋巴细胞瘤-6(BCL-6)基因重排及与生存期的相关性。方法回顾性选取98例均获随访的DLBCL患者石蜡标本,通过免疫组化法对其cyclin D1、CD68和BCL-6进行免疫标记,并通过荧光原位杂交技术对BCL-6基因重排进行测定。分析cyclin D1、CD68蛋白表达和BCL-6基因重排与生存期的相关性。采用单因素分析法分析cyclin D1、CD68蛋白表达和BCL-6基因重排与DLBCL患者临床病理特征的相关性,并分析DLBCL患者临床病理特征与预后效果的关系,同时采用多因素COX风险模型分析cyclin D1、CD68蛋白表达和BCL-6基因重排与DLBCL患者生存期的相关性。结果 98例患者随访时间为1~36个月,平均为(21. 54±4. 65)个月,其中死亡14例,死亡率为14. 29%。98例患者中,cyclin D1蛋白高水平表达37例(37. 76%),CD68蛋白高水平表达17例(17. 35%),BCL-6基因重排20例(20. 41%)。cyclin D1、CD68蛋白表达和BCL-6基因重排与患者年龄、性别、血清乳酸脱氢酶(LDH)含量、Ann Arbor分期、原发部位、国际预后指数(IPI)及化疗方案均无显著关系(均P> 0. 05)。单因素分析结果显示,性别、原发部位与患者预后均无显著相关性(P> 0. 05),而年龄≥60岁、Ann Arbor分期为Ⅲ~Ⅳ、血清LDH≥245 IU/L、IPI评分为3~5分、化疗方案为CHOP的患者预后均较差(P <0. 05)。cyclin D1蛋白高表达、CD68蛋白高表达、BCL-6基因重排患者的生存率明显低于cyclin D1蛋白低表达、CD68蛋白低表达、BCL-6基因未重排者(均P <0. 05)。多因素COX模型分析结果发现,cyclin D1蛋白高表达、CD68蛋白高表达、BCL-6基因重排与患者预后效果均存在显著关系(P <0. 05)。结论 cyclin D1、CD68和BCL-6基因与DLBCL患者预后效果均存在密切关系,其中cyclin D1、CD68蛋白高表达及BCL-6基因重排者预后情况较差,提示cyclin D1、CD68蛋白及BCL-6基因可作为评估DLBCL患者预后的重要指标。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 细胞周期蛋白d1 Cd68蛋白 B淋巴细胞瘤-6基因 预后
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高产优质抗病杂交稻D优68的特征特性及栽培制种技术
7
作者 汪旭东 周开达 +1 位作者 李仕贵 黎汉云 《中国稻米》 1999年第5期15-15,共1页
关键词 杂交水稻 d68 特征 栽培 制种
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SA68D21 DL全双工无线数传报警模块及其应用 被引量:1
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作者 李敏 孟臣 《国外电子元器件》 2003年第7期49-51,共3页
SA68D21DL是一种可在微机或单片机之间进行全双工无线通信的数传收发模块 ,该模块具有透明式数据传输、与上位机接口简单方便、通信距离较远、数据误码率低、可独立工作、可组网应用等特点。文中介绍了SA68D21DL模块的功能、特点、引脚... SA68D21DL是一种可在微机或单片机之间进行全双工无线通信的数传收发模块 ,该模块具有透明式数据传输、与上位机接口简单方便、通信距离较远、数据误码率低、可独立工作、可组网应用等特点。文中介绍了SA68D21DL模块的功能、特点、引脚分布 。 展开更多
关键词 SA68d21dL 全双工无线通信 数传报警模块 应用
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肠道病毒D68型感染前后转录组分析及差异表达基因的验证 被引量:4
9
作者 唐霞 司俊卓 +5 位作者 卢楠 何永林 徐蕾 包嘉佳 唐佳玲 杨春 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期275-282,共8页
目的探讨肠道病毒D68型(enterovirus D68, EV-D68)感染前后宿主细胞转录组的表达变化,寻找与EV-D68感染的相关基因及信号通路,为初步探索EV-D68的感染机制奠定基础。方法将病毒以感染复数(multiplicity of infection,MOI)0.01接种于人... 目的探讨肠道病毒D68型(enterovirus D68, EV-D68)感染前后宿主细胞转录组的表达变化,寻找与EV-D68感染的相关基因及信号通路,为初步探索EV-D68的感染机制奠定基础。方法将病毒以感染复数(multiplicity of infection,MOI)0.01接种于人横纹肌瘤(rhabdomyosarcoma, RD)细胞,24 h后提取感染组和对照组细胞总RNA进行转录组测序,筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),对其进行GO和KEGG富集分析,并用RT-qPCR验证8个主要差异表达的基因(EGR1、c-fos、ZNF625、ARRDC3、c-jun、ASNS、CHAC1、ADM2)。结果从测序结果中共筛选出差异表达两倍以上的基因140个,其中上调基因71个,下调基因69个。GO功能富集分析结果主要涉及离子的调控与应答;KEGG富集分析结果主要与甲状旁腺激素的合成分泌和作用、GnRH信号通路、Toll样受体信号通路、IL-17信号通路和MAPK信号通路等有关。RT-qPCR验证结果表明选取的8个基因上调或下调的差异表达倍数趋势与测序结果基本一致,c-fos和c-jun的表达量随病毒MOI及感染时长的增加而增加。结论通过对差异表达基因的功能和信号通路富集分析及验证,EV-D68加重哮喘的机制可能与c-fos上调有关;而MAPK信号通路可能在EV-D68感染期间发挥促炎作用和抗病毒作用。 展开更多
关键词 ev-d68 转录组测序 差异表达基因
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基于M68HC08系列单片机的高位D/A扩展接口技术
10
作者 王宜怀 《微机发展》 2001年第4期79-80,F003,共3页
本文从实际应用的角度介绍了 12位D/A转换器TLV5 6 19的基本特点、结构 ,以MotorolaM 6 8HC0 8系列单片机中MC6 8HC90 8GP32单片机为例 ,探讨了TLV5 6 19与单片机的一种接口方法 。
关键词 单片机 M68HC08系列 d/A转换 接口
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高产优质杂交稻新组合D优68制种技术总结 被引量:1
11
作者 曾凡东 陈永昌 +1 位作者 李宏伟 李平 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2000年第S1期27-,共1页
D优 6 8具有产量高、米质优、抗性强、适应性广等特点 ,且制种高产稳产。其高产策略是促进母本早生快发 ,成大穗 ,合理安排播差期 ,确保花期相遇 ;培育壮秧 ,合理密植 ;加强肥水管理 ,培育高产群体 ;正确喷施“九二○” ,提高异交结实... D优 6 8具有产量高、米质优、抗性强、适应性广等特点 ,且制种高产稳产。其高产策略是促进母本早生快发 ,成大穗 ,合理安排播差期 ,确保花期相遇 ;培育壮秧 ,合理密植 ;加强肥水管理 ,培育高产群体 ;正确喷施“九二○” ,提高异交结实率 ;防治病虫 。 展开更多
关键词 杂交水稻 d68 制种技术
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M68HC912D60 MCU在税务监控系统设计中的应用 被引量:1
12
作者 田茂 李广军 +1 位作者 林水生 包孔林 《半导体技术》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期60-62,68,共4页
讨论了一个基于M68HC912D60 16位MCU的嵌入式税务监控系统的设计实例,分析了各功能模块和通信协议。本系统已通过实际测试及试运行,结果表明该设计具有较好的应用前景,对利用M68HC912系列MCU进行嵌入式系统设计的研发人员有一定的参考... 讨论了一个基于M68HC912D60 16位MCU的嵌入式税务监控系统的设计实例,分析了各功能模块和通信协议。本系统已通过实际测试及试运行,结果表明该设计具有较好的应用前景,对利用M68HC912系列MCU进行嵌入式系统设计的研发人员有一定的参考价值。 展开更多
关键词 M68HC912d60 16位MCU 税务监控系统 单片机 嵌入式系统
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肠道病毒D组68型假病毒的构建 被引量:2
13
作者 董方玉 崔博沛 +5 位作者 李克雷 崔力沙 刘佩 马超 吴星 梁争论 《微生物学免疫学进展》 2019年第6期8-14,共7页
目的制备携带萤火虫荧光素酶报告基因的肠道病毒D组68型(enterovirus D68,EV-D68)假病毒。方法分别构建携带绿色荧光蛋白报告基因的EV-D68表达子和携带萤光虫荧光素酶报告基因的EV-D68复制子,共转染HEK-293T细胞后收获EV-D68假病毒;实... 目的制备携带萤火虫荧光素酶报告基因的肠道病毒D组68型(enterovirus D68,EV-D68)假病毒。方法分别构建携带绿色荧光蛋白报告基因的EV-D68表达子和携带萤光虫荧光素酶报告基因的EV-D68复制子,共转染HEK-293T细胞后收获EV-D68假病毒;实时逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)及蛋白质印迹法(Western blotting)鉴定EV-D68假病毒;实时荧光定量PCR检测假病毒滴度,荧光强度定量检测假病毒感染活性。结果成功构建EV-D68表达子和复制子;成功制备EV-D68假病毒,RT-PCR和Western blotting结果表明其具有萤火虫荧光素酶报告基因和与活病毒相同的衣壳蛋白,拷贝数为(4~8)×10^6 copies/mL,荧光强度与假病毒感染剂量呈正相关,证明其具有感染活性。结论成功构建了EV-D68假病毒。 展开更多
关键词 肠道病毒d68 假病毒 鉴定方法 急性弛缓性脊髓炎
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多路A/D转换器AD7714及其与M68HC11单片机接口技术 被引量:1
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作者 郑芳庭 《测控技术》 CSCD 2000年第11期55-57,共3页
介绍一种高分辨率的多路A/D转换器AD7714,能满足智能仪器设计中高精度多路A/D采样要求。内容包括AD7714的特点、内部寄存器结构和外部接口 ,并详细阐述了AD7714与M68HC11系列单片机的接口技术。
关键词 A/d转换器 Ad7714 M68HC11 单片机 接口
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The Genomic Characterization of Enterovirus D68 from 2011 to 2015 in Beijing, China 被引量:2
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作者 ZHANG Tie Gang LI Hong Quan +5 位作者 LI Ai Hua CHEN Meng GONG Cheng LUO Ming DONG Mei HUANG Fang 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2016年第9期675-677,共3页
A retrospective surveillance study on enterovirus D68 was performed in Beijing, China, following the largest and most widespread EV-D68 infection, which occurred in the USA. From January 2011 to July 2015, EV-D68 was ... A retrospective surveillance study on enterovirus D68 was performed in Beijing, China, following the largest and most widespread EV-D68 infection, which occurred in the USA. From January 2011 to July 2015, EV-D68 was identified in 12 individuals with respiratory infections in Beijing, China. The phylogenetic relationships based on the genomic sequence alignment showed that there were two lineages circulating in Beijing from 2011 to 2015. Eight EV-D68 strains belonged to group 1 and four belonged to group 3. All EV-D68 strains from Beijing in 2014 were separately clustered into subgroup II of group 1. Based on these results, we concluded that the Beijing EV-D68 strains had little association with the EV-D68 strains circulating in the 2014 USA outbreak. 展开更多
关键词 The Genomic Characterization of Enterovirus d68 from 2011 to 2015 in Beijing China EV
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优质杂稻新组合D优68主要特征特性及高产栽培措施 被引量:1
16
作者 郭惠民 《种子》 CSCD 北大核心 2002年第4期70-71,共2页
D优 6 8在福安试种示范中 ,表现出较强的杂种优势 ,高产栽培应掌握稀播种培育壮秧 ,插足基本苗 ,早施基肥。
关键词 d68品种 特征特性 高产栽培技术 杂交水稻
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杂交稻D702优多系1号和D优68新组合高产制种技术
17
作者 蔡为铭 林宜茂 +2 位作者 刘文炳 陈双龙 郑旋 《中国稻米》 2003年第2期8-10,共3页
关键词 杂交稻 d702优多系1号 d68 组合 制种技术
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水稻新品种宛粳68D的选育及高产栽培技术 被引量:2
18
作者 郭俊红 杨阳 李民 《农业科技通讯》 2021年第5期246-248,共3页
宛粳68D是南阳市农业科学院以花育446为母本、旱稻502为父本经系谱法选育而成的水稻新品种,具有优质、高产稳产、多抗、适应性广的特点,于2020年9月通过河南省审定。笔者详细介绍了该品种的选育过程、品种特征特性、抗病性及高产栽培技术。
关键词 宛粳68d 粳稻 品种选育 栽培技术
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Acute flaccid paralysis and neurogenic respiratory failure associated with enterovirus D68 infection in children: Report of two cases
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作者 Yv Zhang Sheng-Yuan Wang +2 位作者 Da-Zhi Guo Shu-Yi Pan Yan Lv 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2021年第14期3327-3333,共7页
BACKGROUND Acute flaccid paralysis(AFP)and neurogenic respiratory failure rarely occur in children.At the end of 2018,some children with such symptoms were admitted to our hospital.In this study,we aimed to assess two... BACKGROUND Acute flaccid paralysis(AFP)and neurogenic respiratory failure rarely occur in children.At the end of 2018,some children with such symptoms were admitted to our hospital.In this study,we aimed to assess two children with AFP and neurogenic respiratory failure associated with enterovirus D68(EV-D68).CASE SUMMARY Two children admitted to our hospital presented with symptoms and imaging results different from those of acute disseminated encephalomyelitis and hand,foot,and mouth disease.Their main symptoms were AFP and neurogenic respiratory failure.Magnetic resonance imaging showed severe inflammatory injury mainly to the anterior horn cells of the spinal cord.Blood and cerebrospinal fluid samples were collected to assess for pathogens,including bacteria,tuberculosis,cryptococcus,herpes virus,and coxsackie virus,and the results were negative.At the beginning,the two cases were not assessed for EV-D68 in the nasopharyngeal,blood,and cerebrospinal fluid specimens.About 2 mo later,EVD68 was detected in the stool sample of one of the cases.The symptom of AFP was caused by injury to the anterior horn cells at levels C5-L5 of the spinal cord,while neurogenic respiratory failure was at levels C3-C5.CONCLUSION We should pay attention to the detection and diagnosis of EV-D68 and make efforts to develop antivirus drugs and vaccines. 展开更多
关键词 INFECTION Enterovirus d68 Flaccid PARALYSIS NEUROGENIC Respiratory failure Case report
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香125S和D68亲本特性及制种对策
20
作者 周卜龙 龚光雄 +5 位作者 郑云书 满小刚 向宽涛 田华 郑自友 余雄 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 1998年第S2期30-32,共3页
阐述了香125S和D68的特性,并提出了选择好制种基地;定好3个安全期;合理安排“倒播差”;培育足蘖壮秧;协调亲本群体;科学运筹肥水;巧施“九二0”;提高人工辅助授粉质量;综合防治病虫害等制种配套技术措施。
关键词 香125S d68 特性 制种对策
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